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BD02T64_scaffold_22_196

Organism: BD02T64_Colwellia_psychrerythraea_38_180_partial

partial RP 29 / 55 MC: 4 BSCG 30 / 51 MC: 3 ASCG 10 / 38 MC: 1
Location: 228865..231972

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
transporter n=1 Tax=Colwellia piezophila RepID=UPI0003781724 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 85.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1753
  • Evalue 0.0
Transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family {ECO:0000313|EMBL:KGJ97056.1}; TaxID=28229 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Alteromonadales; Colwelliaceae; Colwellia.; similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 85.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1757
  • Evalue 0.0
hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 85.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1747
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Colwellia psychrerythraea → Colwellia → Alteromonadales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3108
ATGATCAGTAAAACCTTTATACACCGACCTAAACTTGCCTTTGTTATTTCAATCGTTATTTCTTTAGCGGGTTTGATTGCGATGGGGGTATTGCCGGTAAATATGTATCCGGAAATTACTCCGCCGCAAATACAAATATCTGCAGTATATCCAGGCGCGAGTGCACAAGTTGTAGAAGAATCTGTTATTCGCCCCATTGAAGAGCAGATTAATGGCGTAGAAGATATGATGTATATTGACTCTTCTGCATCGAATAATGGTAGTGCCGTTATTACCGTCTACTTCAAAGTGGGTACGGATGGCGATATTGCCCAAGTTAATGTGCAAAATAGGGTTGCGCTCGCTACGAGCTCATTACCTGCAGAAGTGACTCGACAAGGCGTAAATGTAAAGAAAAAATCTAGCGCTATGTTACTCGGTATTAACTTATATTCTGAACAAGCTGCCATCGACCAATTATTCTTAAGTAATTATGCAAGTAATTATTTAACAGAGCCTTTAGGTAGAATCAAAGGCGTTGCATCTGCAGAGATTATGGGCGCAATGACCTATAGTATGCGAATTTGGTTAAACCCAGATCGTATGTCCTCGCTAAACGTCACAGTTAGTGAAGTGCAGCAAGCGCTTAAAGAACAAAATATGATTGTTGCTGCGGGAAAATTAGGCTCTAGCCCATCTGTGCCGAACCAACAATTTGAATACTCAATTCAAGCACAAGGCCGTTTGAAAAGCCCAGAAGAGTTTGGTCAGACAATTATCAGAGCCCAAGAAAGTGGCAACTTTGTCCGTTTGACGGATATTGCTAAAATTGAAATGGGCGCAGAAGACTATGCAACCAAGGCACGATTAAATGGCAAGGATACCGCTTTTTTAGTTATATATCAGTTGCCTGATGCTAATGCTACAGAAGTTGCTGATCTAGTAAAAGCTGAAATGCTTAAATTGTCTGAACGATTTCCTGATGGCTTAAATTATGTTGTGCCTTTTGATACCACTGAATTTATTGATCGCTCAATGGAAGAAGTAAAAGTAACTTTATTTCAGGCTGTTGCCCTTGTTATTTTAGTGGTGTTCTTATTTTTACAAAACTGGCGTGCCACAATTATTCCTACATTAGCTATCCCCGTATCATTAATTGGCACGTTTGCTTTTATGTTGTTAATGGGATATTCCATCAATACTATTACTTTGTTTGGTTTAGTATTGGCAATTGGTATCGTGGTTGATGATGCCATCATTGTTATTGAAAATGTAGAACGGATCCTAAAAGAAGAACAGTTACCTATTAAAGAAGCCGTAACTAAAGCTATGGAGCAAGTTTCAGGGCCTATTATAGCAACGACATTAGTATTATTGGCGGTATTTGTACCGGTTGGTTTTATGCCTGGCATTACCGGGGAGCTATATAAACAATTCTCTGTAACGATTTCTTTCGCTGTCATAATCTCTTCAGTTAATGCATTAACATTAAGTCCTGCCTTGTGTGTTGTTTTATTATCAGAAAAAAATATGAAACCAATTTCATGGTTACAACCTATGGAGCGATTAATAGCACGAATGACGGGTGGTTATACTAAAACCGTAAACTTTTTGTTAAAGCGAGTAGTAAGAGTAAGTTTGTTCGTTGGTGTTCTTTTTGCTAGTGCAGGTTGGTTAACGAGTACTGTTCCTACGGCTTTTTTACCAGGAGAAGATCAAGGCTACTTATTTGTTGATATTCAACTTCCTGACGCTGCTTCAACTAACCGAACTCAAGCCGTAATGGATAAAATATCCCCAATCATTACTAATGACCCAGCTGTTGAAGATATTATAACGGTTAGTGGCGTTTCGCTGCTTGGTGGGCCAGGCTCGAATAATGGCTTAGCCATTATTCTTTTAAAGGATTGGGATGAAAGAACAGCCCCCGAACTTGGTTTGAGACAGGTAATCCCTCGATTAATGGGACAACTTTGGTCTATGCCGGAGGCGCAGATTATGGTTTTTAACCCTCCGCCAATTCCAGGGTTAGGTAACAGCTCAGGTTTTGAATTTCAATTACAAGATAGTGAAGGTAGAGATCCTGCCTTGCTTGCACAAGTAATGAATGGCTTTATTTATGAAGCTAATCAACGTCCTGAATTGAATCGAGTGTTCAGTACCTTTAGGGCAAACGTACCGCAATACTTTCTAGAAGTTGATCGCAACAAAGCTAAAGCTCAAGGTGTTGCGCTATCTGATATTTTTGTTACCTTACAAGCACAACTTGGTTCAATGTATATAAACGACTTCAGCCAGTTTGGTCGTACTTATAAAGTGACTATTCAAGCGCAACGAGAGTTTCGTAAAGACCCAGCAGACTTGCGGCATTACTACGTACGTAATAAAGATAATGACATGGTGCCGTTAACAACATTGGCTAAGCTTACTCCTATCTTAGGGCCAACTACTATTAAGCACTTTAACCTTTATCGAAGTGCCAGTATTTCAGGACAAGCAGCTTTAGGGTATTCATCCGGTCAAGCAATTGAAGCTATACAAGCAATAGCCGAGAACTTACCTCAAGGTTATATTTATGAATGGTCAGGACAATCAAAACAAGAAATAGAAGCAGGTGACCTAGCACCAATACTTTTTGCTTTAGCTATTTTATTTGTCTATTTATTCTTAGTTGCGCAATATGAAAGTTGGTCTATACCATTTTCAGTTATTGCAGCAGTACCGCTAGCTTTATTTGGTGCTATGTTGACTTTGTATACCGTCGGCATGGCGAATAACATTTACGCACAAGTAGGTTTAGTATTATTAATAGGTATGTCGACTAAGACAGCAATACTTATTGTTGAATTTGCTATGGAAGAAAGAGCTGGGGGGAAAAGTATTTTTGATGCGGCCTTAACGGCTGCTAAAATGCGTTTTCGCGCGGTACTTATGACGGCACTTTCCTTTGTATTGGGGGTACTTCCTTTAGTGTTTGCAAGTGGAGCAGGGGCTGGAAGCCGAGTGTCATTAGGTATAACTGTGCTTGCAGGTATGTTAGCGGCGACTATTTTTGGTACATTACTTGTGCCGTATTTTTATATGATGGTGCAAAGCATGCGTGAAAAATTCAAAGGTAAAATAAGCTAA
PROTEIN sequence
Length: 1036
MISKTFIHRPKLAFVISIVISLAGLIAMGVLPVNMYPEITPPQIQISAVYPGASAQVVEESVIRPIEEQINGVEDMMYIDSSASNNGSAVITVYFKVGTDGDIAQVNVQNRVALATSSLPAEVTRQGVNVKKKSSAMLLGINLYSEQAAIDQLFLSNYASNYLTEPLGRIKGVASAEIMGAMTYSMRIWLNPDRMSSLNVTVSEVQQALKEQNMIVAAGKLGSSPSVPNQQFEYSIQAQGRLKSPEEFGQTIIRAQESGNFVRLTDIAKIEMGAEDYATKARLNGKDTAFLVIYQLPDANATEVADLVKAEMLKLSERFPDGLNYVVPFDTTEFIDRSMEEVKVTLFQAVALVILVVFLFLQNWRATIIPTLAIPVSLIGTFAFMLLMGYSINTITLFGLVLAIGIVVDDAIIVIENVERILKEEQLPIKEAVTKAMEQVSGPIIATTLVLLAVFVPVGFMPGITGELYKQFSVTISFAVIISSVNALTLSPALCVVLLSEKNMKPISWLQPMERLIARMTGGYTKTVNFLLKRVVRVSLFVGVLFASAGWLTSTVPTAFLPGEDQGYLFVDIQLPDAASTNRTQAVMDKISPIITNDPAVEDIITVSGVSLLGGPGSNNGLAIILLKDWDERTAPELGLRQVIPRLMGQLWSMPEAQIMVFNPPPIPGLGNSSGFEFQLQDSEGRDPALLAQVMNGFIYEANQRPELNRVFSTFRANVPQYFLEVDRNKAKAQGVALSDIFVTLQAQLGSMYINDFSQFGRTYKVTIQAQREFRKDPADLRHYYVRNKDNDMVPLTTLAKLTPILGPTTIKHFNLYRSASISGQAALGYSSGQAIEAIQAIAENLPQGYIYEWSGQSKQEIEAGDLAPILFALAILFVYLFLVAQYESWSIPFSVIAAVPLALFGAMLTLYTVGMANNIYAQVGLVLLIGMSTKTAILIVEFAMEERAGGKSIFDAALTAAKMRFRAVLMTALSFVLGVLPLVFASGAGAGSRVSLGITVLAGMLAATIFGTLLVPYFYMMVQSMREKFKGKIS*