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ar4r2_scaffold_345_10

Organism: ALUMROCK_MS4_Bacteriodetes_30_51_curated

near complete RP 53 / 55 BSCG 51 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: comp(8671..12945)

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
rpoC; putative DNA-directed RNA polymerase beta' chain (EC:2.7.7.6) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 76.3
  • Coverage: 1420.0
  • Bit_score: 2198
  • Evalue 0.0
DNA-directed RNA polymerase subunit beta'''' id=5034396 bin=GWA2_Bacteroidetes_33_15 species=unknown genus=unknown taxon_order=Bacteroidales taxon_class=Bacteroidia phylum=Bacteroidetes tax=GWA2_Bacteroidetes_33_15 organism_group=Bacteroidetes similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 80.6
  • Coverage: 1420.0
  • Bit_score: 2318
  • Evalue 0.0
  • rbh
Tax=GWD2_Bacteroidetes_33_33_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 80.6
  • Coverage: 1420.0
  • Bit_score: 2318
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

GWD2_Bacteroidetes_33_33_curated → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4275
ATGGCTTTTAGAAAAGAGAATAACGTAAAAAGTGGATTTACAAAAATCTCTATAGGATTGGCATCTCCAGAAGAAATTTTACTAACATCGAGCGGAGAAGTATTAAAACCCGAAACTATAAATTACAGAACCTATAAACCCGAAAGAGACGGCTTGTTCTGTGAAAGAATATTTGGACCAGTTAAAGATTACGAGTGCCATTGTGGTAAATACAAAAGAATTAGGTACAAAGGTATTGTATGTGATAGATGCGGAGTAGAAGTAACCGAGAAAAAAGTTCGCCGTGAACGCTCTGGACACATATCGCTTGTAGTTCCCGTTGCTCATATTTGGTATTTTAAATCACTACCTAACAAAATTGGCTATCTTTTAGGTTTACCAACAAAAAAACTTGATGCAATAGTTTATTACGAAAAATACGTTGTAATACAACCGGGTATTGCCAAAAATACCGATGGTGAATCCCTAAATAAATTAGATTTTTTGTCGGAAGATGAATACTTAGACATATTAGAAACTATTCCTAAAGAAAACCAATACCTTGATGACTCTGACCCAACCAAATTTATTGCAAAAATGGGAGCAGAAGCATTGCAACAGCTATTATCAAACATCGATTTAGATGATTTAGCCTCATCACTCAGAGTTAAAGCAAATACAGAATCATCACAACAAAGAAAAAATGAAGCTCTAAAACGATTAAATGTTGTTGAAGCATTTAGATCATCAAAAGGAAGAAATAAACCTGAATGGATGATTGTTAAAGTAGTGCCTGTAATTCCACCTGAACTTAGACCTTTAGTCCCTTTAGATGGTGGTAGATTTGCAACATCTGATTTAAATGATTTATACAGAAGAGTTATTATAAGAAATAATCGATTAAAAAGATTAATAGAAATTAAAGCACCAGAGGTAATTCTACGTAATGAAAAACGTATGTTACAAGAATCTGTTGATTCTTTATTCGATAATTCACGTAAAGCTAATGCAGTTAAAACAGATGCAAATAGACCTTTAAAATCTTTAAGCGATAGTTTAAAAGGAAAATCAGGACGTTTTCGTCAAAATTTATTAGGTAAACGCGTCGATTACTCTGCACGTTCAGTAATTGTAGTTGGACCAGAATTAAAAATGCACGAGTGTGGTATTCCAAAAGGAATGGCGGCAGAGCTATACAAACCATTTATTATTCGTAAATTAATAGAAAGAGGTATAGTAAAAACAGTTAAATCTGCCAGAAAAATTGTTGATAGAAGAGACCCAGTTGTTTGGGATATTCTCGAAAACATACTAAAAGGTCATCCAGTTTTATTAAACCGTGCCCCTACCCTTCACAGATTGGGTATTCAAGCTTTTCAACCAAAATTAATTGAAGGTAAAGCAATACAACTTCATCCATTAGCTTGTACAGCATTTAACGCCGATTTTGACGGTGACCAAATGGCTGTTCACTTACCTTTAAGTAATGCAGCAATACTAGAAGCCCAATTACTTATGTTAGGTTCACATAACATTCTTAATCCAGCTAACGGAGCACCTATTACAGTGCCTTCACAAGACATGGTTCTCGGTTTGTATTATATAACAAAACCTAGAAAAGGAGTAAAAGGCGAAGGGCTAAAATTTTATTCACCCGAAGAAGTAATAATAGCTTTAAACGAAGGTGCAGTTGATATACATGCCGAAATTAAAGTTAGAATTAACGATTATACTAAAGGTTTCCAACCAGAAAAAGTTATAATTGAAACAACAGTTGGTAGAGTAATATTTAATCAAGTAGTTCCAAAAGAAGTAGGTTATATAAATGAAATTCTAACAAAAAAATCACTAAGAGATATAATTGGAAAAGTTCTAAAGATTGCAGGAAACTCACGCACCGCCAAGTTTCTTGACGATATAAAAGACTTAGGTTATAAAATGGCTTTTGAAGGTGGATTATCATTTAATTTAAATGATGTAATTATACCTGCAAATAAAGCAGAACTTGTTAAAGATGGCTATGTACAAGTTGAAGAAGTAATGAATAACTATAATATGGGATTTATTACCAACAACGAACGTTACAACCAAATAATTGATATTTGGACACATATAAACGCCAAACTAACTAACACATTAATGCAACAGATTAGCACTGATAATCAAGGATTTAATGCTGTTTATATGATGCTCGATTCTGGTGCAAGGGGTTCTAGAGAACAAATTCGACAGTTATCAGGAATGAGAGGTTTAATGGCAAAACCACAAAAATCTGGTGCTACTGGAGGACAAATTATCGAAAATCCTATCCTTTCAAACTTCAAAGAAGGTTTATCGGTATTAGAATATTTTATTTCAACTCACGGAGCACGTAAAGGTTTGGCTGATACTGCTTTGAAAACAGCAGATGCGGGTTATTTAACTCGTCGTTTAGTAGACGTATCGCAAGATATGATTATTACTGATGAAGACTGTGGAACTCTTCGTGGTTTAATTGCTACTGCATTAAAAAATAACGAAGAAGTTGTAGAATCGCTTTACGATAAAATTCTTGGTAGAACTACTGTTCACGATATATATTACCCAAAAACAGGAGAACTTATTATTGCATCTGGAGAAGAAATAACTGAAGAAATAGCTAAAATAATTGAAAATTCGCCAATAGAAAGCGTTGAAATTCGTTCAGCTCTTACTTGCGAAAGCAAACAAGGTATTTGTGCTAAATGCTATGGTCGTAATCTTGCTACTGGAAAAATGGTTCAAAAAGGCGAGGCTGTTGGTGTAGTTGCCGCACAATCAATTGGAGAACCAGGTACTCAGTTAACACTGCGTACATTCCATGCTGGAGGTACAGCTGGTAACATTGGAACAGAAAATAAAGTAATTACAAAAAGCGACGGGTTTGTTGAAATTGAGGAGCTACGAACAATAGAAACTATTGATAAAGATGGTAAAACTATTGATGTAGTTGTTGGTCGAATGGCTGAAATGAAACTTATTGATAAAAACTCTGATGTTGTTCTTTCAACTCATACAATTCCTTATAGCTCAAAAATTTATGTAAAAAACAATACTGAAGTTACTAAAGGAACATTAATTTGCGAGTGGGATGCTTTTAATTCATTAATAATTTCTGAAGCTAAAGGAAAAATTGTTTTTGAAGGATTAGTTGAAGGTATAACATACAAAGAAGAGTCTGACGAACAAACCGGGTTCAAAGAAAAAATTATAATTGAAACTAAAGATAAAAAATTAAGCCCAGTAATTCAAGTAGTAGATAAAAAAGAAGTTTTAAAACAATACGATATTCCTGTAGGTTCCCATGTTGTGGTAGAAGAAGGAAATCAAGTTAAACTTGGAGATATAATTGTTAAAATTCCTCGTGCCACTAGTAAAGCTGGCGACATTACTGGAGGTTTACCTAGAGTAACTGAATTATTTGAAGCTAGAAATCCATCAAATCCTGCTGTTGTAGCTGAAGTTGACGGAGAAGTTTCTTTTGGTAAAATAAAAAGAGGAAACAGAGAAATTATTATTACAACAAAATCAGGTGATGAAAGAAAATACCTTGTTTCCTTATCAAAACAAATTCTAGTACAAACTAACGATTATGTTAAAGCAGGAACTCCATTATCAGACGGAGCTATCACACCAGCTGAAATACTTGAAATTAAAGGTCCTACAAAAGTTCAAGAATATATTGTAAATGAAGTACAAGCAGTTTATAGATTACAAGGTGTAAAAATTAACGATAAACATTTTGAAGTAATAGTACGTCAAATGATGCGTAAAGTATCAATTGAAGATACTGGCGATACAAAGTTTCTTGAAAAACAGATTGTTGATAAATGGGAAATAATGGCTGAAAACGATTCGATATACGGAATGAAGTATATAGAAAATAATGGCGATTCTACAATTTACAAGAGTGGACAAATTATTTCTGTACGTAAACTACGCGATGAAAATTCTATGCTTAAAAGAAAAGATTTAAAACTAATGGAAGCTAGAGATGCTATGCCTGCAACATCAAAACAAGTATTGCAAGGTATAACCAGAGCATCATTGCAAACTACTAGTTTCTTATCTTCGGCTTCTTTCCAAGAAACAACTAAAGTGCTTAATGAAGCTGCAATAAGTGGAAAAGTTGATTATTTAGAAGGTCTTAAAGAAAATGTACTTGTTGGCCATAAAATACCAGCAGGAACCGGTTTAAGAGAATACGAAGACATAGTTGTTGGGTCTCAAAAAGAATATGATAAAATTACTTCAAATTCATTTTCCGGATTTCGTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1425
MAFRKENNVKSGFTKISIGLASPEEILLTSSGEVLKPETINYRTYKPERDGLFCERIFGPVKDYECHCGKYKRIRYKGIVCDRCGVEVTEKKVRRERSGHISLVVPVAHIWYFKSLPNKIGYLLGLPTKKLDAIVYYEKYVVIQPGIAKNTDGESLNKLDFLSEDEYLDILETIPKENQYLDDSDPTKFIAKMGAEALQQLLSNIDLDDLASSLRVKANTESSQQRKNEALKRLNVVEAFRSSKGRNKPEWMIVKVVPVIPPELRPLVPLDGGRFATSDLNDLYRRVIIRNNRLKRLIEIKAPEVILRNEKRMLQESVDSLFDNSRKANAVKTDANRPLKSLSDSLKGKSGRFRQNLLGKRVDYSARSVIVVGPELKMHECGIPKGMAAELYKPFIIRKLIERGIVKTVKSARKIVDRRDPVVWDILENILKGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPKLIEGKAIQLHPLACTAFNADFDGDQMAVHLPLSNAAILEAQLLMLGSHNILNPANGAPITVPSQDMVLGLYYITKPRKGVKGEGLKFYSPEEVIIALNEGAVDIHAEIKVRINDYTKGFQPEKVIIETTVGRVIFNQVVPKEVGYINEILTKKSLRDIIGKVLKIAGNSRTAKFLDDIKDLGYKMAFEGGLSFNLNDVIIPANKAELVKDGYVQVEEVMNNYNMGFITNNERYNQIIDIWTHINAKLTNTLMQQISTDNQGFNAVYMMLDSGARGSREQIRQLSGMRGLMAKPQKSGATGGQIIENPILSNFKEGLSVLEYFISTHGARKGLADTALKTADAGYLTRRLVDVSQDMIITDEDCGTLRGLIATALKNNEEVVESLYDKILGRTTVHDIYYPKTGELIIASGEEITEEIAKIIENSPIESVEIRSALTCESKQGICAKCYGRNLATGKMVQKGEAVGVVAAQSIGEPGTQLTLRTFHAGGTAGNIGTENKVITKSDGFVEIEELRTIETIDKDGKTIDVVVGRMAEMKLIDKNSDVVLSTHTIPYSSKIYVKNNTEVTKGTLICEWDAFNSLIISEAKGKIVFEGLVEGITYKEESDEQTGFKEKIIIETKDKKLSPVIQVVDKKEVLKQYDIPVGSHVVVEEGNQVKLGDIIVKIPRATSKAGDITGGLPRVTELFEARNPSNPAVVAEVDGEVSFGKIKRGNREIIITTKSGDERKYLVSLSKQILVQTNDYVKAGTPLSDGAITPAEILEIKGPTKVQEYIVNEVQAVYRLQGVKINDKHFEVIVRQMMRKVSIEDTGDTKFLEKQIVDKWEIMAENDSIYGMKYIENNGDSTIYKSGQIISVRKLRDENSMLKRKDLKLMEARDAMPATSKQVLQGITRASLQTTSFLSSASFQETTKVLNEAAISGKVDYLEGLKENVLVGHKIPAGTGLREYEDIVVGSQKEYDKITSNSFSGFR*