ggKbase home page

You do not have permission to do that.

Please email help@ggkbase.berkeley.edu for help.

ar4r2_scaffold_700_9

Organism: ALUMROCK_MS4_Bacteriodetes_30_51_curated

near complete RP 53 / 55 BSCG 51 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: 10950..13466

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Putative inner spore coat protein H id=3761748 bin=GWA2_Bacteroidetes_32_17 species=unknown genus=unknown taxon_order=unknown taxon_class=unknown phylum=unknown tax=GWA2_Bacteroidetes_32_17 organism_group=Bacteroidetes similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 43.1
  • Coverage: 839.0
  • Bit_score: 682
  • Evalue 4.70e-193
  • rbh
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 30.9
  • Coverage: 346.0
  • Bit_score: 139
  • Evalue 4.20e-30
Tax=GWA2_Bacteroidetes_31_9_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 44.7
  • Coverage: 836.0
  • Bit_score: 729
  • Evalue 4.70e-207

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

GWA2_Bacteroidetes_31_9_curated → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2517
ATGGTAAAGTGGTGTTATTTAATAATTATTTTTTTAATGTTTTCTTATTCTTGCACGCAAGGTTTATCAAGTAAAATTGAAGCAGAAGTAACTGTTAAAGAGTTTAGAATTGAATTAAATGAAAAAGAATTAGAAAACATTTACAAAAACTATAAGGAAGATATTTATATTTCAATAAAAATTTCTAATGGGAAAGATACTGTAAGTGCTAAATTGAGAATAAAAGGCGACACATCAAGAGAATACGATAAAAAGTCGTTGAAAATAGTTTTTAATAAAGATTCACTTTTGGAAGGTGAAAGGCAAAAAATAAATTTAAATAGCGAGTTTACTGATAAATCGTATATACGACAATTTATTTCGTCTAGATTGTTTGAGAGTGCAGGTTTGGCTACATATAAAACAAATTATGCAAAAGTATATTTAAACGGCAAATTTTATGGCTTATACCTTCAAGTAGAAAATGTTGATAAAGATTTTTTAAAAGAAAGAGATATTGATAAAAAGGGGAATTTATATAAAGCTGAAAAAGATGGTGCAAGTCTTAGTATGTTCGAATTTGAAAATCCATCAATAAAATGGGTAAATAAAACGCATAAAAAAGACACTACTTTTGAAGATTTAAAGGAGCTTATTTATAATATAAACAATATTTCTGATGCTGAATTTTATCCTTTTATTATTAGAAATTTTGAGTACGATAAATTAGTAAGTTTAGTAGCTATGAATATGCTAGTGCAAAATGGAAGCACATACTATCATAACTATTATTTATTTCACGATGTAAATGGAAATGGAAAATGGCAAATTTTACCTTGGGACCTCGATAAGAGTTTGAATTATTATTCGTGGAAGCCATACAAATATAACGAAACTTCGAGTAATTGGGAATCTGATAACCCACTAATTGAACGTATTTTTATGAATACAAAAATAATGAACGATGTAAAGAATAAAATAATACACTTAAAAAAAACAATTTTTAACACAGAAACTCTATATCCAATTATAGATTTAATAAAAGTTAAAATTGAAGAGAGCGTTAAACTTGATGTTAGAGATAAAATTAAAAGCGTTGATGAATGGAAAAAAATGCTAGAAAATGAAAAGGAGTTTATTAAAAAACATGCCGATAATATATTAAATCAGTTAAATACTTTTCCAAAAGGATTTGTATTACTAAACCAAAATAAAAAGTACACAAAATCGCCTAAATTGTATTGGACTGCCTCAAAATCTACAAGTAAAATAACTTACAAACTTTTGTATGGAAAGCACTTTTTATTAGAAGATTCTACAACAAAAATTATTGAAAATATTGCAGACACATCATATCAAATAACACAATTACTTCCAAAAGGAAAGTATTATTGGAGGGTATATGCAAGCGACGGAACTCATATTATTGAAGGGTTTAACACAAAAACCACTTTCGAAATTGTTGAAAAAACAAATATAATTTCAAGTATAAACCAGAATACTACATTAATTCGAAAAGATAGTCCATATTTTATATCCAAAGATATTACCATACCTAAAAATGTTACTCTTACGGTAAATGAGGGTGTAGAAATAATTTTTGCGAAAAACGCAAATCTTTTAGTGCAAGGAAATATTAAAATGATTGGAGGTAAATTTAATCCTATAAAATTGAATCCCGAAGAAAATGAATGGGAATCAATATATATCGATAGCGAAAATAGTGAATGCATTTTCGAAAATGTAATTTTTAATGCAGGTGCACTTCGCTCTAAGAAAGCTAAAATAATTATCGAAAATGTAATTTTTGATGCAAGGCTTAAAACTCTTGTGTTTGGAGAAGAACGTCAAAGTTTAATATGGCTAAATTACGGAACTTTTTCAATGAAAAACTCTTATGTTTATGGCTCTGGTAAAGGAGAGGGTTTAAATATAAACTATGCCGAAACTAATATTTCAAACTCCTATTTTGAAAACTTTCCAGATGCAATTGAAATAATGAAAGTAAATAAAGCAATTGTTAATAACAATATTATTGTAAATTCGCCCGATGATGCTATTGATATGAATGGTTGTAAAAATGTTTTAATTGAAAATAATTTAATTAAAAGTAATAAAGATAAGGCTATTTCTATTGGAACTGAACAATACGGACCATCAACGAACATTAACATAATAAACAATTTAATTGTTAAAAATAATTATGGAATTTCGATTAAAGATAGCTCTTTTGCGGTTTCTAAAGGAAATGTATTTATTGCAAACAACATAAATTTAGATGCTCATCTTAAAAATAATTGGAAAAAATATACTGTTGGAGGAAATATATTGGCTGATAGTAGCTATTTTTTTAATACCTCAAAAAATATATTTACTGTTGACGAAAAATCGAATGTTAATATAAAAAATTCAGTAAGTAATTTTATAGAAATTCGTAATAATTCTTTCGATAACAGTTATAATTACTCAGAACTTATTTCCAAAAAATTTGAATATATCAAATTTAAAAATTACAATATTTTAGAATTTTATAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 839
MVKWCYLIIIFLMFSYSCTQGLSSKIEAEVTVKEFRIELNEKELENIYKNYKEDIYISIKISNGKDTVSAKLRIKGDTSREYDKKSLKIVFNKDSLLEGERQKINLNSEFTDKSYIRQFISSRLFESAGLATYKTNYAKVYLNGKFYGLYLQVENVDKDFLKERDIDKKGNLYKAEKDGASLSMFEFENPSIKWVNKTHKKDTTFEDLKELIYNINNISDAEFYPFIIRNFEYDKLVSLVAMNMLVQNGSTYYHNYYLFHDVNGNGKWQILPWDLDKSLNYYSWKPYKYNETSSNWESDNPLIERIFMNTKIMNDVKNKIIHLKKTIFNTETLYPIIDLIKVKIEESVKLDVRDKIKSVDEWKKMLENEKEFIKKHADNILNQLNTFPKGFVLLNQNKKYTKSPKLYWTASKSTSKITYKLLYGKHFLLEDSTTKIIENIADTSYQITQLLPKGKYYWRVYASDGTHIIEGFNTKTTFEIVEKTNIISSINQNTTLIRKDSPYFISKDITIPKNVTLTVNEGVEIIFAKNANLLVQGNIKMIGGKFNPIKLNPEENEWESIYIDSENSECIFENVIFNAGALRSKKAKIIIENVIFDARLKTLVFGEERQSLIWLNYGTFSMKNSYVYGSGKGEGLNINYAETNISNSYFENFPDAIEIMKVNKAIVNNNIIVNSPDDAIDMNGCKNVLIENNLIKSNKDKAISIGTEQYGPSTNINIINNLIVKNNYGISIKDSSFAVSKGNVFIANNINLDAHLKNNWKKYTVGGNILADSSYFFNTSKNIFTVDEKSNVNIKNSVSNFIEIRNNSFDNSYNYSELISKKFEYIKFKNYNILEFYN*