ggKbase home page

cg1_0.2A_scaffold_26_30

Organism: CG1_02A_Bin3

near complete RP 52 / 55 BSCG 51 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 3
Location: comp(28552..30846)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Outer membrane protein assembly factor BamA n=1 Tax=Thiomicrospira crunogena (strain XCL-2) RepID=Q31G50_THICR similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 69.9
  • Coverage: 765.0
  • Bit_score: 1076
  • Evalue 0.0
  • rbh
surface antigen (D15); K07277 outer membrane protein Tax=CG_Thiomicrospira_01 similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 764.0
  • Bit_score: 1495
  • Evalue 0.0
surface antigen (D15) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 69.9
  • Coverage: 765.0
  • Bit_score: 1076
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

CG_Thiomicrospira_01 → Thiomicrospira → Thiotrichales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2295
ATGGTTAAACATTTTTTAAATTTTATCATTCTTGCTGCCTTGGCAGCGAGTTTGTCAATTGCGCATGCAGAAACCCGCTTTACCATTCAAAAAATTGAGTTGGAAGGGAATCAGCGGGTAAGTTTTGAAACCGTTCGAAGTTATTTACCGATTGAAGTGGGTGACTTAATCACTGAGAAAACAATTCAAGAGGGTATTCAAGCACTTTATAAAACGGGCTTTTTTCGAGATATTGCTTTTTTTCAAGCCGGGCAAGGGGTGTTAAAAATTCGAGTATTGGAACGACCTTCTATTTCAGAGGTTAAGCTAGAAGGCAATAAGCTGATTACCAAAGATGAAATGACGATGGCTTTAAGTTCTATGGGGATTAAACAGGGTCGTATCTTTAATGATACGCGTATGGAATCCATCATTCTGGATCTAAGAAGACGCTATCAAAACCAGGGGTACTATGCGGCTGAAGTGGATATTGAAGTCACTGAGCTGGAAAGGAATCGAGTGGCGCTTTTAATTAAAGTTGAAGAAGGGAAGCCGGCAACGATTGGTCGAATTACACTGGTTGGTAACAAAACCTATTTGGATAGTACTTTAAAAAATCAGCTGTTATTAACAGAAACGGCCTTAATCGGGGATTCAAATAAGTACGCAAAACCAAAGCTAGAGTCAGACATCGAAAGTTTGCGATCTTACTATATGGATAGAGGGTTTGCTGAATACGACGTTACCTCTTCACAGGTCAGTTTGTCATTGGATAAAACTCAGGTCTTTATTACGATTAATATGAATGAAGGCCCTCAATATACCGTGTCGAAAATTGATTTCAGCGGTGATCCGGTCTTGGAAAGAACTGAGTTGGAGTCGTTATTACAAATCCAAATTGGCGATTACTTTTCACGTGGGCAAATTGTTGAAACGGTCAATGCGTTGCGTAATCGTTTAAGTGAAGAAGGCTATGCGTTTGCTGAAATTGAACCGATTACGAATTTGGACAAAAACAACCGTTTAGTCAGTTTAGATTTTCGTATTGAACCCAAAAGCCGTGTTTATGTCCGGCGTATACGCATTGAGGGCAATACTCGAACTTGGGATACGGTCATTCGACGTGAATTAAGGCAGTTTGAAAGTGCGCCTTATTCATTAGAAGCTGTTCGCCAGTCCAATTTGCGGTTAAATCAATTGGGGTATTTCCGTACGGCAAGAGTGGGGACGGAGAGAATAACAAAAGACTTAGTTGATTTAGTGGTTAAGGTTGAGGAACAATCGACCGGGTCTTTTAATGCGGGTGTGGGTTATTCTCAAGTCGATGGTATTAGCTTTTCTTTAGGGGTTACTGAACGAAATGTGATTGGTTCTGGTTATAGAACCAATATTAACGCTAGGAGCAGTGCATCCACTAAATATGCAGACGTTAGCGTAACCGATCCTTATTTTACCCAATATGGCGTTTCCTTAACGGGTGCCTTTTACTTTAGACAAGTTGATGCAGCGCAATTAAACGTTGCTGACTATACCACCAATAATCTCGGTGTGAGAACCAGCATTTCTTACCCCACAGATGAGTGGAGTAAGCTCAGTTATGGTCTGAAATTAGATCGACAGGCATTAGAATGTGTCAGTACCTTTTTGGTCTGTAATGATTATGTTGCTCAAACAGATGCCACTGCCAATGAATCGGTGCGTTTAACCTTAGGGTGGCGTAGTAACACCACTAACAGTTACAGTTTTTCAACAGATGGACGAAATTTAAATTTGAGCAGTGAGTTAGTGGTGCCGACAAACTCTGATTTGTCTTTTTATAAACTGTATTTACAAGATTCACATTATTTTCCATTGAATTCAATCTTTACCTTAAAGTTAAAAGGGGATTTGGCTTACGCGGGAACTTATGGAAAAACCAAAGAAATCCCTTTTTACGAAAATTTTTATGCAGGTGGATTTGGAACCGTAAGAGGCTATGAAGCGAATTCATTAGGGGAACGTTATGATCTTGCCACTCAAGGATCTAATCGTCCGATTGGTGGTGCCTATCGTGTTGTTACCAATGCAGAAATCATTTTCCCGATGCCCTTTGTCGAAGATTCTGGCAATTTACGACTGAGTTTTTTTGTTGACGCGGGGAATGTTTTTAATCAGGGTAATAATATTCAGTTACCGGAGTTTCGTTCAGCTACCGGGTTAGCCCTTTCTTGGATAACGCCGGTTGGACCTTTGGCCTTTAGTTTGGCAAAACCCTTGAATTACCGTGAGGGTGATCGCACCCAAGTGTTTCAGTTTAACTTAGGGATTCCAATGTAG
PROTEIN sequence
Length: 765
MVKHFLNFIILAALAASLSIAHAETRFTIQKIELEGNQRVSFETVRSYLPIEVGDLITEKTIQEGIQALYKTGFFRDIAFFQAGQGVLKIRVLERPSISEVKLEGNKLITKDEMTMALSSMGIKQGRIFNDTRMESIILDLRRRYQNQGYYAAEVDIEVTELERNRVALLIKVEEGKPATIGRITLVGNKTYLDSTLKNQLLLTETALIGDSNKYAKPKLESDIESLRSYYMDRGFAEYDVTSSQVSLSLDKTQVFITINMNEGPQYTVSKIDFSGDPVLERTELESLLQIQIGDYFSRGQIVETVNALRNRLSEEGYAFAEIEPITNLDKNNRLVSLDFRIEPKSRVYVRRIRIEGNTRTWDTVIRRELRQFESAPYSLEAVRQSNLRLNQLGYFRTARVGTERITKDLVDLVVKVEEQSTGSFNAGVGYSQVDGISFSLGVTERNVIGSGYRTNINARSSASTKYADVSVTDPYFTQYGVSLTGAFYFRQVDAAQLNVADYTTNNLGVRTSISYPTDEWSKLSYGLKLDRQALECVSTFLVCNDYVAQTDATANESVRLTLGWRSNTTNSYSFSTDGRNLNLSSELVVPTNSDLSFYKLYLQDSHYFPLNSIFTLKLKGDLAYAGTYGKTKEIPFYENFYAGGFGTVRGYEANSLGERYDLATQGSNRPIGGAYRVVTNAEIIFPMPFVEDSGNLRLSFFVDAGNVFNQGNNIQLPEFRSATGLALSWITPVGPLAFSLAKPLNYREGDRTQVFQFNLGIPM*