ggKbase home page

gwc2_scaffold_27_4

Organism: GWC2_OD1-rel_40_17

near complete RP 48 / 55 BSCG 48 / 51 ASCG 12 / 38
Location: 5308..7458

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein {ECO:0000313|EMBL:KKS57364.1}; TaxID=1619039 species="Bacteria; Parcubacteria.;" source="Parcubacteria (Magasanikbacteria) bacterium GW2011_GWA2_42_32.;" UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 716.0
  • Bit_score: 1428
  • Evalue 0.0
hypothetical protein KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 27.8
  • Coverage: 266.0
  • Bit_score: 79
  • Evalue 3.30e-12
Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 79
  • Evalue 4.00e+00

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

GWA2_OD1_42_32 → Magasanikbacteria → Parcubacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2151
ATGTTAGAAAAAAAGCTAGTTTGGGCGATTAAATTTTTAATTTACGCTTCTTTTATCATGCCCTTAATTGTCATGGGTGATGTTTTTATTTTCCCTTTTGTTTTTCCCAAGGCTATTTATTTTAGAATTTTAGTGGAATTGATGTTGGGGATTTATGTTTTGCTTTGCCTTGTCAACAAAAATTATCGGCCGCAAAAAAATAATGTTTTTTGGGCAGTACTTATTTGGGCCACGGCTTTGCTTCTTGCTTGTGTCTTTGGCACGGATGTTGGGCGTAGTTTTTGGGGAAATTTTGAACGCATGAGCGGTTGGTTTACTTTGATTCACTTTGCTCTTTATTTTGTAGTTGTTTCCGCAACTTTAAAAATGTGGGAAGAATGGAGGAATCTTTTTCGTTGGGGGTTGCTTTGGAGTTTTTTTGTCGGTTTAACCGGTTTAAATTTTTTATTGCCGTCAAATTCCATTATGAGGATCGGCGGAGGAGGGAGCTTGGGAAACCAAATTTACATTGCTAATTATATTTTATTTTTTATTTTTATTGCCGGTTATTTATTTAAACGGGAAGAAAAAAAGTTATGGAAGTTTTTTTCCGCCGCCTATATAGTTATTGGCATCGTCCTTATGCTTTATAACGGCAAAAGAGGACCATTTATCGGTTTACTTGCCGGTATTTTTGTAGCGACATTATTGTACAGTCTGCTTACAAAAGTTAAAAAATGGAAGGTAATCGGTTTAAGCGTAATTGGCGTTTTGGTCGTTTGCGCCGGTTTAATTTTTGTTTTTCGCCAGACAAATTTTGTTGGTAATTTGCCGGCTATCGGGCCGATCGCCAGAACCAGTTTATCTGGCGGCACGGCCGAAACTCGTTTAATCGCCTGGGGAATCGCCTGGCAATCTTTTAAAGAACGTCCGGTTTTTGGCTGGGGGATGGAGAATTTTTATTATGCTTTTAATAAATATTATAATCCCAAATCTTTAGAGCATGGCTATTATGAAACTTGGTTTGATAGGAGCCATAATATTTTTATGGATTACTTATCCACAGCCGGTATTGTAGGTTTTTTAGCCTATTTAAGCCTTTTTGCCGCTTGTTTGTGGGTAATTTTAAAAGTTTATAAAAATAAAACCGTCACTAGCGATACCATAGTTTTTTTATCCGTTTTTTTAATTGGTTACGCCGTGCAAAATGTTTTTGTTTTTGATCATCTAAGTTCTTATTTGATTTTCTTTTTAATTTTAGCCTTTGCCAATTGGCTGGAGCCGATTGAGCAGGCTAAAGAAGCGAGTCAAAAAGCAATTAAAGAGCAAAAATTATCTCCCGGTTACTTTTTAGGCGTTGGTTTGATTGTTCTAGTCTTAATTTATTTTACGAATATCAAACCGGCTCAAGCTAATAAAGCCGATTTGGAAACGCAAAAAATGGCGCAACAAGATTTTTTTGGCGCTATCAAACAAATGCAACCGGCTTTGGAAATTGACAGTCAATTCCATGCCGACATGCGCAATGATTTTGCGCGGCTGATTTTATCTTACAGTCAAAATCAACAAGTGGCACAAAGCAGTGATTACGGAAAAGCTTTGGTTTTTGCCATGGAACAAATGAAAAGCAATATTAAAAAGCATCCTTTGGAGCTGCAATCTTACATAACTTTGAGCCAACTCTATGCCGTTGGCGGGGATTTTGCCAATTCAGAGACAATTTTAAATCAAGCTCAAACTTTAAGTCCCGAACGCCAGCAAATTGCTTATTTATTAGTGCGCATTAAAGGCATTAAAAAAGATTTTATCGGTGCTTTGAATGTTTTAAAGCAAACATTGTCCAAAAATGACAAAATACCGGATACCTATTGGTATTTGGGATTGGTTTACAATGATTTGGGAGATAAAAAGTTGGCTTTGGAAAACATTAAAAAAGCCGTTGAAAAAGGAAAAGTTTTTTCCGTTAATCAGGAATTTTATTTTGCCGGAAAAATTTTATTGGAGGGAGGGGAGTTGGAAATGGCCAAAAATATTTTTGAAGACGTTTTATCTAAAAACCAAAATGACACTACCGCGCTTTCGGCTTTAGCGCAGATTTATGAAAAATTGGGAGACAAAGACAAGGCCAAAGAAATGTTTTTAAGAAGCGCCGCGGGAGCGGTTAAAAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 717
MLEKKLVWAIKFLIYASFIMPLIVMGDVFIFPFVFPKAIYFRILVELMLGIYVLLCLVNKNYRPQKNNVFWAVLIWATALLLACVFGTDVGRSFWGNFERMSGWFTLIHFALYFVVVSATLKMWEEWRNLFRWGLLWSFFVGLTGLNFLLPSNSIMRIGGGGSLGNQIYIANYILFFIFIAGYLFKREEKKLWKFFSAAYIVIGIVLMLYNGKRGPFIGLLAGIFVATLLYSLLTKVKKWKVIGLSVIGVLVVCAGLIFVFRQTNFVGNLPAIGPIARTSLSGGTAETRLIAWGIAWQSFKERPVFGWGMENFYYAFNKYYNPKSLEHGYYETWFDRSHNIFMDYLSTAGIVGFLAYLSLFAACLWVILKVYKNKTVTSDTIVFLSVFLIGYAVQNVFVFDHLSSYLIFFLILAFANWLEPIEQAKEASQKAIKEQKLSPGYFLGVGLIVLVLIYFTNIKPAQANKADLETQKMAQQDFFGAIKQMQPALEIDSQFHADMRNDFARLILSYSQNQQVAQSSDYGKALVFAMEQMKSNIKKHPLELQSYITLSQLYAVGGDFANSETILNQAQTLSPERQQIAYLLVRIKGIKKDFIGALNVLKQTLSKNDKIPDTYWYLGLVYNDLGDKKLALENIKKAVEKGKVFSVNQEFYFAGKILLEGGELEMAKNIFEDVLSKNQNDTTALSALAQIYEKLGDKDKAKEMFLRSAAGAVKK*