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gwa2_scaffold_16311_3

Organism: GWA2_OD1_39_24

partial RP 29 / 55 MC: 2 BSCG 28 / 51 MC: 3 ASCG 3 / 38
Location: comp(4153..7650)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
DNA-directed RNA polymerase subunit beta {ECO:0000313|EMBL:KKR15055.1}; TaxID=1618634 species="Bacteria; Parcubacteria.;" source="Parcubacteria (Falkowbacteria) bacterium GW2011_GWA2_39_24.;" UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2278
  • Evalue 0.0
DNA-directed RNA polymerase subunit beta KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 55.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1257
  • Evalue 0.0
DNA-directed RNA polymerase subunit beta similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 1256
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

GWA2_OD1_39_24 → Falkowbacteria → Parcubacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3498
ATGCCCATGCCTGATTTGATTGAAGTGCAAAAAGATTCCTATGTCTGGTTTATTAAAGAGGGCTTGCGAGAATTATTTGATGAATTCTCTCCCATCACCGATTTTATCGGTCGTGACTTGGAATTAACTTTCGGCGATTACTATTTTGATGAGCCAAAGTTTTCTGAGGCAGAAAGCAAAGCTAAAAATATCAGTTATGAATCTGCTTTGCGCATTCAGGTTACTTTAAACAACAAAAAGACCGAACAAAAAACTACCCAAGAAGTATTTTTGGGCGACTTCCCCGTGATTACCAAGAACGGCACTTTTGTTATCAACGGTATTGAACGAGCCATTGTTTCCCAGTTGATCCGTAGTGCCGGTGTTATTTTTTCTTCCAATCAAATCAAAGATCGCAATTATTATGGTTCCAAAATTATTCCTAATCGTGGTGCTTGGATTGAAATGGAAGAAGATGCTGCTAAAGTTATTTGGGTGCGCATTGATCGTAAGCGTAAAGTCTCTGTCACTTCTTTACTGCGTGCTTTTGGTTACAGTACTAATGAAGAAATTAAACAGCTGTTTACCACTGCTAATAATTCATATATTGCCGAACATAAATTAGATGAAGCTGAAGTTTTGTCTTACATTGAGGCCAGCATTGCCAAGGATGCTTCCAGTAATGAAGAAGAGGGCTTAATTGAAGTTTACAAACGTATTCGTCCCGGAGATTTAGCGACCGCTGATAATGCCAAGAGTTTGATCTATTCCATGTTCTTCCGCTTTGATCGTTATGATTTTGATCGTGTTGGTCGCTACAAACTGAATAAACGTTTTGGTTTTAATATACCTAACAACAAAGAAACTCGCATTTTGCGTCGCGAAGATTTGATTGCCATTATTAGTGAATTAATTAGATTGTCAATCAATCAGGATTCGGCCGATGATATTGATCATCTCGGTAACCGTCGCGTACGCGCCATTGGCGAATTATTGCAGAACAAAACTCGTGTTGGTTTTTCTCGCATGGAACGTATTATTCGTGACCGCATGTCCATTATGGATATGGACACTTTAACGCCCAATAAACTGATTAACGCCCGTCCTTTGATTTCCGTAGTCAAGGAATTTTTTATGTCTTCCCAATTATCTCAGTTCATGGATCAAACCAATCCCATTGCTGAATTGGAACACAAACGACGTTTGTCAGCCCTAGGTCCGGGCGGTTTGACCCGTGAGCGTGCTGGTTTTGAAGTGCGCGATGTGCACTCCACTCACTATGGTCGTATTTGTCCAATTGCTACTCCGGAAGGACCGAATATTGGTTTAGTCGGCCATTTCGCCACTTATGCTAAACTAAACAGCTATGGCTTTATTGAATCTCCCTATCGCAAAGTGTTACATGATATCAAGAATGATCCTAGTCTGACCGTGGGCCGAATTGCTCGTGAAGACATCTATGATGACCGTGGTAAAAAGGTTTTGGTTAAAGCCGGCACCAAGATTGATGATCAGATGGCTAAACTATTAGTCGCTGAAGCTGGCCAAGTTTTAATTCCTATTAAACCACAAATCACTCATGAAATTGAATACTTAGACGCTTTCACTGAAGAAAAATATATTACCACTGATTTTAATGCGCCTTACGATGCTAATGGTTATTTTTTGGTAGATAAGACTGAGGTTAGAAAATATGGTGAGCCAGCCATTGAAGACGTCAGCAAGATTGACTATATCGGTGTGGCCGCTAACCAAATTGTTTCCGTGGCTACTTCTTTAATTCCTTTCTTAGAACATGATGATGGTATTCGCGCTTTGATGGGTACTAATATGCAACGTCAGGCCGTGCCTTTACTTAATGCCCAAGCGCCGATTGTTGGCACTGGCGTAGAATATCGTGCTGCTAAAGACTCTGGCCATGTGGTCGTAGCGGAAATGACTGGTGAAGTTTTCAAGGTGGACGGCAACCATATTATTCTGAAAGACAAGGAAGGTAACAAGATTGAATACAAATTAAACAAGTTTTTGCGCTCCAATGCCCTGACCTGTATTAATCAGAAACCAATTGTTAAGCGGGGTGACAAAGTTAAGGTCGGTGATATTTTAACCGATGCTTCAGCCATCGACAATGGCGAGTTAGCCTTGGGTAATAATATCTTAGTGGGTTTTATGACTTGGGAAGGTTTTAATTATGAAGACGCTATTATAATTTCTGAACGTTTAGTTAAAGAAGACACCTATTCTTCCATCCATATTGAAAACTATACTATTGACGTGCGCGATACCAAATTGGGACCGGAAGTCGTGACTAATGATATTCCTAATATCTCTGAAGAAAAATTAAAGAATCTAGATGAGCACGGTATTATCCGCATTGGCGCTGAAGTTTCTTCTGGCGATATTTTGGCTGGGAAGATTACGCCCAAAGGCGAAACTGAATTATCAGCTGAGGAAAAACTATTACGAGCTATTTTCGGTGACAAGGCCAAGGATGTTAGAGATTCTTCTCTGTATTTGGAACATGGTGAGCATGGTCGCGTGATTGATGTGAATATTTTCAGCCGTGAGCAGGGTGACAAGCTATCTACCGGTGTGATTCAATCCATTCAGATAACTATTGCTAATTTACGCAAGGTCAGACAGGGCGACAAGATGGCGGGACGTCATGGTAACAAGGGTGTTATTTCTCGCATTGTGCCTATTGAAGATATGCCTTATTTAGCTGATGGCACGCCTTTGGATATTATTCTTTCTCCTTTGGGTGTTGTCTCTCGTATGAACTTAGGCCAATTACTGGAAACTCATTTGGGTTTTGCTGCTAAGAAACTTAATATCAAAGTGGCTACCCCACCTTTGAATGGTATTCCTGAAAGCAAGATTCGCGAACTGCTGAGAGAAGCTGGTTTGTCTGAAGACGGTAAATCTACTCTCTATGATGGTAAAAGTGGCGAGAGTTTTGATAATCAAGTAACTGTGGGCTACAAATATATGTTGAAGCTGAATCATATGGTGGAAGACAAGATCCACCAACGTTCCATTGGCCCTTACTCTTTGATTACCCAACAGCCTTTAGGTGGTAAAGCTCAATTTGGTGGCCAGCGTTTTGGTGAAATGGAAGTTTGGGCTTTGGAAGCTTATGGCGCTGCCCATAATTTACAGGAAATTTTGACTATTAAGTCCGATGATGTCTCTGGACGTAGTAAGGCTTACGAGGCAATCATTAAAGGTGAAACAATTAGGAAACTTAACGTTCCGGAGTCGTTCAACGTGTTAGTACGTGAACTCAAAGGTCTGGCTCTGGATGTGGAATTATTAGACAAGGACGACAAGGCGGTTGATATGGAACAGCTTGATCAACAGAACCAATTAATAGCTAAAGAAGAGGCCAGATTGAAACGTGAAGAGCTTTTGGCCATAGTAGCTGATGCAGATGATGAGGTTATTAAGCAAGAGGAACTGGTGGCTGAATTACCCGTAGTGGAAGAAGAGGCTCCCGTCGTCGAGAAAGCTGAAGAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1166
MPMPDLIEVQKDSYVWFIKEGLRELFDEFSPITDFIGRDLELTFGDYYFDEPKFSEAESKAKNISYESALRIQVTLNNKKTEQKTTQEVFLGDFPVITKNGTFVINGIERAIVSQLIRSAGVIFSSNQIKDRNYYGSKIIPNRGAWIEMEEDAAKVIWVRIDRKRKVSVTSLLRAFGYSTNEEIKQLFTTANNSYIAEHKLDEAEVLSYIEASIAKDASSNEEEGLIEVYKRIRPGDLATADNAKSLIYSMFFRFDRYDFDRVGRYKLNKRFGFNIPNNKETRILRREDLIAIISELIRLSINQDSADDIDHLGNRRVRAIGELLQNKTRVGFSRMERIIRDRMSIMDMDTLTPNKLINARPLISVVKEFFMSSQLSQFMDQTNPIAELEHKRRLSALGPGGLTRERAGFEVRDVHSTHYGRICPIATPEGPNIGLVGHFATYAKLNSYGFIESPYRKVLHDIKNDPSLTVGRIAREDIYDDRGKKVLVKAGTKIDDQMAKLLVAEAGQVLIPIKPQITHEIEYLDAFTEEKYITTDFNAPYDANGYFLVDKTEVRKYGEPAIEDVSKIDYIGVAANQIVSVATSLIPFLEHDDGIRALMGTNMQRQAVPLLNAQAPIVGTGVEYRAAKDSGHVVVAEMTGEVFKVDGNHIILKDKEGNKIEYKLNKFLRSNALTCINQKPIVKRGDKVKVGDILTDASAIDNGELALGNNILVGFMTWEGFNYEDAIIISERLVKEDTYSSIHIENYTIDVRDTKLGPEVVTNDIPNISEEKLKNLDEHGIIRIGAEVSSGDILAGKITPKGETELSAEEKLLRAIFGDKAKDVRDSSLYLEHGEHGRVIDVNIFSREQGDKLSTGVIQSIQITIANLRKVRQGDKMAGRHGNKGVISRIVPIEDMPYLADGTPLDIILSPLGVVSRMNLGQLLETHLGFAAKKLNIKVATPPLNGIPESKIRELLREAGLSEDGKSTLYDGKSGESFDNQVTVGYKYMLKLNHMVEDKIHQRSIGPYSLITQQPLGGKAQFGGQRFGEMEVWALEAYGAAHNLQEILTIKSDDVSGRSKAYEAIIKGETIRKLNVPESFNVLVRELKGLALDVELLDKDDKAVDMEQLDQQNQLIAKEEARLKREELLAIVADADDEVIKQEELVAELPVVEEEAPVVEKAEE*