ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

ar4r2_scaffold_567_6

Organism: ALUMROCK_MS4_BD1-5_24_33_curated

partial RP 47 / 55 MC: 2 BSCG 38 / 51 MC: 2 ASCG 4 / 38 MC: 2
Location: comp(4549..9645)

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
hypothetical protein n=1 Tax=Spirosoma panaciterrae RepID=UPI000370B6FD similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 27.4
  • Coverage: 755.0
  • Bit_score: 159
  • Evalue 2.80e-35
Conserved repeat domain protein {ECO:0000313|EMBL:EIJ36029.1}; Flags: Precursor;; TaxID=870187 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Thiotrichales; Thiotrichaceae; Thiothrix.;" source="Thiothrix nivea DSM 5205.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 30.7
  • Coverage: 420.0
  • Bit_score: 137
  • Evalue 9.30e-29
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 27.4
  • Coverage: 532.0
  • Bit_score: 131
  • Evalue 1.30e-27

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Thiothrix nivea → Thiothrix → Thiotrichales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5097
ATGAAAAAGTTATATATATTTTTAATATTAATAATACTAGCTATTGCAAGTATTTCTTACAGTAGTGCTGACTATTCTTGTGATCAAACATTTCAATCAGTAAAACTTCGTAAGTGATTTTCTTATGGTTTTAATGATAGTTATGTGAATCCATATTTAAGCCAGTTAAATAGTTTTTCAGTTTCTTTTACAGAACAATGAGATATAAATTGAGCTTCAAATCCAAGTTTTAATTGGACTCCAGAAGTAGTAAGTCAAAACTATCTTATTCAGCCAAATACAAATACAAAAATCATATCTTGAGCACCAAGATATGATATATTGTATAATCCTGTAAGAAGACAGTCGGATAATATTTATATAAAGTATACTCTTCAGTATAGAGAAAAAGTAAATTGAGTAATTAAATGACCCTATTTTCATACTGAATGTCAACCATATGAAATCACTTGGTGTTGAGATTGAATAAAAGATAACTATACAGACCCAACTTGATTTCAAGTTGCAGAAGCTTGTGATCCAGCTGATGCAAGCCACTCTGGTTGGGGAACTGGATGATGTCATCCTACTACTTGTCAACCAATAGTTGCTGACCCAGTTTGTAAAGGGATTACAGTAGATCCAAATAAAGGTCAAATGCCTTTGGATGTAAATGTAAGTTGTATATGAACTTTTGCTGACACAATCACTATTGATTGTGGAAATGGAGTTACACAGGATTTTACATGAAACAAATCTTGAGACAAAACTGTAAATAAAGTATGTAAATATACTACAGCAAAAACATATACTCCTGTTTGTAAAGTAAATTGACAAACACCTATTAGAGTATGTCAATGAAGTGTAGAGGTTACTGCTCCAACTCCAAGTATTCAAATAGTAAAAACAGACTTGAATACTGCAGATAAAGATGGAACAGTTGAGAATGATACTCAAACAGTTGTAAAATGAGCAGAGGCCATTTTTAAAATTACTGTGACTAATAATGGAACAGAAGATTTAAAAAATATTGTTTTGACTGACACTATTGCTCCTAATTGTGCTTGAAGTGTAACTTTACCAAATACAAAACCAGCTAGTTTTGAAAATTTCCAAGTATATGGTTCTTGAGACCATAATGATAATTTATTACAACCTTGAGAAAAATTTAGTTATACTTGTAAAAAATGAGATACACAAAATAACTATACTAATACTGCAGATGTTTCAGCTAAATGAAATGTAACAGGAAATGATGTTAATGCTACTGATCCAACTCAAGTAAAAGTTGTAGATCCAGTTTGTGAATCTTTAACTGTAGATCCAAGTGAAAGTAATGTAACTTTTACTTCAAACTTTGTTTGTAAATGAAAATATGCAGATAAATACAAAATAGAAGTAAAAAATTCTGCTTGAACAGTTATCAAAACTATTTCTCAAGATACTTGAAGTCATAGTTTTGCTACAGCTTGAGATTATACAGTAAGTTGTTATATAAATGATAAAACAACAACAGAACAGGCTTGTATAAAACCTATAAAAGCTAATCCTAGTCCTGAACCTAGTATTTTAATACAAAAATTTTCAGATAATCCTAATGACAGAGATTGAGATAAGAGACATACTCCAGCTGATGATTCTCAAACTATTTATAAGTGAGGTGATTCTGTTTTTAAAATCAGAGTTACAAATAATGGAACTGAAAATTTAAATAATATAGTTTTAACAGATACACTTGCTCCAAATTGTTGAGGAAATGTAGTTTTACCAAACATAAAACCATCAACTTTCTCAAATTTTGTTGTTTGATGAAATTGAAATAATACAAATAATGTCTTAGAACCTGGAGAATATTTTGAATATACTTGTAGTAAATCAAATATTCAAGCAAATTATACCAATACTGCAAAAGTTGATGCAAAATGAGTAACAAGTACAGATCCTGTTACTTCTAATGATCCAACTGATATAAAAGTAGTTGAACCAGTTTGTAACAGTTTAACTGTTACTCCAGACTCTGGAAGTGTGGCATTTACTTCAAGTTTTACTTGTGCTGGAACAGAAGTTGATACTTATAAAATACTAGTAAAAACTTCTACTTGAGGAATTGTGCAAACTATTAATTCAAATGTTTGACAATACAATTTTACAGCATCTGGTTCATATTTAGTAGAATGTTATATGAATACTGAAACTACAACTGAAGATGCTTGTAAAAAAACTATTACTGCAAATTCTTCAGTAGAACCGAAAATTGCTATAGACAAAGTTGATGCAAATGCTTCTTTAGATAAAGATTGAGTTGTTTGAAATGATACTCAAACTTTGGTATTGTGAAATAAAGCAGTATTCAAAATTAGAGTTACAAATAATTGAACTGAAAGTCTAAAAGAAATTAATCTAATTGATACTATTGCTCCTAATTGTGCTTGAAGTGTAACTTTACCAAATACAAAACCAGCTACATTTTTAACATTTTCTACAGCTTGAGAAGGGGATCATACAAATAATATATTAGAAGCTTGAGAGTATTTTGAATATACTTGTGAAAAAGATAATACACAATCAAGTTATATGAATTCAGCTACAGTTAATGCTAAATGAAATTCTAGTAATAGAGATGTTACAGCAACTGATACAACACTTGTAAATACTTCTATTTATGATTTAGCTTTGATTAAAAAAGTAGTAAATCCTAAAACTTCTTATTCTAGTTGAGAAACAGTAACTTTTGAAATAACAACATATAATCAATGAACTATTGATGCAAATGATGTTATTATTACAGATTATATTCCAACTTGACTTACTTTACAAGATACTTCTTGGACACAAAGTGGAAGCTTAGCTACTAGAAATATTGGTTCTATTATCAAATGACAAAATAAAGTAGTTACAATTACTTTCAAGATTTCTGCAATAAGTTGAGATATTCTAAACTGGGCAGAAATATCAAGTGATAATTGAGATGATATAGATTCAACTACAGATCAAAATAATACAGATTGTAATTGAGATTCTACAACTGATAGGACAAGATTATGAAATTGAGATGATTATATTTTATGAAATGCTAAATTAAATGCTTGTTGAACACAATCTTGAGATGAAGATGATCATGACTGAGCAAAAATAACTGTGAGCCAAACTCCAGTCTATACTTGTACTAATCTTGATACAAGTGCTATTTCTTGAAATGTAAGTTTTACTTCTAATTTTACTTGTACTTGAAACAATGCAAATTCTTATAAAATAGAGTTAAAAGATTCTTCTTGAAACTTAGTCTATACAAGTACTAGTTCTACTTGAGCATATAATTTTGCAAATACAGGAACTTATACAGCAATTTGTTATGTGAATAATGAAACAACTCAGACAAATTCTGCTTGTGTAAAAACTATTACTGCTTCAACTTGAGGTGGTGGATGAGGTGGTGGATGAAATTCTCCAATTTGTGAAGATACTTATATTCTTTCTCATACTCCATCTACTTGAAGAACAGTTCCTGACTCTGCTTGACATACAAAAATAGTTTCGTTTTCGGGATCTAGTTTAGATGTAAGAGTTTTATGTGATTGAAACTGAAGTTCTAATCAAGTGAAAATAGATTGTTGAAATGGAACGAGCCATATAGTTCCAGTTAATTCTAATAATGAAAGAAAGTGAGAGGCTACTTGTAGATATACTTCTCAAAATACTTACAAAATAAAATGTGAAGTTAGTCCAGATTTAAGTTGATGAAATGCTTTCGTTTGATCTTTAGCTTGTCATGCTGATGTATTAATTTGAAGTTGAAGTCCTTGAGGTGGTGGTGGTTGATGAGCAGATCCTTCTTGTTGAAACGGAATTGTTGAGACTTGAGAAGAATGTGATTTTTGAACTAGAAATTGAAACTTTTGAGTAAAATGTTCTACAAGTTGTGATTATAATAAAACTGTTCCAACTTGATGAGATATGACATTTTATCCAAGTTGAAAAGTAATAATGTGAGGACAATACTTATTTGATTATCCAGGTCAAACTTGATTAATAGATTGAGATGATATTTACATAAAAAATACTTGAACTTGAGCTAATTTATGAACTTTGAAATTTGATATACCTTTATGTATTTATAAAAAAACTCCTAATGATAATATTGTTACTCCAAATATTGAAAAATATTGTAATACTACAAATGTTTGATATATTTTCCCTTGAGAAACTAAAAAATTAAATATTAGAGTTCCTTATAAATGAAATACAATTGCAGCAACTGCAAATTGAAGTAAATCTGAATTAAATGTAACTTTAGAATGACATCAAGCTTCATACTTTGCATCAAAACTTGATATAACTGTTGTTAAACCAACAATTATAACAACTTGAGGTTGAACAACTTATTTGAATAAACAAGTTTGAAATGTTGCAGAATCTGCAAAAACTGCTTGAAAAAATTCTATTGCAGATAAAAATAAAAACTTTGTTTCAACAGTATTATGACCACAAAATGATTTAAGTTTTGTAAAAACAGTTACTGATACAAATAAAGTTGAAAAAACAGCTAACGAATGAACAAAATATTCAAGTTGAGCAAGTAATGTTGTTAAATCTACTTGAAATACAACAAATTGAACTGGAACTTTGAACGATGTAAAAAGTTATAATTGAATGTCTGATGTATTTATTTTAAAAGATAAAAGTTTAAAAATAGATTCACTTTCTAGACTACAATCTATAACTACTCCAACAACATACATTGTTGAAAATGGTAATTTAGAAATTTTAATAAATATAGAGAATATTCCACAAAATATTGCATTTGTTGTAAAAAATTGAAATATTATTGTTGATAAAAATGTTAATGTTTTAGAATGAACTTATATAACAATTCCTTGAACAGTTTGATGAAAAGTTATGTCTAATTGAGAAAATAATACTTCTCCTTTGAAATTGTCTTGAACTGTTTATTGAGATTTAAATAACTTAATAGACAATAGAACTTTTGTAAAAGAAGAAGCTTGAAAAATCTCAGTTTGAACTGTTGTAAACTTTGGTTCTTCTTTACTTAAAAAACCAGCACCACTTATTTCAAGATTTATTTGAGAATATATGGATGCTACAAAAACTGCTAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1699
MKKLYIFLILIILAIASISYSSADYSCDQTFQSVKLRKGFSYGFNDSYVNPYLSQLNSFSVSFTEQGDINGASNPSFNWTPEVVSQNYLIQPNTNTKIISGAPRYDILYNPVRRQSDNIYIKYTLQYREKVNGVIKGPYFHTECQPYEITWCGDGIKDNYTDPTGFQVAEACDPADASHSGWGTGGCHPTTCQPIVADPVCKGITVDPNKGQMPLDVNVSCIGTFADTITIDCGNGVTQDFTGNKSGDKTVNKVCKYTTAKTYTPVCKVNGQTPIRVCQGSVEVTAPTPSIQIVKTDLNTADKDGTVENDTQTVVKGAEAIFKITVTNNGTEDLKNIVLTDTIAPNCAGSVTLPNTKPASFENFQVYGSGDHNDNLLQPGEKFSYTCKKGDTQNNYTNTADVSAKGNVTGNDVNATDPTQVKVVDPVCESLTVDPSESNVTFTSNFVCKGKYADKYKIEVKNSAGTVIKTISQDTGSHSFATAGDYTVSCYINDKTTTEQACIKPIKANPSPEPSILIQKFSDNPNDRDGDKRHTPADDSQTIYKGGDSVFKIRVTNNGTENLNNIVLTDTLAPNCGGNVVLPNIKPSTFSNFVVGGNGNNTNNVLEPGEYFEYTCSKSNIQANYTNTAKVDAKGVTSTDPVTSNDPTDIKVVEPVCNSLTVTPDSGSVAFTSSFTCAGTEVDTYKILVKTSTGGIVQTINSNVGQYNFTASGSYLVECYMNTETTTEDACKKTITANSSVEPKIAIDKVDANASLDKDGVVGNDTQTLVLGNKAVFKIRVTNNGTESLKEINLIDTIAPNCAGSVTLPNTKPATFLTFSTAGEGDHTNNILEAGEYFEYTCEKDNTQSSYMNSATVNAKGNSSNRDVTATDTTLVNTSIYDLALIKKVVNPKTSYSSGETVTFEITTYNQGTIDANDVIITDYIPTGLTLQDTSWTQSGSLATRNIGSIIKGQNKVVTITFKISAISGDILNWAEISSDNGDDIDSTTDQNNTDCNGDSTTDRTRLGNGDDYILGNAKLNACGTQSGDEDDHDGAKITVSQTPVYTCTNLDTSAISGNVSFTSNFTCTGNNANSYKIELKDSSGNLVYTSTSSTGAYNFANTGTYTAICYVNNETTQTNSACVKTITASTGGGGGGGGGNSPICEDTYILSHTPSTGRTVPDSAGHTKIVSFSGSSLDVRVLCDGNGSSNQVKIDCGNGTSHIVPVNSNNERKGEATCRYTSQNTYKIKCEVSPDLSGGNAFVGSLACHADVLIGSGSPGGGGGGGADPSCGNGIVETGEECDFGTRNGNFGVKCSTSCDYNKTVPTGGDMTFYPSGKVIMGGQYLFDYPGQTGLIDGDDIYIKNTGTGANLGTLKFDIPLCIYKKTPNDNIVTPNIEKYCNTTNVGYIFPGETKKLNIRVPYKGNTIAATANGSKSELNVTLEGHQASYFASKLDITVVKPTIITTGGGTTYLNKQVGNVAESAKTAGKNSIADKNKNFVSTVLGPQNDLSFVKTVTDTNKVEKTANEGTKYSSGASNVVKSTGNTTNGTGTLNDVKSYNGMSDVFILKDKSLKIDSLSRLQSITTPTTYIVENGNLEILINIENIPQNIAFVVKNGNIIVDKNVNVLEGTYITIPGTVGGKVMSNGENNTSPLKLSGTVYGDLNNLIDNRTFVKEEAGKISVGTVVNFGSSLLKKPAPLISRFIGEYMDATKTAK*