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gwa2_scaffold_7265_17

Organism: GWA2_Berkelbacteria_35_9

near complete RP 41 / 55 BSCG 43 / 51 ASCG 12 / 38
Location: comp(11808..15413)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
rpoC; DNA-directed RNA polymerase subunit beta' (EC:2.7.7.6) KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 45.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1006
  • Evalue 5.70e-291
DNA-directed RNA polymerase subunit beta Tax=GWA2_Berkelbacteria_35_9 UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2353
  • Evalue 0.0
DNA-directed RNA polymerase subunit beta similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 996
  • Evalue 4.00e+00

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

GWA2_Berkelbacteria_35_9 → Berkelbacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3606
ATGACACACAACACACTAACCAGTTTAAATGATTTTGACAAGATAAGAGTCAAAATTGCTTCCCCGGAAGATATAAACAAATGGTCAAATGGTGAAATTTTGAAACCAGAAACGATTAATTACCGAACCCAAAAACCTGAAAGGGATGGTCTATTTTGTGAAAAAATCTTTGGTCCAACTAAAGATTATGAGTGTTATTGTGGAAAATATAAAAAAATCCGCTATAAGGGTGTAGTGTGTGATAAGTGTGGAGTTGAAGTTATGTCGATGAGTGATATTGAAAAAGTTGTCTACTTCGCTTCGTTTGTTGTTCTCGAGATTAATGAAGAGGTAAAAAATGACTTAATGAAACAACTTGATGAAGAATATGAACAAATCAAACAAACAAAAAATCGAGATAGTTTAATGTCAATTGAGTCTGAATACAAAAAAACTAAAAATGAAATTTGCTCTTTGTCGGTTGGGCAACTTGTTAATGAGCAAGATTATTTTATCATCAGTGAAAAGTATGGCAATCTTGTTCGAGTTGGTATCGGTGCCGAAGCAATTTATGAATTGTTGAAAAAAATTGATCTAACTAAAGCTTTAGAAGAACTTGAAGCCACTATTGCTGAAAATCGACATGATTATAGCTATATCAAAAAAGAATTGCGTCGCTATCGAGTTATTAAAAAAATGGCAAAAGCCGGTATTAAACCCGAATGGACAATACTTACCAAACTGCCAGTTCTACCGCCAGATTTAAGACCGATGGTTCAACTCGATGGTGGTCGTTTTGCAGCCAGTGATTTGAACGATCTTTATCGAAGAATTATCAATCGCAACAATCGCCTAAAAAAACTAAATGAATCCGGTGCTCCAGAAGTTATTACTCGTAACGAACGAAGAATGTTGCAGGAAGCTGTCGATGCTTTAATTGACAATACTAACCGAAGAGATAAATCCCCACAAATGACTGCTGCGGGCAGAAAGCTCCGTTCCCTTTCCGATATGTTGAGAGGAAAACAAGGTCGTTTTAGACAAAACCTTTTAGGAAAAAGAGTCGATTATTCAGGTAGAAGTGTGATTGTGGTTGGACCAGAGTTACAACTAAATGAATGCGGATTGCCTAAGAAAATGGCGCTGGAATTGTTTAAACCTTATGTAATTTCAAAATTAATTGAAGAGGGTTATGTACATAATGTTAAAAATGCTTCAAAATTAATCTCCCAAAATACCCCTGAGGTTTGGGATATATTAGAAAGAATTATCAAAGTTTCTTATGTTTTACTCAACCGAGCACCAACCCTTCACCGTCTCGGAATTGAAGCCTTTCAACCAAAATTAGTTGAAGGAAAATCAATCCGAATTCATCCATTAGTCTGTTATGCTTTTAACGCTGACTTTGATGGTGACCAAATGGCTGTTCATGTTCCGTTATCAAAACAAGCGGTTGATGAAGCAAAAAATATTATTTTAGCCTCAAAAAATTTACTTAAACCTGCGTCTGGAGAACCAACTGTTCATCCAAATTATGATATTATTTACGGTTGTTTCTATATTACCAGTATCAAGGAAAACGCTAAGGGCGAGAATAAATCATTTTCTTCAAAGAATGATACAATCTCTGCTTATCAATCAGATATTATCGATCTCCAAGCATTGATTAAAACTAGAATCAATGATCAATTAATTGATACTACGGTAGGACGCATATTGTTTAACAATTTGCTACCAAAAGAAATCGACTTTATCAATGAAGAAATAACTAGTAAAAAACTCAAAAAAATAGTTAGTCAAATTTATCGAGCCTACGGCTCACTCAAAACTGCAAAATTTGTCGATGATTTAAAAGATATAGGTTTTGAATATGCCACAATTTCAGGACTGACTATTGCGATTGAAGATGTTATTGTTCCTGAAAGTAAACATCAATTAATAAAAAATGGGGAAAAAGAATCTGAAGAAATTGAAAATCAATTTACACTTGGGTTGATTACCGAAAATGAAAAAAAATATAAAATTATCGAATGTTGGCAAAATATTCGATATCAAATTGAAAAAACAATGATTTCCGAATATAAGCATGATAATAATATTTTTCAAACCGTTTCATCTGGTGCTCGTGGTTCGTTTGCTCAAGTTATTCAGATGGGTGGAATGAAAGGTTTGGTAGTTAATCCAGCTGGAGAAATTATTACTCATCCAGTAAAATCATCCTTCAAAGAAGGACTGGATGTTTATGAATACTTTATTTCTTCCCATGCTGCTAGAAAAGGAAAATCAGATACTTCCCTGAAAACATCTGACGCCGGATATTTAACTAGGAGATTAGTTGATGTTGCCCAAGATGTGGTTATTTCAGAGGAAGATTGTCAAACCAAAAAAGGTATGATTGTCTACAATATCGAAGGCGAAGATTTTATGCAATCATTTGACAAAAAAATTCTCGGTCGTGTTGCCTTGAAAGATATAAAAATAGCTAATAGGGTAGTTGTTAAGGCTAATGAAATTATTAACGAAGATGCGGTTAAGTTGATTTGTGATGCTAATCTTGAATCAATTGAGGTTCGAAGCCCTATTTATTGCCAAACTAAATGGGGTATTTGCCAAAATTGTTATGGTAGAGATTTGGCAACTGGTAATATTGTCAATATCGGCGAAGCAGTTGGTATTATCGCTGCACAAGCGATTGGGGAACCAGGTACTCAGTTAACCATGCAGACTTTTCATGTCGGTGGAGTACAAGGTTCAGGTGATGTTACGACTGGATTGCCTCGAGTTGAAGAATTGTTTGAAGCTCGACCTCCAAAAAAATCAGCAGTAATTAGCCATATTGATGGAAAAGTAAAGATTATTGAAAGTAAAAACTTTACAACAATTCAAGTTTCCTCAGGAATTCCTCAAAAAAATAGCCTTGAAATTCCTGATAATTATTCTATTTGTGTTAAGGATGGCGACGAGATTAAAGCCAAACAATCAATCGCTACGCATAAAACTGAAAAAGCGATTCGAGCCACTATATCTGGTACAATTAAGATAGATAAGAATATTGTTACAATCTCATCAACTGAAGATTTGGTTTTTGAGGCTATCGTAAATCCTAATACTAATTTATTAGTTGAGGGCGGAGAAGAAGTTAAAAAAGGACAAGTATTAACCGACGATTATTTGAACCTTTCGGATGGTTTGAGATTGATTGGATCAGAACCAATTCAACAATATATCATAAATGAGGTTCAAAAAATTTATCAAGTCCAAGGACAAGATATTCATGATAAACATATCGAAATAATTCTACGAAAAATGTTTTCAAAAAGATTAATTCTTGATCCTGGCGATAGCGAAGAGATTCCCGGTCAATTAATTGATTTAATCGAACTAGAAAATATTAACGCTGAGTTGGCTAAGAATAAAAAGAAACCAATCGTGTCTGAAATGGTAATTCTTGGAGTTAGTCGAATTTCGCTTAAAACAAAAAGCTTCTTATCGGCTGCATCTTTCCAAGAAACAACCAATGTTTTGATTGAAGCTGCTAGCTCAGGTCAAATCGATAACCTTGAAGGATTGAAAGAAAATGTTATAATAGGTAGGTTAATCCCAGCTGGTACAGGATTTAAAAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1202
MTHNTLTSLNDFDKIRVKIASPEDINKWSNGEILKPETINYRTQKPERDGLFCEKIFGPTKDYECYCGKYKKIRYKGVVCDKCGVEVMSMSDIEKVVYFASFVVLEINEEVKNDLMKQLDEEYEQIKQTKNRDSLMSIESEYKKTKNEICSLSVGQLVNEQDYFIISEKYGNLVRVGIGAEAIYELLKKIDLTKALEELEATIAENRHDYSYIKKELRRYRVIKKMAKAGIKPEWTILTKLPVLPPDLRPMVQLDGGRFAASDLNDLYRRIINRNNRLKKLNESGAPEVITRNERRMLQEAVDALIDNTNRRDKSPQMTAAGRKLRSLSDMLRGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPELQLNECGLPKKMALELFKPYVISKLIEEGYVHNVKNASKLISQNTPEVWDILERIIKVSYVLLNRAPTLHRLGIEAFQPKLVEGKSIRIHPLVCYAFNADFDGDQMAVHVPLSKQAVDEAKNIILASKNLLKPASGEPTVHPNYDIIYGCFYITSIKENAKGENKSFSSKNDTISAYQSDIIDLQALIKTRINDQLIDTTVGRILFNNLLPKEIDFINEEITSKKLKKIVSQIYRAYGSLKTAKFVDDLKDIGFEYATISGLTIAIEDVIVPESKHQLIKNGEKESEEIENQFTLGLITENEKKYKIIECWQNIRYQIEKTMISEYKHDNNIFQTVSSGARGSFAQVIQMGGMKGLVVNPAGEIITHPVKSSFKEGLDVYEYFISSHAARKGKSDTSLKTSDAGYLTRRLVDVAQDVVISEEDCQTKKGMIVYNIEGEDFMQSFDKKILGRVALKDIKIANRVVVKANEIINEDAVKLICDANLESIEVRSPIYCQTKWGICQNCYGRDLATGNIVNIGEAVGIIAAQAIGEPGTQLTMQTFHVGGVQGSGDVTTGLPRVEELFEARPPKKSAVISHIDGKVKIIESKNFTTIQVSSGIPQKNSLEIPDNYSICVKDGDEIKAKQSIATHKTEKAIRATISGTIKIDKNIVTISSTEDLVFEAIVNPNTNLLVEGGEEVKKGQVLTDDYLNLSDGLRLIGSEPIQQYIINEVQKIYQVQGQDIHDKHIEIILRKMFSKRLILDPGDSEEIPGQLIDLIELENINAELAKNKKKPIVSEMVILGVSRISLKTKSFLSAASFQETTNVLIEAASSGQIDNLEGLKENVIIGRLIPAGTGFKK*