ggKbase home page

BD02T64_scaffold_887_12

Organism: BD02T64_Colwellia_psychrerythraea_38_180_partial

partial RP 29 / 55 MC: 4 BSCG 30 / 51 MC: 3 ASCG 10 / 38 MC: 1
Location: comp(15255..16601)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
transporter n=1 Tax=Colwellia piezophila RepID=UPI0003713A24 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 86.6
  • Coverage: 433.0
  • Bit_score: 758
  • Evalue 3.60e-216
Transporter {ECO:0000256|RuleBase:RU003732}; TaxID=28229 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Alteromonadales; Colwelliaceae; Colwellia.;" source="Colwellia psychrerythraea (Vibrio similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 81.7
  • Coverage: 448.0
  • Bit_score: 742
  • Evalue 2.80e-211
sodium-dependent symporter family protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 80.4
  • Coverage: 448.0
  • Bit_score: 730
  • Evalue 2.90e-208

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Colwellia psychrerythraea → Colwellia → Alteromonadales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1347
ATGAGTGCAGTAAGAGGCGGTTTTAGTTCACGATTAGGGTTTATATTAGCCGCAGCGGGTTCGGCCGTGGGACTAGGTAATATCTGGGGTTTTCCAACTCAAACGGCTAGTAATGGTGGCGCTGCCTTTGTCTTAGTGTATTTGGTGTTGGCCTTTTGTTTAGCTTATCCTGCCTTTATGGCTGAATTATTGATTGGCCGATACGGACAAGCCAATGCCGTGACCTCTATGGAAAAAATGTCGCGGAACTTATGGCAAAAACGCTTTGCTTTTATTGTGGGTTTCGGTGGTATTATTTGTGCAGCACTTATTTTAAGCTTTTATGGCATTTTAGCTGGTTGGATGATGTCATATGCGATTGAACCCGTAACCTCACTTCTGGGGTATAGCGAAGCGTCTAGTTGGCTTACCTCACAATCAATTACTCGTAACTTAATATTTACCGCCTTGTTTATGATGTTGACCATTTCGATTATTCGTCGTGGTGTTGAAGACGGTATCGAAAAGTGGTCTAAACGCTTAATGCCAATGTTGATTGGTTTATTAATATTATTAATTATCTATGTTTTTACCTTAGAAGGCTCAAGAGAGGGGTTTGTTGCGTACCTCAACCCTGATATTTCACGGATATTTGAGCCAGATTTATTAATTAGTGCGCTCGGCCAAGCTTTCTTCTCTTTGTCTTTAGGGACCAGTGTTATGGTTATTTATGGCTCGTACATTTCTAAGAAAGAGAATCTGGTAACACTTGGTGCACAAGTAACTTTAATTGACGTATCAATTGCCTTTCTAGCGGGATTGTTAATCATTCCTTCAATGTACGTTGCTCAATCACAAGGTGTTGCTATCTTTAGTGATGAGGGAGCGCTAATTTCAGGTCCTAATTTAGTCTTTGATGTATTGCCTTCACTATTTGATGGTATGGGGGCAATTGGTCTATTTGTAGGATTTGGATTTTTTGTTTTAATGTCAATCGCGGCGTTAACTTCTTCTATTTCCATGTTAGAAGGCCCTGTTTCATTTGTGGTAGAGCGTCATAATATAGAACGTAAAAGAGCAACGACTTTTATCGGCTTTGGCATTTTTGTAACTAGTGCATTAATTGTGCTCAATTTTGATGCTTTATTTGGTTTAGTTATTTCTATCTCTACGGTCTACGGTCAGCCACTTATTGCGATGCTATGTTGTGTTTTTGTTGGCTGGATTTGGCAACGAAGTGGCATATTAGCCGAGATTAAACTCGGTAATGACACCGTTGAACATAGTCTTTTTTGGAAAATATGGCCTTGGTATACTAAGTTTATTTGTCCTAGTGCCATCGCTATTGTGTTTTACCATTCCCTTTAG
PROTEIN sequence
Length: 449
MSAVRGGFSSRLGFILAAAGSAVGLGNIWGFPTQTASNGGAAFVLVYLVLAFCLAYPAFMAELLIGRYGQANAVTSMEKMSRNLWQKRFAFIVGFGGIICAALILSFYGILAGWMMSYAIEPVTSLLGYSEASSWLTSQSITRNLIFTALFMMLTISIIRRGVEDGIEKWSKRLMPMLIGLLILLIIYVFTLEGSREGFVAYLNPDISRIFEPDLLISALGQAFFSLSLGTSVMVIYGSYISKKENLVTLGAQVTLIDVSIAFLAGLLIIPSMYVAQSQGVAIFSDEGALISGPNLVFDVLPSLFDGMGAIGLFVGFGFFVLMSIAALTSSISMLEGPVSFVVERHNIERKRATTFIGFGIFVTSALIVLNFDALFGLVISISTVYGQPLIAMLCCVFVGWIWQRSGILAEIKLGNDTVEHSLFWKIWPWYTKFICPSAIAIVFYHSL*