ggKbase home page

ar4r2_scaffold_2008_6

Organism: ALUMROCK_MS4_BD1-5_23_16_curated

near complete RP 47 / 55 MC: 2 BSCG 47 / 51 ASCG 2 / 38
Location: comp(3539..7561)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
rpoC; DNA-directed RNA polymerase subunit beta' (EC:2.7.7.6) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 45.4
  • Coverage: 1274.0
  • Bit_score: 1145
  • Evalue 0.0
DNA-directed RNA polymerase n=1 Tax=uncultured bacterium (gcode 4) RepID=K2H2D1_9BACT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 61.2
  • Coverage: 1344.0
  • Bit_score: 1585
  • Evalue 0.0
  • rbh
Tax=CG_GN02-01 similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 62.4
  • Coverage: 1338.0
  • Bit_score: 1648
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

CG_GN02-01 → Gracilibacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4023
ATGTTTGATAAATCTTTAGATAATTTTCTAAATGACAAAATCACTGACTTTTCAGAGATATGACAAAATATAGGAAAAAAAGATATTACTGAAGGTAAAAATTTAGATAACCTTGCTTGAATATCTCTATGAATTGCAAGTCCTGAAAGAATTAGATCTTTATCTCATGGTAAAGTTTTGATAAGTGAAACTATAAACTATAGAACACAAAGACCAGAAAGATGAGGGTTATTTTGTGAACAAATATTTGGTCCTAGAAAAAACTATGAATGTGCTTGTTGAAAATATAAAAGAATAAGATACAAAGGTATAGTTTGTGAAAGATGTTGAGTTGAAGTAACTAAATCTTCAGCTAGAAGAGAAAGAATGGCTCATATTGATTTATATGCACCAGTAGCACATACTTGGTATCTTAAATCTGTTCCAGGTAGAATAGGGTTATTACTTGATTTACCTGTAAAAAAATTAGAACAAGTTGTATATTTTGCTTCATATATTATTACTGATGTTTATGAAGATAAATTACTTGAAGTAAATAAAGACTTAGAAGAAAAATATAAAGTTTCAAAAGCAGAAATGCAAAAAGAACTTCAAAGAGAACTTGGCGAATTAAAATCTAGAAAAGACTCAGGAGAATTAAATGATAAAAAATATAAAGTTGAAGAAGCAATTTTAATGTCAAAAATTGATGAGTTAACTGCTGAATTCGAAGAATTAAGAGCTTGATTAAAATCACTTCAAGTTTGAGCAATTATATGAGAATTAGAATATAGAGTTTTAGATGCAAAATTTCCACATGCATTTAAATGAGGTACTTGAGCTGAATATTTAAAATTATTACTTGAAAGAATAGATTTATTAAAATTTATTGAAGAACAAGAAATTGAATTAAAAAATTCTACTCAAATTAAACAAAAGAAAATACTTCAAAAAATTAAGTTAGCATCTAGCTTACTTAAATCAGGACAAAGACCTGAATGGTTTATATTAGAAGCACTTCCAATTATACCACCAGACTTAAGACCAATGATTCAATTAGATGGTTGAAGATTTGCAAGTTCTGACTTAAATGATTTATATAGAAGAGTTATAAACAGAAATAACAGACTTAAAAAATTAATTGAACTATGAGCACCTGATGTAATTTTGAAAAATGAAAAAAGAATGCTTCAAGAATCAGTTGATATGTTATTAACTGGTGAAACTAGAACTAATAGATCATGATTTGTTACTGCTAATAAAAAGAAATTAAAATCATTAACTGAAATTTTAAAAGGTAAACAAGGACGTTTCAGACAAAACTTACTAGGTAAAAGAGTTGATTACTCTGCTAGATCTGTAATCGTTGTTTGACCTTCTCTTAAAATTGATGAATGTGGTATACCAAAATCAATGGCTTTAATATTATTTAAACCTTTTGTTATTGGTAAACTTATAGAAGATGGTTTAGTTTACAACATAAAACATGCTGAAAAATTTATAGAAAAATCTGGAAAAGAAGTTTGGGATGCACTTGATGAAGTAATTGAGTGAAAATATGTTTTAATGAACAGAGCACCAACTCTTCATAGACTTTCTATACAAGCATTTAGACCAGTTTTAATTGAATGAAAAGCTATTCAATTACATCCTTTAACTTGTACTGCCTTCAATGCCGATTTCGACTGAGATCAAATGGCAATACATTTACCTATTACTGATCAAGCTCAAAGAGAAGCTCGTGATTTAATGGTTACTTCAAAAAATTTACTAGCTCCATCAAGTTGAGAACCAATAGTTGCACCAGGTCAAGATATGATTTTGTGAAATTATTATGTTACAGCTATACAAGAATGAGGTCTTTGAGAAGGTAAAGTTTTTTCAAATATAAATGATGTATGACTTGCATATGAAGCTTGAGTTTTAGGTATTAAATCTAAAATAAAAGTTAGAATAAATTGAGAGTTTGTTGATACAAGTTATGGTAGATTACTTTTTAACGAAATAGTTCCAGAAGGATTAGGATTTATTAATGAAACACTTAAAAAATGAGCAATTAAAAAAATTCTAGCTAGATCATTTGAAGAATTATGAGCTGAAGTTACTGCACAATTCGTAGATCAAATTAAAAATTTCTGATATAAATATTCTACTATTTCATGATTATCTATTTCTATAGATGATATGGTTACTCCTGAAAATAAAAAGGAATTATTAGCTGCTGCATGAGAAAAAGTAAAATATATCCAAAAGAAATGGTGGCTTGGTTTCATGACTGAAGATGAAAAATATAATCAATCAATTGTAGTTTGGGCTGAAGTTAAAAAAGTAATTGAGTCTGAATTAAAAGAATTATTCTTACCAAGTAATCATATATTTAACTTTATTGATTCTTGAGCAAGATGAAATCGGTGAAATATTACGCAATTATGTTGAATGAAAGGTTTAGTTGCTTCTACTACAGGTAAAACAATTGAACTTCCAATAAAATCTACTCTAAAAGAATGATTTTCTACTCTAGAATATTTTATTGCAACACATGGTTGAAGAAAAGGTAAATCAGATACTGCCTTAAAAACAGCACAATCTGGTTACTTAACAAGAAGACTTGTTGATTCTAGTCAAAATATATTAATAAAAGAAGATGATTGTCATACAGTTCATTGTAAAACAGTTGTTAGATGAGAAAAATCTTGAAGTTTTGATGAAAAATTTGAAGATAGAATTTATTCTCATACTCTTGCAAAAGATATAGTTGATGAAAATTGAAAAGTATTAGTTCCTGCTTGAAAAATAGTAGATACTAAAACTTTAGTAATAATCAATGCTAATAACATAAATAAAGTAGATATTAGATCAGTTCTTACTTGTGAATCTGAAGGTTGAGTTTGTAAAGCTTGTTATGGTTTAGATTTAGGTCTAAATAAAGAAGTTGAAATTTGAACTCCAGTTTGAGTAATTGCTGCTCAATCTATATGAGAACCTGGTACTCAGCTAACGATGAGAACTTTCCACTCTGGTTGAGTTGCGAAAGAAGGTTGAGATATGGCCCAAGGTTTATCAAGAGTAGAAGAATTATTTGAAGCAAGATCTCCAAAAGTTTCTGCTGAAATATCTGATATTGATTGAACAGTTCAAATTGAACAAATTGATTCTAATATTATTGTTAGAGTAATTGCTGAAAATTTATACAATGAAGAATATTATCATGAAGATAATTTTGATGTTGTAGTTAAAGTTGGTCAAACAATTAAAGCTAAACAAGTACTTGCTAAATCAAATATAGATAAACAAAAAATCGTTTCTTTATTTGCTTGAGAAGTTAAAAAAATAGAAGAATGAGTTATTATTGTTAAAGATTTAGAAACAAGAGTATATGAATATAGTTTTGATTTAGGTAGAAGATTATTGGTAAAAGACGGTCAAAAAGTAACAAAATGACAAAAAATAACTGAATGATCATTAAATTTACAAAAATTAAAAGATGTTGCTTGAGTTTTAGTTACTCAACAATATATCGTTGATGAAATCAAAGCAATTTATTCATCTCAATGACAAACAGTTAATTCTAAACATATTGAATTAATCGTTAGACAAATGCTTTCTAGAGTAAGAGTTACTTCTAAATGAGATACTGAATTCTTCCCATGAGATATCGTAGATATCATTAAATTTAAATCAGAAAATGCAAGATTAATTAAAGAAGGTAAAAAACCAGGTATAGCTGAAAGATTACTTTTAGGTATTACTAAAATATCACTTTATACTGAATCTTGGTTATCTGCTGCATCATTCCAAGAAACTGTTAGAGTACTTGTTGAATGATCTGTATCAGGTAAAATTGATAAATTTAAAGAAATGAAAGAAAACGTTATTATCGGTAGACTTATTCCTGCAGGTAAACAATATAGAAAAATTCATAATCAATCAACTGAAGAAGATATTGAAAGTCAATATTTTGATCCAAACGAAGATGATATCGATGTTTGAGAATTTCATCTTGAAGAAGTTATGAAAGATATGGAACACGAAAGTGATTTCTAA
PROTEIN sequence
Length: 1341
MFDKSLDNFLNDKITDFSEIGQNIGKKDITEGKNLDNLAGISLGIASPERIRSLSHGKVLISETINYRTQRPERGGLFCEQIFGPRKNYECACGKYKRIRYKGIVCERCGVEVTKSSARRERMAHIDLYAPVAHTWYLKSVPGRIGLLLDLPVKKLEQVVYFASYIITDVYEDKLLEVNKDLEEKYKVSKAEMQKELQRELGELKSRKDSGELNDKKYKVEEAILMSKIDELTAEFEELRAGLKSLQVGAIIGELEYRVLDAKFPHAFKGGTGAEYLKLLLERIDLLKFIEEQEIELKNSTQIKQKKILQKIKLASSLLKSGQRPEWFILEALPIIPPDLRPMIQLDGGRFASSDLNDLYRRVINRNNRLKKLIELGAPDVILKNEKRMLQESVDMLLTGETRTNRSGFVTANKKKLKSLTEILKGKQGRFRQNLLGKRVDYSARSVIVVGPSLKIDECGIPKSMALILFKPFVIGKLIEDGLVYNIKHAEKFIEKSGKEVWDALDEVIEGKYVLMNRAPTLHRLSIQAFRPVLIEGKAIQLHPLTCTAFNADFDGDQMAIHLPITDQAQREARDLMVTSKNLLAPSSGEPIVAPGQDMILGNYYVTAIQEGGLGEGKVFSNINDVGLAYEAGVLGIKSKIKVRINGEFVDTSYGRLLFNEIVPEGLGFINETLKKGAIKKILARSFEELGAEVTAQFVDQIKNFGYKYSTISGLSISIDDMVTPENKKELLAAAGEKVKYIQKKWWLGFMTEDEKYNQSIVVWAEVKKVIESELKELFLPSNHIFNFIDSGARGNRGNITQLCGMKGLVASTTGKTIELPIKSTLKEGFSTLEYFIATHGGRKGKSDTALKTAQSGYLTRRLVDSSQNILIKEDDCHTVHCKTVVRGEKSGSFDEKFEDRIYSHTLAKDIVDENGKVLVPAGKIVDTKTLVIINANNINKVDIRSVLTCESEGGVCKACYGLDLGLNKEVEIGTPVGVIAAQSIGEPGTQLTMRTFHSGGVAKEGGDMAQGLSRVEELFEARSPKVSAEISDIDGTVQIEQIDSNIIVRVIAENLYNEEYYHEDNFDVVVKVGQTIKAKQVLAKSNIDKQKIVSLFAGEVKKIEEGVIIVKDLETRVYEYSFDLGRRLLVKDGQKVTKGQKITEGSLNLQKLKDVAGVLVTQQYIVDEIKAIYSSQGQTVNSKHIELIVRQMLSRVRVTSKGDTEFFPGDIVDIIKFKSENARLIKEGKKPGIAERLLLGITKISLYTESWLSAASFQETVRVLVEGSVSGKIDKFKEMKENVIIGRLIPAGKQYRKIHNQSTEEDIESQYFDPNEDDIDVGEFHLEEVMKDMEHESDF*