ggKbase home page

gwf2_scaffold_18179_2

Organism: GWF2_OD1_43_38_partial

partial RP 34 / 55 MC: 1 BSCG 35 / 51 MC: 4 ASCG 5 / 38
Location: comp(1595..3979)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TPR domain protein {ECO:0000313|EMBL:KKS79487.1}; TaxID=1618938 species="Bacteria; Parcubacteria.;" source="Parcubacteria bacterium GW2011_GWD1_42_9.;" UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 794.0
  • Bit_score: 1543
  • Evalue 0.0
Tetratricopeptide TPR_2 KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 26.6
  • Coverage: 703.0
  • Bit_score: 216
  • Evalue 2.50e-53
TPR domain protein similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 71
  • Evalue 9.00e+00

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Parcubacteria bacterium GW2011_GWD1_42_9 → Parcubacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2385
ATGGATATTAGTCAAATAACCTCTGCATTTTCACCAGTTCCGCCCACCCCGCAGTCTGGAGTGTGGCAAGTTTTGGCCAAGGTAAATCGGTGGGGCCTTAGGCTATTAACTTTGTTGTTACCTCTGTTCATTTTGCCTTTTACTTTTGAGGCTTTTGAGTTTAGCAAGCAAGTACTGCTTATTGGCCTAGGCTTTATTTTATTGGTTATTTGGTTTAGCCAGGCTGTGGCTAGCCGTCAGGCTAGTATGCTGAAATCACCGCTTAATTGGGCGGCCCTAGCTTTATTGGTAGTGACCATTGTCGCCGCTGTAACTTCAGTTGATCCGATTAATTCAATATTAGGTTATTACGGCAGATTCAATGGCGGAGTAGTTAGCTTGGTTGGCTATTTGTTATTCTTCTTTTTAGTAACTGTAAATTCTAGAACACGCGAAGATATTCATTGGTTGTTAGGATCCTGGCTTAGTGGTGTGGGTTTGAGCAGTCTGATTTTATTGGTGCAACTCTTGGGTGCACGCTGGCTGCCATTTGCCTTTGCTCAAGTGTCTAGTTTTACGCCCCTAGGCGGAGCCCTGAACGCCGTGGTTTTAATTTTGGCAGCTTCTTTCCCGCTGGCTATTTATTTTTCTCGTTCAGCCAGCAAAGCTTGGTTGCGTATTTTGAATATTTTGCTGGCGGTGTTAACGATCGTATTAGTTTTTATGGTTGATTACCATTTTGGTTGGTTGGGGTTAGGTGTAGGTTCATTGGTCTGGCTTGGCTTATTGTTTTATAAAAATGAGAGCACCAGTTTCCAATGGACTGTTATTCCCGCTATTGCCATTTTATTGAGTGTGATTGCTTGGCCGCTGGTGTTGGTAAATATCACCCGGGTTTCAGTGCCGGTGGAAGTAAACTTATCATTACCGGCTAGCTGGCGTATTGCCTTGCAGAATGCCAAAAGTAATCCTTTGCTTGGTACTGGACCAGATACATTCAGTTATGGTTTTTCTAAATTCAAACCAGATGGTTTTAATGATTCTAATTTTTGGTCTTTCCGTTTTGACCGGGCTACTTCAGAATATGCCCAACTCTTAAGCACTACCGGTTTCTTAGGTCTGGCAGTTTATTTGGCCGTGTTTATTATGGGTTTGTATTTGTGCTGGCGAGTGTTGAAAGACAAACAAGCTAATGATTGGTATTTGCGTGCTGTTTTGGCTGCTAGTTTTGTCGTTTTAGTGACGGCTCAGGGAGTTTATTTCTTAAATACCGTCATGGCGGTAATGACGTGGCTGGTGTTGGGCTTGCTGGCAGTTGTCAGCAGCCGTGGCGAGAGAAACTTATCTTTAACTGATTCGCCACGAACCTCACTATCATTTTCTTTTGGTTTGGCTGTAGTTGTTTTGGTTGGGGTGGCGGTGTGGCTGGGGCTTGGGCGATTTTGGTTGGCTGATGTGGCTTATGCCAAAGCTCAGCGCGCGCCTTTGACAGTTGAAGGACTAAAACAAGCTGAAATAGATTTACTCAACTCTATTAATTTAAATCCCTGGCGAGATACATATCGTGTAACTTTAGCTCAAGTGTATTTGGGACTGGCTAATTATGAAGCCAGTCAACCAGTAGCTGAGAAAAAAGAAGATCAAGAAGTCCAAATAGCCCGTTTGCAAAGTTATATTGCCTCATCTATTTCCGCCGCTCGTTCCGCCACCGAGTTAGCCAGTCAAAGTGTGTCCAATTGGGAAGTGCTCGGCTCAATTTATCGAGGTACTGTTTTGTTTGCCCGTGACGCTGAACCTTGGGTGATAGCTTCTTTCCAAAAAGCAATTGACCTTGATCCGACCAATCCAGCATTGGTTACTGAATTAGGCAAAGCTTATCTAGTCTCTGCTAGTCGTAAACAACAGCTGGCCCAACAAGCGACTGATGAAGAAAAAGGAAAACTTGAAGCGGAGGCTTCCCAGCAATTAACTTTGGCGCAAGAACAATTCAGTCGCGCAATTAGTTTAAAGGCTGATTATTCCCCAGCCCATTTTCAGGAAGTAGTCGCTTTGGAATTGCAGGGTAAGTTTACTGAAGCTATAGATAAATTAGAGCGGCTGCGTCAGTCAATTCCTCAAGACATTGATGTTTTATATGAACTTGGAAGCTTGGCTTATAACACGAGCGATTATAATAAAGCGGAAGAAGCATTTGTCACAATTACGGCTTTGGTACCGAATCACTCCAACGCTCACTTTAGTTTAAGTTTGGTGTATCAGAAAAAAGGTGAAACTGATAAGGCAATTACCGAGCTAGAAAAGGTTTTAGAGCTTAACCCGGGCAATGAACAGGTAACAAAGTTACTGGATGATTTAAAAGCTGGTAAAACTGAAGAGCCAACTGCACCCGAAACGCCGCAACCATAA
PROTEIN sequence
Length: 795
MDISQITSAFSPVPPTPQSGVWQVLAKVNRWGLRLLTLLLPLFILPFTFEAFEFSKQVLLIGLGFILLVIWFSQAVASRQASMLKSPLNWAALALLVVTIVAAVTSVDPINSILGYYGRFNGGVVSLVGYLLFFFLVTVNSRTREDIHWLLGSWLSGVGLSSLILLVQLLGARWLPFAFAQVSSFTPLGGALNAVVLILAASFPLAIYFSRSASKAWLRILNILLAVLTIVLVFMVDYHFGWLGLGVGSLVWLGLLFYKNESTSFQWTVIPAIAILLSVIAWPLVLVNITRVSVPVEVNLSLPASWRIALQNAKSNPLLGTGPDTFSYGFSKFKPDGFNDSNFWSFRFDRATSEYAQLLSTTGFLGLAVYLAVFIMGLYLCWRVLKDKQANDWYLRAVLAASFVVLVTAQGVYFLNTVMAVMTWLVLGLLAVVSSRGERNLSLTDSPRTSLSFSFGLAVVVLVGVAVWLGLGRFWLADVAYAKAQRAPLTVEGLKQAEIDLLNSINLNPWRDTYRVTLAQVYLGLANYEASQPVAEKKEDQEVQIARLQSYIASSISAARSATELASQSVSNWEVLGSIYRGTVLFARDAEPWVIASFQKAIDLDPTNPALVTELGKAYLVSASRKQQLAQQATDEEKGKLEAEASQQLTLAQEQFSRAISLKADYSPAHFQEVVALELQGKFTEAIDKLERLRQSIPQDIDVLYELGSLAYNTSDYNKAEEAFVTITALVPNHSNAHFSLSLVYQKKGETDKAITELEKVLELNPGNEQVTKLLDDLKAGKTEEPTAPETPQP*