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ar4r2_scaffold_1446_4

Organism: ALUMROCK_MS4_BD1-5_23_16

near complete RP 48 / 55 MC: 2 BSCG 47 / 51 ASCG 6 / 38
Location: comp(1785..4562)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
transmembrane_regions 12..34 id=49665 bin=ACD3 species=ACD3 genus=ACD3 taxon_order=ACD3 taxon_class=ACD3 phylum=BD1-5 tax=ACD3 organism_group=BD1-5 (Gracilibacteria) organism_desc=BD1-5 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 34.7
  • Coverage: 976.0
  • Bit_score: 550
  • Evalue 3.00e-153
  • rbh
transmembrane_regions 9..31 Tax=ACD2 similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 33.9
  • Coverage: 951.0
  • Bit_score: 424
  • Evalue 4.50e-115

Lists

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Notes

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Taxonomy

ACD2 → Gracilibacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2778
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PROTEIN sequence
Length: 926
MKKFHLHISILFISSLFLIGTAYSAVAPIQNMS*EQKCYYKIS*TRYNATSYTTGASWLEKPCNTSLDF*TTGLNLEDGTYTITLKSEDRAVT*DVKSYTSETATTYSNKY*VTTW*PYKIDTRTPTCVLKSITFKS*YSENQYYNA*NFYYK*N**A*QFELEIESDDGNN*AWTNVS*LSKIQFPTIL*ATPTTVSYSPST*AKVTIKVIYNWS*NNTDV*DMLNNPSRHFCYDEA*NSSMLTTTASTYLKIEDGNHTIN*ITSLVLTPDNAVPTVA*VAYNAMTNGIKYKT*NT*L*VSSSIYS*NTSTIKFFAALSTRQIELPSFQDNGS*LKTFRVKLERSNNKTLYDLYTRDLSTKDTKVTTLSIPNLVHDFRDVDSDINVT*YRSYDWEIETLNL*GTKILSDSICDMV*NCVSTPTPDFKVVSNEPAIASNTDLLT*TL*TKHNLND*IYSGRVSNLQSPYETYINFEDTY*NAIVPVA*VKELKLNSTFDNTL*CDQYISPND*NCIDFTFRNN*SPLVGSSNPAVSEKKVFNYTLNNYSQFVS*SLKIELASAMPTKDEYTTTT*DNLYGSLNPRLQLTSLTLKTDDLT*YN*I*ENLAALQIANSATNRPFYKWNPLINFNNIQDIYPLVE*QEKPVLIANLVGDSARLDSYKLETKI*TNNLFLRFRNISLQN*NVTTGENTYDILKNP*FTTSNGY*NINYSDSDTYKFQPKTI**ISSTNTKIALYTILNYKV*TKTVKIPSLQS*FNDYGIHEDIDFTNPTEYSSLSNVTLAEIDIR*ISQSRNTA*TAA*V*SVDTSNKFVDFSSIKLYDIKTQINKNVEALL**YNKND*IESG*FTVNNLSTFPTN**INTHN*QVLYFKDTDVTIDCS*TCNVNGKKTIIVEN*NIFIKSDMRYNNSSSVL*FILI*