ggKbase home page

gwc2_scaffold_1309_14

Organism: GWC2_OD1_32_10

near complete RP 43 / 55 MC: 2 BSCG 47 / 51 MC: 2 ASCG 11 / 38 MC: 1
Location: 10875..13235

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
SLEI family protein; K12600 superkiller protein 3 Tax=RIFOXYD1_FULL_RIF_OD1_06_32_13_curated UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 786.0
  • Bit_score: 1517
  • Evalue 0.0
Tetratricopeptide TPR_2 KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 25.3
  • Coverage: 715.0
  • Bit_score: 237
  • Evalue 1.80e-59
TPR repeat:Tetratricopeptide TPR_3 similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 100
  • Evalue 2.00e+00

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFOXYD1_FULL_RIF_OD1_06_32_13_curated → RIF-OD1-6 → Parcubacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2361
ATGGTCAAAGAATTTTCAAGAGTTTTAAAAGTTTGTGAAGCAATTTCAAAATATAGTATTTATGTTTTGGTTGCCTTAGTTCCAGTTTTATTTATTCCAATAACTTCAGAAGTTTTGGATTTTAATAAGCAAGCCTTAATGGTTATTTTAGTGTTTGTAGCACTTTTTGCTCAAATGGTAAAAATTCTAATCTCTGGCAAATTTTCTGCAAATTTAAACAAGACCCACGTTGCAGTTAGTGTTTTATTTTTAGTTTATTTAGCTTCAACAATATTTTCTCAAGATAAATATGGCAGTTTTTGGGGGTGGCCAAGAATAACTGTTGAAAGTTTACTTACTATAACTTGTTTGTGTTTATTTTATTTTATAGTATCAAATATTTTCTCTAAAAAAGAAATTCTAATTTCAATGACAATATTTTTGTTATCTTGTTTGCTTGCTACTTTATTTGGAATACTTCAATTGCTTGGTTTATTTATTGTGCCATTAAATTTTACCAAAACTGGAAGTTTCAACACTTTTGGTTCTGTGGGAAATTTTGGAAATATTTTGGCAATTTTGCTTCCTTTGCTAACTGTTTTTGTGGTTACTGTTAAGGAAAAATGGCTTAGGATTATTTTTGGAGTAGGTATTGTGATTACTGCTATTTCACTTTTATTGATTAATTTTATATTCGTTTGGTGGATTGTTTTGATAAGTTGTGCGTTGATAGTTGCGTTCGGAATGTTTAAAAGAAATTTATTTGATTTAAGATGGCTGTCTATTCCAATATTTTTCTTTGTACTTGCATTATTTTTTATAATTGTAAATCCTAAAATTTCTATTCCGCAAAGACCATTGGAAGTATATTTAAATCAATCTTCTACAATGGATATTGCCTTAAAAACTATAAAGGATAAACCTATTTTAGGATCTGGTCCTGGAACTTTTATTTTTGATTTTTCAAAATATAAAAAAACAGAATTCAATCAAAGTCAATTATGGAATTTACGATTTGATGGAGGGGCTTCAAAAGTTCTAACAGTTTTAGCTACAACAGGAATCCTTGGGTTTGCATCACTTTTAGCTTTAATGGTAATTGTAATTTTTTATGGGGCAATGTTTATAACTAAAGGCATTGATGAATTAAAAACAAAATCACAAGACAAGTCAGATGTAGCTTTAAAGATCGTTATTGCAGGAATTTTCATATCTTTTTTAGTTCAGTCAATATCTTACTTTATTTTTAATTCAAGTTTTTCTTTAGATTTTTTATTTTTCTTTTTAATAGCTTGTTTTATTGGCATAATTTCCAATAAAGAAGAATATAATCTTTTACCATCATCTTTTTTAACTTTAGGGGTTACTCTTATATTTACTTTAATATTTATTTTCGGTCTTGGAATAGTTATTTTAAAGGGTCAAAGATATATAGCTGAAGTAGATTTTAATAAAGGAATTATGGCTTATGCTAAAGGAAATAAAATTGAAGGTTTAAAGAATCTTGAAAAAGCTGTTATGCAAAATCCAAACTCTGATATATATTTAACTAATCTGTCTCAAGCATATTTATCAGAAATTTCTGATTTAGTTAGTAGGAAGGAATTGTTAGATGTAGAGAAAGAAAAATTTCAAGCTTTGATTGGTAATACAATTAATTCAGTAAAAATTGCAACTGAGGCAAATCCTAAAAATGTTTCTAATTGGTCAATTAGAGGTTTTATTTATCAAAATTTAATTGGAATTGTTCCAGAATCTGAAGATTGGGCAATTAAAAGTTACGAAGAAGCTTCGTTGCTTGATCCAGCAAATCCTTATTATGTAACTCAAAAAGGAATTATTTTACTATCAAAAGCTTATGGAATAGATAAAGATTCAGAATCTGCGAAAAAAATAGATTTATCATTAGCTAAAGAACAATTTGATAAAGCTATTAAACTAAAATCTGATTATGCTTCTGCTCGTTTTCAATTAGCAATGGTTTTGCAAGCTCAAGGTAAGGCAGATCAAGTTATGCCAGCTTTGCAAGAAGCTAAAAAGTATTCACCAAATGATGTTGGTTTATCTTTCCAAATAGGTTTACTATACTATCAGGGAAAAGATTATAAAAATGCACAACTTGAATTAGAAAGAGCAATAACATTAGATGCAAAATATTCAAATGCTTTGTATTTCTTAGGATTAACATATTCAGCTTTAGGACAAAATAGTAAAGCAATAGATAATATAAAACAAGTTTTAAAAATAAATCCAGAAAATCAAGAAGTTAAAAAAGTATTAGAAAACCTTAATAATGGTAAAGAAGCACTATATGGAATTAAAGAGGATATTCCAGCTCAATTACCAGTAGAAGATGAGGCATCGGAAAAAAATAATAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 787
MVKEFSRVLKVCEAISKYSIYVLVALVPVLFIPITSEVLDFNKQALMVILVFVALFAQMVKILISGKFSANLNKTHVAVSVLFLVYLASTIFSQDKYGSFWGWPRITVESLLTITCLCLFYFIVSNIFSKKEILISMTIFLLSCLLATLFGILQLLGLFIVPLNFTKTGSFNTFGSVGNFGNILAILLPLLTVFVVTVKEKWLRIIFGVGIVITAISLLLINFIFVWWIVLISCALIVAFGMFKRNLFDLRWLSIPIFFFVLALFFIIVNPKISIPQRPLEVYLNQSSTMDIALKTIKDKPILGSGPGTFIFDFSKYKKTEFNQSQLWNLRFDGGASKVLTVLATTGILGFASLLALMVIVIFYGAMFITKGIDELKTKSQDKSDVALKIVIAGIFISFLVQSISYFIFNSSFSLDFLFFFLIACFIGIISNKEEYNLLPSSFLTLGVTLIFTLIFIFGLGIVILKGQRYIAEVDFNKGIMAYAKGNKIEGLKNLEKAVMQNPNSDIYLTNLSQAYLSEISDLVSRKELLDVEKEKFQALIGNTINSVKIATEANPKNVSNWSIRGFIYQNLIGIVPESEDWAIKSYEEASLLDPANPYYVTQKGIILLSKAYGIDKDSESAKKIDLSLAKEQFDKAIKLKSDYASARFQLAMVLQAQGKADQVMPALQEAKKYSPNDVGLSFQIGLLYYQGKDYKNAQLELERAITLDAKYSNALYFLGLTYSALGQNSKAIDNIKQVLKINPENQEVKKVLENLNNGKEALYGIKEDIPAQLPVEDEASEKNNN*