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BSR_Lac_UAPBR_inlet_p_1_118530_24

Organism: BSR_Lac_UAPBR_inlet_p_1_Bacteroides_graminisolvens_42_17

near complete RP 52 / 55 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38
Location: comp(38891..42124)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein n=1 Tax=Bacteroides massiliensis dnLKV3 RepID=R9I1C8_9BACE similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 69.4
  • Coverage: 1081.0
  • Bit_score: 1563
  • Evalue 0.0
SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein {ECO:0000313|EMBL:EOS09891.1}; TaxID=1235788 species="Bacteria; Bacteroidetes; Bacteroidia; Bacteroidales; Bacteroidaceae; Bacteroides.;" source="Bacteroides massiliensis dnLKV3.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 69.4
  • Coverage: 1081.0
  • Bit_score: 1563
  • Evalue 0.0
collagen-binding protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 69.3
  • Coverage: 1081.0
  • Bit_score: 1560
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

Bacteroides massiliensis → Bacteroides → Bacteroidales → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3234
ATGAATCGAAAAACACTTGCCAGAAAGGCAATTGCGTCTCTGTTTATGAGTATGCTATGTTTGCTTTCTTATGCACAAACCCGACAAGTTACGGGATTGGTCACTGATGCTAATGGTGAACCGATGATTGGAGTGAATGTTACTGTGGTTGGAACAACCAACGGAACAATAACCGATATCGATGGAAACTATTCACTATCCGTAGCATCTAATGCTAAACTTCAATTTTCTTTTATTGGCTATCTGAGCAAAACAGTTGAAGTTGGTACCCAAAAACAAATCAATGTTAAGTTGGTGGAAGATGCCAAGAACCTCGATGAAGTGGTGGTAATTGGTTATGGTACAGTAAAAAGAAGAGATTTAACAGGTGCGGTAGCATCTGTCTCGGGTGAGAAACTGGCTGCAAATCCGGTTTCTAATGTGGCGCAGGCACTACAAGGTCAGCTGCCGGGTGTGTCTGTGACATCTCAGGATGGTCGTCCGGGAGCTACCATGTCTATTCGTGTACGTGGAGGTGGCTCTATAACTCAAAGCAATGATCCTTTGTTTATTGTTGATGGTGTTCAAGTGAGTGGCATTGATGATATTCCAGCCGATAACATTGAAAGTATTGATGTGTTGAAAGATGCTGCTTCAACAGCTATTTATGGTGCACGCGGTGCAAATGGTGTTATTTTGGTAACTACTAAAGCGGGTAAAGAAGGAAAGGTTTCTGTTAATTACAACATGTATTACCAGATGAAAGAGAAACCCGAAACATTGGATGTGCTGAATGCTTATGATTATGTTTATTCAACTTGGGCTTACGGAACCGCTTACGGTGGTACTTATGGTGATAATATTGCCAAATATTTTGGACTGGGATCCAAATATGGAAATCATTTAAATGAATATAAAGGTGTTGCTTCTCATAATTATGTTAACGATATTATGCGTAGTGCCGCCGCTTGGAACCATGACCTTTCTTTGAGTGGAGGTAACGATAAGACCAAGTATTATGCCTCTGTTAACTATACGGATGAAGAAGGTGCTCGTATTAATACAGGATTTAGTCGTTGGAGCGGTAGCTTTAAAATAGATCAGAAGATTAATAAATCATTGAGTTTTGATGCTGACTTGCGTTATACTGAAACCGAATATTTAGGAACCAAATATGATGTGTCTACTTCTGCTTATAAATACCGCCCGGTAGATAATCCGTTGGGCGATGCTGAACTTACAACTGCATTTGGTAATGGTAGCTCTTATGTCGAATTAGGAAGAGATCCTGTTTCTGTTATTAATAATTATGATAACAATAGCAAGATGCAACGTATCCGTGCTAAAGGTGGATTAACGTGGAATGTAATAAAAGGCTTGACTGCCAAATCAGAATTGTCACTTAGCCGTCACTGGCAAGAAACAAAAAAATGGGATGGCGGTTTGGAGGCTGGTTACAACACGGCGGAACTGACTAATAAAAATGGTTATGCTATACGTTGGGCTACAACCTTGAACTATGAGGTGCAAGGTTTGGGAGCTGACAATAATCTGTCGTTCATGGTTGGTAACGAAGTGCTCTCTTCTAAAACTAACGAAAGTTATATCTCCGGATCCGGATATCCTGATGGTTTTACCAAGGAAGATGCATTCGGTATGATTAATATGACAACTCCTAGTTTGGGAAAAGATGAATTTGGGTCAACAATCGGTACTCCTAATCACACTCAATCATGGTTTGGACGTGGTAATTATTCATACAAAGGACGCTATTTGTTAACAGCTACATTTCGTGCCGATGGTTCAAGTAAATTTGCACCCAATCATCATTGGGGATACTTTCCTGCAGCAGCTGTAGCATGGCGTATATCTGACGAACCGTTCATGGAAGCACAGAAGGAATGGTTGGATAATTTAAAATTACGTATGTCTTATGGATCAACGGGTGCTGATAATATCGATGCGCTTTTGTGGAAAGAAACCTGGACAACAGAATTAATCAAGGTAGACGGTGAATCAGTAACAATCTATAAACCGGGCTCAATGAAAGGCAATCCTGACTTGAAGTGGGAAACAACGATATCGCGCAACATTGGTTTAGACTTTGGTTTCTTTAATAGCCGCATTCGTGGTAGTTTAGATTTCTATTGGAATACAACAAAAGATTTATTAATGAAAGTTCCTGTAGACTCTTCTACCGGATATAGCTATCAATTCCAAAATGTAGGTCAAACGTCTAATAAAGGTATTGAATTAGCATTGGGTACCGACTTGGTTCGTTCGAAAGATTTCAATTTATCAGTGAATTTGACTTATAACTTTAATAAAAATAACATTGATGATTTAGACGAAAACACACTTGCAGATACTAATACTGGATGGGGATCTTCTATGCGTTTACCTCAATATGACTACATCATTCGTAAAGGACAACCGGTGGGTCTGATTCAGGGATTCAAGTCTGACGGATTCTATACTGTTGACGATTTTGATTATGCTAATGGTGTGTATACTTTAAAACAAGGAGTTCCCGACATTAAGAATGTGGTTAATTACCCCACAGGCATGTCAGGTTTTAAACGCGCCGACGGTCAGCTTGCATTTCCCGGTATGTTGAAGCTCAAGGATGTTGACGGTAGTGAGACAGTTGACTTAGGTGATGCAACTGTAATAGGTAAAACATTGCCCGAGCATACCGGAGGTTTTAATTTTACAGGTAACTATCGTAACTTCGACTTCTCTCTTGGCTTTACTTATCAGATTGGCGGAGATGTGTATAACGCCAATGCTATGCACAGCATGATGGGAGATAAAGATAATGCTTTGGGAGCTAATCGTTTGAATATTGTGAAAGATTGCTATAAAGTATATGATGTTGATAGCAATGGAGATTTATTCTTGGTAACTGAGCCTGATGCATTGAATACTTTGAATCAGAATGCCAAATATGCTCTTAATTATTCAGAGTACGGTATTACGGTTTCTGAATTTGTGGAAGACGCTTCTTATTTACGCTTACAGACTTTAACTTTGGGGTATACTTTACCTAAGACTTGGACCAAGAAAGCCGGTATGCAACGTGTACGTCTTTATTTTACAGGCAGCAACCTTTTCTGTTTGACTGGCTATTCTGGTCTTGATCCGGATGTCAATACTGACACTGATGGTGTTAATGGATTCCCAACACCTAACTATGATTATCAAGCATATCCTAAAAATCGGTCGTATACATTCGGCGTTAACGTATCATTCTAA
PROTEIN sequence
Length: 1078
MNRKTLARKAIASLFMSMLCLLSYAQTRQVTGLVTDANGEPMIGVNVTVVGTTNGTITDIDGNYSLSVASNAKLQFSFIGYLSKTVEVGTQKQINVKLVEDAKNLDEVVVIGYGTVKRRDLTGAVASVSGEKLAANPVSNVAQALQGQLPGVSVTSQDGRPGATMSIRVRGGGSITQSNDPLFIVDGVQVSGIDDIPADNIESIDVLKDAASTAIYGARGANGVILVTTKAGKEGKVSVNYNMYYQMKEKPETLDVLNAYDYVYSTWAYGTAYGGTYGDNIAKYFGLGSKYGNHLNEYKGVASHNYVNDIMRSAAAWNHDLSLSGGNDKTKYYASVNYTDEEGARINTGFSRWSGSFKIDQKINKSLSFDADLRYTETEYLGTKYDVSTSAYKYRPVDNPLGDAELTTAFGNGSSYVELGRDPVSVINNYDNNSKMQRIRAKGGLTWNVIKGLTAKSELSLSRHWQETKKWDGGLEAGYNTAELTNKNGYAIRWATTLNYEVQGLGADNNLSFMVGNEVLSSKTNESYISGSGYPDGFTKEDAFGMINMTTPSLGKDEFGSTIGTPNHTQSWFGRGNYSYKGRYLLTATFRADGSSKFAPNHHWGYFPAAAVAWRISDEPFMEAQKEWLDNLKLRMSYGSTGADNIDALLWKETWTTELIKVDGESVTIYKPGSMKGNPDLKWETTISRNIGLDFGFFNSRIRGSLDFYWNTTKDLLMKVPVDSSTGYSYQFQNVGQTSNKGIELALGTDLVRSKDFNLSVNLTYNFNKNNIDDLDENTLADTNTGWGSSMRLPQYDYIIRKGQPVGLIQGFKSDGFYTVDDFDYANGVYTLKQGVPDIKNVVNYPTGMSGFKRADGQLAFPGMLKLKDVDGSETVDLGDATVIGKTLPEHTGGFNFTGNYRNFDFSLGFTYQIGGDVYNANAMHSMMGDKDNALGANRLNIVKDCYKVYDVDSNGDLFLVTEPDALNTLNQNAKYALNYSEYGITVSEFVEDASYLRLQTLTLGYTLPKTWTKKAGMQRVRLYFTGSNLFCLTGYSGLDPDVNTDTDGVNGFPTPNYDYQAYPKNRSYTFGVNVSF*