ggKbase home page

ar4r2_scaffold_7342_1

Organism: ALUMROCK_MS4_Gammaproteobacteria_45_49

near complete RP 41 / 55 MC: 3 BSCG 46 / 51 MC: 2 ASCG 11 / 38 MC: 1
Location: 1..3624

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Uncharacterized protein n=1 Tax=Thiothrix nivea DSM 5205 RepID=I3BQT2_9GAMM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 49.8
  • Coverage: 693.0
  • Bit_score: 628
  • Evalue 1.10e-176
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:EIJ33725.1}; Flags: Precursor;; TaxID=870187 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Thiotrichales; Thiotrichaceae; Thiothrix.;" source="Thiot similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 49.8
  • Coverage: 693.0
  • Bit_score: 628
  • Evalue 1.60e-176
Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 33.9
  • Coverage: 725.0
  • Bit_score: 368
  • Evalue 6.10e-99

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Thiothrix nivea → Thiothrix → Thiotrichales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3624
TGGCTGGCTCCATTGTTGTTTGCTTCCACCTTGATGGCGGATGAAACGGATATTTATTACGCGCAAAATACTTCCGCAAATCCTAACATTTTGTTTGTGCTGGATAATTCTGGGAGTATGAACTGTACTGATCCGAACAATGCTAATGCCGTTATTCCTTCGTGTTTATCGGGTGGGAAAACACGGATGGAAATATTGAAAGATGTGTTTGGTCAGGTTATGGATAGTGCGCCATCAAATTTGAATATTGGTTTGATGCGTTATAGTGGGCATAAAGATTTTCGAGCTAATGGTATGAGTTTTCCAGTTAAACCGATTGAATTGGATGAGAACAGTAATGGCAGTGCGCATGATATTATTACTGCCCGTATTTCACCGGGGCTGGATAATTTACCTAACCCGACAGGTGCAAAACAACCGGTACGTGAATTTTTGAAAGATGTAGTTAATGACTGGCAGGCAGAAGGATATACCCCGATTGTGGATGCGTTGTATGAAGCGGCACTGTATTACCAAGGAAAAACCGTAGTGGCGGGTAATCGTATTCCTTCTGAAATACAAGCGGCTCATCCAGCGACGTATACCGGTACAGCAAATTGGGATTATGGAGCAGGTTGGTGTAGTGAGCCTTGGACATGTTTAAAAGAATACTGTTACCCTGAATCTTATGTTGTGAGTAACTGTCGTACTGAATCGACACCCATCTGCGCAGAATATGGCACAGATAATACGGGTTGTTGTGCGTATACTGAAACCTACGATGAAGCAGGCAATTTTGCGGGTGCAGTATGTACTGGGGGGAATACTTGCCCTCAACAGGTTTGCACAAGATACGAAAATCAAGATAGGGAAGTCTGTGATGCTAAATCGTGTGATGGAGCACCCGTAGGTGATGCTAAATACGAGTCACCCATTAAGCAATCCTGCCAATCTAACTATATTGTATTGATGTCCGATGGTAAGCCAGAATACCCTGCGTGGCGAGCAAATCCATTGAATGCAGATAATATTGCGACGTTGACTTCTACAAGTTGTGCTAACAGTACGCCTAACGGTTATGCACACGGCGCATGTGGCCCTGAATTAACGAATTATTTGTTAAATGAAGATCAAGCTCCTACTGTGGATGGCGATCAATTTATTCAAACCTTCACTATTGGTTTTGGCTTAGAAGATGTCAATGCGACTAATTATTTAAAGGTATTGGCAAGTGTGGATGGTGGTTCATTGGCGGCAAATAATGCGGATAGTTTAAAACTAGCATTTGAAAATGTGATTAAGCGCGTGCAGGATGAAAACTCGCCTAAATTACAATTATCCGGTACGCCAACCTTTCAAAGTACGGGTGATGGATTGCAACCTGCATTGCCAGCCGCACCGGCATTGGCAGCGTTAACCGATTATGAGCAGCAGGTAATGGCTTCGTTGTTTAATCCAATGAGCTATATGCGCACTTTGGCGGCAGGTGGTTTTTTTGAAGCTTCTGATACATCGACTCTCTTAGATGCTTTTAATAGTATTATTAATAAAGTGACCGCTTCGGCTTCTTCATTTAGTTCTCCCAGTTATCAAGCAGATCAGAATTCATTATTAAGTCATAATGAATTCGTTTATATTCCTGTTTTTGACCGTAATGTTATGCCTTTGTGGCCAGGTAATCTTAAGAAGTTTAAACGTGATAGTACGGGTAAATTAATTGATAAGAATGGCAATGAAGCTGTCGATGCGCAAGGTGTATTTAAAGATAATGCTCAGGATTTGTGGAGTAGCACACAAGACGGTAAAGATGTCTCTAAAGGTGGGGCTGCAAATAAGTTGCCATTGCCAGATAGTCGCAAATTACTGACACATACTTCTGATGCTACACTCAATGCACCATTGCTAGATTTGAATAAAACCAATGTGACACCTGCTATGTTGGGGTTGGCAGCAACTGATAATGCGATGCGAGATAAATTGGTCGATTTTATCCGTGGTAAAAAAGCTGATGGCACGCCTCGTTATCATATGGGGGATATGCTTAATGGTAAACCACAGATAATAACAGCAGATGATAATAAACCCTATATTTTTGTTGGTAGTAATGAAGGTTACTTACATGCGATTGATGCAGATACAGGTATCGAGAAGTGGGCATTTATGCCGAAATCATTATTAAAGAATACAGATATTTTTTATCAGAATAGTCAGCCTAAAAAACATATTTCTGGCGTTGATGGCGCATTAAATATATGGCGTTTTCAATATGATGGCAGTGATGCTAACACCACAATAGATGCTACAGACCCGTATAAAACTTATTTGTATTTCGGTTTACGTCAAGGTGGAAATGAATATTACATGCTTGATATTAGTGCTATCAGTAATCCAAAAGTAGTTTGGCATATTACTGATAGTACCACAGGTTTTGCGGAGTTAGGTCAGGCATGGTCAAAACCGGCATTGGCTAAAATGCGCCTTGCTAAACCAATACTTGAAAATACAAATCATGATAGTGAGTTGGTTGATGTATTGATCTTCGGTGGTGGTTATGATCCAATTAAAAACAATGAAAATACCACAACACCAGCTTATACCCGTGCCGCAGATAGTAAGGGGCGAAATGTTTACATTGTGCGTGCGGATACAGGCGAGTTAATTTGGTCATTACGTGATAATGTCAGTGGCGCGGCTGCAAAATTAACGGATAGCATTCCGGGTGATATTCGTGTTTTGGATATGGACCGTAACGGGGCATTAGAACGCTTGTATTTCTCAGATACCGGCGGGCGTGTGTGGCGTGTGGATATGGATGTGGACGTAACCGACGGTTTGCCAGCCGGTACAGATACGTTTTATGACTATAGTAAGGCACGTTTGAGTGAGTTTGCTAATGTAGCCGGAAGTGGACTAAATAAACGGATGTTTTTCTATGAGCCAGATGTGGCCTTAATGCAGCATCAAGGCAAGACTATTTTAACATTGGCAATTGGGAGTGGTTATCGCACACGCCCATTGAGTGCAAGTGATGATCGGTTTTATGTATTTGTTGATCGCAATCCGTTTAATGAACCGGATAGTGGTATTTTCCCCATTCAGGAAGATGCGAAATTGATTAGTTTAACAAAACCTGATGGTACAGATAACACGACTGCTATTGGTGCAAGCAAAAGTTTATTGACCGAAACTACATTAAATGGTTGGTATTATGATCTGCCTAATGTTGGTGAGAAAGCATTAGCTCCCGCAGTAACTTTTATGAATAAAGTGATCTTTACAACCTTTGCGTCTGCACCTGCAAGCGAAGAAGGTATAGATCCTTGCTCCGCGCCACCGAATAGCGCAAGAGCTTATGTGCTGGACTTATTTAATGGTGATGCTGTGGCAGACCTTGATCGTGAAGGTGGTGATACAGAGCGTTCTGTGATCGCTGGTATTAATGAAATATTAGATGCCGCACAAATTGTCTTTAATAAACCCACAGCAGCAGATGGCACGACCTGCAAAGCTGATGATTGTAGTCAGCAAGTGGTTGAAGTCCGTATTGGTAAAATGAATTTACCTTTGGTTGATAATAACAATATTTCGACAGGTACTGATATAAGTAATCTTTGGCAACGAATGTTTTGGCGAGATGATCCTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1208
WLAPLLFASTLMADETDIYYAQNTSANPNILFVLDNSGSMNCTDPNNANAVIPSCLSGGKTRMEILKDVFGQVMDSAPSNLNIGLMRYSGHKDFRANGMSFPVKPIELDENSNGSAHDIITARISPGLDNLPNPTGAKQPVREFLKDVVNDWQAEGYTPIVDALYEAALYYQGKTVVAGNRIPSEIQAAHPATYTGTANWDYGAGWCSEPWTCLKEYCYPESYVVSNCRTESTPICAEYGTDNTGCCAYTETYDEAGNFAGAVCTGGNTCPQQVCTRYENQDREVCDAKSCDGAPVGDAKYESPIKQSCQSNYIVLMSDGKPEYPAWRANPLNADNIATLTSTSCANSTPNGYAHGACGPELTNYLLNEDQAPTVDGDQFIQTFTIGFGLEDVNATNYLKVLASVDGGSLAANNADSLKLAFENVIKRVQDENSPKLQLSGTPTFQSTGDGLQPALPAAPALAALTDYEQQVMASLFNPMSYMRTLAAGGFFEASDTSTLLDAFNSIINKVTASASSFSSPSYQADQNSLLSHNEFVYIPVFDRNVMPLWPGNLKKFKRDSTGKLIDKNGNEAVDAQGVFKDNAQDLWSSTQDGKDVSKGGAANKLPLPDSRKLLTHTSDATLNAPLLDLNKTNVTPAMLGLAATDNAMRDKLVDFIRGKKADGTPRYHMGDMLNGKPQIITADDNKPYIFVGSNEGYLHAIDADTGIEKWAFMPKSLLKNTDIFYQNSQPKKHISGVDGALNIWRFQYDGSDANTTIDATDPYKTYLYFGLRQGGNEYYMLDISAISNPKVVWHITDSTTGFAELGQAWSKPALAKMRLAKPILENTNHDSELVDVLIFGGGYDPIKNNENTTTPAYTRAADSKGRNVYIVRADTGELIWSLRDNVSGAAAKLTDSIPGDIRVLDMDRNGALERLYFSDTGGRVWRVDMDVDVTDGLPAGTDTFYDYSKARLSEFANVAGSGLNKRMFFYEPDVALMQHQGKTILTLAIGSGYRTRPLSASDDRFYVFVDRNPFNEPDSGIFPIQEDAKLISLTKPDGTDNTTAIGASKSLLTETTLNGWYYDLPNVGEKALAPAVTFMNKVIFTTFASAPASEEGIDPCSAPPNSARAYVLDLFNGDAVADLDREGGDTERSVIAGINEILDAAQIVFNKPTAADGTTCKADDCSQQVVEVRIGKMNLPLVDNNNISTGTDISNLWQRMFWRDDP*