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ar4r2_scaffold_2082_2

Organism: ALUMROCK_MS4_Beggiotoa_37_524_curated

near complete RP 52 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 MC: 2 ASCG 14 / 38 MC: 1
Location: comp(1140..5903)

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Value Algorithm Source
DNA-directed DNA polymerase {ECO:0000256|SAAS:SAAS00057170}; EC=2.7.7.7 {ECO:0000256|SAAS:SAAS00057170};; TaxID=572477 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Chromatiales; Chromatiaceae; Allochromatium.;" source="Allochromatium vinosum (strain ATCC 17899 / DSM 180 / NBRC 103801 /; NCIMB 10441 / D) (Chromatium vinosum).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 63.3
  • Coverage: 1190.0
  • Bit_score: 1517
  • Evalue 0.0
DNA polymerase III, alpha subunit n=1 Tax=Allochromatium vinosum (strain ATCC 17899 / DSM 180 / NBRC 103801 / D) RepID=D3RNR6_ALLVD similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 63.3
  • Coverage: 1190.0
  • Bit_score: 1517
  • Evalue 0.0
  • rbh
DNA polymerase III subunit alpha similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 63.3
  • Coverage: 1190.0
  • Bit_score: 1517
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

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Taxonomy

Allochromatium vinosum → Allochromatium → Chromatiales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4764
ATGACAGCACGTTTTATTCATTTGCATTGTCATACTGAATATTCCTTAGTGGATGGTATTGTACGCATTAAACCTTTGATCAAAACAATACGTGAAATGGGAATGCCAGCTTGTGCCATCACTGACCATTTTAATTTATTTGGTTTAGTTAAATTTTACAAAGCGGCACAATCTAACGGTATTAAACCGATTATTGGTGTTGATTTGCGATTTAAAACAACACATAAAGAAGAAACACCAGCACGTATTACTTTATTATGTCAAAATTCAATTGGTTATCATCATTTGACGCAATTAATTTCACGCTGTTATTTAGAAGGACAAATACAAGGCATTCCTTATCTACAAAAATCGTGGCTACAAGGTCATACAGAGGGTTTGATTGCTTTATCTGGTGGGATAGAAGGAGAAATTGGACAATCCTTATTAATGGAACGTCATACTGTTGCACAAGAACAATTGGTTGAATGGTCAAGCTTATTTCCACAACGATTTTATTTAGAATTGCAACGAATAGGACAGCCACAAGAAGAATCTTACATTCAAGCTGCAGTAGAACTTGCTTTAGCGACATCAACTCCTGTGGTAGCGACCAATGGTGTCTGTTTTCTACGTGCTGATGACTTTGAAGCCCATGAAATACGGGTTTGTATCAATCAAGGTTATACTCTTAATGATCAACGTCGTCCACGTTTGTATACAGCACAACAATATTTACGTACGCCAGATGAAATGGCAGAATTGTTTGCTGATATTCCAGAAGCGATTGAAAATACTTGGTATATTGCACAACGCTGTACTTTAGAATTATCCTTAGGTAAAAATTTTCTGCCTGAATTTCCAGTGCCTATTGGTAAAACCACTGAAGAATATTTTACTGAACAAGCCAAATTAGGTTTAGAACAACGTTTATTAAAACAAGAAATATTCCTTACTGATCCACAAGCCCGTATCCCTTATGATGAAAGGCTACAATTTGAACTCAATGTCATTCAACAAATGGGCTTTCCCGGTTACTTCTTGATTGTAGCGGATTTTATTCAATGGGCAAAAGAAAATAGAATACCCGTTGGACCGGGGCGTGGTTCTGGTGCGGGTTCATTAGTCGCTTACGCCTTAGGAATCACTGACTTAGACCCATTGCGCTATGAATTATTATTTGAACGCTTTCTCAACCCAGAACGGGTTTCTATGCCTGACTTTGACATTGATTTTTGTATGGAAGGACGGGATGATGTTATCAAATATGTCATGCAACGCTATGGTAAAGAAAGAGTTTCTCAAATTATTACACATGGTACAATGGCAGCAAAAGCGGTTGTGCGAGATGTAGGACGAGTATTAGGACATCCTTATGGTTTTACTGATCAAATTGCCAAATTAATTCCTATAGAATTAGGCATTACTTTAGATAAAGCATTAGAATCAGAAGAAATTTTACGTAATCGTTATCAACAAGAAGAAGAGGTACGTACTTTATTAGATATGGCGCGTAAATTAGAAGGGATTACGCGTAACGTAGGTACACATGCCGGTGGTGTTGTCATTGCACCTTCTCAATTAACTGATTTTTCAGCACTTTATTGGGATAATAATCCAGAGAGTAATATTGTCACACAATTTGACAAAGGAGATATTGAAGCGGTTGGATTAGTTAAATTTGACTTTTTGGGCTTGCGTACTTTAACCATTATTAAATGGGCTTTAGACAATATTGCACAATTTAACGATACTCCACCACCTGACATTCTCTCTATTCCATTAGATGATGAAGACACATTTGACTTATTTAAAAGCGGAAACACCACAGCCGTGTTCCAATTGGAATCTTCTGGTATTAAAAAATTAGTCAAGCGGTTAAAACCAGATTGTTTTGAAGATATTGTTGCTTTAGTCGCCTTATATCGTCCGGGCCCTTTACAATCAGGCATGGTCGATGATTTTATTGCGCGTAAACATGGTGAAGCGAAAATTGAATATCCCCATCCTGATTTAGCCCCGATTTTGAAACCCACTTACGGTGTTATTTTATATCAAGAGCAAGTCATGCAAATTGCTCAAGTATTAGCCGGTTATACATTGGGTGGTGCGGATTTATTACGTCGTTGTCTCAGTGGTTCTACTCAAATTGTTGATGCTGCAACAGGACAATTAGTGACATTAAAGGAGATATATGTAAATGCGTCATACTGGCAAGGACGTCTTATTTTTTGTTTAGATTTAATCACACAAAAGATACTTCAGCAGCCTATTGAAGCGATTTATCATAATGGAATACGTGATGTTTGGGAAATCACAACAAAAACCAAGCGTAAAATTAGAGCGACAGCAGATCATCTTTTCTACAGTTTATTGGGTTGGCAACCATTACAAAAATTTAACATTGGTGACACAATTGGTTTAGCTAAAACTTTACCTATTCAACAAAATAGTATTATTTCAGATGCTCAAATCAAAATAACTGCTTATTTATTAGGAGATGGTTATTTATCTCCTAAAAAATCCAGTCATAGTTATTTTTGTAATACAAATTATGAATTGATTGAAGATTTTAATCTGTGTGCTACTCAATTATTTGGTAAACCTGCACCTGTTGATTATCAATTTCATTCAGGAAAAAAAACAGTCGCTTATGCCAGAGTCGGTTTTATTTCAGCATTTAATCAATGGATAGATCAACATATTAAACGGGCATTATCTCAAGATAAAACCATTCCAACTTGGGTTTATTCATTATCCAAACAACAATTACAATTATTTTTAGGAACATTATGGTCGACAGATGGTAGTTTTGACACAGCCATTGGACATGCAGATTATAACTCGACGTCACCTCAATTAATTGAACAAATACAACACTTATTATTACGTTTAGGCATTATTGCATTATTTAATGTAAAACATACAACCTACCAAGATAAACCCTATGTTTCTTATCGCGCTCAAGTAACAGGGCGTGAAGATATGCTTAAATTCTGTGAATTAATACAACCTTACTTAAGCCAAGAAAAAGCACAATTTGCTATTCAATGTTACCATATTGTTAAAAACAAACAACGTAACCAATCTAAACATCTTATTCCTGCTCAAGTGATTCAATTAATTGCTGATGCAAAGAGATCGAGTCACATGACTTGGCAACAGATAGATATGGCAATAGGTTGTAAAGCGGGCACTATGTCAAGTGGGTTAAATTTTCATGTTCCACCAACACGTAGATTATCGCGTCATCGTGTGTATAATTTTGGGATTGCGTTACAAAATGAACAATTGATACAGATTGCTCAATCTGATGTATTTTGGGATCAAATTACTCAAATAGCTTATGTAGGACAAGAAGAAGTTTTTGATTTAACGATACCTAAAACGCATAATTTTGTAGCCAACGATTTCATTGTGCATAACTGTATGGGAAAAAAGAATGCAGTTGAAATGGCACAACAACGTTCTACTTTTGTACAAGGGGCAACTGAACGTCATGTGGCTACTGAAAAATCAGAATATATCTTTGATTTAATGGAAAAATTTGCTGGATATGGTTTCAATCGTTCCCACTCTGCCGCTTATGCTTTAATCTCTTATCAAACGGCTTGGTTAAAAGCGCATTTTCCTTCTGCATTTATGGCGGCTGTACTGTCGGCTGATATGGATAATACTGATAAAGTAGTGAGTTTAATTGAGGAATGCCGACAAATGAAATTACGCGTATTGCCACCTCATATCAATACTTGTCGTTATCCATTTACTGTCGCTAGTCAGGAAGCAATTTACTATGGGTTAGGCGCATTAAAAGGCGCAGGCGATGCCGCATTAAGTAATATTATTGAAGAACGACAACAACAGGGTAAGTTTAAGGATTTATTTGATTTTTGCCGTCGTATTGATTTACGTAAAACTAATCGACGTGTGTTAGAAACATTAATTAAATCAGGTGCTTTAGATGGATTGAGTGAAGCAAATCAACCCAATAATCGTGCCATTTTATTAGCTTCTTTAGATACTGCAATTAAATTTGCTGAACAACATCATCAAACGAAAACAACGGGACAAAATGATATTTTTGGTGCGTTATTAAATAATTCTTCTACTGTCAAAGAAGAAATTTCACCTTTTGTCATTGTAGATGACTGGACAACAACTGAACGTCTTAACCATGAGAAAGATAGTTTAGGCTTATATTTTAGTGGTCATCCTATCGAACAGTATTTAACTGAATTAAAGGCACTAATCACTGCACGTTTGGCTAGTTTGAGAAGTGGAGAACGTGCAAAGGTTGCTGGGTTAGTTTTGCAAGTACGAATAGTGAATAGTAAGCGTGGCAAGATGGCTGCTTTAACTTTAGATGATAGCACAGCGCGTTTAGAAGTCATGGTTTATTCTGATTTATATCAAACTAAACGAGATATTTTGGTTAAAGATCAATTATTAATTATTGAAGGAGATGTTAAGGAAGATGATTATACGGGTGGCTATAATGTCACTGCAACAGAAATATTGACAATAGAACAAGCCAGAACTACTTATGCAAAACGCTTAGATATCACGATTTCTCCTACACAAGCGCATAATGGAGTAGCACAATCTTTATTAAACACGTTACAACTCCATCGTCAAGGCCAATGCCAAGTACGTATTTGCTATCAACATCCTCAAGCTGATGTCGAACTATTTTTAGGAAATCAATGGCAAATCAAAGTAAATCCGTTATTGTTAGAGCAAGTGCAACAATTATTAGGTGAAGGACGGGTTAATATTATTTACTAA
PROTEIN sequence
Length: 1588
MTARFIHLHCHTEYSLVDGIVRIKPLIKTIREMGMPACAITDHFNLFGLVKFYKAAQSNGIKPIIGVDLRFKTTHKEETPARITLLCQNSIGYHHLTQLISRCYLEGQIQGIPYLQKSWLQGHTEGLIALSGGIEGEIGQSLLMERHTVAQEQLVEWSSLFPQRFYLELQRIGQPQEESYIQAAVELALATSTPVVATNGVCFLRADDFEAHEIRVCINQGYTLNDQRRPRLYTAQQYLRTPDEMAELFADIPEAIENTWYIAQRCTLELSLGKNFLPEFPVPIGKTTEEYFTEQAKLGLEQRLLKQEIFLTDPQARIPYDERLQFELNVIQQMGFPGYFLIVADFIQWAKENRIPVGPGRGSGAGSLVAYALGITDLDPLRYELLFERFLNPERVSMPDFDIDFCMEGRDDVIKYVMQRYGKERVSQIITHGTMAAKAVVRDVGRVLGHPYGFTDQIAKLIPIELGITLDKALESEEILRNRYQQEEEVRTLLDMARKLEGITRNVGTHAGGVVIAPSQLTDFSALYWDNNPESNIVTQFDKGDIEAVGLVKFDFLGLRTLTIIKWALDNIAQFNDTPPPDILSIPLDDEDTFDLFKSGNTTAVFQLESSGIKKLVKRLKPDCFEDIVALVALYRPGPLQSGMVDDFIARKHGEAKIEYPHPDLAPILKPTYGVILYQEQVMQIAQVLAGYTLGGADLLRRCLSGSTQIVDAATGQLVTLKEIYVNASYWQGRLIFCLDLITQKILQQPIEAIYHNGIRDVWEITTKTKRKIRATADHLFYSLLGWQPLQKFNIGDTIGLAKTLPIQQNSIISDAQIKITAYLLGDGYLSPKKSSHSYFCNTNYELIEDFNLCATQLFGKPAPVDYQFHSGKKTVAYARVGFISAFNQWIDQHIKRALSQDKTIPTWVYSLSKQQLQLFLGTLWSTDGSFDTAIGHADYNSTSPQLIEQIQHLLLRLGIIALFNVKHTTYQDKPYVSYRAQVTGREDMLKFCELIQPYLSQEKAQFAIQCYHIVKNKQRNQSKHLIPAQVIQLIADAKRSSHMTWQQIDMAIGCKAGTMSSGLNFHVPPTRRLSRHRVYNFGIALQNEQLIQIAQSDVFWDQITQIAYVGQEEVFDLTIPKTHNFVANDFIVHNCMGKKNAVEMAQQRSTFVQGATERHVATEKSEYIFDLMEKFAGYGFNRSHSAAYALISYQTAWLKAHFPSAFMAAVLSADMDNTDKVVSLIEECRQMKLRVLPPHINTCRYPFTVASQEAIYYGLGALKGAGDAALSNIIEERQQQGKFKDLFDFCRRIDLRKTNRRVLETLIKSGALDGLSEANQPNNRAILLASLDTAIKFAEQHHQTKTTGQNDIFGALLNNSSTVKEEISPFVIVDDWTTTERLNHEKDSLGLYFSGHPIEQYLTELKALITARLASLRSGERAKVAGLVLQVRIVNSKRGKMAALTLDDSTARLEVMVYSDLYQTKRDILVKDQLLIIEGDVKEDDYTGGYNVTATEILTIEQARTTYAKRLDITISPTQAHNGVAQSLLNTLQLHRQGQCQVRICYQHPQADVELFLGNQWQIKVNPLLLEQVQQLLGEGRVNIIY*