ggKbase home page

gwf2_scaffold_103_66

Organism: GWF2_TM6_33_332

near complete RP 48 / 55 BSCG 50 / 51 ASCG 12 / 38
Location: 65001..69329

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
DNA-directed RNA polymerase subunit beta {ECO:0000313|EMBL:KKP26568.1}; TaxID=1619073 species="Bacteria; candidate division TM6.;" source="candidate division TM6 bacterium GW2011_GWE2_31_21.;" UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2844
  • Evalue 0.0
rpoB; DNA-directed RNA polymerase beta subunit KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 61.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1826
  • Evalue 0.0
DNA-directed RNA polymerase subunit beta similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 1272
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

GWE2_TM6_31_21 → TM6 → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4329
ATGTCTCATTTTCGAAGAGGTAAAGGCGTTCTTAGAAGGTCTTTTGGAAAAATAAAAGATGTTGTTTCTTTGCCGAACTTAATAGAAGTTCAATCAAAATCATTTAATGATTTTGTGCAGTTAGATTTTTTGCCATCAGAAAGGAAGTCTGTTGGGCTTGAAAAGATATTAAAAGATATTTTTCCAATAGAACACGAGGATTCTATTTCTTTAGAATATGTAAGTTATGAACTAGGTGATTGGGCCTGTTCTTGTGGTCAATTGACTGGGCTTGCAAATCGATATCATTGGAGTTGCTCGAATTGTAAAAAAAGTGGTTATGATAGATTAAACTCTTTAAATGAGTGTCCTAATTGTAAAGAAAAAACAGCAAATTATGTTCCTTGTAAAAAATGTTTATCAAGAGTTTCTGTTGCTTTATCTACAACTGCTGATGAATGTCGATATAGCGGTAAAACTTATTCATTGCCTTTAAAAATAAAAGTACAGCTTGTTTCTTGGGATAAAGATCCTAAAACAGAAAAGAAAATTGTTAAAGATATTAAAGAGCAAGAAGTTTTCTTTGGCGATTTGCCAATGATGGTTGATATTTACGAAGGTGATCACAAAAGGCTTTATTTGGGAAGTTGCGGAACCTTTTTAATAAATGGTGTTGATAGAGTAATAGTTAGCCAAATTCATAGATCTCCCGGAGTTGTTTTTGTTTTAAGCAAAAAATCAAAAGATTTCCGAGGCAATCCTTATCATATGGCAAGAATTATTCCCGCAAGAGGTTCTTGGCTTGATTTCGAATTTGATCACAATGATATTCTTTACGTAAAAATCGATAAAAAAAGAAAAATATTAGTTACAACATTTTTACAGGCTTTGGGAGTTGAAAGAAACGACATTCTTCCTTTATTCTATTCTTTTGAAAACCTATACGTTGAAAATGGCGAGTTTTTGAAAAAGGTTGATAGCACCATTGTTGGACAAAGATTAGAAGCGGGAGTTTTACCAAAAAATGTTGAAAAAGACTTTATTATTGGTAAAAGAATTTCTACTGAAGATTTGAAAAAACTTCAAAAACATAAAATTCAATCATTCTCTATTCGTAAATCAAGTTTGCTAAATCGTGTTGTTGGAGAAGATATAGTTAATCCTAACACCGGTGAAGTAATAGTTGAACAGGGGAGAGCTTTAACGGAGGAATTGTTAACGGAATTGGCTTTTCATGATGGTTTAAGCATAAAAGTTATTCAATCTTCTGGTTACGTTTTCCAACCAACGATAGCTACAACACTTGCGGAAGACGATATTTTTAGTAAAGAAGATTCCGTCAAAGAAATTTACTACAAGCTTCGTCCTGGCGATTCTGCCGAACCTGCTGTCATGGAAGAATATATAAAGAATTTATTTTTCAATGCAAGATTTTATGATTTAAGTAAGCTTGGACGAATTAGAACTAATCGAAAATTAGGTCTTTCTGTAGACGAAAATATTTCAACTTTGACAATGGAAGATGTCATTGCCACTCTTAGATATCTTGTTAATTTGAAAGAGCGTGGCGAGGGCGACCTGGATGATATTGATCATCTTGGTAATCGTTGTGTCAGACTTGTTGGTGAATTGCTTCAAAGTCAGATGTATATTGGTTATGCTCGAATTGAAAAAATTGTTAAGGAAAGATTTAGATTACAAGAACATAATGCAGTATTAATGCCTTATGATTTTTTAAATGTAAAGCCTTTAGCAGCTGTTTTAAAAGAGTTCTTTGGTACAGGTCAGCTTTCACAGTTTATGGATCAAACAAATCCTCTTTCTGAGATTGCTCATAAGCGACGATTGTCTGCTTTCGGTCCTGGTGGTATTACAAGAGAGCGTGCAACATTTGAAGTTCGAGACGTTCATACTTCTCACTATGGTAGAATTTGTCCTATAGAAACTCCAGAAGGTCAAAATATTGGTCTTATTTCTTCTCTTGCTACTTATGCTCGAGTCAATGAGTTAGGTTTCATCGAAACAACTTATAGACCTGTTGAAAATAAAGAGGTAAAAGAAGAAGTCATTTATATGGATGCATTTAATGAGCAAGATGAAATTATTGCTCAAGCAACCGTAAAAACTGATAAAAAAGGCCATATGCTGGAAGACAAAGTTCTTGCTAGAAAAAATGGTAATATTATCGAAGTTGACTCTTCACAAGTAAGTTATGTTGACGCATCTCCAAAACAGCTAGTTTCTGTACCTACATCACTTATTCCATTTTTGGAACACGATGATGCTAACCGAGCTCTTATGGGTTCTAATATGCAACGTCAAGCTGTTCCTTTGATTAAATGCCAGCCTCCTATTGTTGGAACTGGAATGGAACGCGAGTTGGGAGCTCTTGAAGGTGCTGTTATAACAACTAGACATCCTGGAATTGTAAAATATGTAACAGCGGATACGATAATAATTACTCGAGATAAAGAGTCTTATAATCCAGATGAATGGTTCTCGAATCCTCTAGATGTTTATTCCTTAAAAAAATATGCAAGATCTAATCACTGTACTTGGATACATCAAACTCCTATAGTAAAAGTTGGTGACATTGTTAAAAAAGGCGATGTTTTAACTAATGGTGCAGCTGTAGCTAACGGTGAACTTGCTTTAGGTTCAAATGTTTTAGTTGCGTTTATGCCATGGCAAGGTTACAACTTTGAAGATGCTATTGTTTTGAGTAAAAGATTAGTTTCTGAGGATGTTTTTTCATCTGTTCACGTAGAAGAATTTACAGTTGAAGCTAGAGATACCAAGCTTGGACCTGAAGAAATTACTTGCGATATTCCAAATGTTAGCGAAAAAGCTCTTGAATCACTTGATGAAGATGGAATCGTAAAAATAGGTACAAGAGTAAAGCCAGGAGGAATTTTAGTTGGAAAAGTTACTTTAAAAGGTGATATTCAATATTCCCCAGAAGAAAAGCTTCTTAGAGCAATATTTGGTGAAAAATCTAGAGAGGTAAGAGATACTTCTCTAAGAGTTCCACCTGGAATAGAAGGTACAGTTATAAATGTAAAAGTATTTTCTAGAAGTGGTGCCAGAAAAGATAAAAGATATAAAAGAATTGTTGAACTAGAAACTGAAAAAGTAGAGAAAATATTCGCACAACATATTTCAGTTTTGAGCGAAGAAGCTAAAAACAAGATTATATCGATGCTTGATGGTAAAAAATCTAATAAAAAACTTGAAAAATATGCAACAAGTGGTTCTTTCGATAAGAAAAAATTGTCGTCATTAACATTAGACGAATTGTTTGCTTTAGAAATTTCTGATGAAAAAGTTTTGTCAGTAATTAAAGATCTAAAAGAGATTATAAAAAACCAAACATTAGTTTTGATGTCTCAAAAAGAATTGCAAATTAGCAGATTAAAAAAGGGAGACGATCTTCCTTCCGGTGTTATTAAGATGATTCGTGTTTATATTGCTATGAGACGTCCTGTTTCTGTTGGCGATAAAATGGCAGGAAGACACGGAAACAAGGGAGTTGTTTCTCGAATCGTTGATATTGAAGATATGCCTTACATGGAAGATGGTACCCCTGTTGATATAGTTTTAAATCCATTGGGTGTTCCTAGTCGTATGAATATTGGTCAGATATTAGAAACTATTCTAGGTATGGCAGGAAAAGTTTTAGGAAAAAAATTATCTTCAATGATCGAAGAAAAATCATACGAAGAAGTAAAATCATATGTTGCTAATTGGTATGGAGAAAATCTGATCAAAGATATTGAAAAAAAATATGGTAAAGAGTCCATATATGATATAGCAAGAGAATCAGCTCAGCTTGGAATGGCGGTAACAACGCCTATTTTTGATGGAGCTGATTTCAACAAAGATATTCAACCTTTGCTTAAAGAGGCAAATCTTTCAGATCAAGGTATTTGTACATTGTATGATGGAAGAACGGGAGATGCTTTTGATCAGCCAGTAACAGTTGGTTTTATTTATATGATGAAACTTAATCACTTAGCTGATGACAAATTGCATGCACGATCCGTTGGACCTTATTCCTTGATTACTCAGCAGCCTTTAGGAGGTAAAGCTCAATTCGGAGGTCAAAGGCTCGGAGAAATGGAAGTTTGGGCATTGTTTGGTTATGGTGCAGCTTATACATTGCAAGAAATGTTGACTGTAAAATCTGATGATGTAAATGGACGTGTTAAAGTTTATGAATCTATTGTTCGTGGTGAAGATATTCCTGAACCAGGAATTCCAGAGTCATTTAATGTTCTTGTAAAAGAACTACAGAGTTTGGCATTGCAGGTAGATTTATTTAAGGCAAGCAAGGAGCAAATAGGTGAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1443
MSHFRRGKGVLRRSFGKIKDVVSLPNLIEVQSKSFNDFVQLDFLPSERKSVGLEKILKDIFPIEHEDSISLEYVSYELGDWACSCGQLTGLANRYHWSCSNCKKSGYDRLNSLNECPNCKEKTANYVPCKKCLSRVSVALSTTADECRYSGKTYSLPLKIKVQLVSWDKDPKTEKKIVKDIKEQEVFFGDLPMMVDIYEGDHKRLYLGSCGTFLINGVDRVIVSQIHRSPGVVFVLSKKSKDFRGNPYHMARIIPARGSWLDFEFDHNDILYVKIDKKRKILVTTFLQALGVERNDILPLFYSFENLYVENGEFLKKVDSTIVGQRLEAGVLPKNVEKDFIIGKRISTEDLKKLQKHKIQSFSIRKSSLLNRVVGEDIVNPNTGEVIVEQGRALTEELLTELAFHDGLSIKVIQSSGYVFQPTIATTLAEDDIFSKEDSVKEIYYKLRPGDSAEPAVMEEYIKNLFFNARFYDLSKLGRIRTNRKLGLSVDENISTLTMEDVIATLRYLVNLKERGEGDLDDIDHLGNRCVRLVGELLQSQMYIGYARIEKIVKERFRLQEHNAVLMPYDFLNVKPLAAVLKEFFGTGQLSQFMDQTNPLSEIAHKRRLSAFGPGGITRERATFEVRDVHTSHYGRICPIETPEGQNIGLISSLATYARVNELGFIETTYRPVENKEVKEEVIYMDAFNEQDEIIAQATVKTDKKGHMLEDKVLARKNGNIIEVDSSQVSYVDASPKQLVSVPTSLIPFLEHDDANRALMGSNMQRQAVPLIKCQPPIVGTGMERELGALEGAVITTRHPGIVKYVTADTIIITRDKESYNPDEWFSNPLDVYSLKKYARSNHCTWIHQTPIVKVGDIVKKGDVLTNGAAVANGELALGSNVLVAFMPWQGYNFEDAIVLSKRLVSEDVFSSVHVEEFTVEARDTKLGPEEITCDIPNVSEKALESLDEDGIVKIGTRVKPGGILVGKVTLKGDIQYSPEEKLLRAIFGEKSREVRDTSLRVPPGIEGTVINVKVFSRSGARKDKRYKRIVELETEKVEKIFAQHISVLSEEAKNKIISMLDGKKSNKKLEKYATSGSFDKKKLSSLTLDELFALEISDEKVLSVIKDLKEIIKNQTLVLMSQKELQISRLKKGDDLPSGVIKMIRVYIAMRRPVSVGDKMAGRHGNKGVVSRIVDIEDMPYMEDGTPVDIVLNPLGVPSRMNIGQILETILGMAGKVLGKKLSSMIEEKSYEEVKSYVANWYGENLIKDIEKKYGKESIYDIARESAQLGMAVTTPIFDGADFNKDIQPLLKEANLSDQGICTLYDGRTGDAFDQPVTVGFIYMMKLNHLADDKLHARSVGPYSLITQQPLGGKAQFGGQRLGEMEVWALFGYGAAYTLQEMLTVKSDDVNGRVKVYESIVRGEDIPEPGIPESFNVLVKELQSLALQVDLFKASKEQIGE*