ggKbase home page

RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_rifcsplowo2_12_scaffold_25379_6

Organism: Bacteroidetes bacterium RIFCSPLOWO2_12_FULL_31_6

near complete RP 44 / 55 MC: 3 BSCG 43 / 51 MC: 5 ASCG 9 / 38 MC: 3
Location: comp(4109..5554)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
membrane protein Tax=RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 481.0
  • Bit_score: 922
  • Evalue 2.80e-265
Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid id=3843132 bin=GWF2_Bacteroidetes_33_38 species=Owenweeksia hongkongensis genus=Owenweeksia taxon_order=Flavobacteriales taxon_class=Flavobacteriia phylum=Bacteroidetes tax=GWF2_Bacteroidetes_33_38 organism_group=Bacteroidetes organism_desc=a699 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 53.4
  • Coverage: 476.0
  • Bit_score: 520
  • Evalue 1.80e-144
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 48.2
  • Coverage: 481.0
  • Bit_score: 455
  • Evalue 1.50e-125

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1446
GTGCAAAGAAAATTCATAACCAATTTAGCTCTTTTATTATTCCTTAATTTTTTAATTAAACCCTTTTGGATATTTGGAATAGATCGAACTGTTCAAAATACAGTATCTGCTGAAGAGTATGGCATCTATTTTACCTTGTTCAATTTTTCGATGCTGTTTAATATCTTGTTAGACTTAGGAATTACCAACTACAACAATAGAAATATTGCTCAACACAAGCAGTTGTTAGCTAAATATTTTTCTGGAATTGTGGTGTTTAAATTTTTGCTGGCTATTGTTTATTTTTTAATAACGTTTGTTGTTGGTTATTTAGTAGGTTACGATTCTAGTAGATTTTACATGTTGTTATTCCTCTCCATCAATCAATTTTTAATTTCATTTGTTCAGTATTTACGTTCCAATATAGCTGGTTTACAACTTTATACATTAGACAGTATGTTGTCGGTATTAGACAAAGCTTTAATGATAGGTTTTTGCTCAGTTATTTTATGGGGAAATATTTTTGAAGTTCAATTTCAATTGATGCATTTTGTTTATGCTCAAACCTTGGCTTATTCGATTACTTTATTGGTAGTGTTTACCATAGTTTTAGTAAAATCGAAACAATTTAAGTTTAAGTTAAATAAACCTTTTTCAATATTCATTTTAAAACAAACCTATCCTTATGCATTGTTAATATTAACTATGACTTTTTATTACCGATTAGATGCAATAATGCTAGATGTACTATTAGAAAATGGTGAAAAACAAGTAGCAATTTACGCACAAGCCTACAGATTGATGGATGCCTCCAATCAAATAGGAGTTTTATTTTCAATTTTGCTTTTGCCCATGTTTGCCAACATGATAAAAAACAAGAAAAAATTAGATGATTTAGTTCAACTTTCTTTCAGTTTACTTTTTGTTCCTGCTGTAATTCTTGCAGTTATGTGTTATTTTTTCTCCAATCAAATAATGAATATTTTATACCATTTTAATACTGAAAATTCTGCTCTAATTTTAAGTTTATTAATGGTTTGTTTTGTTGCAATTTGTTCTTCTTATATTTTTGGAACACTACTAACTGCAAATGGAAATTTAAGGGAATTAAATAAATTAGCTATTGGAGGAGTGTTACTTAATTTTACTTTAAATTTAGTTTTAATTCCTAACTATCAAGCTGTTGGTTCAGCTATTGCTAGTTTAATAACCCAATTCATCATTGTAATTCTACAAGTAATAATTGCTAAAAATGTATTTAAATTTTCGATTAATTATAAACTTATAAGTGTTTTAATAGGCTATACAATTTTTGTTTTTTTTGAAATGAAACTGATTAATTTATACATTTCAGGGTTTTTACTTCAACTAACTTTATCAGTGTTAATTGCTGTTATTTTTGGAATAATGGTGCGATTAATTAATATAAAAAAAATGTATCAAATTGTTATTGATAAGGAGCTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 482
VQRKFITNLALLLFLNFLIKPFWIFGIDRTVQNTVSAEEYGIYFTLFNFSMLFNILLDLGITNYNNRNIAQHKQLLAKYFSGIVVFKFLLAIVYFLITFVVGYLVGYDSSRFYMLLFLSINQFLISFVQYLRSNIAGLQLYTLDSMLSVLDKALMIGFCSVILWGNIFEVQFQLMHFVYAQTLAYSITLLVVFTIVLVKSKQFKFKLNKPFSIFILKQTYPYALLILTMTFYYRLDAIMLDVLLENGEKQVAIYAQAYRLMDASNQIGVLFSILLLPMFANMIKNKKKLDDLVQLSFSLLFVPAVILAVMCYFFSNQIMNILYHFNTENSALILSLLMVCFVAICSSYIFGTLLTANGNLRELNKLAIGGVLLNFTLNLVLIPNYQAVGSAIASLITQFIIVILQVIIAKNVFKFSINYKLISVLIGYTIFVFFEMKLINLYISGFLLQLTLSVLIAVIFGIMVRLINIKKMYQIVIDKEL*