ggKbase home page

gwa2_scaffold_3578_24

Organism: GW2011_AR13

partial RP 27 / 55 MC: 2 BSCG 18 / 51 ASCG 26 / 38 MC: 1
Location: comp(17548..21033)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
rpoA1; DNA-directed RNA polymerase subunit A' (EC:2.7.7.6); K03041 DNA-directed RNA polymerase subunit A' [EC:2.7.7.6] Tax=AR13 UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2280
  • Evalue 0.0
DNA-directed RNA polymerase n=1 Tax=Archaeoglobus fulgidus (strain ATCC 49558 / VC-16 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126) RepID=O28391_ARCFU similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 47.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 783
  • Evalue 8.00e+00
DNA-directed RNA polymerase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 55.1
  • Coverage: 818.0
  • Bit_score: 904
  • Evalue 3.90e-260

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

AR13 → Pacearchaeaota → DPANN → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 3486
ATGAAACCGATAAGAAAAAAGATTGGAGCATTGAATTTTACTTTACTTAGTCCTGAACAAATTAAAAGACTTTCATCAGCAAAAATTGTTACTCCTGAATTATATAATATCGACGGATATCCAGTAGATGGTGGTTTAATGGATTTAAAACTTGGTGCAATTGATCCCGGTGTTAGGTGTAGAACTTGCGGTGGAAGAATAAAAGAATGTTTAGGTCATCCTGGAAGTATTGATTTGGCAAGGGCTGTTATTCATTTGAAATATGTTCCGTTAATTGAATTATGCTTAAGATGTTTTTGCAGTGATTGTGGAAAGTTAATGCTTGATGATAAATTTTTAACCAAACTTTCTCCTGCTGAAAGGGCAAAAAAAGCTAAAGATTGCAAAAAATGTCCTCACTGTCAAAATGAGCAGGTTAAAATTAAGTTAGATAAGCCTACTAGTTTTTATCGAGATAAAACAAGAGTTTTCCCGACTGAGATTAGAGAAATTTTAGTGAATATTACTGATGAAGAATTAAGAAAAGTTGGGGTTAATCCTCGAACTTGTAGACCTGAGTGGGCAATTTTAACTATGTTGCTTGTTCCGCCTGTAACTGTTAGACCGAGTATTATTTTAGAATCGGGGGAAAGAAGTGAGGATGATTTAACTCATAAACTTTCTGATATTATTCGTGCAAATCAAAGATTATGGGAGAATTTGAATGCTGGTGCACCTGAAGTTATTATTGAAGATTTATGGGATTTATTGCAATTCCATATTACTACTTTCTTTGATAATAGTGTTGCAAGAATTCCTCCTGCAAGACATAGAAGCGGTCAACCATTAAAAACTATTACTGAGAGAATTAAGGGTAAAGAGGGAAGATTAAGAAAGAACTTAGCTGGTAAAAGGGTAAATTATTCAGCAAGAACAGTTATTTCTCCTGATCCATCAATTGAAATTAATGAAGTTGGTATTCCTTTCCAAATTGCTAAAATTGTTACTGTTGCCGAGACTGTTACTGAGTTAAATTTAGAAAAATTAAAAAAATTAATTGAAACTGCAGATAAATATCCGGGAGCAAATTATATTATTAGAACTGATGGAAAAAGAAAGAAAATTACTGAAGAATTGAAAGAAGAAATTATGAATGAGCTTAGTGTCGGATATAAAGTTGAAAGACATTTACAGGACGGTGATATTGTATTATTTAACCGACATCCAAGTTTGCATAAAGGAAGTTTAATGGCACACTATGCTAAGATTCTTCCAGGCAAAACATTCAGAATGCATCCTGCTGTTGCTTCTCCTTATAATGCGGATTATGATGGTGATGAAATGAATATTCATTCTCCTCAAACTGAAGAAGCGAGAGCTGAAGCAAAAGTGTTATTGGATGTTAAACAAAATTTAATTTCTCCGAAGAACAATACTAATTTTATGGGTTGTGAAGTTGATGCTATTACCGGTGGATATTTATTGGGTAGACATGAATTTTCAAAAGAAGATGCAAATCAACTTTTATTCCAATCTGGTGTTGATTTTGAATGCACTAAAAAATCTATCTCTGGTTTAGAATTATTTTCGAAAATTTTACCAAAAATTGATTTTGTAAATGATTCTATTACTATTAAGAAAGGTGAAATTACCGGCGGTATTATTGATAAAACTGCATTTGGCGGTGGAAGCGGGGAACTTATCAAAGAGTTAGATAAAACTGTTGGAAGAATGGAGACTTTTGAAACTATTAAGAAAGCTTTCAATTTAGGTAAAAATTATTTATCAAATAGGGGTATTACACTTTCTGTTGAGGATTTAAATTTGGATAAGAGAGTTGTTGATGCCGGTAAAAAAATTATTCAGGATGCTGAAGAAAAAACTCAGGAAACTTTAGATTTATATAACGCTGGTAAATTAGAAATTATTCCTGGTAAAACTGCGGAAGAATCAAGAGAGATTCAAATTTTGAAGATATTAAATGAAGTAAGAACAAAGGTTGGTTCATTAGTTAAAAAAGAATTCCTTGAAACTAACGCTGTTAATCATATGATTAAGTCTGGTGGTGGTGGTAATATTTTGAATATTACTCAGATGGCTAGTTGTGTTGGTCAGCAGGTATTACGTGGCGGAAGAATTGATTTAGGTTATAATGAAAGAACATTATCATTTTTCGAGAAAGGAGATTTATCTCCAAAGGCTAGAGGATTTATTAATAGTCCATTCATTAAAGGTTTAAGACCTGATGAATTTTTCTTTGGTGCGATTACTGGTAGAGATTCACTTATGGATACTGCTTTACGTACTCCAAAGTCTGGTTATTTATACCGTAGACTTGCTAATGCTTTACAAGATTTAAGGGTTGAATATGATGGTACTGTAAGAGATAGTAATAATCGAATTATTCAATTCCAATTTGGCGATGATGGTATAGATGTTTCACAAATTCATAAAGACGGACAAATTGCTCCGGGTGAAGCTATTGGTATTATTACTGCTCAGTCATTTGGTGAATCTTCAACTCAGATGGTTTTGAACACTTTCCATATGGCTGGTGTAGCTGAAATGCAGGTTACAAGTGGTTTACCTAGAATTATTGAAATTTTTGATGCCAGAAAAACTCCTTCTTCTCCGAAGATGGAAATTTATTTAGATAAAGAGTTTAATAATGAAGGAAATGCAAGGGTATTTGCTGAGAAAATCAAGGAAGTTACATTAAAAGAAATTTCTTCTGAAGTTAAATTAGATTTTAGCAACAAGAAAATTGAAATTGTTATTGATAAAAAAGGATTGAAACAAACTCATACTACTATTAAGAAAGTTGTTGAAAGATTAAATGATCTTGGATTTAATGTTAATGAACAAGCTGATTCAATTACTTTGAATGCTTCTGAATATAGTTTTAGGGAAATTTATAAATTAAAAGAGAAGCTTAAAGCAACTATTATTTCTGGTGTTAAGGGTGTTAAACAAATTTTAATTGTTAAACGAAACAAGGATTTTGTTATTATTACTCTTGGTACAAATTTAAAGGAGATGTTAAAGTTAAAGGAAGTTGACAAATATAGATTAATCTCTAATGATTTTTATGAAGTTGCAAAAGTTTTCGGTATTGAGGCTGCCAGACAATTAATTATTAATGAAGTTGTTGAGGTATTAAATTCTCAAGGTTTAGATATTGATTACAGGCATTCAAAGTTAATTGCTGATGCTATGACTGATAATGGTATTGTTAAGGGTGTAACTCGTATGGGTATTATTACTCAGAAATCTTCAATTTTAGCGAGGGCAACTTTTGAAACTCCGGATAAACAATTTGTTAATGCTTCAATTAAGGGTACTCAAGATAAATTGACTAGTGTTATTGAAAATATTATTTTGAACCAGCCTGTTCCAATTGGTGCAGGGTTACCTGGATTATTTGTTAAGGTGGTTGGTCCTTTAGTTAAGGAAGAAAAAGATAAAAAATTGGCTAAGTCAAAGATTGTTGAAGAAGCTAATAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1162
MKPIRKKIGALNFTLLSPEQIKRLSSAKIVTPELYNIDGYPVDGGLMDLKLGAIDPGVRCRTCGGRIKECLGHPGSIDLARAVIHLKYVPLIELCLRCFCSDCGKLMLDDKFLTKLSPAERAKKAKDCKKCPHCQNEQVKIKLDKPTSFYRDKTRVFPTEIREILVNITDEELRKVGVNPRTCRPEWAILTMLLVPPVTVRPSIILESGERSEDDLTHKLSDIIRANQRLWENLNAGAPEVIIEDLWDLLQFHITTFFDNSVARIPPARHRSGQPLKTITERIKGKEGRLRKNLAGKRVNYSARTVISPDPSIEINEVGIPFQIAKIVTVAETVTELNLEKLKKLIETADKYPGANYIIRTDGKRKKITEELKEEIMNELSVGYKVERHLQDGDIVLFNRHPSLHKGSLMAHYAKILPGKTFRMHPAVASPYNADYDGDEMNIHSPQTEEARAEAKVLLDVKQNLISPKNNTNFMGCEVDAITGGYLLGRHEFSKEDANQLLFQSGVDFECTKKSISGLELFSKILPKIDFVNDSITIKKGEITGGIIDKTAFGGGSGELIKELDKTVGRMETFETIKKAFNLGKNYLSNRGITLSVEDLNLDKRVVDAGKKIIQDAEEKTQETLDLYNAGKLEIIPGKTAEESREIQILKILNEVRTKVGSLVKKEFLETNAVNHMIKSGGGGNILNITQMASCVGQQVLRGGRIDLGYNERTLSFFEKGDLSPKARGFINSPFIKGLRPDEFFFGAITGRDSLMDTALRTPKSGYLYRRLANALQDLRVEYDGTVRDSNNRIIQFQFGDDGIDVSQIHKDGQIAPGEAIGIITAQSFGESSTQMVLNTFHMAGVAEMQVTSGLPRIIEIFDARKTPSSPKMEIYLDKEFNNEGNARVFAEKIKEVTLKEISSEVKLDFSNKKIEIVIDKKGLKQTHTTIKKVVERLNDLGFNVNEQADSITLNASEYSFREIYKLKEKLKATIISGVKGVKQILIVKRNKDFVIITLGTNLKEMLKLKEVDKYRLISNDFYEVAKVFGIEAARQLIINEVVEVLNSQGLDIDYRHSKLIADAMTDNGIVKGVTRMGIITQKSSILARATFETPDKQFVNASIKGTQDKLTSVIENIILNQPVPIGAGLPGLFVKVVGPLVKEEKDKKLAKSKIVEEANK*