ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

scn_reactorb_scaffold_136140_1

Organism: 2019_SCN_bioreactor_inoc_reactorb_Clostridiales_33_7

near complete RP 39 / 55 MC: 1 BSCG 45 / 51 MC: 3 ASCG 12 / 38 MC: 3
Location: 1..5256

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
Uncharacterized protein n=1 Tax=Firmicutes bacterium CAG:41 RepID=R6MJ11_9FIRM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 34.0
  • Coverage: 1569.0
  • Bit_score: 899
  • Evalue 3.00e-258
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:CDB99613.1}; TaxID=1263021 species="Bacteria; Firmicutes; environmental samples.;" source="Firmicutes bacterium CAG:41.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 34.0
  • Coverage: 1569.0
  • Bit_score: 899
  • Evalue 4.20e-258
cell wall/surface repeat-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 32.5
  • Coverage: 468.0
  • Bit_score: 176
  • Evalue 6.40e-41

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Firmicutes bacterium CAG:41 → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5256
ATTGCGACTAATTATGGAGTTTATTCTAATGATAAGGTTTCAAATAAAAATACTGTTGCTGTAAACTTAGCTTCTCCTTCTGCGATGGAATTGACAGAGGATAAAAAAGGCTATTTGTCTAAGGTGGATGGCGGAAATCCGGGAGACTTTACTATTCAAACAAGTGTTGAAAACTTCAAAACGGATACCTCCAAAGCATATAAAAATGTAAAAATAGCTGTATATAGTCAAACAGGTATAGTTCCTTTAAACGATGACGGAGTTAAACAGGATAATGCAAGCTATGCCAATCCTTATACAAAAGAGGTCAATGATTTTAAGATAGATGAAATAAAATCAATATCATGGAAATTCAATGCTTCTGTCGGGGAGGAAGCTGACTACAGAAAAATTCAATTTAAGGTATATAATGTAAGCTCGGATGTAGATCCTACAGGAAGCGGACAATTGCTGGAAGAAAATCTTTTGGGAGAGGCATATTGTTATATTTTGTGCCCGGGTGGAGACGGCTTACTGCCAGAAATTAAATTTACAGGCTCATCACCTGAAATTATATACAACGAAGGAAACAGACATCTGTTTTTGAGCGGAACAAATTTCAGTATGCTCCAAAATAAATCAGAGTACACTGTGCTTGCGAAATCTCTTTCAAAAAATGGAAAGACTTATACGATACCTTCGGACAATTTTTTAATTGATTCAAATACGAACACAATAGATGTTCTTATGACTGAAAAGATGGAAACAGGAAGCTATCAGATGGTGATAGATTATAGCGATTCAGCTAAAAAAGACATTGCTGCACCTGCTATGATGTTTGCTGTAAGTGATGATAAGCAATACAAAAATGATGCTTATGGTATTATAGCTATAGTTCAGAAAAAGGGAACTTCTTATGCAAGCTCAAGGTACGAAATAAAAACCTTTGGCAGTGAAACAGAATATAAAAAAGCTAAGGCCAATTTAGGAGAGGTTCTAATTGAACTAAAGGGCGAATTTGTTGCGACAGACCAAGTTGCAGGAGATGGAACTATACTCAAATATACAGGGATTTCAAGTAAAAGCGGAAATAATGTCATGACTGTAAACAACTGTATTGATGTAGAAAACGGAAATCTTACTGTGACTATAAAGAATTACGGAGAAAGCAATCAGGGTATAGATATTGATTTTGATGCAGACCTGTATACAACCGGAGCAAGAACTCCTATATGGAAGGGCATTGTAGCTTTAACGTCTATAATAGACGGAACTGATTATCAGCTTATTGAATATGACAGAAACGGTGAACGTATCAGCGGTCAGATGGCGAATAAACAAACTATTGATTTGGTGTGGCCAAGTGCTGCAAGCTTGGCACAGACCATTGCAGGCATAATTTTTGAATTCCGTTACGGAGAGCTGGGAGTGTTAAAGTATCAAGGAGAAGAAACACTGGTTATAGGTTTTGGAGCTATGCTTGATTTATCCTTTGTAATTCCAAATAATGCTAAAAAATCTCCTGTACAGTTTAGTGCATTTGAAAAAATAGGTCTTACACTTAGCGGAAACTTAAAGTATTCTACGGAACACATGAGAAGTGCATGGGATTATCATAAGGACCAGGTTAAAATGAATAAGGAAGCGGATGCAGGTGAGGGTTCTGTAAAGGTTAAGGATATATTGTTCGGGGGAAGATATATAGGCTTTAATGCAAATCTAAAGGTACAAATTCCCGGGTATACTCCTGCTATGCCTACGGTGAGAGCAGATTTAACGATAAATACCATAGGTGATTGGAAAGTCACAGTAGACGGGAAAGCTAAATTTACAAAGCTTGAAATGGAGGTTTCAATATACATAAACAGCAAGGATGGATATCCTGTTCCCGATAAACTTTATTTCTTTATAAAAGGTTTTACTCCCGGAGTAAATATAGACGGCTTTGGAGTAGTATGGCTTCAAGGAGGCGGAGGTGGAATTGATAAACTTTACGATACTATATTTTCTACCGATTCCATACCTCCTTTAAAGCTTCTTATTTCGGCACAGCTATCGATATTGCAGGCTTTCTCTGCAAAGGCTGACCTTTCGCTTAGCTTAAGAGGCATAGGAATAAAGGTAAGCAACGGTGTAATAGCCAATACCAACATAAAAGTATTAAACCATGCTCAACTTCAGTTTGAATGGTATCCTGAGTTTTATTTCATGGCTGCGGTAAGTATAAACCTGCTTGAAATAATAACAGGAGCTGGATATATCGTAGTAGAAAGTGATGGATTCTTCGAATTTTATGTAAAGGCTGCGGTTAAAATACCCGATGTAGTATTCTTTATAGGTGGTATGCATCTTGGAAGTGTTGAGTTGGGAGCCAGCTCTGAAAGGATATGGGGAGGCATTGACATAATCGGTATTAGAGTTGGAATATGCTACTATTGGGGAGGAGAATTTGATTTTGGATTTGGCGGTACTGCACCTGCTCCTACCTATCCTCAGCTATTAGGCGAAGATGATGTTCCTGTATATACTGATCCTGAGACTGGAAGAACGATGTATTTACACGTAGGAACTAATCTTGAAGCAGCAGATAACACATATCTTGTTGAGAGCTTTGATAAAGCAATTGAGCTGATGGATGCCGGCTCACGCATAGAATCAAAACCGGACAGGAAAGAGCATAAGCTTACACTTGGTACAAAGGAAGATAAAGATGCTATTTTAGCAATGAACTTTAGTGCTGATTCAAAGGCGGCTGCTATTGAAACAGCTAAAAAAATTACTATTAAAGATGAAGGTGGCAATCCATATCCGATAAAAATATATAATCCTGAATTTGAAGTAGATTCAACTGAAAATCAAGGCGCAAATGCAAATATAACATATAATTCAGAAACAAAAATCGCAGGATTTAATATTACATTTACAGATGCATCGCATTACAATAAGATATGGAATATATTAACTCCGGATGCCTCAACAGACTTGCTTATGTACAATGTATTGCCGATGGCAAGCCTTAATAGTTTAAGCCATATAATAAATGTAGATAAAATTACTGCAAGCTGGGATGGATATGAGCTTGACAGCTTTGAAAATATGAGCTTTATGGTCGTTGAAAGTCCTGAAGATACTGAAGGAACTTTAGTTTATAAAATAAGTGACAGCAGTAAAATCGCAAGTAAAGGCGTCGAGTTTGAATTGCCTGAAACATTGCCAAGCGGAACTTACTATTTAAAAGCTACCGCTGTAAAAGATGGGGAATTATGCGAAACAAAAGTAAGCTCATCAGCATTTGCATTTACAAACTCTAAGATACCTAACGTACCTACAGCTGTTGCCGCATCAAAAATCGGAGATTTAAAAATTGCAGCTGATATATCAGCAACAGGAGATTATGACGGATATTTAGTCAATATTTATGAGAAGAAAGACGGCTTATGGGTATTACATCAATCAGGAGGTCTAGAATATGAAAAAGATGCTGAAAACATATCCGTTGGAGGAAGCTACAGCTATACAGATAATGAAACTCATGAGACACATATTTTAGGGCTTGAATCCGGACACACTTATAGGTTAGGAGTTTCAACATATAAAAAATATGGAATAAATCCTGATGACTTAAAAGTGTTGTATTCACCGGAAAAAGAATCAAATGAGATTACTTTGGATGCACCTAATCCTGCTAAGGTAGAGCTTATAGCAAATAATTCAGTATCAGTAAGATATTCTTCCGGAGAAAATGAAGATGTAAACATTGATACCTTTAAAACAAAAGATATAAAATTTAGTTTAAAATCAAATCAAATTGTTTCCGGAACATGGACTTTGGATAAGGGCTATGTTATCGAGTTGAAGGACGGCGATGAGGTTCAAAATAAAAAAGGAATGACAGGCGATATAAAAGAATTACAAAATGCAGAAATAGAGCTTGCAGATGTTGAGGATGGCAACCATATGCTCACATTTATAGGCAAAAATAGCTCAGGAGATTCTGTTATAGTTCAGAAAAGATTTGCTGTGGATACTTTACCGCCTAGATTACTTTTAGAATCACCGGTAAACGGAGGATTTTTTGAAGCAGACGGAAAACTGACAGTCAAAGGGATAACAGATATAGGCACTCAAATTATAATAAATGGAAAAGCATATAATCCAATTGTAAACTCAGATGGGAGCTTTGAAATTGAAGCCGTAGCTGATAATACAGCTATATCCTGTGATGTTGAAATTTCAGCAATTGATAATGCAGGGAATAAAATATCCGAAAAAATGACACTTAGAAATAAAGCAATAGGACAAATTAAAGGCTTAAAAATTTACAACAAAGATAAAACAGATGTCACAAACAAGTCTATAACAGACAATAAAGACTTAACATCTGCTCTTACGGAAAAATTTGCTTTAAAAGCAGAGCTTCAAAATGGAAAAGCACTTTTGCTTGATGATTCTTCACTTGTGTCGTGGGATACTTTGGTTGTATCTGGCACTGCATCTGTAAGTGAAAACGGAGAGCTTACACTTGGAGCCGGTACAAGAGGAATGCTAACAGGCAAGCTTGCAGTTTCTGAAGAAGGAAGTTTAACGGCTGCTGTTTCTTTCGGTTTGCAGAAATATGAAAGCCCTAAAGGAGAGTACACAGGCGGAGACAACAATCCTGATGATAAACCAAGACCTTCGAAGCCGGAAACACCTAAAGAATCAGTATATGACAAATTTACTGATGTTAAAGGTCATTGGGCTGAGAAATACATGAGATTAATGGTAGAAAGAGGATTATTCAACGGTGTAAGTGAAAAAGAATTCGCTCCTAATAAATCTATGACCAGAGGAATGTTTGTAACTGTTATGGGTAGGCTTGAAGATGCTCCTCAAGCTATAAAAACAGATAAATTCGCAGATGTTTCATCAGATATGTACTATGCACCATATGTTGCATGGGCATCTGAAAATGGCATTGTAAACGGGGCAGAGCAAGGAAAGTTTATACCTGATGGAAACATAACAAGAGAGCAATTGGCTGCTATTATTTACAGATATGCTAAATATAAAAACTACGATTTATCGTTAAATGAAGCAAGTAATAGTATAAATATCAATCATTTTGCTGATTATACACAAATTTCTGATTTTGCTTCAGAAGCTATAAACTGGTGTGTAAAAACAGGCATAATTCAGGGCAGCGATGATGGAAATCTATATCCTAAAAAAACTGCAACAAGAGCAGAGGTCTCTGCTATGCTATACAGATTTATAGAAAAGTATCTTGGTTTATAG
PROTEIN sequence
Length: 1752
IATNYGVYSNDKVSNKNTVAVNLASPSAMELTEDKKGYLSKVDGGNPGDFTIQTSVENFKTDTSKAYKNVKIAVYSQTGIVPLNDDGVKQDNASYANPYTKEVNDFKIDEIKSISWKFNASVGEEADYRKIQFKVYNVSSDVDPTGSGQLLEENLLGEAYCYILCPGGDGLLPEIKFTGSSPEIIYNEGNRHLFLSGTNFSMLQNKSEYTVLAKSLSKNGKTYTIPSDNFLIDSNTNTIDVLMTEKMETGSYQMVIDYSDSAKKDIAAPAMMFAVSDDKQYKNDAYGIIAIVQKKGTSYASSRYEIKTFGSETEYKKAKANLGEVLIELKGEFVATDQVAGDGTILKYTGISSKSGNNVMTVNNCIDVENGNLTVTIKNYGESNQGIDIDFDADLYTTGARTPIWKGIVALTSIIDGTDYQLIEYDRNGERISGQMANKQTIDLVWPSAASLAQTIAGIIFEFRYGELGVLKYQGEETLVIGFGAMLDLSFVIPNNAKKSPVQFSAFEKIGLTLSGNLKYSTEHMRSAWDYHKDQVKMNKEADAGEGSVKVKDILFGGRYIGFNANLKVQIPGYTPAMPTVRADLTINTIGDWKVTVDGKAKFTKLEMEVSIYINSKDGYPVPDKLYFFIKGFTPGVNIDGFGVVWLQGGGGGIDKLYDTIFSTDSIPPLKLLISAQLSILQAFSAKADLSLSLRGIGIKVSNGVIANTNIKVLNHAQLQFEWYPEFYFMAAVSINLLEIITGAGYIVVESDGFFEFYVKAAVKIPDVVFFIGGMHLGSVELGASSERIWGGIDIIGIRVGICYYWGGEFDFGFGGTAPAPTYPQLLGEDDVPVYTDPETGRTMYLHVGTNLEAADNTYLVESFDKAIELMDAGSRIESKPDRKEHKLTLGTKEDKDAILAMNFSADSKAAAIETAKKITIKDEGGNPYPIKIYNPEFEVDSTENQGANANITYNSETKIAGFNITFTDASHYNKIWNILTPDASTDLLMYNVLPMASLNSLSHIINVDKITASWDGYELDSFENMSFMVVESPEDTEGTLVYKISDSSKIASKGVEFELPETLPSGTYYLKATAVKDGELCETKVSSSAFAFTNSKIPNVPTAVAASKIGDLKIAADISATGDYDGYLVNIYEKKDGLWVLHQSGGLEYEKDAENISVGGSYSYTDNETHETHILGLESGHTYRLGVSTYKKYGINPDDLKVLYSPEKESNEITLDAPNPAKVELIANNSVSVRYSSGENEDVNIDTFKTKDIKFSLKSNQIVSGTWTLDKGYVIELKDGDEVQNKKGMTGDIKELQNAEIELADVEDGNHMLTFIGKNSSGDSVIVQKRFAVDTLPPRLLLESPVNGGFFEADGKLTVKGITDIGTQIIINGKAYNPIVNSDGSFEIEAVADNTAISCDVEISAIDNAGNKISEKMTLRNKAIGQIKGLKIYNKDKTDVTNKSITDNKDLTSALTEKFALKAELQNGKALLLDDSSLVSWDTLVVSGTASVSENGELTLGAGTRGMLTGKLAVSEEGSLTAAVSFGLQKYESPKGEYTGGDNNPDDKPRPSKPETPKESVYDKFTDVKGHWAEKYMRLMVERGLFNGVSEKEFAPNKSMTRGMFVTVMGRLEDAPQAIKTDKFADVSSDMYYAPYVAWASENGIVNGAEQGKFIPDGNITREQLAAIIYRYAKYKNYDLSLNEASNSININHFADYTQISDFASEAINWCVKTGIIQGSDDGNLYPKKTATRAEVSAMLYRFIEKYLGL*