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ar4r2_scaffold_5144_2

Organism: ALUMROCK_MS4_CPR_32_13

near complete RP 43 / 55 MC: 4 BSCG 44 / 51 MC: 3 ASCG 7 / 38
Location: 1025..4969

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Value Algorithm Source
DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; K03046 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6] Tax=RIFCSPHIGHO2_01_FULL_SM2F11_43_23_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 47.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1212
  • Evalue 0.0
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' n=1 Tax=uncultured bacterium RepID=K2AI73_9BACT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 47.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1158
  • Evalue 0.0
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 43.3
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1054
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

R_SM2F11_43_23 → SM2F11 → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3945
ATGTCATACGTTGCTATTCCATCAAATTTAAAAAATGTTGATTCTATCAAATTAGAATTAATGTCTCCAGAAGAAGTGTTAAACATAAGTTATGGAGAAGTTTTAACCGCTGAAACTATTAATTACCGTACAGGAACTCCACAAATGAATGGTTTGTTTTGTCAGGCAATTTTTGGTCCTATTAAATCCTGGGAGTGTGCTTGTGGCAAATACAAAAGATACAGATATGCTGGTGTGATTTGTGATAAATGTGGTGTTGAAGTTACATCTTCATCTGTAAGAAGAGAAAGAATGGGTCATATATCTCTTGCTGCTCCGGCAGTGCATCCATGGTTTCTAAGAGTTATACCTTCTAGGATCGCTACTATTTTAGATATGAAAACTCTTGATGTAAGTAAAATCACTTATTTTTCAGCCCATGTAATTACTAAAGTTGATGAATCTTTGCAACAAGAGTATTTAGATAAAATTAATCGTGAAGCCGAGTCTAGAGTCAAATCTACAAAATCCAATTTTGATAAAAGATTTGAAGAAGTGGCTAAACAATTTCAAATAGATAAGTCTCAATCTGGTGCAGATGTTGACTTTTTGAGAGATGAGTATGAAACAGAAAAAGAATTGTTAAAAATACAAGAAGCTGAGACTATAGCTAAGATTGAAACTATAACCGAGGTGGCTAAGAAGGAGCTTTCGTCTTTAAAATACAAAGATGTTATTAGCGAATTCCAATATCAGGAACTAGCGAAAAAGTTTGGCCCTGTGTTTAAGGCTTCTATTGGTGCAGATGCTATTAACGAGTTATTATGTCAAATTGATTTAGTGGAAGAAAAATCAACACTAGAAGAACAATTAAAAAATTCTAAAGGTGAAGCAAAGAAAAAGTTACTAAAAAGATACAAACTTATAAATTCTTTTATTAAAACAGAAGCTAGGCCAGAGTGGATGGTAATGAAAAATGTTTTAGTTCTGCCTCCTGAACTTAGACCAATGTTACAATTAGATGGTGGTAGATTTGCAGCCTCAGATTTGAACGAATTGTATAGAAGGCTTATAAATAGAAACAATCGTTTACGAAAGCTTATTCAAATAGGCGCGCCAGAAGTAATTCTAAGAAATGAAAAAAGAATGTTGCAAGAAGCTGTGGAGGCTTTGATAGATAACTCTAGCCGTAATGGTAAACAGGTTATGGCCTCTACTGGAGTGAGGAGACCTTTAAAGTCTTTAACAGATATTTTAAAAGGTAAACAAGGTAGATTTAGACAAAATTTATTAGGTAAACGTGTAGATTATTCTGGTCGTTCTGTAATTATCATCGGTCCTAACTTAAAGTTAGAAGAAGTTGGCTTACCAAAAAGCATGGCTGTAGAGCTTTTTACACCTTTTTTGATTGGAGCTATTATAAAAAAATCCGAAGAAGGTAATATAGACGAGGAAAAACAAGCTTTTAACGTACATTCAGCTAGAAGGCTTATTGAAGATAAAGACCCTGTAATATTCGATATATTAGATGAAATTATTCAAGATAAATATGTTCTTTTAAATCGTGCTCCTACCTTACATAGACTGTCATTCTTGGCCTTTAGACCAGTTCTAACCGAGGGTAAAGCGATTCAATTACATCCTTTGGTGTGCCGTGCTTTTAATGCTGATTTTGATGGAGATCAAATGGCTGTTCATTTACCAATAACTGTGAAAGGTCAAGAAGAAGCGAGAGATTTAATGACAGCTACTAAAAATTTATTAAAACCTGCTTCAGGTGAACTTATTATGGGTGGTCACCAAGATATCGTTTTAGGATCTTATTATTTAACTGTTATGACGGCAGAATCTGAACATCCAAAATATTTTGCGGACGAGTCAGAAGCAATGGTAGCTTTAGATTCTGGAAATATTACTTTAGGTGAGAAAATTATAACTAAACACAAAGATGGGCAAGGTGGATTGGTAACAGGTGAAACTACTGTTGGTAGATTAATTTTTAACAATTCATTTCCTAAAAAGCATAAATATTACAATGAGGAAATTAACAAAAATGCTTTTGAATCAATGCTAAACGAAGCTTTCCATGTATTTTCTAACGAAAAAATGGGTCAGATTTTGGATAATATTAAAAATACAGCTTTTAAATATGTAACTAAGTCTGGAATTACTTTGTCTACTTTCGATTTAATTAGTCCAAAAGGAAAAGAGGATATACTTGTAACTGCTAGAGGTACTATTTCCGAGATTCAGGAATTATCAAATTATGGTTTAATGACTGACAATGAAAGATATACACAGAGTGTGACTGTATGGGCTAAAGCAGGTGACGATATTGTTGAATTAGTTAAACAAGATGTGGATAAATTATCTAATATTGGCTTAATGATTAAATCTGGTTCTAGAGGTAATATATCTCAGTTGAATCAGATGGCTGGTATAAAAGGTTTATCAGTTGACTCTACTGGTAGAGTTATGGAATTACCAGCTCAACATGGATACTTAGAAGGTTTAACAGGTTTAGAATACTTCGTGTCCATGAAAGGTGGTCGTAAAGCTTTGTCTGATATAGCTTTAAAAACTGCAGATGCTGGTTACTTAACTCGTCGTTTAGTTGATGTTGCTCAAAATGTGATAGTTATGGAAGAGGATTGTGGAACTGTTAGAGGCGCTGTTATAACTAAAGTAGAATCCGCTAGAATGAATCAAACTGTTCTAGATAGAGCATATGGAAGATATACTATGGAAGATGTTAAAGATGCTTCTGGTAAAGTAGTTTTACCTTCTGGAAGTCTTTTAGATTACAATAATGCTGCCAAAATCAAAGATATAGATTTGGATTCTTTAATGGTTAGATCTGCAACCAAATGTTCTTTACCTCGTGGTGTGTGTCAAAAATGTTATGGTGCTGATTTTTCAACTCACAAAGAAGTTAAAATTGGTACGGCAGTTGGCGTTATAGCGGCTCAAAGTTTAGGAGAGCCTAGTACTCAGCTAACCATGAGATCTAAACACACGGGTGGTGTATTAACTAAAACAGATATCACCGCAGGTCTTCCTAGAGTAGAAGAAATATTTGAAGCTAGAACACCTAAGGTCATAGCTCCAATGTCTGATTTTGATGGTATTATAGAGAAAATAGATGGTGATTTAGATAGAGGTTACACGATCACATTAGCAACTCAAAAAGCCGAGTTAACACTACCAATGTTTATGGGTGATAAACTATTAGTTGATGAAGGTGTTAATGTTAAAATTGGCCAGTCTATTATGGTTGATCCTAACGGAGAGGCGAGACGTGCCACTTTCTCTGGTTTAATAGAAAAAACAGGCGATACTCTGATTATTAGACAAGATAATCCACAAGTTAAAGAGTATTATGTTACACCTAATATACCCCTTAAAGTAAAAGTTGGGGATAAAGTAAGAGCCGCCACACCTCTATCAGAAGGTCCTTTGGACTTACAAGAGCTGTTGGAAAAAACAGATGTTGATACTTTACAAACATATATAATCGAACAACTTGAAGATGTATACACATCTAATGGTTTAATAGTTAATGAAAAACATATTGAGGTTGTTATTAGAAGAATGACCAACAAGGTTGAAATATTATCATCTGGTAATTCTGAGTTTACAGAGGGTGATATCGTAAGTTTGTCTGTAGTTTTAGCTAAGAATGTTGAGTTAACAAAGGCTAATAAAAATATCATAGTTTACAAGAGAACGGTCACAGGTATTTCCAAGGCTTCTTTAGCCACTGAGAGCTTCTTATCAGCAGCTTCTTTCCAAGAGACATCTAGAGTATTGGTTGATGCTGTTATAACAGGCAGAGTTGATTCTTTAACTGGTCTAAAGGAAAATGTTATCTTAGGTCAATTAATTCCAGCTGGTACAGGTTTTCAAGCTGAAAAGAGTGAGGCTGAAATTCAAGAAGAAATAGAAGAAGAAATTGCTGTTTTATAG
PROTEIN sequence
Length: 1315
MSYVAIPSNLKNVDSIKLELMSPEEVLNISYGEVLTAETINYRTGTPQMNGLFCQAIFGPIKSWECACGKYKRYRYAGVICDKCGVEVTSSSVRRERMGHISLAAPAVHPWFLRVIPSRIATILDMKTLDVSKITYFSAHVITKVDESLQQEYLDKINREAESRVKSTKSNFDKRFEEVAKQFQIDKSQSGADVDFLRDEYETEKELLKIQEAETIAKIETITEVAKKELSSLKYKDVISEFQYQELAKKFGPVFKASIGADAINELLCQIDLVEEKSTLEEQLKNSKGEAKKKLLKRYKLINSFIKTEARPEWMVMKNVLVLPPELRPMLQLDGGRFAASDLNELYRRLINRNNRLRKLIQIGAPEVILRNEKRMLQEAVEALIDNSSRNGKQVMASTGVRRPLKSLTDILKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIIIGPNLKLEEVGLPKSMAVELFTPFLIGAIIKKSEEGNIDEEKQAFNVHSARRLIEDKDPVIFDILDEIIQDKYVLLNRAPTLHRLSFLAFRPVLTEGKAIQLHPLVCRAFNADFDGDQMAVHLPITVKGQEEARDLMTATKNLLKPASGELIMGGHQDIVLGSYYLTVMTAESEHPKYFADESEAMVALDSGNITLGEKIITKHKDGQGGLVTGETTVGRLIFNNSFPKKHKYYNEEINKNAFESMLNEAFHVFSNEKMGQILDNIKNTAFKYVTKSGITLSTFDLISPKGKEDILVTARGTISEIQELSNYGLMTDNERYTQSVTVWAKAGDDIVELVKQDVDKLSNIGLMIKSGSRGNISQLNQMAGIKGLSVDSTGRVMELPAQHGYLEGLTGLEYFVSMKGGRKALSDIALKTADAGYLTRRLVDVAQNVIVMEEDCGTVRGAVITKVESARMNQTVLDRAYGRYTMEDVKDASGKVVLPSGSLLDYNNAAKIKDIDLDSLMVRSATKCSLPRGVCQKCYGADFSTHKEVKIGTAVGVIAAQSLGEPSTQLTMRSKHTGGVLTKTDITAGLPRVEEIFEARTPKVIAPMSDFDGIIEKIDGDLDRGYTITLATQKAELTLPMFMGDKLLVDEGVNVKIGQSIMVDPNGEARRATFSGLIEKTGDTLIIRQDNPQVKEYYVTPNIPLKVKVGDKVRAATPLSEGPLDLQELLEKTDVDTLQTYIIEQLEDVYTSNGLIVNEKHIEVVIRRMTNKVEILSSGNSEFTEGDIVSLSVVLAKNVELTKANKNIIVYKRTVTGISKASLATESFLSAASFQETSRVLVDAVITGRVDSLTGLKENVILGQLIPAGTGFQAEKSEAEIQEEIEEEIAVL*