ggKbase home page

rifcsphigho2_02_scaffold_15184_4

Organism: RIFCSPHIGHO2_02_FULL_Archaea_Woesearchaeota_30_12

near complete RP 35 / 55 MC: 4 BSCG 15 / 51 ASCG 34 / 38 MC: 3
Location: 3755..5809

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
SMC domain protein n=1 Tax=Nitrosopumilus maritimus (strain SCM1) RepID=A9A5V4_NITMS id=5103605 bin=GW2011_AR20_complete species=GW2011_AR20 genus=GW2011_AR20 taxon_order=GW2011_AR20 taxon_class=GW2011_AR20 phylum=Archaeon tax=GW2011_AR20_complete organism_group=Woesearchaeota organism_desc=GWA2_A_30_20A_AR20 Complete genome similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 45.1
  • Coverage: 690.0
  • Bit_score: 596
  • Evalue 4.70e-167
SMC protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 45.1
  • Coverage: 690.0
  • Bit_score: 596
  • Evalue 1.30e-167
SMC protein {ECO:0000313|EMBL:AJF62886.1}; TaxID=1579378 species="Archaea.;" source="archaeon GW2011_AR20.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 45.1
  • Coverage: 690.0
  • Bit_score: 596
  • Evalue 6.60e-167

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

archaeon GW2011_AR20 → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 2055
ATGATAATTAAAAGAATTAAGATAAAGAATATCAGGAGTTATTCTGAAGAAGAGATAAAATTTCCAGAAGGCACTATTATGTTATCTGGAGATATTGGTTCTGGTAAATCTACTATTTTATTAGCTGTTGAATTTGCTTTATTTGGTATTAAACGTGGAGAATTATCTGGTAATGCTTTATTGAGGAATGGTTCTGATGATGGTTATGTTATTCTTGATTTTAATATTGATAATAATGTTTTTTCTGTCAAAAGAACTCTGAAAAGATCTGTTAATGGTATATCTCAGGATTCTGGTTTTCTTTCTATTAATGATGTTACTCAGCAATTGACTCCAGTTGAACTTAAACAGAGAGTTACTCAGCTTCTTAACTACCCATTAGATTCAATATCTAAAAAATCTCTGACTTATCGTTATACTGTTTACACACCTCAGGAAGAGATGAAATTAATACTTTTAGGAGAAAAGGAATATCGTCTAGAAACTTTAAGGAAAGTTTTCAATATTGACAAATATAAGAGGATTAAGGAAAATTCAAAAATAGCATTATCAGAAGCTAAGCAGAAGAAAAAAGAGTTATCATTATTTGTATCAGATATTGAACAAAAGAGGTTATTATTTAAAGAAAAAGAATTGAAATTATCTAGTATTTCTGAAAATATTATATTGCTTAATGAAAAACTATTAGTATTGAATTCTGAATTAGCATTGAATAAAAATAAAGTTTTAGAATTTGAGGAAAGTATTAAGAAATTAAACAATACTAAAAAAGATTTTGAATTATTAAATTTTAATATAAAGACTAAGGAAGATTCTAAAAACAAGAATACCTTTAATTTATCACAATTAGAGAAACAGATTATAGAATTATCTAGTAATATTAAGGAAATAAATTTTGAAGATGTTAAAAATAAGATTATTGAACATGAAAAACATCTTGATGATCATGATAAAGAGCTTAAATTAATAAACAATAATATAACATCTATAAGGACTAAGAAAATTTCTAGTATTGAGATAAAAAATCAGATAAATAAACTGGATAACTGTCCTTTATGCAGGCAGGTAGTCTCTATTGATTATAAGAATGGAGTTATTTCTAGAGAAGATGATAATTTATTAAAATTAGATAATGATATTAAAGAATTTTTGATTAAAGAATCTGAATTTATATTAAAAATTAAAGAAATTAAGGTTTTAATTCAGGATTTAAAGAATAAAGAGAGAGATTATGAGATTAATAAGATTAAGATTAAAGATTTAGAATCTAAGAAAGAAACTTTAGATAAATTAAAAAAAGAGAATGAAGAATTGGATTTTATTATAAAAGAACTTAATGATAAAAAATTTATTATTCAAAATGATATTGAATCAAATAAAGAGTTAGAAAATAATTATGTTATGAATAAAAAACTTCTTGAGCAATTATTAGATTCTCAGAAGAAATTAGAATTATCTATTGTCATTAATAATAAAGATAAAGATTTTATTGAAAAAGAATTAATGATATTAAAATCAGATATTGAAAATAAGGAAAAAGCAAGTTCTAAATTAGACTATTACACTAAATTGTGTGATTGGTTTGACTCTTTCTTCATTAATATTATTGATATTATAGAAAAGAAGACTATGTCTAAACTTCATTCTGATTTTAGTGATCTTTTCCAGAAATGGTTCTCTATGCTTATTGATGAATCAGTTCTTAAAGTCAGATTAGACGAAGAATTCACCCCTATTATTGAACAGAATTCTCACGATATTGAATACGAGAATCTTTCTGGTGGTGAAAAGACATCTTGTGCTTTAGCTTATCGTTTAGCTTTAAATCAGGTAATTAATAATATTAGTAATTCTATTAACACTAAGGATTTGATTATTTTAGACGAACCAACAGATGGTTTTAGTGAAGAACAACTAGATAAGATTAGAGATATTATTAAAGAATTAAAGATGAGACAGATTATTATTGTAAGTCATGAGAATAAAGTAGAATCTTTTGTAGACAATGTTATAAAAATTAAGAAAGAGAATCACATTAGTAAGGTTATTAGATAA
PROTEIN sequence
Length: 685
MIIKRIKIKNIRSYSEEEIKFPEGTIMLSGDIGSGKSTILLAVEFALFGIKRGELSGNALLRNGSDDGYVILDFNIDNNVFSVKRTLKRSVNGISQDSGFLSINDVTQQLTPVELKQRVTQLLNYPLDSISKKSLTYRYTVYTPQEEMKLILLGEKEYRLETLRKVFNIDKYKRIKENSKIALSEAKQKKKELSLFVSDIEQKRLLFKEKELKLSSISENIILLNEKLLVLNSELALNKNKVLEFEESIKKLNNTKKDFELLNFNIKTKEDSKNKNTFNLSQLEKQIIELSSNIKEINFEDVKNKIIEHEKHLDDHDKELKLINNNITSIRTKKISSIEIKNQINKLDNCPLCRQVVSIDYKNGVISREDDNLLKLDNDIKEFLIKESEFILKIKEIKVLIQDLKNKERDYEINKIKIKDLESKKETLDKLKKENEELDFIIKELNDKKFIIQNDIESNKELENNYVMNKKLLEQLLDSQKKLELSIVINNKDKDFIEKELMILKSDIENKEKASSKLDYYTKLCDWFDSFFINIIDIIEKKTMSKLHSDFSDLFQKWFSMLIDESVLKVRLDEEFTPIIEQNSHDIEYENLSGGEKTSCALAYRLALNQVINNISNSINTKDLIILDEPTDGFSEEQLDKIRDIIKELKMRQIIIVSHENKVESFVDNVIKIKKENHISKVIR*