ggKbase home page

rifcsplowo2_01_scaffold_10638_22

Organism: RIFCSPLOWO2_01_FULL_Archaea_Woesearchaeota_41_36

near complete RP 34 / 55 MC: 5 BSCG 6 / 51 ASCG 33 / 38 MC: 3
Location: 16626..22223

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
periplasmic copper-binding protein Tax=RIFCSPHIGHO2_02_FULL_OD1_Falkowbacteria_45_15_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 41.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1391
  • Evalue 0.0
Halomucin id=4379343 bin=PER_GWC2_41_7 species=Haloquadratum walsbyi genus=Haloquadratum taxon_order=Halobacteriales taxon_class=Halobacteria phylum=Euryarchaeota tax=PER_GWC2_41_7 organism_group=PER (Peregrinibacteria) similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 28.4
  • Coverage: 402.0
  • Bit_score: 161
  • Evalue 6.10e-36

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

R_OD1_Falkowbacteria_45_15 → Falkowbacteria → Parcubacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5598
ATGTTCTTGCTTCTTACTGTTTCATTTGTAGAAGGAAGTTCGATAAGCAATGGTGTTGTGCATGGAATATCTGCTTATAATGAACTTAATGTTGCTACACCACGTTTCAGAGTGTGGAATGGCTCAACCAATAATTTCACTGCTGAGCAAAGCGCACAATCTGTTGGAGTCGATGGTTCTGCGGACTTATCATGGACTGTGCTGAGGGCAAATCATGAGCGTGATGAAATTGTCATGGGAACGCTTGACCAGAATAATGATGTCAATGTTCAGGTCATGAACTCAACACGACAATGGGGCAATCTGCTTGAAGTAAGTTCTGATGTACCTAACTCTGCGTATCGTGCCTTTGACATTGCAATAGAAGATGTGTCTGGCGATGTGCTGGTTGTCTATGAGAATAGCAGTGCCGCAACTAATAATGGTGCGGCATATCGTGTCTGGAATGGCACGTCGTTTAGTTCGGAATATCCAATAAACACTCTGCTTGCTGCTAGCGCTATTCAATGGATACAACTCACACCTCGTGCAGGTTCGAATGACATTATGGTGTTGTTCCACAATAGTGTGGGCGATTTATATGCAGCCCTTTGGAATGGAACTGATTTTGAGGTTGAACGAAATCTTACATTGTCCACATCAACAGCATCAAATACAGAAGAACACTTTGCCTTTGCATGGGAACAGGGCAACCAGGGACTTGTGACGTATGGTGCTGGAAACGATTTTGTCTATAGGACGTTTTCTCTTACTGCACCTTATTGGAGTAATGAAGCGACTATCGCTCTCGGCAATGCGTTGCACAGCGTACGGCTTTGTTCTGATAGCAGTTCTGATTACATTGGTATTATCGTGCAGGATGGCGGTAATGATATTAACGTTCGTATGTGGGATGGCACTCAGATTCTTGGCAGTGCACCGACAGAAGACGCGCAGACTGAATCGGGTGGCGCTGACACGGCCAATATTGATTGCGTCTGGCTTAATAGCTCAACTGCCCTTTTCTCTTTTGTTGACTTTAATGCTCTCACTGTAGATTATCTTAATTTCACGAAGACAAATGCCTGGAGCACGAGCGATTTAACCATTACACCTACAACTAATAGCTTTGCGAGTGATGACATTGCTGCGCTGCGGATGAAAAAGCATTCTGTCACTGATGAAGTACTTATTGTTGCATCTGACATTGCAGAAGATGTATCTGCTGTTCGTTGGAATGGGACGGCCTTCACGGGTATCGGAGAGTCTCCTCTTGAACAGAGCACAGAAGTGCTGAATGGTGATCAGGAAAGTGCTTTTTTTACCTGGGATAATTTTGACCCTGTTCCAAATGTAACAAACATAACTCCCAACGGCATCAATTTTGAACTAAATCAGGTCATCAATCTCAGTGTCAATGTCACGGACAATCTTAATGTGTCTGCGGTCATTGCAAACATTACACTGCCCAATGGAACGGTACGACAGGTTACCATGGTTAACGTCTCTGCGGCTCGTTACAATGCTACTTTTGATGTTACCAATCTTAACGGATATTATACACTCCTGATTGTTGCAAACGATAGCAGCCTGCATCAGAATTTCAACAATTCACAGTCTGTCACTTTTACTGTTGGTGATGCGATTGTTCCGAATGTTACCAATATTACTACTCGAGGTACGGCGACATTCGAGCAGTATGCAATCGTCAATATCACTGCAAATGTTACCGATGAAATCGCAGTCAGCGTTGTCACTGCAAACATCACTGCACCTAATGGCTCTGTGTTTCAGCTCACTTTGCGGAATGATACCAACATCACAAAAAATTTCAACGCATCATTCTACAATACAGAAACTATCGGGACGTACACGATACAAATCTTTTCAAATGATTCTTCGAACAATGTCAATAGCACACAGACAGGTACTTTCGTTGTTGGCGATATTGTTTTTCCTGCTGTCACCAATGTGCTGCCCGCCAGTGGTTCTAATTTTAGTGATTATAGCATTGTCAACATCAGCGTAAATGTAAGTGACGATAGGCTTGTTTCTATTGTACAAATCAATGTGACGCTGCCCAATGGAACGATTCGCCAATTTACTCTCGATAACATGAGTGCGCAACGATATAATCTTACGTTTGATGTGACCAATCTTGTTGGCATCTATTCTGTACGAGTCATTGCGAATGATACGACGAACAATGTCAATTCATCTGAAACGACGAGCTTTACTATTGGTAATTCCGTTGCTCCACTTATTGTTCTTAATTATCCCACAAATAATTCGAACATATCTGCAACAAGCATCGCGTTTAACTTTACTGCAACTGATGACTCTCATGCGACGCTCAATTGTTCTATTACTATCAACAATACTGCAAATTTGAGCAATTCTGCAGTTGTGAGTGCGCAGCAAACTCTTTTCAATATTAGTGGTTTTGTCAACGCGCACTACAACTGGAGCATCTCCTGTAATGATTCAATTCCCAATATAAACCAAAGTTTGACGTTTCGTTTTGCTGTTGATACGGTTGCACCGCAATTCAATAGTCTTGTGACGAGCCCCAGTGCTGCTGCTGACCTTGACCCAAACGTCAATGTTACGGTGCTTGCGAACATCACTGATAATACAACAACAGTGCATACAGTCATTCTTCAGCACAAGTTGAGCAATGAAAGTGATGACAACTATATCAATGTCAGCATGAGCTTTTGGACGGGCAGCAAGTTATTCAATGCATCGTTCAATGCGACTGTCAATGCAACGTACACTCTGCGGCTTTTTGCCAATGACAGTGCAGGAAACAAAGATGTGAGTAATACCATATCTCTTGTTGTTGAATACGACCGCACGTGGACGAGAATTCCGTCGGCATTTACAGCAATAAGCGCGTCGCTCAATGAAAATGTGTCATTAGGAAATCTTACCATCAATAACACGGGAGATTTCGCACTGTATTTTAATATTACATCAGACTCAAGTCTGACGCGCATCAATGAAACATCGAATTTTAGCCTTGCACCTAGCACAGTGAAGAGTTTGCTCGTCATGGACAATAGCACTGTTGCTGGTGTCAAAACAATAAAGCTTAACATCAGTGTTAATGACACCCAGGCAAGTCCACGCTCCGAAACGGTGACGGGCACAATTGTTGTTGCACAGGGGCAGCCAATACTTTCTGCAACTTTTACAACCCCATCAGGTGACACGCTTGCTGCAACACTCGGGGATACGGTTGAATTTATTTCTCAACTTAAAAACATTGGCGAAGGAAATGCAACAAATGTCAGCTTCCAGTTTTCTGCTCCTTCGGGTTGGACGGTTACCTTTGGCTCTTTAGCTATTGCCTATGCTGAGCTGAATTCGGGCGATACACAGGAAGAAACACTCAGAATGAGTATTCCAAGCAATTCAGATACGGGTACTTTTGCCGTTTATGTCAATGCGACAGGCATCAATGCGTCGGGTGCTAATCTTACGACTAATAACTTGACATTTGGAGATATTGTTTTTGTCACGGTTAATGCTCAGGCTTCCAATTTAGGCAGTGGTTCAGGCGGCGGTGGCGGTAGCTCGAGTCCAAGCTCACCGTCCGCAGCGTCTTCTTCAGGTGGTGGTGGGGGCGGTGGTGGCAGTGTGTCGTTCAAAGCAGCAGGTGGTGTTAGTAACATCCTTCAAACGACGCAGAATATACGAACAGTTCGCGGTTCGGGTGAAAGCGTTCCTGTTGTCGTTACAAACCTTTATGAGCATGCAATGATGAAAAACATCTATGTTCGTGCAGAAGGATTCTTGTCTGATTATGTTGTTATATCTGCTCCGATAAATCATGCAAAATTCTTGGAGAAAGAACTGAAAAAAGGTGATGTCGAGCGCGTATCCTCTTTCAGAGCGGGAGAACATACGCTTACGGTTGATGACGTATGGGATAATGGCGTTCGTCTTACTCTTGCATCAACACCTCAAACAGTACTTGTTCCAATCGGTAAAGTCAGATATGTTGACCTTACGGGTGATGGATATGGCGATGTGGCTCTTGATGTGCTTCAGGTGACGGGAAGGCGTGTGCTCCTTCGTATGTATGAATTGCGCGACCTTTCACGAATTCAGTTGGCTTATGGTGAAGAAATTCAATTTGCGCTTGACATTACTGCGCCTGAGTATATTACAAAAGACGATTTTAATTGTACGATACGCATTGATGCAGAGCTTTATCCTGTGAACGAAACAGTTGCAGGATTTACAAAGCGTCTTATCTCTGATGTCAGAACCTTTTTGTTTAGTGTCGGTGCGGTTGGCGCTGAAGATGCAGAACTTCAGCTCAATGAGGGACAGCAGGCACTTCAGGACATGCTCAATGCGGGATTTTCTGTTGGAAAAGCTCAGAATTTACTCGAGCGCGCACGCGAGGCTCTTGCTCGTGGCGATTATGAACTCTCTGCTGTAAGTATTCAGGAATTGATTGCTCTTAAAAATGCTGCTTTTGATGCACATCATTTGCTTCTCGATTTGCAACAGGACGTTGCACTTGCGCAGTCACAGTGGCTTGATATTCCGCAAACAACCGATGCGTTGCAGCTTGCAGTTGTTTCGTTTGAGCGTGGTGATTTTATGCAATCTCTGGAACGGGCGAGAACAGCACAACTCCAGCTTGTCCTTGAAACAAAAGGTCGTGTTAATATCTTGTGGTTTGTTGTAACATACTGGTGGGCATTGATTCTGGGAAGCATTGTTTCGCTTCTTGTTGCGCTGACGTTGTATAGCCAGTTGCTCATGAGCATCATCTCGCAACGGTTGCGTAATCTGGACAATGAAGAAAAGACCATCGGAAAACTGTTACAGGAAACTCAACAAAAATATTTCGATGTGAAACAGTTGTCATCCGCACAGTATAAGCGTGCAATTGCATATTATGATGACAGGCTCACGAAGATACGTCAGATACGAGCGAGGCTCAGACACCAGAGAAATGCGTTTCTTACAGCACAGTCAAAGCTCTCGGCGTTGCTCAGAGAAAAAAATGATGTCAAGCGCTTGATGGCAGAAAACCAGTCTGATTATCTTGTCAGAAAAAAAATAAGCCGTACAAATTTTGTACGAAATCATGACAGCTATATTTCACGGCTTGCGGATATCGAGCATGACGAAGCTCTTCTTGAACGCAGATTGCTGGTTGAGAAACGAGTTCATGTATGGATATTGGAGATGGCACAGTTATTTTTAGAATTTATCTCTCAGTTGCTTGTGCGATTTGGTCGTTATGTTCATGGTTATCGTGTTCCTCAAAAGTTCGCTAAACCATCCGGTCATTCGCAGGTTCAGTCTCGTCACCATCCACAATCCTCATGGGTTCCTGTTTCAGTGCCGGAATCATCTGCTCTTGATGTTTATTCCGATAAAATGAGTGTTGCGTTGCCGGTCAAAAGAATTGAATATAAACCATCGTTTTCGCATGCTGTCGAGGCATTTGACACAGAGCTGTTGCGGATGGCGAAGACTGCCCAGCAGGAAGAACGTGATGCAGGGACTGAGCGGACGATGCTCGATGTTGCTCATTATAAAAGAAAAGCTGAAGAAAAATTACGTAATTTTAGGCAAGGTGATATTCGATGA
PROTEIN sequence
Length: 1866
MFLLLTVSFVEGSSISNGVVHGISAYNELNVATPRFRVWNGSTNNFTAEQSAQSVGVDGSADLSWTVLRANHERDEIVMGTLDQNNDVNVQVMNSTRQWGNLLEVSSDVPNSAYRAFDIAIEDVSGDVLVVYENSSAATNNGAAYRVWNGTSFSSEYPINTLLAASAIQWIQLTPRAGSNDIMVLFHNSVGDLYAALWNGTDFEVERNLTLSTSTASNTEEHFAFAWEQGNQGLVTYGAGNDFVYRTFSLTAPYWSNEATIALGNALHSVRLCSDSSSDYIGIIVQDGGNDINVRMWDGTQILGSAPTEDAQTESGGADTANIDCVWLNSSTALFSFVDFNALTVDYLNFTKTNAWSTSDLTITPTTNSFASDDIAALRMKKHSVTDEVLIVASDIAEDVSAVRWNGTAFTGIGESPLEQSTEVLNGDQESAFFTWDNFDPVPNVTNITPNGINFELNQVINLSVNVTDNLNVSAVIANITLPNGTVRQVTMVNVSAARYNATFDVTNLNGYYTLLIVANDSSLHQNFNNSQSVTFTVGDAIVPNVTNITTRGTATFEQYAIVNITANVTDEIAVSVVTANITAPNGSVFQLTLRNDTNITKNFNASFYNTETIGTYTIQIFSNDSSNNVNSTQTGTFVVGDIVFPAVTNVLPASGSNFSDYSIVNISVNVSDDRLVSIVQINVTLPNGTIRQFTLDNMSAQRYNLTFDVTNLVGIYSVRVIANDTTNNVNSSETTSFTIGNSVAPLIVLNYPTNNSNISATSIAFNFTATDDSHATLNCSITINNTANLSNSAVVSAQQTLFNISGFVNAHYNWSISCNDSIPNINQSLTFRFAVDTVAPQFNSLVTSPSAAADLDPNVNVTVLANITDNTTTVHTVILQHKLSNESDDNYINVSMSFWTGSKLFNASFNATVNATYTLRLFANDSAGNKDVSNTISLVVEYDRTWTRIPSAFTAISASLNENVSLGNLTINNTGDFALYFNITSDSSLTRINETSNFSLAPSTVKSLLVMDNSTVAGVKTIKLNISVNDTQASPRSETVTGTIVVAQGQPILSATFTTPSGDTLAATLGDTVEFISQLKNIGEGNATNVSFQFSAPSGWTVTFGSLAIAYAELNSGDTQEETLRMSIPSNSDTGTFAVYVNATGINASGANLTTNNLTFGDIVFVTVNAQASNLGSGSGGGGGSSSPSSPSAASSSGGGGGGGGSVSFKAAGGVSNILQTTQNIRTVRGSGESVPVVVTNLYEHAMMKNIYVRAEGFLSDYVVISAPINHAKFLEKELKKGDVERVSSFRAGEHTLTVDDVWDNGVRLTLASTPQTVLVPIGKVRYVDLTGDGYGDVALDVLQVTGRRVLLRMYELRDLSRIQLAYGEEIQFALDITAPEYITKDDFNCTIRIDAELYPVNETVAGFTKRLISDVRTFLFSVGAVGAEDAELQLNEGQQALQDMLNAGFSVGKAQNLLERAREALARGDYELSAVSIQELIALKNAAFDAHHLLLDLQQDVALAQSQWLDIPQTTDALQLAVVSFERGDFMQSLERARTAQLQLVLETKGRVNILWFVVTYWWALILGSIVSLLVALTLYSQLLMSIISQRLRNLDNEEKTIGKLLQETQQKYFDVKQLSSAQYKRAIAYYDDRLTKIRQIRARLRHQRNAFLTAQSKLSALLREKNDVKRLMAENQSDYLVRKKISRTNFVRNHDSYISRLADIEHDEALLERRLLVEKRVHVWILEMAQLFLEFISQLLVRFGRYVHGYRVPQKFAKPSGHSQVQSRHHPQSSWVPVSVPESSALDVYSDKMSVALPVKRIEYKPSFSHAVEAFDTELLRMAKTAQQEERDAGTERTMLDVAHYKRKAEEKLRNFRQGDIR*