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ar4r2_scaffold_4131_1

Organism: ALUMROCK_MS4_Beggiotoa_37_524_curated

near complete RP 52 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 MC: 2 ASCG 14 / 38 MC: 1
Location: 3..6347

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
YD repeat protein n=1 Tax=Nitrosococcus halophilus (strain Nc4) RepID=D5C3N7_NITHN similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 41.3
  • Coverage: 2087.0
  • Bit_score: 1465
  • Evalue 0.0
  • rbh
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 41.2
  • Coverage: 2087.0
  • Bit_score: 1465
  • Evalue 0.0
  • rbh
YD repeat protein {ECO:0000313|EMBL:ADE15009.1}; Flags: Precursor;; TaxID=472759 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Chromatiales; Chromatiaceae; Nitrosococcus.;" source="Nitrosococcus halophilus (strain Nc4).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 41.3
  • Coverage: 2087.0
  • Bit_score: 1465
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

Nitrosococcus halophilus → Nitrosococcus → Chromatiales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 6345
AGTAGCTTACCAAGTCAACGCCCAGTTACGCCAACTTATTATGTAAAAGATGATTCAACAGATTGGTTAATGAATGAAATTTGGCAAATGGATTTAACGAGCTTAATAAATGATTTAGTTAATCAAAATTATTTAACAAACACATTAGGTTTAGTTATTAAGGGTCAATATAAAGAACCTCGTTATTTCTTCAATCATCGCAAATCTGGTATTGCCACAAAAGATTTACCCACATTGTATGTAGCGCACCGAGTTCCTCCCCCAGTAGACGATAAAACAGCGTTACAAGATTATTTCTCACAACAAACGGGTTTTGAGGGGTTTAAATGGGGAGAAAATAGTGCTTTTAGTATTACTTTAGCAGGTAAGGAACATCGTTGGCAATTAGATAGCACGGTTATTTCTGGGATTCCGACCCGACAATTTCAACTAATTGAATTAACAAATGACAATGTAAATGCATTAAAGAAATATCAAATTATTTATCCAAATGGAGATCAACAAGTTGCTTATTATTTAGGAATTAAGCAAGACGTTGTATTACCACCCGACCCCGCTGTCGTTGCTAATCCTATTAATACAGTACAAACAACTTTGTTTAGTAAAACAAATGCTTTTCTTTATACAGGAGAAACTCCAATTCAAACGGGTGTTGCTCCTAGTGTAATTGATGCAATTCGTGCAGCAGTTATTCGCGGACAAATATTTTCTCGCGATGGTGTATTTCTCAGTGGAGTAAAAATAACTATCCATAACCATCCAGAATATGGTCAAACTTTAAGTCGTGCGGATGGGATGTTTGATTTGGTAGTTAATGGTGGAGGAGAATTAGTTGTTAATTATGAGAAAGAAGGTTATCTTCCCGTTCAACGGCAAGTAAGTCTTCCTCTAAGAGACTACACTTGGGCAAGTGATGTTGTAATGGTGCAATTAGACAATCAAGTTACTCGTGTTAGCCTAGTAAATGATAATGCTAAGCCATTTCAAGTTGCGAAAGGAAGCTTAGTGCAAGATGAGCATGGAAAACGCCAAGTAACTTTGTTATTTCCAGCAGGAACTACTGCTACAATGGAGCTGCCTGATGGGTCTGTTCAACCTTTAACTGAGTTAGACATACGTGCAACAGAATACACAGTAGGCACAAATGGGCCTAAAGCCATGCCAGGTGATTTACCAGCAAGTAGTGGCTATACCTATGCAGTGGAACTTAGTGTGGATCAAGCAATTACTGCTAAAGCCACTAAAGTAACTTTTAATCAAGCTGTTCCATTTTATGTTGATAACTTTTTGAACTTTCCAACCGGAGAAGCAGTTCCTGTTGGTTGGTATGATAGAGAGAAAAATGCATGGATACCTGCTAATAATGGAAGAGTTATTACAATATTGTCAATAGATGGCAATGGTATGGCGATATTGGACACCGAAGGAAATAATCTTCCAGCAACTACTGCACAACTCGCAGTATTGGGTATTTCTGAAGTGGAACTTTTACAGCTTGCTACTCTCTACCAAACAGGACAGAGTTTATGGCGAGTGCCTATTAGTCATTTTACCCCGTGGGATTGCAACTGGCCTTATGGTCCCCCCTCTGATGCGCAATCTTGCAAAGCGCCACCCCCTGCAAAAAAAGAACAAAAGAAACCTTGTTTGCAATCTGGCTGCATTATTGAAGCAGAAAACCAAGCATTAGGGGAAATTGTCCCAATTACAGGAACACCTTTCACCTTAAACTACCGTAGTAGTCGCAGTGCGGGTTATAAATCAAATTCAGCCCTAGAAATCCCACTCCGCACTGAACAAGTGCCTGCTAGCCTAAAACAAATTGACTTACAAATTAACGTTGCTGGACAAAGAATCCTTAAGAGCTTTTCTCCAGATACTTATAACACGACCTTTGAGTGGAATGGTAAAGATGCTTTTGGGCGAGAAATACAAGGTCAACAGCCTGTAAATATTGCTATTGGTTATGTGTATGATGCTACTTATTACTCAGCCTCTCGTGACTTTACACAAAGCTTTGCTAAGTTTGGTCAACAACCTTTAACCAATAACAGAGCACGCAAAGAAGTTACTTTATGGCAAAACTATACTGAAACTTTAAAACATCACCACCCTCAAAATGATGCGTTAGGTGGTTTCAGCCTTAATGCTCATCACCTTTACGATGTTAACAACAAAACGATTTATCGAGGCGACGGTTCTTCTGGGGGAGCTTCTGCTAGCTATGTGGAAGCTGTGTTTAAAACTGTTGCAGGTGGGGCATTAGAAGATACTTTAATTTTTGGAGATAATATTCCTGCCACTACTGCAAATCTTGATAACTCAGGAAATTATGTTTTAGGAGGAGTTGATGGTGATGGAAATGTTTATATTCGTAATCGTAATGATATACGCCAAATAAGCACAGATGGAATTGTTAGAACCATTTTAAAGCCTTTGTCTTCTTCTGAAAACTTAGGGAGTTTTGCGGTTGGAAAAGATAATAATTTATATGCAGTGTATGTGACATATCAATATGGTACTAGCTCTATCGTTAAATTTCGTATTATCCGTAGAAATAAAGATGGGAGTATTACTGATAGACCTTTCCTTAACCAAGAAAGCTTTGGATTATTCTCAATTTCAAGGTACGCCCCTCTAGTAGTAGATGAAAAAGGAGTTTTATATTTTTCTGCCTATTATAGCTCTCAGCGTATTAGTAGTATTTTTAAAGTTGATTTAGATGGTACTATTACAAGAATAGCAGGTAGTGGCAGTACGGAACATGTGGAGGATGGTGCACTTGCAACGACCGGAAAGCTTGGGGATATATGGGGACTAGCCATAGGAAGAGATGGTAGCTTATATTTTAACGAAGGTTACTCTGGTGTTTTTATTCGTAGAATAGCACCAAATGGTATTGTTAGCACCGTAGCAGGTTCTGGAAAAGAAGTTAATACAGGGAATGGCAGCTGTTATCAGACTAGAAAACCAGCTAAGGATGTTGTTCTAACTGAAACGTCAGGGCTTGTTGCTGGAAAAGATGGTAGCTTATATTTTTCAGAAAGAATAGGCAATGGTTGGGGAACGCACGAGTGTATCCGTCAAATAACCCCTGATGGGATGGTAACAACTATTGCTGGAATTGGAAATAAATTTGGAATAGATGGTATACCCGCTAATCAAACATATTTGTATCAAGCAAATTTAGCAATTGGAGGAATAGAGGGAGATTTATATATTGAGCACGATCCCAGTTACTATGCTGGTTATAACCCCGACAGAATAGGGCTAACAATTAGCCGTATTAGACCAAGTTTTCCAGAATTTCAAATAGGTACATTTACTGTCGCATCAGAAGATGGTAGTGAAATATACGAATTTACTGAAGGTGGAATACATTTAAGAACAGTTGATGCATTAACTAAACAAACCCGTTATAGTTTTAGTTATGATACTAGTGGATACTTAACTGAAATTACTGATTTAAATGGAGAAGTAACGCGAATAGAAAGAAATGGAAAAACACCAATAGCAATTATTTCACCAGATGGACTGCGTACCTCCTTTGAACTAGATAACAATGGTTATTTAAAAGTTGTTACAAATCCAGCCGACGAACGTTATCAATTTACGTTTGATGCACAAGGATTATTAAAAGAGTTTAGTAATCCTCGCCGAAGCAAATCTACCTATAATTACGATGTCCAAGGATTATTGCTTGAGGATACAAATGCTTTAGGAGGTGGTTGGTATTTAGAACGCCCAATGGACACTGGTAATAATCAAACGGTTATAATGAGAAGTAAAGGGGGATTGGCTTACCGCTATGAAACAATTACTGCAACTAATGGAGATAAAACCCGTATTCAAACTGCTCCTAATGGGCAAAAAACAACCACTCTAACCGAATTAAATGGCAAAGTTACTATTACTAAACCAGATGGAACAGTCATTGTAAATTCAGAGCCTAGTCCAGACCCACGCTTTGGTATGCAAGCGCCTTTTATTAAAACAACTACGATTACTCCCCCCAACGGGCAAAAACTTACTACAACTAATGAATTGCTGGCATCTTTAGCAGATAAAAATGATCCGTTAAGCTTGATTTCATTAACGAATAAAACAACTGTAAACGGCAATAAAACAAGTTCCTCAACTTATGATGCAGCTACACGAGTGTTAACCACACTTACACCACAAGGACGAACCAGTTACACTCAAATGGATGAGAAGGGTCGAATTATTAGTGGTAAAACTTCAGATTTAGCCGACTATACTAACCAATATGATTCACGAGGACGTTTAATTCAAACAACTGTAGGAAGTGAAAGAACAACCCGTTTTGAATATGATGATAATGGTTATGTAAAGAAAGTTGTCGACCCATTACAACAAGAGATTAGTTTTACTTACGATAAGGTAGGTAGAATTCTGCAAAAAACGTTATCTGATGGAAGAGTGATTAATTATCAATATGATAGTAATGGTAATTTAGTTTCTATTGCCCCGCCAAGTCGACCAGTGCATAGCTTTAATTACGATGCAATTGATCAACAAATTCAATATGCTCCACCGACTTTGCCGACAGTTTCTCAACCACAAACAAAATATGAGTACAACTTAGATAAACAACCTACCAAAATAACTCGCCCTGATGGACAGGAAATTAGTTTCAATTATGATGCAGTTGGACAACTAAATAGTGTTGTTTCTCCAAATGGAAGTCAAAGTATAACTTATGATACTGCCGGTCGCCTTCAATTATTAAAAAGCTTTGATAATCAACAGTTAAGCTACCTTTATAATGGTTCATTGCCATTATCTGAAACTTGGTCTGGCACAATAAAAGGAGTAGTTGCTCAAGCTTATAATGAGGAACTTCGGGTTTCATTGGTTGCTATAAATAGTAGTACCTCTTCTTATCTATACAACAATCCAATTTATTATCAATATGATAAAGATGGATTACTAACTAAAGTTGGTGATTTGAGTTTAATTCGTGATGCTCAAAATGGGCT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PROTEIN sequence
Length: 2115
SSLPSQRPVTPTYYVKDDSTDWLMNEIWQMDLTSLINDLVNQNYLTNTLGLVIKGQYKEPRYFFNHRKSGIATKDLPTLYVAHRVPPPVDDKTALQDYFSQQTGFEGFKWGENSAFSITLAGKEHRWQLDSTVISGIPTRQFQLIELTNDNVNALKKYQIIYPNGDQQVAYYLGIKQDVVLPPDPAVVANPINTVQTTLFSKTNAFLYTGETPIQTGVAPSVIDAIRAAVIRGQIFSRDGVFLSGVKITIHNHPEYGQTLSRADGMFDLVVNGGGELVVNYEKEGYLPVQRQVSLPLRDYTWASDVVMVQLDNQVTRVSLVNDNAKPFQVAKGSLVQDEHGKRQVTLLFPAGTTATMELPDGSVQPLTELDIRATEYTVGTNGPKAMPGDLPASSGYTYAVELSVDQAITAKATKVTFNQAVPFYVDNFLNFPTGEAVPVGWYDREKNAWIPANNGRVITILSIDGNGMAILDTEGNNLPATTAQLAVLGISEVELLQLATLYQTGQSLWRVPISHFTPWDCNWPYGPPSDAQSCKAPPPAKKEQKKPCLQSGCIIEAENQALGEIVPITGTPFTLNYRSSRSAGYKSNSALEIPLRTEQVPASLKQIDLQINVAGQRILKSFSPDTYNTTFEWNGKDAFGREIQGQQPVNIAIGYVYDATYYSASRDFTQSFAKFGQQPLTNNRARKEVTLWQNYTETLKHHHPQNDALGGFSLNAHHLYDVNNKTIYRGDGSSGGASASYVEAVFKTVAGGALEDTLIFGDNIPATTANLDNSGNYVLGGVDGDGNVYIRNRNDIRQISTDGIVRTILKPLSSSENLGSFAVGKDNNLYAVYVTYQYGTSSIVKFRIIRRNKDGSITDRPFLNQESFGLFSISRYAPLVVDEKGVLYFSAYYSSQRISSIFKVDLDGTITRIAGSGSTEHVEDGALATTGKLGDIWGLAIGRDGSLYFNEGYSGVFIRRIAPNGIVSTVAGSGKEVNTGNGSCYQTRKPAKDVVLTETSGLVAGKDGSLYFSERIGNGWGTHECIRQITPDGMVTTIAGIGNKFGIDGIPANQTYLYQANLAIGGIEGDLYIEHDPSYYAGYNPDRIGLTISRIRPSFPEFQIGTFTVASEDGSEIYEFTEGGIHLRTVDALTKQTRYSFSYDTSGYLTEITDLNGEVTRIERNGKTPIAIISPDGLRTSFELDNNGYLKVVTNPADERYQFTFDAQGLLKEFSNPRRSKSTYNYDVQGLLLEDTNALGGGWYLERPMDTGNNQTVIMRSKGGLAYRYETITATNGDKTRIQTAPNGQKTTTLTELNGKVTITKPDGTVIVNSEPSPDPRFGMQAPFIKTTTITPPNGQKLTTTNELLASLADKNDPLSLISLTNKTTVNGNKTSSSTYDAATRVLTTLTPQGRTSYTQMDEKGRIISGKTSDLADYTNQYDSRGRLIQTTVGSERTTRFEYDDNGYVKKVVDPLQQEISFTYDKVGRILQKTLSDGRVINYQYDSNGNLVSIAPPSRPVHSFNYDAIDQQIQYAPPTLPTVSQPQTKYEYNLDKQPTKITRPDGQEISFNYDAVGQLNSVVSPNGSQSITYDTAGRLQLLKSFDNQQLSYLYNGSLPLSETWSGTIKGVVAQAYNEELRVSLVAINSSTSSYLYNNPIYYQYDKDGLLTKVGDLSLIRDAQNGLLKETKLGNLTTQRTHSNFAELKEEVANYSNNELYHAYYSRDKGGRITQKQEIINGVSKTFDYRYDVVGRLVEVKLDNSIIETYQYDANGNRLNNNAIYDDQDRLLQYNSNTYTYSQNGDLKTKNNASYHYDVFGNLRSVTLPEKTIDYVIDARNRRIGKKINGQLVQGFLYSGKLKPVAELDSNGNIVARFIYGSKINVPDYILKGNKTYRVISDHLGSPRLIIDISDGSIAQQIDYDTFGNILFDSNPNFQPFAFAGGLNDNDTALIRFGARDYDPQIGRWTAKDPILFDGGDSNLFGYVSNDPVNWIDVDGEIGLVASAIIGSGIELSLQLYENGGRIECINWWNVGQAAVVGAGLSFALRPFTAAQQAVTHWNTAENIANNALKPGSWVMTGERTWRNYAMSGVFQRGYKYEDAITTIVPSSSLKYPSGFEAWKGVLGQRIYSP*