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BD02T64_scaffold_887_23

Organism: BD02T64_Colwellia_psychrerythraea_38_180_partial

partial RP 29 / 55 MC: 4 BSCG 30 / 51 MC: 3 ASCG 10 / 38 MC: 1
Location: 27748..30594

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-dependent receptor n=1 Tax=Shewanella woodyi (strain ATCC 51908 / MS32) RepID=B1KDJ6_SHEWM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 69.7
  • Coverage: 954.0
  • Bit_score: 1332
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor {ECO:0000313|EMBL:KGJ92014.1}; TaxID=28229 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Alteromonadales; Colwelliaceae; Colwellia.;" source="Colwellia psychrerythrae similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 73.4
  • Coverage: 945.0
  • Bit_score: 1386
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 69.7
  • Coverage: 954.0
  • Bit_score: 1332
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Colwellia psychrerythraea → Colwellia → Alteromonadales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2847
ATGTCGATGGCGTTGTTTACTTTTCATGTGAGTGCTGACGGCTTAATACGTTTTGATATTAACAAGCAGCGAGCTGATAAAGCCTTAATATCATTTGCTCAAAAAGCCAATCAAACTATTGTTTTTTCATTTGATCTAACTAAAAATCATCAAGCCAATGAGTTGAAAGGTTTCCACTCTGTAGCTTCAGGGCTTAAAAAGTTACTAAAAGGCTCTGGTCTAATGGCTGTTACAAACAGTGCAGCACAATGGAGCATTCAAATTGATAATAGTGAGACCATCAGCACAGAAACAGTAAAGCACATTGTAAACTCTGCAGTTATAGCAACTTCACCAGACTCTGAAATACGTTCAAATTTAGCTCATGTAGATGAAATTGAAAAAATTTCTATCGTCGGCAGTCGAGTAGAAGGACGTTCGGTAAGTGATCTTCCTGTAGCTGTCGATATTCTTTCAGCTAAAGCTTTGGCTAATACTGGTCAAACCGAAGTAGGTAGAATGCTACAATCAATAGCGCCCTCTTTTAACTTTTCTAGTTCGTCAATTAGTGATGGCACTGATGCTATACGCCCTGCCACTTTACGCGGTTTAGGACCAGATCAGACTTTAGTACTTATTAACGGAAAACGTCGTCATCAAGCTAGCCTAATACATATCAATACTTCTGTTGGTCGAGGTACGGCAGGTACTGATATGAACGCTATACCTGCTTCATCGATTAAAAGAATTGAAGTATTACGAGATGGCGCATCGGCGCAGTATGGCTCTGATGCTATTGCTGGTGTTATTAACATTGTGTTAAATGATGAAAGTAAAGGTGGTAAGGTTGCAATCTCTTATGGTGAATACATAGAAGGTGATGGGGAAACCACCAATATAGATATCTCCAAGGGATTTTTGTTAGGTGATGATGGCTATTTAAACACTACATTAAATTTCCGTGATCGCGGTTACACGAATAGGGCTGGTCTACATGGCACATGTCAGTTTTCTGGCTGTAGTGAACTTACCAATGGCACACTATTATTAAGTGATCCACGTGAAGCTACAGCGACACGTAATACCTTTAGAATTGGTGATGCTGATTCACGTCAATTGGGCTTTACCATTAATTCGGGCTATGAGTTAGATATTGGCGAATTATATGGTTTTTTTACCTATTCAAATCGTGATAGTGAGTCTGCAGCTTTCTTTCGCCATAATGCCAATAGTAATGGTAATGCACCATTGCAAGATGGTGACGCCGCTATCCCGGCTGGTTTCTTACCTAAAATCAACTCTGAAATCAAAGATCGATCCTTTAGTTTAGGTTACCAAACTGAGTTTGAAAGTGGCGCGAGTATAGACTTATCTTATACATATGGTCAAAATAATATTGATTACATAACCAGCGATACTATCAATTCATCCTTCGCTAACGCATTGCAGTATAATTCAGATGGCTCTTTTGCCAATATAACATCAAACGAGATACGTAACTCAATACCAAGAGAAGCTTTTGCTTATGGTTTAGAGTTAGCTTTATCAACTTTGAATATTGATTACACTCAAAGCTTTAATATGTTTTCTTTGGCTATGGGAGCCGAAATTCGCACTGACTTCTATAAAGTAACGGCTGGGGATGAATACTCATTTACAGATTATGATACTGTTCTTGGAGAGAGTATTTTTACTGATGATAGAAGCGCTGGTACACAGGGTTTTGGCGGCATTGCACCAATATCTCAAGTTGATGAAAAACGTAATGTTTTCTCGTTTTATGCTGATGCAGAAATGGAAGTTACTGAAGAATTAATTATTAGTGGCGCAGTCCGTTACGATTACTATGATGGTTTTGGTGATAACTCTAGCGTAAAAGTAGCGGGTAACTGGTCTCTCACACCAGATTTAGCAATTCGTGGTGCCATGAGCACAGGGTTTCGAGCTCCTTCTATGCAGCAACTCTATTTTAATAATATCAGTACACAATTTATTACTGATGTTAATTATCCAACTAGCGATCAGATTGCCGTACAAGTTGGCACTTTCCGCAATGATTCTCTATTAGCACAAGCTATTGGCATTCCAGAATTAAAAGAAGAGGAAGCAATAAATTTGAGTTTAGGAGCCGTTATTCAACTTGCTGACAATATTAGTTTGACCATAGATTGGTATGCTATTGATATTGACGATCGCATTGTCATCAGCAATAAACTGGGCAGAGGCTTATCTTCTACATTAGATACTGCCTTAGAAGCAGTAGAAGCTGATAAAGGTCAATTTTTCTTAAATGGCGCTAACACTGAAACCACCGGTATTGATATTATTGCGACTTGGAATACAAACATGCTAAGTGGTAATTTAGCGTTAACGTTTGCGGCAAACTTCACTGAGACCGACGTAGTCAATATTTTTGCACCACAAGATAGTAGCCTACATGATATTTCTCCTAGGGAAATCTTTTCTGAGCAAGATATTTCTATTATTGAAGAATGGCAACCAGAAGATCGTATAAGTTTAAGTAGCTTGTATAAAATAAAAGATGTCACTATAAACCTAACTTTTAACCGCTATGGTCAATATACGATAACGGATGGTGGCAGACAAACTTATGGCAGAGAAGTAATAGCTGACTTACGCGTTAGTTACCAACTGACTGATAATTTATCTTTTAATATTGGCAGCAATAATTTATTGGATGTTTACCCTGATAAAAACGACATTGGTAATTCAAGAACGGGCACTATTGTCGATAACGACGGTAATACTATTGTAAATAGCTTAGGCGTATTTACTTACTCTCGAAGATCTGCCCCATTTGGATTTAACGGTGCATTTTACTATGCTGGCGTTGAATACAAACTGTAG
PROTEIN sequence
Length: 949
MSMALFTFHVSADGLIRFDINKQRADKALISFAQKANQTIVFSFDLTKNHQANELKGFHSVASGLKKLLKGSGLMAVTNSAAQWSIQIDNSETISTETVKHIVNSAVIATSPDSEIRSNLAHVDEIEKISIVGSRVEGRSVSDLPVAVDILSAKALANTGQTEVGRMLQSIAPSFNFSSSSISDGTDAIRPATLRGLGPDQTLVLINGKRRHQASLIHINTSVGRGTAGTDMNAIPASSIKRIEVLRDGASAQYGSDAIAGVINIVLNDESKGGKVAISYGEYIEGDGETTNIDISKGFLLGDDGYLNTTLNFRDRGYTNRAGLHGTCQFSGCSELTNGTLLLSDPREATATRNTFRIGDADSRQLGFTINSGYELDIGELYGFFTYSNRDSESAAFFRHNANSNGNAPLQDGDAAIPAGFLPKINSEIKDRSFSLGYQTEFESGASIDLSYTYGQNNIDYITSDTINSSFANALQYNSDGSFANITSNEIRNSIPREAFAYGLELALSTLNIDYTQSFNMFSLAMGAEIRTDFYKVTAGDEYSFTDYDTVLGESIFTDDRSAGTQGFGGIAPISQVDEKRNVFSFYADAEMEVTEELIISGAVRYDYYDGFGDNSSVKVAGNWSLTPDLAIRGAMSTGFRAPSMQQLYFNNISTQFITDVNYPTSDQIAVQVGTFRNDSLLAQAIGIPELKEEEAINLSLGAVIQLADNISLTIDWYAIDIDDRIVISNKLGRGLSSTLDTALEAVEADKGQFFLNGANTETTGIDIIATWNTNMLSGNLALTFAANFTETDVVNIFAPQDSSLHDISPREIFSEQDISIIEEWQPEDRISLSSLYKIKDVTINLTFNRYGQYTITDGGRQTYGREVIADLRVSYQLTDNLSFNIGSNNLLDVYPDKNDIGNSRTGTIVDNDGNTIVNSLGVFTYSRRSAPFGFNGAFYYAGVEYKL*