ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

AB_3033_bin_19_scaffold_4991_1

Organism: AB_3033_bin_19

near complete RP 30 / 55 MC: 5 BSCG 19 / 51 MC: 2 ASCG 35 / 38
Location: 3..4022

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
rpoB; DNA-directed RNA polymerase subunit beta (EC:2.7.7.6) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 26.6
  • Coverage: 798.0
  • Bit_score: 231
  • Evalue 1.30e-57
DNA-directed RNA polymerase subunit beta n=1 Tax=Mycoplasma genitalium M6320 RepID=J3ZHL1_MYCGT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 26.6
  • Coverage: 798.0
  • Bit_score: 231
  • Evalue 4.50e-57
Marine sediment metagenome DNA, contig: S01H1_S10710 {ECO:0000313|EMBL:GAG04666.1}; Flags: Fragment;; TaxID=412755 species="unclassified sequences; metagenomes; ecological metagenomes.;" source="marine sediment metagenome.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 59.0
  • Coverage: 266.0
  • Bit_score: 327
  • Evalue 5.00e-86

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

marine sediment metagenome

Sequences

DNA sequence
Length: 4020
TTAAATGAACCTTTTTTATTCGTATATTTTTCCGAAAACTCACTATTTGTACAGGATTATAATAGACTAAAATTAAAAAGGATTGATTTTAGACATGCAGTTATTCCAGTTACAAAAATACCTGTTACACGATTAACTCCAGACATAAGAGCTGCATATAAACAAATTGGAATGTTATCTTATTCCTCAAATATGAAATTTCCAAATAATAAAAATTTGGTTGTTGATACTTCATTTTTTACGCAGAATGTTGATAAGATATATAAACCAAATACATATCGTCAACGAGCAGGTTATTTAATTCAGAATCTCCTAACAAAAGCATTTCAAATGTTTCCTGATAATTATAAAAAGATTTTGGTATATTCTGTTGATACAACAAAACCAGCAAATAATTTCATTAATAAAAAAGTATTTCCCATCATTAAACAATTGAAAGCCAAAGAAATTGTTTTTGATGATATGTTATTTATAACTCTTGATGAATCATCTGCAAGATATAGAATGCTTATAAGTGAAAAAGATTATAAATTTTCAAGAGTTCTACAATATTTACGAAAAATAAAAATCAAAACTACAGAACAAGAACAAGAAGAAGATGTCAATATAGCAACAACTATAGTAATGAAATTGGTTACACTAAATCTTGATAAACCGGATGTTATAAGAAATGCTATTAAAAACTATTTATCTAAAAATCCTAAAGCAGCAGGAAAGATTGAAGCAGGAGAATTATCAGATGAAGAAATAAAACGCTTAACTGTTGCTTCTATTCTATATGGTGCAAATGGTGATCTTGAAAAAGCAAATAGACTATCAAAATTAATTCCACAAAAGAATGTAACTTCTGCAATTAAGAAAATAAGTAAACAATACGAAGATGATTTATTGAAAAAACAAGAAAGTGTTAATGCCAATCCTTCTATTATTTCACAAAATCAAAGTGTACCGCAAAGAGTTGAAGGGAAAACTCCAGAGCATATATTTGATAAAAGACGAATTGACTTTGAAACAAATCTTAAAAAAGATATGATTAGTGCATTTAAAGTTCTTGAAGCAAGGGATATACCTTTAAAATTTGATTCGATAACAATAAAAAATAAACTTCAAAGAGCAGGAGAACTGTCAAAATCAGATGAAGCTCTTATATTAATTAAATTAAAAGATGGCCGTGGAAAGATTCAAGAAGTGACTATCATTATACCAAAGATTGATCCTAATACAGGCACCTTTAGAGTGAATGGTAAAAAGAAATGCTTAATCAATCAAATTGTATTGAATCCGATTAGTTTTCCAAAAGAATATGATTCTAAATTTGAAAGTTCATATTCGATGTTTCATATTTATAGTAAGAGAACTAAGCGTTTAAAATATCTTGAAGTATATATGGGATCATTCAGATTACCATTAATGATTTTACTTTCATACAGTTTTGGATTTGACAAAACTATAAAACAATATGATTTAAAATATAAAATTGTTAAAGAAAAACCAACAAAAGAGGAATATTTTACAGAAATTCCTAGTTCATATCTAGTTTTTGAAAATGTAAATACTGACTTGAAAAAAGAATTGGTATCATCATTTATTAATGCAAAGGTTAACAATTATCCAGTAGATAAAGAATTTTTAACAAAAGATTACTTTAATGATTTTATTATTAAAACAACCGGTCGAGTTGATTCAACATATTTGATTACAAATAATTTACAGAATATCGTTGATCCAATTGTAAGACAAGTATTAATAAATCAACAATTGCCATTTGAACTCCCATTAATTATGCAATATATGGCAACTAAATGTGTAATTGGTTATGTACAAGATCGAAATGATCTGACAAATCAACGTATTAGAAACTCAGAAGTTTTAGTTCATTTAGCTCAAAAACAACTATTAAAAGCATATACTGAATATCGTGAGCAAGTTTTAGCTGGTAATAAAGATGCTATTTTGAATATCCCAGAAGGCGGCGTACTTAGTCAATTTACAAATCTTGAAATTGTGCAAGACATGGAATATGCAAATCCAATGGAAGAAATGGCCACAATTACAAAAGTTTCTCCTGTTGGAAAAACAGTTGGAGGCATCCCAGATAAACAAGCTGTACAGTTAGATGCTAGAAATGTTCATCCAACATATTATGGAAATATCGATCCACTAGATACAGCAGAAGGTGCTAATATTGGTATTACCCAACAATTAACCGTAGATGCATATATTACTTCTGCTCGTGGTCTTTTTGGACAAAAAGCTATGAATAATAAAGAAAAATCTGGAATTCTTTCAACGTCAGCTTCAATGATTCCTTTCATTGAAAATAATGAAGGTGCAAGAATTATTATGTCCACGAACCAAGCAAAACAGATGTTACCTCTTAAAAATCCTGAAGTACCAATATGCCAATCAGGATATGAATCTTTGCTAACAAATGTTTTATCTGATAGTTTTATAAAGAGATCACCTTGCAAAGGAAAGATTACATCAGTTACATCTGACTATATCGAAGTTATTTGTACTAATGGCAAAAAGAAAAAAGTAGATATTACTCCTATTCAATTAAAATCTGGATCAGGAAAAAATACATTAAGTACATTTAAACCTGTTGTGAAAGAAAAACAGGCAGTTAAAGATAAACAAATTATTGCAGAAGGAAGTGGTATTTCTAACGGAACAATTGCAATGGGTCGAAATCTTTCATGCTGTTATATGCCTTATAAAGGATATAATTTTGAAGATGGTTTAGTTATTAGCGAACGACTTATATCAGGAGATAAACTTACATCATTACATGGAATTGATGTTGAGGTTACAGTCGATAAAAGAGATAAAGTAATGTCAATTATTGAGTTGGGAAAGGAAACTAAAAAAGGTGAACCTCTATTCAGAAAGTTTCCAGGTGATATTGATGAACTTCTTGGGTTTGATCAAGAGGAAGATGAAGGAACTGATGTATATGATGGTCAAATGGTTACAAAAAGTCCTGGCGGTAAAGTAGTTGATATTGAAGTATTTTCAAATATAGATATAGCTACATTTCCTATATTGAAACCTTATATTGAAAGAACTAATAAAAAATATAAAAAACCTCCAAAAGAAAAATATACTAACCGAGGCATTTCTGTTAAAGGAATTAGGATTATATTTAAAATTGAGCAAGAATTAAAAATAGGACTTGGAGATAAATTATGTAACAGATTTGGAAATAAAGGAATTATAGCTTTAATAGAAAAAGATGAATTAATGCCGAGAACTCCGTGGGGAGAACGAGCTGATATTATATTAAATCCATTGGGAGTTATCGGGCGTATGAACTTAGGTCAAATATATGAATTATATTGTGGTTTAATTTCTAAATTCGCTTCAATTCAAATGGTCAAGACAAAAAGTAAAGCAGAAATAATAAAACTATTCGATGTCATAATGAAAGGTCTTGATACAACACCAGGAAAAACGTTTGGATTGAAATTTATGTCAAATTTGATTAAATTGAGTGATGCTCAATTTAAAACAATGATAAGTCAAATTAAGCAATCCGGATTTTTTCCTATAATTATTCCACCTTTTCAAGCACCAACATATAAACATATTTTACCATTATTGAAAACACTTGGTTTGAAATCAGGATATAACTTGACATTACCTGAGTTTAATACAAAGACTAAAAGCATCGTACCATTTGGTTATATATATATTTCAAAGTTAGAACATATAGGAGAAATGAAAGTTCATGCAAGATCAACCGGTCCAACAGTAGGGAAAACACTTCAGCCCACAGCTGGGAAAGCACATGAAGGCGGTCAACGTATGGGTGAAGGTGACACATGGGCGTTAGCTTCTTATAATTGTCCTATTTTATTAGCAGAATTTTTTGGTCCTTTATCAGATGATCAAGTAACAAAGAATGAAATATTAACTGAAATCATTCAATCGGGTGAGGCTGATTTTAGACCTGCTAAAACTTCACCAACAAAAGAATTATTAAATGCATACTTTACTTCATTAATGTTGGCAGATTAA
PROTEIN sequence
Length: 1340
LNEPFLFVYFSENSLFVQDYNRLKLKRIDFRHAVIPVTKIPVTRLTPDIRAAYKQIGMLSYSSNMKFPNNKNLVVDTSFFTQNVDKIYKPNTYRQRAGYLIQNLLTKAFQMFPDNYKKILVYSVDTTKPANNFINKKVFPIIKQLKAKEIVFDDMLFITLDESSARYRMLISEKDYKFSRVLQYLRKIKIKTTEQEQEEDVNIATTIVMKLVTLNLDKPDVIRNAIKNYLSKNPKAAGKIEAGELSDEEIKRLTVASILYGANGDLEKANRLSKLIPQKNVTSAIKKISKQYEDDLLKKQESVNANPSIISQNQSVPQRVEGKTPEHIFDKRRIDFETNLKKDMISAFKVLEARDIPLKFDSITIKNKLQRAGELSKSDEALILIKLKDGRGKIQEVTIIIPKIDPNTGTFRVNGKKKCLINQIVLNPISFPKEYDSKFESSYSMFHIYSKRTKRLKYLEVYMGSFRLPLMILLSYSFGFDKTIKQYDLKYKIVKEKPTKEEYFTEIPSSYLVFENVNTDLKKELVSSFINAKVNNYPVDKEFLTKDYFNDFIIKTTGRVDSTYLITNNLQNIVDPIVRQVLINQQLPFELPLIMQYMATKCVIGYVQDRNDLTNQRIRNSEVLVHLAQKQLLKAYTEYREQVLAGNKDAILNIPEGGVLSQFTNLEIVQDMEYANPMEEMATITKVSPVGKTVGGIPDKQAVQLDARNVHPTYYGNIDPLDTAEGANIGITQQLTVDAYITSARGLFGQKAMNNKEKSGILSTSASMIPFIENNEGARIIMSTNQAKQMLPLKNPEVPICQSGYESLLTNVLSDSFIKRSPCKGKITSVTSDYIEVICTNGKKKKVDITPIQLKSGSGKNTLSTFKPVVKEKQAVKDKQIIAEGSGISNGTIAMGRNLSCCYMPYKGYNFEDGLVISERLISGDKLTSLHGIDVEVTVDKRDKVMSIIELGKETKKGEPLFRKFPGDIDELLGFDQEEDEGTDVYDGQMVTKSPGGKVVDIEVFSNIDIATFPILKPYIERTNKKYKKPPKEKYTNRGISVKGIRIIFKIEQELKIGLGDKLCNRFGNKGIIALIEKDELMPRTPWGERADIILNPLGVIGRMNLGQIYELYCGLISKFASIQMVKTKSKAEIIKLFDVIMKGLDTTPGKTFGLKFMSNLIKLSDAQFKTMISQIKQSGFFPIIIPPFQAPTYKHILPLLKTLGLKSGYNLTLPEFNTKTKSIVPFGYIYISKLEHIGEMKVHARSTGPTVGKTLQPTAGKAHEGGQRMGEGDTWALASYNCPILLAEFFGPLSDDQVTKNEILTEIIQSGEADFRPAKTSPTKELLNAYFTSLMLAD*