ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

scn_reactorb_scaffold_108816_10

Organism: 2019_SCN_bioreactor_inoc_reactorb_Clostridiales_33_7

near complete RP 39 / 55 MC: 1 BSCG 45 / 51 MC: 3 ASCG 12 / 38 MC: 3
Location: 7942..14004

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
Lipoprotein (Fragment) n=1 Tax=uncultured bacterium (gcode 4) RepID=K1XXE6_9BACT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 31.1
  • Coverage: 383.0
  • Bit_score: 118
  • Evalue 4.90e-23
ChW repeat-containing protein,Internalin-A,Leucine Rich repeats (2 copies) {ECO:0000313|EMBL:CEK32701.1}; TaxID=1505 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Peptostreptococcaceae; Peptoclostridium.;" source="Clostridium sordellii.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 23.7
  • Coverage: 840.0
  • Bit_score: 111
  • Evalue 8.50e-21
surface protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 23.8
  • Coverage: 822.0
  • Bit_score: 92
  • Evalue 1.40e-15

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

[Clostridium] sordellii → Peptoclostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 6063
ATGGATTTTAGGAAAAAAATGAAGAGAGCGATTTCTATGCTGATAGCTGTTTTAATGGTTATTTCAATGCTTACTGTTAATATAGCTTATGCTTCAATTGCTCCGGTTAATCCGGTTGAGACTCTGGGTGTAAAAAACATGGTAAAAATGGGGTCATCAAGCAGAGTTAAAGGTTCTTATACTTATGCTAGTTATAGTTCTAATACGATACCAGGTGATTCCGGACCGGTGTATAGAAATGTTGACGGCATGTCTTGGGAAGAGGGCGGAATATGGACTCGAAGGGAGAAAGATGGTGCTATAACAGTGCATCCGGGTAAATCGGATGATGCTTCTATGGGCTTTGTAGTAGATTTAGTGGGACATAATATGCTTGGTGCAGCATTAAAAGGTGATTTAAGAGCAATTAATGAAACTAGATATAAAAATTATATTCTTGATAAAGATTATGGACAGCCTTATATAAGCTTTTATAATATAGATGGAGCGAAAATAAATACTGTTGCGGGTGATGCAAAGGATTTTGATAATTATACTATTAATGCGATGGAAACAGCTGTATATCCGAAAACAGCTTATATTATATTTTCTATATATGCTAAAAGAAAGGCAAGTGCTGCTGACGATTTGGATATATTTTTGGAGTACATAAAAGGTGTAATAACAGATAATAAAGCTCCAAAATTTGTTAGTGCTACAAATGATTGTAATGCTGATGGTTCACCTTTACAGCTCTCACAATATGATGAGGTAATTAAGCAAAATATTAATGCTCAGGAACCAAATATATATATTACAATGGATGAAGATTGTACATTTCCAATCAATATAAATGCTACCCTGTACGCTACAGATGGTAGTGAAGTAGGAACTAATCTAATTTACATGGGCAGATCCCATATAAATTACAGTAATGGTAATATGACCTATAAATTCAGGATAAATGTAGAGGATTTACAAAACAGAGGTATTTTCAAACATTTTTATGAAATGGAAATAAAGAATTTTTATGCAGAGGATACATTTCTAAATCCAATTATAGCTAACACAACACCTATAAAATTCAAAAAAAGAATTGATACTAAAGCTCCAATAATAGAGACTGATTATATGCTCTCTCCACCAAATATGTTTTTGGTAGATGATGAATTTGGATTATCGTCAGTAAAATACGATATGAAAATAAATGGCGTTACAAATAGTACAGTATTAGTTCAAGAACCAAAAACTACTAAGGTAGGACTATCGACAAAAGACATAATGTTCTATATTGAAAACACTACAAAATATTCGGGTGAATTCGATATTGAAATCAGTGCTTCAGATTTGGTTAACGATACTAATACGGAACGACAAAAATACAACAGCTCTAAACTAACAAAGAAACTGTTTTTAATATCTAATCAAGATGCTTTAGGATTTTCGCTAAAAAATAGTAATAATCCAATGCTTAAGTTAGAAGAAAGTAATGTTAGTAACACTACAACAAACGCACTTACCAATATGTATCTTGAATCAAGCTTAAAACTAAAAGATATAACTAAAGATATCATTTATTATAAATGGAGCGGTACATATGATGAAATTAGTGTACCTGTTGTAATAAAAACTGATGATAAGGGAGGTTCATATCTTGCTCCGGTGTATAAGGATGGCGGTTATTTATACATAATACCAAAAATCAAGGATGATACAGCGGATGAAGCAAAAATTAGAACTGGTTCAATGGCAAAAAATTATAAGGGTGAAGAATCCTATGATGAAAATAAAAATAAAGGTTACTTCAAGCTAAGCAGCAATCCTGTTGAAGGTAATTTTGAAAACAGAGGATGCGATTGTACAGGACAAGGAACTGGAGATAACAGTATTTTACACTATAGTTCATATGGAAATCACAAAAAAGATATTGGCTTTGATGTGACAAACAATAATGAAGAGCTAGCCAGCTTGAAATATTACATAAGTGAGGGAATTGGTGCTAATAAAAGCTCTTCCTATATTGCACAGGGCTCTTTTGCAAAAAATAGCACAGGAAAGTATGATGTGCCGATTAATTCAATTATAAATAAAACCGGTGAATATACTATTACTGTAGTGCTTTATTCTAGTAAAGGGGATATAACTGTTAATAACTTAGATATAAGAATTGAAAATCCAATTGTAAGTATAACAGACATCCTATATAATCAAGCAACAAAGGATTTTGATTTTACCTTAAAGTATTTAAAAAATTCATTTGTTGATAAGGCTCTTACTGATATACAAATAGAATTTGCAGCTGAGGATATAGTTAAGTTTACAGAAAAGGACGCAGAAACAGAAAACAAAATAAGTATATATGCTATTTCAGAGGGTGCAGTTATTCCAAAGGATGACTGGAGTACATCCGATAAGGCATTTGTTAGAACTGAATTTTATCAAGATATATCTAATGAAAACCTGATGGTTGCAAACTTTAGAGCTTCCTTAACAAATATGGAAAAGGCAGGGGATGCCTTTATTAAAGCAGCAGGCGAAAAGAGGGTACACTTGAAGTACACGAGCTCTAACAAGGTTGAGATATATAACAATAACCTTAGTGTTATCAAAAAAGCTAACCTGCCTCCTAGTATAAACAATACAGGCAATACTAATTTGCTTGGGAAATATTTGAAGGCAAGCGAATTTAATAACACTGGTTCAGTTCCTATCATAAGCATTGATGTAGAGGAGTCAATCGTTGATTTGGAAAAGGTTAATTATGCATGGGTTGAAAGTGCTGATGCTTCATTAATTATAGACGAGGATAATATAGCTGGAACCCCTGTCGTTTTGTCAGATACAGATAAGCTTAATATTAGTCCAAGGGATATTCCTTCTATTGCTACTACTGATAGTGAACTATATAAGCCTTACTTCCTCATTGTATATGCTGAAAATTCAGCAGGCAAATATATTGAAAGAAGTTTCGGACCATTTTATGTGTTAAATGAAGATATTGATAATAAAAGATTTGAAATTACAGTTACTGATGAAGCAATAAGTGAGGAGCACGTATTTATTGCAGTTGATGACAGGCTTCATATGATAACTGAGCTTGATAAAGCAGATAAAGTTAAGCTTAAGTGGAATAAAAACGACATAGAAATCGTTAAAACTTATGATATTTGCTTTGAGAAGGGTGAAGACACAAGTAATTTAGCATATATAAATATCCCATATATAGATTTGACAGATACAAATGGTGTTGGAGGAACCTTTAAATTAAGCAGTGTTGAGATAATTAATTCAGGAAAACCAACAGTGTCAATAAAAGCTAAGACAATAAATGAAGCTGATATAAAGCAGGTGTTGCCTGAGCATTTTGTATCTATTAATATGATTGGTGACAAAGATAATTACAGCGGAGCTAATGTTAAATCTGATATTGATGATATACAATATTCGTGGTCAAGTAATCAATATGATAATCCAAGTGTATGGACAGCAATATCAGGTCTTAGTAGTGAGTTGGGAAAGAATTTTTATCCTATAGAAAATAAAAGCCTTATAAATACAAGAAACTATTTGTTCTTAAAAATAAGAGACAGTATTTACAGGACAGATGAAATAAAGCTTCAAGATCCTGATACATTAGCTGAAGTAACAGCTGCAAGCATAAAAATAGGTGCAGCAGAAGACGGCTATTTAGGAGCTGAGAATGGAGCTCAAGCAAATGTCATGCTTAGAATTAAAGTAGATAATGCACAAGATTTAAGCAAGATTAATCAGATAAAATGCTTTGACCTATATAGTGGTGCATCTTCTGGTACAGCTATAAGTGTAAACAATGTTTATAAGATTTCTGATAATGAGATAGCAGCTTTCATACCAAGTCTTGTTACAAGCAGTGGAGCAATTAGTTGTACGGTGTCAATAAATGATTTTACAGCGCTTGAAGTTAAATCTAATCGTGTTGGAGACTTAAGTCCGGTTGATCTAAGTATTACACGCGATAATAGAACAATTACTTTAACTAATAAAGCTGATTATTTAAAATATTCCTTATATCAATCTGATGGAAGAAAGTATACATTTAACGATGAAGGCAAGACAAAAATCTTTGAAAATGGTAAATATTTGTTAGTTTATAGAGATAGCACAAATAATTATATGTATACAAAGGTGATAGAGGTATCAGGTATTACATATACATCTGCTGATATTAGCAAGACACTTACAGCTATTGAAACAGAAGGTAAAGTGACAAATGTAAATATAGAAATTACTATGCCTTTAGGCTCTATGATAATTGATAAATATGGTATTTTAAATAATGTTGTAGTAAATAAGGAAAATAAAACAGTGGTAGCAACATCTGTTGTTACTAATAGTGCAATATATGCTTTTGATATTAAATTAGCTGACGGTACAGTAATTAAGGATTATAAAATAGACGTTACCAGTATTGTACAAAATTATATTCCTGAAAGTACAGAGGGAGCAGCAGCTAATATAAAATATTCTCCTGAAGAGAAAACATTAACTAATCAAGATGTTACAGCAACTATCACAGATGCTAATGCTTTGTTAAGCAACAATGCAACAAACAGTGTGATATTTAATAAAAGCGGAAGCTATAGCCTTGCATTTATGGATAATGAAGCTGTAAACAAGGTGAAAATATACACAGCGGTAATTGATTGGATAGACAAGAGCTGTCCGGAACCTGTTATTAAAAAGTATGTATGGTATGATTTTGATAATGATGGAATAATTGATGATGGCGAAAAAGGTGCTGAAATTAGTCAAGGCTATAAGACAAAGAACAATGTTTTAGTTGAAATAGAATTTTCTAAGGAAAGCAGAGCTGTTAAATTAAGCGATGATACCGGCTTTATAATTACAGAACCGGCAGACAATGACTATGCATATAAATTTACTTATGTGTATAATCCGGCTAAATCTTTAGGTGATACTCCGGTGTTTAGAAAAATGCTGGAATTTTCTGATACTCTAGGCAACACTTTAAAATATAATTTTGTAATTGATGAAATAGACAGAACAGCATTGCTCACTCAATTAAACTATAGCACAACTAACTATACAAACAGAGATGTTGTAGTGTCAATGGCTGCTAATAAAGCTATAAAAAGATTTGATATAGTTCAAGATGCAGAAGGCAAGGATGTCGAAAAAGAAGCATCACCTACTTATATATTTAAGGAAAATGGGTCAAAAGATTTCAATTATAGAGAGATACAAACCGATGATCCGATAGAAGGAACCTTAGTTGCTAATGTTACCTGGATAGATAAAAATGCACCTGTAGTTAAGGTTTCATACAATAATACACTTACGAATCAAGATGTTGAAATAAGATTAACAGTTGTAAATGGTGGAGGATTAAAAGAAAATGCAAGGTTAAAGTATGGCGATAAAATCATTGCATTGACTGATTCAGGAGATGATAGAATAGGAACACATACAGTTTCTGAAAATGGAAATTACAGCTTTACTGTAATAAATAAATATGGAAACACAGGATCAGTAATAATCCCAATTAATTGCATTGACAAAAAAGCACCTGAGCTTAGTATCACCGGAAGAACGATTGTTTATGTGAAGGCTGGAGATAAGTATTACGACAAAGGAGCAACTGCAATTGATAACAGAGATGGAACTATCACTGCAGCTATTAAGTCTACTAGTAATGTTGACACATCTGCAGAGGGTACTTATGAGGTTGTTTATACTGTTAGTGATAATGCAGGAAATACCAGCTTAAAAACAAGAACTGTTCGTGTACTTGATATTAACTCAGCGGTTGCAATTGTTCAGGATAATGTTATAGATTTAAAGAGTACTGTTGTTCATCAAATAGCATTATCTGAGTCTGGAATAGTGTTTATGGAGCTTGTTGGTATAAACGGAAATTATGTAACTAAGTATGCAAAGGGTGAAGGATTTGATAATGCTTACTTTAAAACAAACGGAAGCTACTTGTCAAAACTTGGAACATTTACAGCAGAAAAAGGTAAATACACATTGTATATACAAGACCAGGAGAGAAATACAAGAATAATTACGGTTGAATTTAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 2021
MDFRKKMKRAISMLIAVLMVISMLTVNIAYASIAPVNPVETLGVKNMVKMGSSSRVKGSYTYASYSSNTIPGDSGPVYRNVDGMSWEEGGIWTRREKDGAITVHPGKSDDASMGFVVDLVGHNMLGAALKGDLRAINETRYKNYILDKDYGQPYISFYNIDGAKINTVAGDAKDFDNYTINAMETAVYPKTAYIIFSIYAKRKASAADDLDIFLEYIKGVITDNKAPKFVSATNDCNADGSPLQLSQYDEVIKQNINAQEPNIYITMDEDCTFPININATLYATDGSEVGTNLIYMGRSHINYSNGNMTYKFRINVEDLQNRGIFKHFYEMEIKNFYAEDTFLNPIIANTTPIKFKKRIDTKAPIIETDYMLSPPNMFLVDDEFGLSSVKYDMKINGVTNSTVLVQEPKTTKVGLSTKDIMFYIENTTKYSGEFDIEISASDLVNDTNTERQKYNSSKLTKKLFLISNQDALGFSLKNSNNPMLKLEESNVSNTTTNALTNMYLESSLKLKDITKDIIYYKWSGTYDEISVPVVIKTDDKGGSYLAPVYKDGGYLYIIPKIKDDTADEAKIRTGSMAKNYKGEESYDENKNKGYFKLSSNPVEGNFENRGCDCTGQGTGDNSILHYSSYGNHKKDIGFDVTNNNEELASLKYYISEGIGANKSSSYIAQGSFAKNSTGKYDVPINSIINKTGEYTITVVLYSSKGDITVNNLDIRIENPIVSITDILYNQATKDFDFTLKYLKNSFVDKALTDIQIEFAAEDIVKFTEKDAETENKISIYAISEGAVIPKDDWSTSDKAFVRTEFYQDISNENLMVANFRASLTNMEKAGDAFIKAAGEKRVHLKYTSSNKVEIYNNNLSVIKKANLPPSINNTGNTNLLGKYLKASEFNNTGSVPIISIDVEESIVDLEKVNYAWVESADASLIIDEDNIAGTPVVLSDTDKLNISPRDIPSIATTDSELYKPYFLIVYAENSAGKYIERSFGPFYVLNEDIDNKRFEITVTDEAISEEHVFIAVDDRLHMITELDKADKVKLKWNKNDIEIVKTYDICFEKGEDTSNLAYINIPYIDLTDTNGVGGTFKLSSVEIINSGKPTVSIKAKTINEADIKQVLPEHFVSINMIGDKDNYSGANVKSDIDDIQYSWSSNQYDNPSVWTAISGLSSELGKNFYPIENKSLINTRNYLFLKIRDSIYRTDEIKLQDPDTLAEVTAASIKIGAAEDGYLGAENGAQANVMLRIKVDNAQDLSKINQIKCFDLYSGASSGTAISVNNVYKISDNEIAAFIPSLVTSSGAISCTVSINDFTALEVKSNRVGDLSPVDLSITRDNRTITLTNKADYLKYSLYQSDGRKYTFNDEGKTKIFENGKYLLVYRDSTNNYMYTKVIEVSGITYTSADISKTLTAIETEGKVTNVNIEITMPLGSMIIDKYGILNNVVVNKENKTVVATSVVTNSAIYAFDIKLADGTVIKDYKIDVTSIVQNYIPESTEGAAANIKYSPEEKTLTNQDVTATITDANALLSNNATNSVIFNKSGSYSLAFMDNEAVNKVKIYTAVIDWIDKSCPEPVIKKYVWYDFDNDGIIDDGEKGAEISQGYKTKNNVLVEIEFSKESRAVKLSDDTGFIITEPADNDYAYKFTYVYNPAKSLGDTPVFRKMLEFSDTLGNTLKYNFVIDEIDRTALLTQLNYSTTNYTNRDVVVSMAANKAIKRFDIVQDAEGKDVEKEASPTYIFKENGSKDFNYREIQTDDPIEGTLVANVTWIDKNAPVVKVSYNNTLTNQDVEIRLTVVNGGGLKENARLKYGDKIIALTDSGDDRIGTHTVSENGNYSFTVINKYGNTGSVIIPINCIDKKAPELSITGRTIVYVKAGDKYYDKGATAIDNRDGTITAAIKSTSNVDTSAEGTYEVVYTVSDNAGNTSLKTRTVRVLDINSAVAIVQDNVIDLKSTVVHQIALSESGIVFMELVGINGNYVTKYAKGEGFDNAYFKTNGSYLSKLGTFTAEKGKYTLYIQDQERNTRIITVEFK*