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BD02T64_scaffold_2326_1

Organism: BD02T64_Colwellia_psychrerythraea_38_180_partial

partial RP 29 / 55 MC: 4 BSCG 30 / 51 MC: 3 ASCG 10 / 38 MC: 1
Location: comp(2..13378)

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Value Algorithm Source
OmpA-like transmembrane domain-containing protein n=1 Tax=Glaciecola arctica BSs20135 RepID=K6YT61_9ALTE similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 46.8
  • Coverage: 502.0
  • Bit_score: 382
  • Evalue 5.30e-102
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:KGJ97436.1}; TaxID=28229 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Alteromonadales; Colwelliaceae; Colwellia.;" source="Colwellia psychrerythrae similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 39.3
  • Coverage: 606.0
  • Bit_score: 410
  • Evalue 3.30e-110
HYR domain protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 26.9
  • Coverage: 982.0
  • Bit_score: 264
  • Evalue 5.90e-67

Lists

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Notes

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Taxonomy

Colwellia psychrerythraea → Colwellia → Alteromonadales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 13377
ATGTGGTTGGTAATTATGAATAAATTGATAGAGTCGAACAGTGAATTAAAGTGTGTATTATTTGAAAAGCTAATTTTATTGGCTACCCTAACCTTTGGGTTGATTTCCTCATTTAACACTTTGGCAAGCTCTGCTAATGATAATGGTTTGGTAAATCAGCGATTAAGTAATATTGCCATTTATGACCTAGGTGACGCTCAATGTAAAAACTTGCCCAGTAACTTATCTAATATCAATTTTGCCAACCCGAATGTTTCTGGTTATCAGGTGTCCAACTACATAGCAAATGACTTTGCCATTCGAAGCAGTTCCAATAGTAATTGTGGGAAAACTTTTGCTGATAGCTTTGCTGGCGATGTATATATTCCCGCGGATGAAAATGTCACTTTTTATTTGAACTCAGAAGATGGCAGTAAATTATGGATCAATGGAAATTTAGTTGTAAACAACGATGGCGTTCATAATGCGCAAGAAAATAATGGCTCTGTAGCTTTAAGCCATGGGTGGCACTTTATAGAAGTGCAGTACTTTCATAATGGCGGAGCGGACAACGCCGATTCCAGTTATAGCTTGGATGTCAGTTATAGCTCCAATGGCATAGGTGCTAAGCAAGGGATCCCTAATTCAGCGCTTCGCTTAGGGGCAGCTTTAGACACGGATAACGATGGCGTCGCTAATTATTATGATATTGATAAAGACGGTGATGGCTTAATTGAAATTTCAACTTTGGCTGATTTGGATGAAGTTCGAAATAACTTAACGGGTACAGCATTATTTGGCAATAGCACGGGTTGTAACACTGGCTGCAACGGTTTTGAACTCACCCAAGACTTAGATTTTGATACCTCTGGTGATGGCATTGTTGATGCAAATGATGCCAATGGTGTTTACTGGAATGCAGGAGAAGGCTGGTTGCCTATTGGTCGTACAAGTAGTAATGCTTTTCAAACGACTTTTGAAGGTAATAATTTTACTATCAATAACTTAACCATTAACCGCAGTATAGAAGATGGTATTGGCTTTTTTGGTTTTACTAGAGCTGGCTCTATAATCAATAATTTTGGTTTAACTCATACACGAGTGGAAGGTAATAATGGTGTTGGTGCGTTAGTAGGTAAGGCTGATAATTCGGTTGTTAATAATGTTTATAGCACTGGTAAAGTTAGCGGTAACTATGAAGTAGGTGGTCTGATCGGTTGGGCAAACACTGTTTCGATTACTACTGCTCGTCATATTGGCTATATTACAGGTGTTGATGAATTTATTGGTGGCATTGTAGGCCGTGCGGGTATCAATAGCGCTATTGAAAATGCTTTTAATATAGGCAGTGTTGTCGGTGGTGATCGTGTTGGTGGCATCGCTGGTACAAGTGATAGCGACATAAGTGACGTTTATGTTGCTGGCTATGTTAATGGCGATCAGCGCGTAGGTGGTATTACTTCTGGAGTAAATTCTGCGCATATAGATAGGTCATATGTTGTTGCTAAAATAACAGGTAACTTTGATACAGGGGCTATTCTCGGCTCTATATTTGCACCTGACGCGGGTATTTCGAGCAGTTATTGGTTAACTGGTATTGCAGAAACAGCCGTTTTTTATGATAGAAACGTACCAATTGCAATAACCGCGGCTAACTTAGTTGATTTATCTTGCCCAACTAATGCTGGAGATAACGCTTGTAATCAAATCTTTTATGCTGACTGGGATGATTCAACGCCAGTTTGGCAATTTGGCACTAACAATCAACTTCCAGCATTAATGCAAAATGCCTCAGCCTATTTTCTAGCTGATTTTGATGGCGATGGTGTTAGTGACCAAGTTGATGTTTTTCCAAGCATAGCTCTTGGTGCATTGTTAGATAATGACAGTGATGGGATCCCTGATAACTGTGATGCAGCTTGTTTATCTACGGGCTTAGATACTGATACCGATGATGATAACGACGGTGTTGACGATGTTAGTGATGCATTTCCATTTGATAGTACCGAGTCTGCTGATAATGATTTAGATGGCATTGGTGACAATGCCGACTTGGATGATGACAACGATGGCGTTAATGATGATCAAGATGAATTTCCTTTCGATGCGTCAGAGTCGGCTGATATTGACGGAGATGGTATAGGAGATAATGCCGATAACGATAGTGATAATGATGGTTATATCGACAGCAAAGATAGTGCTCCTTTAAATCCTTTATTACCCGGATTAAGACCAATTCGCCAACAAAGTGCTGACAATGCAGACAATCGATTTGCTTATAGTATTGCTAATGTTGGTGATGTTGACGGTGATGGTGTTGATGATATTGTCACGGGTGCATTTGAAGATAGTGCTAATGGTTTTGACGATAATGGTGTTGTATTTATTATCTCAGCTAAAACGGGAAAAACTCTTTATAAAATATACGGTGATGGCACTGATAACGAATTAGGTAAATATATTAGATCAGCGCCAGATATGGACAATGATAATGTAAATGATTTTTTGGTTTATCGCGCAGGCAGAGGGGAGGATACCAATAATGCAATAGAGTTGTACTCCAGTAGAACAGGCAGCTTGATTTACAGTATATCCAGCGAACACGATGTTTTTGGCCATGATTTTACTTTTACTGGCGATGTGAATAATGATGGAGTTGATGATCTTTTAATCTCAGCACCTGGTTTTGATAATGATCAAACTAATGCTGGGGCAGTATTTATCTACTCAGGCGTTGATGGTTCAGAGCTAAGCCGTATAGAGGGTTCAGGGGGCTATTTTGGAGATAAACTTGTTCCTATCGGGGATATAAATGCCGATCAAATAACTGATTTCATAGTGAGCGCATCAAGTTTTGACGCACAAGCCGGTGAAGATGGGCGTATTTATGTATTTTCTGGAGCAGATAACCAAATTTTATATCAAATTGATGGTGATGAATATCGTCAAAAAATAGGTGATGAGTTAGTTGCGATAGACGATATTAATAATGATGGCATTAGAGATTTTGCTTATTCTAATAACACAACAGCTGAATTTCAAGGTCAACAAAGAGGTTTTATAAGTTTAGTTTCAGGTGCAGATGGCAGCCAAATTAATCAGCTAAGCGCAGACGGTTTTGGCTTGGGTGATTTTGGTAAACACCTTTATTCTGTAAAAGATATTGATGGTGATGGTAGCAATGAACTAGTTGTTATTGATGCTGGTAATATCAACGAAGAACATAACACTAATGTTATTTTTTATTCACTGAGTAAAAACAGGATCATTGGACGAGTTTATAGTGATAATCTTTTTGCTAGTAGCAGTTTTGCCCAAACTCTCGCGGTAATAGACGATATTACCGGTGATAATTTTCCTGAAATTGTTGTGGGAGATTATGGTCACCAAGGACAAGCTTCTGCTACTGGAGCAATATTTACCTACTCATTTGGTGATTTTGTCATTGATACAGACAATGATGGTACTGTAAATGGTGATGATGCTGATATTGATAACGATGGCGTAACGAACTTCAACGATGCTTATCCTTATATTAGCGTGGCGGGCTTAACGGATACAGATTTGGATGGTATACCTGATACTTGCGATAATCTCTGCCAACAAAGCGGTATGGCTGCTGATAATTATATTAATGGCATCATCTATGTTGATAATAGTTCAAGCTGTAATGCGGAAAATGAAACCTGTGGCCAAAACTGGCAATCTGCATTTCGAACATTACAAGATGCGCTATTAGCAAGTAACGCTAATCAACAAATTTGGGTCTCTGAGGGTGTTTATTATCCCAGTGACGTTGATAATAACCCTTATCAAAATATATACATTACTTTTAAGTTACCGACTAATGTTTCAATATTTGGTGGTTTTAATGCGACCGATTTGCCAACACAGCTGAATGAAGCTAACCCTGAGTTATTCAAAACGGTTTTGAGTGGTGATATTGATTTTCAAACCAATCCTGATGTTACTGATGACCAAGGTATTACTCAAAATGTATCAGATATCCTTGGAAATAATGCCAGTACACTTATTTTTACAGCGCTAGATAGCCAAAATTATACCATTTCAGGTGTGACATTAACGGGTGCGGATCGCATGAACAGCAGCCAATATGTACTAAATATTAGCCGTGGTAACGCTACGATAAAACAAGTGGACATTATCGGCAGCAAGTCGTCAATTAGGTTGAATATCAATGATAATTGTCAAATTGATTTTAGCTATATCAATCTAGTGAATATTTCGACTAGTTCGCCGCTTATTAAAATATTTGATACTCGTTGTTCACAAGTGACTATTTCAGAATTTACCACAAGCAATGCGGTTACTAGTGATAATGTTATTGATATTCGTTATGCAGAAAATAACATTGAATTTAATCGACTATCTATTATTAATGATAATCCTTCAACAGATGGTATTTTATATTCTAATTCGGATTATCAAAATTTAAATATCACGGTAAATGATTCGGTGTTTTTTAACCTTGGTAGTCTTCACTCTAAAAGTATCTTAAATATTAATAATTCTATTTTTATGCAAACCCATGGCATTAAACAAACTGAGGATTTTCCACTGACGGTTAAACACTCTAGTTTTATTAATAATCAGTCAACCAACGATGCAGGTGCCGTTAGCTCTGTCAGTACTAATAACAATTTAGGGTTCAATTTGTTTGTTGGTAATACGGGACAAAAAGCCAACAATATCTATGTTGAAAATAGTGTTAATGACTTGGGTTACAATTTAGTTGGTGCTAATAGTATTGATGGTTTTGCGAGCCAATCAGGAAATACTTTTGCTCAAGTCTTTGATTCAGGAACCAGCTTTGTTGCTACACAGTCTATTGAACAAATTACCGAACAAGAGTTAGCGAATAATGGTGGTGATATGTTGTCAGCATTACCTATAGCTGAAGGTCCCGCGGTCGACATTATTCCAGTAAATGAATGTTTGTTGCCGCTTGATATTAGAGGAGAGGTTCGTCCTCAAGCTAGCTTGTGTGATATTGGCGCCGT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PROTEIN sequence
Length: 4459
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