ggKbase home page

ar4r2_scaffold_208_4

Organism: ALUMROCK_MS4_BD1-5_24_44_curated

partial RP 47 / 55 MC: 2 BSCG 34 / 51 MC: 1 ASCG 0 / 38
Location: 3524..7795

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Laminin G sub domain 2 n=1 Tax=Krokinobacter sp. (strain 4H-3-7-5) RepID=F4AY48_KROS4 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 25.1
  • Coverage: 1023.0
  • Bit_score: 224
  • Evalue 4.50e-55
MAM protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 26.2
  • Coverage: 1117.0
  • Bit_score: 226
  • Evalue 2.60e-56
Laminin G sub domain 2 {ECO:0000313|EMBL:AEE18315.1}; TaxID=983548 species="Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Dokdonia.;" source="Dokdonia sp. (strain 4H-3-7-5) (Krokinobacter sp. (strain 4H-3-7-5)).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 25.1
  • Coverage: 1023.0
  • Bit_score: 224
  • Evalue 6.30e-55

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Dokdonia sp. 4H-3-7-5 → Dokdonia → Flavobacteriales → Flavobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4272
ATGATAAAGATTAATTTTTTTAAAGTCCTAAAAACTATACTGATATTTTTTTTATTATTTATAGTAAAAAATACCTATGCCTCTACATGAACTTGGGATTTTACATCAACAAGTGATTATACAATATCTTCATCAACAGGTATATCTATAACATGATCTTTGGCAACATTAAATAGAGTATCAATTGCTCATACTTGAGTTTTATCAAGTACACTAAATTTAAGTTGAGCCTATGATGTTGTAGTAGACTGAAGTTATGCATATGTTTCAGATTATGTGTGAAATAGAGTTGCAATATTAAATATTTCAAATCCATCATCACCAACTTTAGTAACTACCATAAATAATAACTGATGAACAATTAGATTAGCTTGAGCTTCTTGAATAGTAAAAGACTGAAATTATCTGTATGTAGCATCATATACTAGTAATGCTTTACAAGTAATAGATGTTACAAATCCAGCTTCTCCAATAGCTGCTTGACAAGTTTATAACGCTACAACAATGGCATGAGCAAGATGACTTACAAAAGTTTGAAATTATGTTTATGTATGAGTATTTACATATGATGCACTCCAAGTAATAGATGTTACAAATCCAGCATCTCCAACTATATTTGGAACTTATAGAAAAACTACAAAAATGAACTGAGCTAGTGAAGTAAAAATATACTGAAATTATGCCTTTGTTTCTTGTTATAATAGAGATGCCTTATCTGTGATAAATATATCAAATCCAGGATTACCAACTTATGTAACTCAACTTCGTGATTCAACAAATTTAAATTGAGCAAGAGATATTGTCATAACATCTGATTGAAATTATGCATATGTTTCAGCCTATTTAAATAACTCTGTAAGAATAATAAATATATCAACTCCTACAACACCTGCTGCAATATGAAATATATCTTGATGAAGTTATCTTATAAATTGACCTAGAGATCTTGATATAAGTTGAGATTATTTGTATATTGCTTGATATACTTCAAATGCAATAAATATTGCAAATATATCAACACCAACAGCCCCAGTATATGTTACTAGAATAGTACATAATGCATCAAATCCTTTACTTCAGTGAGCTGGCTGATTATTTGTGTCTTGAGATCTAATATATGTAGCATCTTATACTAGTAATGCACTAGAAGTTCTTAGATTTATGTATGATACATCAAGTCCATATTTACAACCAACAACAGCATTCAATTATTGAACTGTAAATAATTTGCTAACTTTCTCTCAAACTCTCTGATCTTGAAATGAGTGAACTATTACATATCAAATATCAAAAAATAATTGAACAACTTGGTATTATTGGAACTGAACTGCTTGGACAGCTACAACAGGATGAGTAGCAAATTCAAGTAGTGCATCAGTGATAAACACAAATTTATCTTCATTTAACTTAGTTTCATGATGAACTTGAAATTTTACATTTAAAGCTTTTCTTACATCAAACTGAGTTCAAAAAATTGAGTTAGATAAAGTAGATATTATAGCTAGTGATCCTGCAAGTCCTTGATGAATAACTGGTATGGCTTTTTGGTTAAAAGCAAATAAATGAACGAGTTCAACAACAGATTGAGCATCTATTACAAGTTGGGCTGATCAATCATGAAATTGATATGATGCAGCAACTTGAGTTGCTCCAACTTATATAAATAATGATACAAATAATCTAAATTATAATCCTCTTGTATATTTTAATTGAAGTACATACTTAGAAAATTTAAATAATTGATGAAATTCAAGAAGTTACTATATTGTAATTGTACCAGATAGTCAGGTTAATTGAACAATCACATGACAAGCTCCATTATGATTTGATTGTACATCATGAGTTTTAAGTTCATGAACTTGTTGATTACCTTTTGCTTGATCAGTACTTTGAGCATTTACAATTTCTATGAATGATGAGGTTATAAGTCATGCAATATGAGCAAGTACAGCCCGGAGATCAGCTCAAATTTGAGCATACTCTTATGATGCATTAAAACCTATGTTAATATCATATAATGAAAATTCTTCAGCAGATTGAACTGACTTGTATGAAAAATGAATAAAAATTGATAACTATACTACAAACACATATCAAACATTATCAACTGCAGATTATAGAATTTGAAGAAGTTTAGATCCAGCAAACCCTTTCCCATATACATGAAGAGTTGCAGAAGTAATAGATTACTCTACAAGGCTATCAGATACTGATAGACAAAAAGTAGAATCTTACTTATCATTAAAATATGGTATAACATTAAGTTGATGAACTCTAAATTACATAGCATCTGATTGAACAATAGTTTGGAATACTGCTACAGCATGAATATATAATTATAATATATTTTGAATTTGAAGAGATGATTCAAGTTGACTAGGTCAAGTTAAATCAAAATCAAGTAATTCAAGTTCTATAATTACAATTGAAGCAATTTGAGAATGAACAAATATGACTAATAGTTTTGTAGATATTGTAGATAAAGAGTTTTTAACTATTTCAAATAATAATTGAAGTAATACATGGACTCAAACATGAAATCCAACTTGATATGAAATACTTACTCGTAAATGGAAAGTTCAAGAAACTTGAGATGTTTGAACTTTAAACTTGGATTTTGATGTTTGAAATTCAAATTTTGACATCCCTATATATAGTTCTTGAAGTGTATATTACTTTATTTACGATACAAACACAAATTGATTATTATCTGATGAAACTCCCATTGCTATGACAAATACATCATGAAATATATGGAGAATATCAGGTTTAAGTTTATCAAGCTGACAGATATTTACATTAGCTTGAGTTACTTCTTCAAACAGTATTCCAACAAATATAACTTTATCAAGCAATACAATAAATGAAAATGTTGCTGCAGGATCAACTATATGAACATTATCGACTACTGATTCAGATTCTTGAGATACACATACATATTCATTTGTATCTTGAATTTGAGATACTGATAATTGAAGTTTTACACTTTCATGAAATATACTTAAAATAAATGAGTCTCCAGATTATGAGATAAAAAATACATATTATATAAGGCTTCAAACAGATGACTGACATTGATGACAATTTCAAAAACAGTTTATTATATATATAAATAATGTATGAGAATCAATTAACTCAATAATAGATTTTGAAACAACTTGAAAATATACTGTAACATCATGAATATGGACTAGAGTAACCACAAATCCATATGAATGATCATACTCAATACAAAGTAATAATCAATCACTAGCTAATTCTCAATCATGTTTTGAAGTAAATAATACATTTTATTGATGAACTTGAACTATATCGTTTTATTATTATGTATCATCTCAATCTTGATGAGATTATTTAAGATTTTATATAGATAATGTCGAACAACAAGCATGGTCATGAACTGTTCCTTGGACATTATATACAAATTCTTTAATATCTGTATGAAGTCACACTTATAAATGGTGTTATATAAAAGATTGAACTATAAATACTTGAACAGATAACGCATATGTAGATTATATAACTTTTATTAATAACAATGATTTAATTCCACCTGCAATAACAAGTACAAATTATTCAAGCTGATATTTATTACCTTGATGAAATCATAGTTTAATAATTTACTATAATGATGTTTCTTCTTGAGTAAATACTTGATCAAGTTTGATAAGTCTATATAAATGGAATTGAACAGCTTGGTGAAGTGATATAGCATCAACTGGTTTAAATCTTGCGTGAAAAATTATTACAACTACACAAGCAACATATTCAACAAACAATTTAGTTTATTGAAAATACTACTATAATTTTCAAATTTCAGATAATATGGCAAATATATCATCTACTTGAGTAACTTTTTATATAGATGAACCTGAAATAATTATAAATACTTGAGCTTTAGATTTATGAAATATTTCTTACCATGATTGATTGAAATTTTCATCCTGAGAATTAATTGCTACAATAAAAACTGTTTGAGCATCATTTCAATTAGAGTTATTAAAAAACACTGATCTTTTAACTTGATCTTGATCTATAATAATTGATTGGGATTGAAACAGTTGAGTTTGATATGATAAATCACCATATACTTATGTAAATAAAAATATAACAACTTACCCTGTTCTTTGATCTTGATCTAAAAATATTAATACAAATTGAGATAAAAACACTTATACATTTCCAATAAAGATTGGTACACTTATATGAGAAGAGCAAACAGCATGAACATATAATATGAATATAGGTTTTAGAGGTATTTTTTGATATTAA
PROTEIN sequence
Length: 1424
MIKINFFKVLKTILIFFLLFIVKNTYASTGTWDFTSTSDYTISSSTGISITGSLATLNRVSIAHTGVLSSTLNLSGAYDVVVDGSYAYVSDYVGNRVAILNISNPSSPTLVTTINNNGGTIRLAGASGIVKDGNYLYVASYTSNALQVIDVTNPASPIAAGQVYNATTMAGARGLTKVGNYVYVGVFTYDALQVIDVTNPASPTIFGTYRKTTKMNGASEVKIYGNYAFVSCYNRDALSVINISNPGLPTYVTQLRDSTNLNGARDIVITSDGNYAYVSAYLNNSVRIINISTPTTPAAIGNISGGSYLINGPRDLDISGDYLYIAGYTSNAINIANISTPTAPVYVTRIVHNASNPLLQGAGGLFVSGDLIYVASYTSNALEVLRFMYDTSSPYLQPTTAFNYGTVNNLLTFSQTLGSGNEGTITYQISKNNGTTWYYWNGTAWTATTGGVANSSSASVINTNLSSFNLVSGGTGNFTFKAFLTSNGVQKIELDKVDIIASDPASPGGITGMAFWLKANKGTSSTTDGASITSWADQSGNGYDAATGVAPTYINNDTNNLNYNPLVYFNGSTYLENLNNGGNSRSYYIVIVPDSQVNGTITGQAPLGFDCTSGVLSSGTCGLPFAGSVLGAFTISMNDEVISHAIGASTARRSAQIGAYSYDALKPMLISYNENSSADGTDLYEKGIKIDNYTTNTYQTLSTADYRIGRSLDPANPFPYTGRVAEVIDYSTRLSDTDRQKVESYLSLKYGITLSGGTLNYIASDGTIVWNTATAGIYNYNIFGIGRDDSSGLGQVKSKSSNSSSIITIEAIGEGTNMTNSFVDIVDKEFLTISNNNGSNTWTQTGNPTGYEILTRKWKVQETGDVGTLNLDFDVGNSNFDIPIYSSGSVYYFIYDTNTNGLLSDETPIAMTNTSGNIWRISGLSLSSGQIFTLAGVTSSNSIPTNITLSSNTINENVAAGSTIGTLSTTDSDSGDTHTYSFVSGIGDTDNGSFTLSGNILKINESPDYEIKNTYYIRLQTDDGHGGQFQKQFIIYINNVGESINSIIDFETTGKYTVTSGIWTRVTTNPYEGSYSIQSNNQSLANSQSCFEVNNTFYGGTGTISFYYYVSSQSGGDYLRFYIDNVEQQAWSGTVPWTLYTNSLISVGSHTYKWCYIKDGTINTGTDNAYVDYITFINNNDLIPPAITSTNYSSGYLLPGGNHSLIIYYNDVSSGVNTGSSLISLYKWNGTAWGSDIASTGLNLAGKIITTTQATYSTNNLVYGKYYYNFQISDNMANISSTGVTFYIDEPEIIINTGALDLGNISYHDGLKFSSGELIATIKTVGASFQLELLKNTDLLTGSGSIIIDWDGNSGVGYDKSPYTYVNKNITTYPVLGSGSKNINTNGDKNTYTFPIKIGTLIGEEQTAGTYNMNIGFRGIFGY*