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rifcsphigho2_01_scaffold_5146_16

Organism: RIFCSPHIGHO2_01_FULL_Archaea_Pacearchaeota_33_47

partial RP 29 / 55 MC: 3 BSCG 17 / 51 ASCG 29 / 38 MC: 1
Location: 12435..15893

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
DNA polymerase II, large subunit DP2 (EC:2.7.7.7); K02322 DNA polymerase II large subunit [EC:2.7.7.7] Tax=RBG_13_Pacearchaeota_33_26_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 61.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1447
  • Evalue 0.0
DNA polymerase II large subunit n=1 Tax=nanoarchaeote Nst1 RepID=R1E5T5_9ARCH id=5103156 bin=GW2011_AR20_complete species=GW2011_AR20 genus=GW2011_AR20 taxon_order=GW2011_AR20 taxon_class=GW2011_AR20 phylum=Archaeon tax=GW2011_AR20_complete organism_group=Woesearchaeota organism_desc=GWA2_A_30_20A_AR20 Complete genome similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 47.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1086
  • Evalue 0.0
DNA polymerase II large subunit similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 46.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1086
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RBG_13_Pacearchaeota_33_26_curated → Pacearchaeota → DPANN → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 3459
ATGACTGGATTAAGCGCTGAGACTGAAATATATTTTGAATCTTTACATAAAGAGATTCAACGAAATTATGTGATTGCGGAAACTGCTCGTAGCAAAGGATTTGATCCTGTCGATAAAGTGGAAGTTCCTTTGGCTTTAAGCATGGCAGCAAAAGTCGTTAGACTTATTTCAACTAAATATCCTCAGCTTGATAGAGATGATATTATTGATAGAATTTTAGAATTAGAAAAGCAATATGGAAGTTTGGATAATTCGGTCAGCTTTAAAATTGCAGAAGAAATTGCACAAGAAAAATATTGTAGATTTGAAACTCAATTAGAAGCAATTGACGCGGGAATTAGAGTAGGTTTTGCATACACTACTTTGGGTGTTGTGTCATCGCCTATCGAGGGATTTACAGAAATAAAGACTGGAAAAACTAAATTAGGTGAAAGTTATTTGAAGGGATTTTTTTCAGGACCTATTCGAAGTGCAGGAACTACTGCGAGTTGTGTTGTTTTAATGTTAATTGATTATTTGAGACAGTTGTTTGGATTCGCGAGATTTGATCCTAGTGAGGATGAATGTAGGAGAATGGTTACAGAGTTATATGATTATCATGAACGAGTTAATAATTTGCAATATTTACCGACGGAAGAAGAAGCGCTTTTTATCGCTAAGAATTTACCTTTTCAGGTTTGTGGTGATCCGACTGAAGATAAGGAAGTTTCTAATTACAAAGATTTACTGCGTGTTGAAACTAATTTTATTCGTGGAGGTGTTTGTTTAATATTGGGTGAGGGATTGGCACAAAAAGCCGCAAAGGGATTAAGAATTTTAAAAGGATTAAAAAAAAATGGATTTAAAATTCATGATTGGGATTGGTTAGAGGATTATGTAAAAATTCACGAAAAAAGAGAGAAGGATAAAAGTGATACCGGCCCCACTTACATTAAAGATTTGGTTGCTGGAAGGCCTGTCTTTGGACATCCTGGAAAAGGATTTCGATTTCGTTACGGGAGGAGTAGGGTGTCCGGTTTTTCTGCAGTGAGTTTGCATCCTGCAACAATGGGAATCACTAATGATTTTCTTGCTGTTGGCACTCAAATAAAAATTGAAAAACCTACCAAAGGAGGCATTGTTACTCCTTGTGATGAAATTGATGGCCCTATTGTGAAATTCAAAAATGGGAATGTAAAAAAAATTCTAAATTATGACGAAGCTAAGTTGGCTTATGATGAAATAGAGGAAATTATCTATTTAGGAGATATTTTATTTCCTTTAGGCGATGTAATGAATAGAAATTCGTTGTTAATTAAACCAGGTTATGTCGAGGAGTGGTGGAATTTAGAATTAGAAAAAGCTGGTGGCAAGGTTGAGGATTTTTATCAGGTTACTTTGGAAATGGCAATTTCTTTGAGTAAAACTTATTCTTTACCTCTCCATCCAAAATATATTTTTTATTGGACTCAAATATCTTATGACCAATTTTTAGGATTTATTGATTGGCTGCAACATGCCAGGATTCACGAAAAAAAATTATTATTTCCTTATAATTCTTCAGAACGAGAGCGATTTCATGTTGGGAAACGTGCACTGGAATTATTAGGTGTTGAACATATTGTTGGAATTGAGCATGTAATTGTTGAAGAAAAAATAACTCAGGCATTGCTTGTTAATTTGGGATTGGATATGTTTCATGATGGGGCGATACATCTAGATCATTCGTTTAAGAAACCTGAAGAAGCTGATACTGGTGAGGTATTGACGACGGTTAATTCATTAAGCGCTTTTATAATAAAAGATAAGGCTGGAGAGTTTATTGGAACTCGAATGGGAAGGCCGGAAAAGGCTAAGTTGAGAAAATTAACCGGTAGTCCTAATATATTATTTCCTGTCGGAGAAGAGGGAGGAAGAATGAGGAGTATTACTGAAGCTATGAAACAGGGAAGTATTCGAGGAGATTTTCCGTATTACTATTGCACTCCATGTTCGAAAGAGACTATTTACAGAATTTGTGAAAATTGTCATACCCGAACCGAAAAAAAATTTTATTGTAGGATGTGTGCTAAAGATATTGACGAAAATTGTGAGATTCATAATGTAAAAACTAATTGTAAAAATGTCCGAATTGATATAAATCATTACATGGAAAAAGCTCGAGAACAATTAGGGATGATGAAAGTTGAATTGCCGGTTTTAATTAAGGGAGTTAAGGGAACAAGCTCTGAGGATCACAACATTGAAAATTTGGTTAAAGGAATTTTACGAGCAAAATATGGATTATGTGTTAACAAAGATGGCACTATTCGTTATGATATGACTGAAATTCCTCTTTCGCATTTTAAACCTATCGAGATTGGTGTTTCTGTTGAGAAGTTATTAGAATTAGGATATGAAAAAGATTATAAGGGAAAAATTTTAGAACACGATGAGCAAATTCTTGAATTAAAACCTCATGATATCTTGTTGCCGTGTAATCCTTATTCTGGGGATGAAAAGGGAGATGAATTGTTTATTAATATGACTCAATTTATTGACGAATTGTTAGTAAAATTATATGGATTGCCAGCTTATTTTAATGTTAAAAAAAGAGAGGATTTGATTGGGCATTTAGGGGTTTGCATGGCGCCTCATAATTGTGCTGGAGTTATTTGTCGTATCATCGGGTTTTCTAAAGTTCAAGGATTGATGGCAAGTCCGTATATGCATGCTGCGATGAGGCGAGATTGTGATGGAGACGAGGCTGCAATCATGTTATTGTTAGATGTATTGTTAAATTTTTCCCGGAAATTTTTACCTTCGCATAGAGGAGGAACACAGGACGCTCCATTAGTTCTTAATGGAAAAATTTATGCTCAAGAGGTAGATGACCAGATTTTGGATTTTGAATTAGTTAATTCTTATCCGTTGGATTTATACGAAAAGGCAGAGAAAAAAATTCATTCTAATGAGGTTCTGATTGAGACGGTGAAAAAAAGATTACATTTGGGTGAGGATCCATATGTGAACACTGGTTTTACTCATCATTCCAATAATTTTAATCTTGGTGCGATATGCAGTTCTTATAAAACGTTGCCGACGATGAAAGATAAAGTTAAAGAACAGATGAGATTATGCGTTAAACTGCGAAGTGTCGATCAAGGAGATGTTGCTCGTTTAATTATTGATAGGCATTTTATGCGTGATTTGAAAGGTAACCTGCGTAAATTTTCACAACAAAACTTCAGATGTTCTAGTTGTAATGCAAGTTATAGACGAACTCCGTTAAGTGGTAAATGTGAAAAATGTCCTGGAAAAATAATTTTTACTATTTCCTATGGCAGTATTGTAAAATATATTGAGACTGCAATGGAATTAATCACCAATTATGATGTGCCCAGTTATATTATTCAAGATTTGGAACTGACTAAAAAATATATTGAGAGTATTTTCGGAAGAGAAACTGAAAAGCAAGAATCAATTGAAAAATGGTTTTGA
PROTEIN sequence
Length: 1153
MTGLSAETEIYFESLHKEIQRNYVIAETARSKGFDPVDKVEVPLALSMAAKVVRLISTKYPQLDRDDIIDRILELEKQYGSLDNSVSFKIAEEIAQEKYCRFETQLEAIDAGIRVGFAYTTLGVVSSPIEGFTEIKTGKTKLGESYLKGFFSGPIRSAGTTASCVVLMLIDYLRQLFGFARFDPSEDECRRMVTELYDYHERVNNLQYLPTEEEALFIAKNLPFQVCGDPTEDKEVSNYKDLLRVETNFIRGGVCLILGEGLAQKAAKGLRILKGLKKNGFKIHDWDWLEDYVKIHEKREKDKSDTGPTYIKDLVAGRPVFGHPGKGFRFRYGRSRVSGFSAVSLHPATMGITNDFLAVGTQIKIEKPTKGGIVTPCDEIDGPIVKFKNGNVKKILNYDEAKLAYDEIEEIIYLGDILFPLGDVMNRNSLLIKPGYVEEWWNLELEKAGGKVEDFYQVTLEMAISLSKTYSLPLHPKYIFYWTQISYDQFLGFIDWLQHARIHEKKLLFPYNSSERERFHVGKRALELLGVEHIVGIEHVIVEEKITQALLVNLGLDMFHDGAIHLDHSFKKPEEADTGEVLTTVNSLSAFIIKDKAGEFIGTRMGRPEKAKLRKLTGSPNILFPVGEEGGRMRSITEAMKQGSIRGDFPYYYCTPCSKETIYRICENCHTRTEKKFYCRMCAKDIDENCEIHNVKTNCKNVRIDINHYMEKAREQLGMMKVELPVLIKGVKGTSSEDHNIENLVKGILRAKYGLCVNKDGTIRYDMTEIPLSHFKPIEIGVSVEKLLELGYEKDYKGKILEHDEQILELKPHDILLPCNPYSGDEKGDELFINMTQFIDELLVKLYGLPAYFNVKKREDLIGHLGVCMAPHNCAGVICRIIGFSKVQGLMASPYMHAAMRRDCDGDEAAIMLLLDVLLNFSRKFLPSHRGGTQDAPLVLNGKIYAQEVDDQILDFELVNSYPLDLYEKAEKKIHSNEVLIETVKKRLHLGEDPYVNTGFTHHSNNFNLGAICSSYKTLPTMKDKVKEQMRLCVKLRSVDQGDVARLIIDRHFMRDLKGNLRKFSQQNFRCSSCNASYRRTPLSGKCEKCPGKIIFTISYGSIVKYIETAMELITNYDVPSYIIQDLELTKKYIESIFGRETEKQESIEKWF*