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RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_rifcsplowo2_12_scaffold_33897_1

Organism: Bacteroidetes bacterium RIFCSPLOWO2_12_FULL_31_6

near complete RP 44 / 55 MC: 3 BSCG 43 / 51 MC: 5 ASCG 9 / 38 MC: 3
Location: 213..3374

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
periplasmic ligand-binding sensor domain protein Tax=RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2148
  • Evalue 0.0
Ggdef domain protein, putative id=3845915 bin=GWF2_Bacteroidetes_38_335 species=Flexibacter litoralis genus=Flexibacter taxon_order=Cytophagales taxon_class=Cytophagia phylum=Bacteroidetes tax=GWF2_Bacteroidetes_38_335 organism_group=Bacteroidetes organism_desc=a11 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 32.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 537
  • Evalue 3.00e-149
periplasmic ligand-binding sensor domain protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 26.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 379
  • Evalue 3.00e-102

Lists

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Notes

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Taxonomy

RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3162
ATGAAATCGGGATTGCCACACACGCAGGTATTGTGTATTTACCAAGATGCGACAGGTTATATTTGGGCAGGAACTATGGGTGGTGGAGTTTCAAAATTTAATGGACTTACTTTTAAAAACTACGATTTAGAACAAGGGTTAACCAACAGCATTGTTCGAGCAATTACACAAGATTCGGCAGGAAGAATGTGGTTTGGAACCATGGGTGGAGGATTGTTTTATTTGCAAAACGATAGCATTTATGCTTTCCAAGATTCAATAATCGACAACACCGTTTATAGTTTGTTTACCGATGCTAAAGGTCAGGTTTGGGTTGGAAGTGCTATTGGAATAACACTTATCGATAAGATGAAAGCTAAACCTTTTCCTATTAAAATTCCTGCTTATGCTGTTACGCACATTATGGGCGATGCCAAAAATAATGTTTGGTTTAATTACAACGATACGTATGGCATTTATAACTACTCGGAGCAAAGGTTAACAAAAATTGATACTACAGTAGGTTTTACCAAAAATACGGTGCTGTTTTGTTATGAGGATATTGATGGTATTATTTGGGCAGGAACTGCCGATGGGTTGTATTCTTTTTCTTCCGAAAGTGAGCATCCTAACATTAAATTTCATGACAAATTAGAGGGAATTCCTGAAAGTTTTACATTTGAAATTACCGAAGATCGTTTTGGTAATTTAATTATCGGAACTGCAAAAGATGGTTTTATTCGTTGGAATAAAAAAACAGGCAAAAAAGTTTTTATTAATCACAACAATGGAACGCTTGCAGACAATATTTTTAGAGTACTAAAGGACAGAGAAGGCAATGTTTGGTTGAGTCCGTATGGCGATGGGTTGAGCAAATTTAATGATGCTTTATTTACACGTTACAGCTCAAAAGAAGGAATTAAAAATCGAATTGTTTCGGGCATTGTTTCGCAAGGCGATAGCACTTGGATAGCAACTTCTAATGGTATTTTTTTAGGAATAGATGGGAAATACAATCAACAATTTGCGACACAAACTTCAACTTCTATTACTGCCATTTATAAAGACATTTTTAACCGAATTTGGTTTACAGGAGATCATCAAATCGGTTATTTTAAAAATGGAAAAATTGTGGATTTAGACCCCACTCACAGTAAAATAAAAGCTGGGAAAGGCATCACAGGAGATTCTAAAGGAAACATTTACATCAACACTTGGGGAGATGGTATTTGGAAATATACCGACCAACTGAATCCTTTTCCAACACCCGACAGCATTATAACTTCTCATACTTACAGTGTTACCATTGATAGCAAAGACAACTTATGGATAAGTTCTTTTGGCTATGGTGCAATAAAAATGGAGGGTGAAAAAATAAAAACATTCGCTCAGCCAGAAGGATTATTATCGGATAAGATTTTTACTGTTGTTGAAGGCAAAAATGAAACAATGTACCTCGGAACAAATGGAGGTGGATTGGCAATTCTGCAACATGATAAATTAGTCAAAAATATCACCAAAGCTGATGGACTACTTCATAATTCCATTGTTTCGGTTTGTATTGACGGCAACAACATTTGGTGTGGTTCGGTAAAAGGATTGGATAAAATTATTAGGCAATCGAATGGAGAATTTACTATTCAAAATTATACCAAATGGGAAGGTTTTGATGCAGAATGTATGCTTTCGTCCATTGCAAAATCAAAAACAGGAGAACTGTTAATTGGTACTGATGAGGGATTAATTGTTTATCATCCAGAAGAAGACCAACACTTAAAAGTGTTGCCTGGAATAATTATTACAGCAGTTGAGCTAGATTACGGTGAAACAGACTACATGAAATATTGTACCAGTAGTAATGAAATTAATGGATTGCCCATCGATTTGGTTCTTCCATCCACTGTAAAAAGAATCTCCTTTAAATTTGATGGCGTTTGTATGAATTATGCAGATGACCTCAGCTATTCATATCGATTAAAAGGGTTAGACGATAAATTTAGCCCTCCTATTTTTTCTTCCGAAATTACTTTTCACGACCTAGCTGCTGGTGTTTATACTTTTGAAGTTGTAGCAACATCACATGGAGTTGCTAGTACAACCGCCACTTACACTTTTGAAGTTTTAAAGCCTTTTTGGAAAACTTGGTGGTTTATTGGTCTTGTTTTAATTCTTATTGTTCTTACCATTTTTGCATTTCTTAGGTGGCGAACAGCAAGTCTGCGTAAAGCAAAAAATCTATTGGAGCGAACAGTTAGAAAAAGAACTTCGGAGTTAAGAACACAAAAAGAAATTGTAGAAGAAAAGAACAAAGAAATATTGGATTCTATTACTTATGCGAAACGGATTCAATCGGCAATATTACCTCCCAACAAAGTGGTAAAAGAATATTTGAAAGAATCTTTTATCATCTACAAACCCAAAGACATTGTAGCGGGAGATTTTTATTGGATGGAACACAAAGATGGTAAAGTACTTTTTGCAGTTGCCGATTGTACAGGGCATGGAGTTCCTGGAGCAATGGTGAGCGTAGTTTGTAACAATGCATTAAACCGTTCGGTGAGAGAGCACGGATTAACAGACCCTGGTAAAATTTTGGATAAGTCCAGAGAAATAGTTGTTCAGGAATTTGAAAAATCGGATCAAGAAGTGAAAGACGGAATGGATATTGCACTTTGTAGTTTGACGTTCAATGTTAAAGGTTTGCCCGCCCGTTCCGGTACGGACGGGAAGTTCAAAAATCCAAAAACAGTTGCTTTACTTCAATACGCTGGAGCACAAAATCCACTATGGATTATAAGGGATTGTCATACTGAGCCTGTCGAAGTATTAGACAATCCTAACACCTCAATCTTTCGACAAGCTAAAAATGACACGCTTTGTATTCTCGAAACTAAAGGAAACAAGCAACCTATTGGCAAATTTGAAAATGTAGTCCCATTTACCACCCATACTTTTGAGTTAAAAGAAAACGATATTATTTACATTTTCTCTGATGGATATGTTGATCAGTTTGGAGGAGAAAAAGGTAAAAAGTTTAAAACAAAATCTTTTAGAGAACTTTTGCTGGAAATAAGTTCCAAACCTATGGAAGAGCAAAAAGTATTAATTGAAAAAGCTTTTGATGCTTGGAAAGGAAGCAACGACCAAGTGGACGATGTTTGTGTTATAGGAGTTAGAATATAA
PROTEIN sequence
Length: 1054
MKSGLPHTQVLCIYQDATGYIWAGTMGGGVSKFNGLTFKNYDLEQGLTNSIVRAITQDSAGRMWFGTMGGGLFYLQNDSIYAFQDSIIDNTVYSLFTDAKGQVWVGSAIGITLIDKMKAKPFPIKIPAYAVTHIMGDAKNNVWFNYNDTYGIYNYSEQRLTKIDTTVGFTKNTVLFCYEDIDGIIWAGTADGLYSFSSESEHPNIKFHDKLEGIPESFTFEITEDRFGNLIIGTAKDGFIRWNKKTGKKVFINHNNGTLADNIFRVLKDREGNVWLSPYGDGLSKFNDALFTRYSSKEGIKNRIVSGIVSQGDSTWIATSNGIFLGIDGKYNQQFATQTSTSITAIYKDIFNRIWFTGDHQIGYFKNGKIVDLDPTHSKIKAGKGITGDSKGNIYINTWGDGIWKYTDQLNPFPTPDSIITSHTYSVTIDSKDNLWISSFGYGAIKMEGEKIKTFAQPEGLLSDKIFTVVEGKNETMYLGTNGGGLAILQHDKLVKNITKADGLLHNSIVSVCIDGNNIWCGSVKGLDKIIRQSNGEFTIQNYTKWEGFDAECMLSSIAKSKTGELLIGTDEGLIVYHPEEDQHLKVLPGIIITAVELDYGETDYMKYCTSSNEINGLPIDLVLPSTVKRISFKFDGVCMNYADDLSYSYRLKGLDDKFSPPIFSSEITFHDLAAGVYTFEVVATSHGVASTTATYTFEVLKPFWKTWWFIGLVLILIVLTIFAFLRWRTASLRKAKNLLERTVRKRTSELRTQKEIVEEKNKEILDSITYAKRIQSAILPPNKVVKEYLKESFIIYKPKDIVAGDFYWMEHKDGKVLFAVADCTGHGVPGAMVSVVCNNALNRSVREHGLTDPGKILDKSREIVVQEFEKSDQEVKDGMDIALCSLTFNVKGLPARSGTDGKFKNPKTVALLQYAGAQNPLWIIRDCHTEPVEVLDNPNTSIFRQAKNDTLCILETKGNKQPIGKFENVVPFTTHTFELKENDIIYIFSDGYVDQFGGEKGKKFKTKSFRELLLEISSKPMEEQKVLIEKAFDAWKGSNDQVDDVCVIGVRI*