ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

gwf2_scaffold_19736_2

Organism: GWF2_TM6_36_6_partial

partial RP 36 / 55 BSCG 37 / 51 MC: 2 ASCG 4 / 38 MC: 1
Location: comp(1203..5498)

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
DNA-directed RNA polymerase subunit beta {ECO:0000313|EMBL:KKQ10752.1}; TaxID=1619082 species="Bacteria; candidate division TM6.;" source="candidate division TM6 bacterium GW2011_GWF2_36_6.;" UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2820
  • Evalue 0.0
rpoB; DNA-directed RNA polymerase beta subunit KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 59.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1753
  • Evalue 0.0
DNA-directed RNA polymerase subunit beta similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 1241
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

GWF2_TM6_36_6_partial → TM6 → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4296
ATGTCTCAATACGGAAGAGGTAAAGGCCTTTTACGAAAATCTTTTAGTAAAATTGAAGAGGTTGTTTCGTTACCAAACCTCATAGAAGTGCAATCAAAATCATTTAATGATTTTGTGCAACTAGATTGTTTGCCTTCTGAACGCAGGAATGTTGGCTTAGAAAAGGTATTTAGAGATACTTTTCCAATTGAGCATAATGAAAAAATTTCTTTGGAATTTATAAGTTATGAGTTAGGTAATTGGGCATGTATTTGTGGGCAAGTTACTGGTGTTGAAAATAGATATAAATGGCAGTGTCGTTCATGTAAAAAAAGTGGACATGGATCGTTAAAAGATTTATGTATATGTCCAAGTTGTAAAAAAGATACGGCTTCATATTCTCGTTGTAAAAAATGCTTTTCGCGCGTTACCATAAAAGTTGATTCCAATGTTGATGATTGCCGATATAGTGGCAAAACCTACTCGATGCCGCTTAAAGTTAAAATGCAATTAATGACATGGGATAATGATCCAGAAACTTCAAAGAGGGTTGTCAGAGACATCAAAGAACAAGATATTTATTTTTGTGATCTACCTGTTATGGTTGATCTTTATGAAGATTATGATGGAAGATATAAGCTTGGCAGCCAGGGAACATTTTTAATTAACGGCGTTGATCGTGTAGTAGTAAGTCAGATTCACCGTGCTCCTGGTGTAATTTTCACAATGAGCAAGAAAAATCGTGACTTTCGTGGTCAGCCTTACCAAGTCGCTCGAATAATTCCTAGCCGTGGTTCGTGGATTGATTTTGAATTTGACCACAACGATATTGTTAACGTTAGAATTGATAAGAAAAAGAAAATTTTAGCTACAACCTTTCTTCAGGCTTTGGGTATTGAAAGAAATGAGATTTTATCTCAATTTTATGAATTTGAGACCATTGAAGTAAAAGGTGATAAGTTTTTTAAAAAAATTAACAATCAGTTGATTGGACAAAGACTTGAAGCTGATTCTATTCCAAAAGAACTTGAAAAACAATTTTCCGTTGGGCAACGTCTTACAAAATCAGCTATAGAAAAATTAATCAAATCTGGCGTAAGTTCGTTAATTGTGCGAAAAAATGCTTTGATTAATAAAGTTGTAGCAAAAGATGTTGTTGATAAGGAAACTGGTGAAATATTGATTACTCAGGGAACTTTTATAACTGAGGAATTGATTGATTCAACATTATGTCTTTTAAAGTCATTCGAAGTAATAAAATCTTCAGGATATGTTTTCCAACCAACAATGGCTCTTACGTTTGATCAGGATAAAATAACAAATCGTGAAGATGCTCTTAAAGAACTTTATAGCAAGTTGAAACCAGGCGATATACAAGAATACATTCAAAATTTGTTCTTCAATTCGCGGTTTTATGATTTGACAATTGTCGGACGAGCAAGAATAAACAGAAAGCTTGGCTTAGATATTGATAAAGATAAGACTTATCTTACTCATGAAGACATTCTTGCCTCATTGCGATATTTGATTGGCCTCAAAGAACGAGGAGAAGGTGAACTTGATGATATCGATCACCTTGGAAACCGTGCAATTCGTCTTGTGGGTGAGTTATTACAATCCCAAATTTATGTTGGTTTTGCAAGAATTGAACGAATAGTAAGAGAGCGTTTTAGATTACAGGAAAATTATGCGTCATTAATGCCGTATGATTTTTTAAATGTTAAACCTCTTGCTGCAGTTCTGCGTGAATTTTTTGGAACAGGCCAATTATCGCAGTTTATGGATCAAACTAATCCGCTTGCTGAGATGGCACATAAGAGACGTTTGTCTGCCCTCGGACCTGGTGGTATAACTCGTGAGCGAGCAACATTTGAAGTTCGCGACGTTCATACCTCTCACTATGGTAGAATTTGTCCAATTGAAACTCCAGAAGGACAAAACATTGGTCTTATTTCGTCTCTATCAACGTATGCGCGTGTTAATGATTTAGGATTTATTGAAACTCCATATCGACCAGTTAAAAACGGCGTAGTTCAGGATGAAGTTTTCTATCTTGATGCCTTTCAGGAGCTGGGTGAAACAATTGCACAGGCATCGACTCTTTTAGATGAAAATCATAAGATTACAGATTCAAGAGTTCTTGCTAGAAAGAATGGAAATATTGTTTCGGTTAATGCTAAAGATGTTTCTTACATTGACGCATCGCCTAGACAAATTTTCTCTGTTCCAACAGGCTTGATCCCATTCCTTGAGCATGACGATGCAAACCGTGCATTAATGGGTTCTAACATGCAACGACAAGCTGTTCCTCTGGTTAAATGTCAGCCTCCTATGGTTGGAACAGGAATGGAAGTTGAAGTTGGAAGTTTAGAAGGCTCGATTGTAAAAGCTCGTACTGAAGGTATTGTTGAATACGTATCTGCAGACAAAATAATTATTCGAGTTGATTTTAACAAGGTCAGCGAAGCAGAATTAATATCAAGACCTATTGAAGTATATAATCTCAAAAAATATGGTCGTTCAAGTCATAATACTTGGATTCATTATGTTCCAAATGTAAAAATTGGTGATAAAATTTCAAAGGGTGATGTAATTGCATCAGGCGCAGCAACTTACAACTCTGAGCTTTCACTTGGCAATGATGTTCTCGTTGCATTTATGCCATGGAATGGTTACAACTTTGAAGACGCAATTGTTTTAAGTAAACGTATGGTTTCTGACGATATGTTTACTTCTGTGCACGTTGAAGAGTTCATTGTTGAGGCTCGCGAAACTAAGTTGGGTGCTGAAGAAATTACAAAAGATATTCCAAACCTTTCAGAAAAAGTATTAGAAGCTCTTGATGAAGATGGAATAGTAAAAATTGGTACGCGAGTAAAACCGGGCAATATTTTGTGTGGTAAGGTGACATTAAAAGGTGATGTTCAAGTATCACCGGAAGAGAAATTATTGCGTGCAATATTTGGTGAAAAATCAAGAGAAGTAAGAGATACATCATTGCGAGTTCCACCTGGAGTTGAGGGGACTGTTGTTGATGTAAAGGTTTTCTCCAGAAGTGGAATTAGAAAAGATAAAAGATATAAAGATATAGCATTAATAGAGACAGCTAAGATTGAAGAAAATTTCAATTTCCATCTTTCAATTCTTAAGGATGGAATAAAAGAAAAATTAGCAGTGCTCCTTGAAAAATGTGAACTTACAAAGGGATCCAAGAAGGATACCATCAAGAAAACTCAAATTGAAAAAATGTCACTTGAAGAAATTCTTGAATTGAAGGTTTCTGATAAAGATGTATCAGACAAGATTAGTATGTATAAAGAAATGTATGCTAATCAAACGCATATTTTAGCTGCGTTGAAGAATGATCGAATTAGTCAACTCCGAAAAGGTGACGATCTACCTTCTGGTGTCATAAAAATGATTAAGGTTTATGTTGCGGCAAAGCGACATGTCTCAGTTGGTGATAAGATGGCTGGTCGACATGGAAACAAAGGTGTCGTATCTACAATTGTTAACCTTGAAGATATGCCATACTTGCACAGTGGAACTCCTGTTGATATCGTTCTTAATCCATTGGGTGTGCCTGGTCGTATGAACGTTGGTCAGATTCTTGAAACCATTTTAGGCATGGCAGGCAAAAAGATGGGTCAGGATTTGGAAGCCGTTATTAACGATTTAAGTTATAACGAAATCAAATCTAAGCTCAGTGATTATTATGGCAAAAAAGTTATTGCTGAAATAGAGAAAGAATATGGCAAAGATGTCATAAATGATCTTGCGCAAAGAACCGTTAAATATGGTGTTGCAATGAAGACGCCAATTTTTGCCGGAGCTGATTATAAGACTGAAATAATGCCTTTGTTAAAATCGCTAGATCTTTCAGAAACAGGTACGTATAAGTTGTTTGATGGAAGAACCGGAGAAACATTTACTCAGCCTGTAACCGTTGGTTATATTCATATGATGAAACTTAACCACTTGGCAGATGATAAATTGCATGCCCGTTCCGTTGGGCCATACTCCTTGATTACGCAACAGCCTCTTGGTGGTAAAGCACAGTTTGGAGGTCAGCGTCTTGGTGAGATGGAAGTATGGGCATTGTATGCTTATGGTGCAGCTTATACATTGCAAGAAATGTTAACGTTAAAATCTGACGACATTAATGGTCGTATCAAGGCTTACGAGGCAATTGTAAGAGGCGAAGAAGTTCCAGAACCTGGAATTCCAGAATCATTTAATGTGTTTGTAAAAGAACTTCAAAGTTTAGGGTTGCAAGTTGATCTTTTAAAAACAAGCAAGGAGCAAGTCGGTGAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1432
MSQYGRGKGLLRKSFSKIEEVVSLPNLIEVQSKSFNDFVQLDCLPSERRNVGLEKVFRDTFPIEHNEKISLEFISYELGNWACICGQVTGVENRYKWQCRSCKKSGHGSLKDLCICPSCKKDTASYSRCKKCFSRVTIKVDSNVDDCRYSGKTYSMPLKVKMQLMTWDNDPETSKRVVRDIKEQDIYFCDLPVMVDLYEDYDGRYKLGSQGTFLINGVDRVVVSQIHRAPGVIFTMSKKNRDFRGQPYQVARIIPSRGSWIDFEFDHNDIVNVRIDKKKKILATTFLQALGIERNEILSQFYEFETIEVKGDKFFKKINNQLIGQRLEADSIPKELEKQFSVGQRLTKSAIEKLIKSGVSSLIVRKNALINKVVAKDVVDKETGEILITQGTFITEELIDSTLCLLKSFEVIKSSGYVFQPTMALTFDQDKITNREDALKELYSKLKPGDIQEYIQNLFFNSRFYDLTIVGRARINRKLGLDIDKDKTYLTHEDILASLRYLIGLKERGEGELDDIDHLGNRAIRLVGELLQSQIYVGFARIERIVRERFRLQENYASLMPYDFLNVKPLAAVLREFFGTGQLSQFMDQTNPLAEMAHKRRLSALGPGGITRERATFEVRDVHTSHYGRICPIETPEGQNIGLISSLSTYARVNDLGFIETPYRPVKNGVVQDEVFYLDAFQELGETIAQASTLLDENHKITDSRVLARKNGNIVSVNAKDVSYIDASPRQIFSVPTGLIPFLEHDDANRALMGSNMQRQAVPLVKCQPPMVGTGMEVEVGSLEGSIVKARTEGIVEYVSADKIIIRVDFNKVSEAELISRPIEVYNLKKYGRSSHNTWIHYVPNVKIGDKISKGDVIASGAATYNSELSLGNDVLVAFMPWNGYNFEDAIVLSKRMVSDDMFTSVHVEEFIVEARETKLGAEEITKDIPNLSEKVLEALDEDGIVKIGTRVKPGNILCGKVTLKGDVQVSPEEKLLRAIFGEKSREVRDTSLRVPPGVEGTVVDVKVFSRSGIRKDKRYKDIALIETAKIEENFNFHLSILKDGIKEKLAVLLEKCELTKGSKKDTIKKTQIEKMSLEEILELKVSDKDVSDKISMYKEMYANQTHILAALKNDRISQLRKGDDLPSGVIKMIKVYVAAKRHVSVGDKMAGRHGNKGVVSTIVNLEDMPYLHSGTPVDIVLNPLGVPGRMNVGQILETILGMAGKKMGQDLEAVINDLSYNEIKSKLSDYYGKKVIAEIEKEYGKDVINDLAQRTVKYGVAMKTPIFAGADYKTEIMPLLKSLDLSETGTYKLFDGRTGETFTQPVTVGYIHMMKLNHLADDKLHARSVGPYSLITQQPLGGKAQFGGQRLGEMEVWALYAYGAAYTLQEMLTLKSDDINGRIKAYEAIVRGEEVPEPGIPESFNVFVKELQSLGLQVDLLKTSKEQVGE*