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AB_3033_bin_19_scaffold_653_12

Organism: AB_3033_bin_19

near complete RP 30 / 55 MC: 5 BSCG 19 / 51 MC: 2 ASCG 35 / 38
Location: 12816..16913

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
DNA-directed RNA polymerase subunit beta n=1 Tax=Phascolarctobacterium succinatutens CAG:287 RepID=R6XVG4_9FIRM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 27.1
  • Coverage: 853.0
  • Bit_score: 230
  • Evalue 6.00e-57
Marine sediment metagenome DNA, contig: S01H1_S10710 {ECO:0000313|EMBL:GAG04666.1}; Flags: Fragment;; TaxID=412755 species="unclassified sequences; metagenomes; ecological metagenomes.;" source="marine sediment metagenome.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 59.6
  • Coverage: 267.0
  • Bit_score: 329
  • Evalue 1.70e-86
rpoB; DNA-directed RNA polymerase subunit beta similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 26.2
  • Coverage: 867.0
  • Bit_score: 229
  • Evalue 5.00e-57

Lists

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Notes

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Taxonomy

marine sediment metagenome

Sequences

DNA sequence
Length: 4098
ATGATTCAATTTAAATCTTTGGTTCAATATACTAGAGTAGTTGATGGAATTAGATTTCCACAAAATAATAAAGAACCTTTTTTGCTTGTATATTTTTCGGAAAATTCTAATCTTATTGAAGATTATCCAAAGTTGAATTTAAGATTAGTTGATTTAAAACATGTGGTCGTACCCTTGACAAAAATTCCTAGAACTCGAATGACACCAGCATTTAAAAAGATATATCAACAATATAAATTATTACCTTATGCATCCAATATGGCATTCCCAAAAAATCGAAATATATTATATGATTTATCTAATTACTTAAATGCAATTGATGTTATGTATAAACCAACAACATATAGGCAAAGAGCTGGATTTTTAATTAATAATGCTTTATTAAAAGCATTTGTTACATTCCCAAGTAATTATAAAAAAACATTAATCTATTCTATTGATATGACAAAAGATTTAAATTCATTTGTCAATAGAAAAGTATTTCCTCTTTTACGGCATATTAAAGATGGAGATTTATATTTTGATAATTTAATTTTAGCGATGGTTGGGGAAACAGATACCAGATATAGATTATTAATAAAAAATGGGGAATTTAAATTTAGTAGACTTTTTCAGCTTTTAAAACGTATAAAACCGATTAGTTCTGAAGAGGAACAAGAAGAAGAGATCAAAAATGCTTCCCAGGTCGTTTACAGCACCGTTTCTAATAAGATAGATGTTAGTGGTAGGGGAACTGTAAAAAATGCCATTCACGACTATTTAAGAAAGGACAAAAAAACATTTGAAAAAGCTTCATCAAATGAACTATCATCTGATGAAATAAATAGGGCTACAATCGCTTCAATCTTATTTAAAGTCAATGGAAATTTGGAAAAATCAAAGAGACTTGCGAAATCAATTCCATCTAAAAACTTAGCTATTGCAGTTAAAAAAATAAGTAGCCAATATAAAGACGAAATGTTAAAACCACAAGAAACTATAAATACAAGTGAGATGATAATCAACAATCAATCTAATATTCCAAAAAGAGTTGATAACAAATCACCTGAGCATATTTTTAACAAACGACAAATAGATTTTCAAACTAATCTTAGAAAAGATTTGATCAATGCATTTAAAGTTTTAGAGACTCAAGATATCCCATTGAAATTTAAATCTTTTAAAATGTCAGATTTACCAAGTAAAATGGGAGAAATAAGAAAGTCTGATGTCGCTCTTATTACAGTAATCTTGGTAGATAAATTTGGCAATGAGCACATTATTCATCTTGAAATTCCAAAGATTGATCCTAACACTGGAACCTTTAGAGTTAATGGTGAAAGAAAATGTTTAATAAATCAAATATCAATAAATCCAATTAGTTTTCCAAAAGAATTTGATTCTAAATTTGAAAGCTCATATTCAACATTTCATATTTATAGTAAGAGAACTAAAACCAAACAATATCTAGAATCATATATGGGATCATTCCGTCTGCCATTTATTATTTTATTATCTTACGCATTTGGATTTGAAAAAACATTAAAACAATATAAAATTAAACATACAATTACAGAAACAAAACCTTCTAAAGATAAACTATTCTGTAAAGTTCCATTATCATATATTGTATTTGAAGGTTTAGATACAAATCTTAAAAAAGAATTAGCTCAATCTTTTATACAAGCTAAAGTTATAAATTATAAAGTAGAACAAGAATTCGGTTCAAAAGAATATTTTAATGATTTAATAATTGCTATAACAGGCAGAGTAGATTCAACATATTTAATAACAAATAATGTTAAATATATAGTAGACCCTATTGCTAAACAAGTGTTAGTTAATCAACAACTTCCTAGTAATTTGTCTGTTATTATGGAATATATGGCAACCAAAGCAGTCACGGGATTTGTGCAAGATAGAAATGATATAACAAATCAAAGAATAAGAAATTCTGAAATTCTAGTCCATCTAGCACAAAAACAAATTTTAGCAGCATATACAGATTATAAAAATCAAGTATTGTCTGGTAATGAAGATGCCAAATTAACATTACAAGAAAATAAATTAATGAGTCAATTTATTAATTTAGAAATAGTTCAAAATATGGAATATGCAAATCCAGTTGAAGAGATGGCTACAATTACAAAAGTATCACCAGTTGGTAAAACAGTTGGAGGTATTCCTGATAAACAAGCTATTCAATTAGATGCTAGAAATGTACACCCTTCATATTTTGGAAATATAGATCCATTAGATACAGCAGAAGGTGGAAATATTGGTATTACTCAACAGTTAACTGTTGATGCATATATTACTTCTGCTAGAGGAATGTTTTCTCAAAAAGAAATTACCAATAAAGAAAACTCTGGAATGCTTTCAACTACAACAGCAATGATTCCATTCATTGAAAATAATGAAGGTGCAAGAATCATAATGGCTGCCAATCAAGCTAAACAAATGCTTCCATTAAAAAATCCAGAAGCACCAATCATTCAATCTGGTTATGAATCTACATTAACAAATGTTCTATCTGATGCTTTTATTAAACGATCACCTTGTAACGGGAAAGTAATAAATATAACAAAAGATTCTATCAATATATTATGTCGAGATAATAAAAAACAACAGGTTGATATTACACCACAACATTTAAAATCTGGATCTGGTGTTGATACTTTAAGTGTTTTTACACCTCGAGTTAAGGAAGGACAAACTATTAAAACAAGACAAATCGTTGCAGAAGGTGGGTGTATGTCGGGTGGAAGTATATCTTTAGGACGAACTCTCTCTGCATGTTATATGGCGTATAAGGGATATAATTTTGAGGATGGTATTGTCATAAGTGAAACTGTTGTTCAAAATCAAAAGCTAACATCTCTTCATGGTATAGCTATAGAAGTAACTGTTGAGGAAGGTGATAGAATAGTTAAACTTGCCGATATTGGACAAAAAACTAAAAAGGGAGATCCTCTATTTGTAAAAGCAATAGGAAGTCTTGAAGAATTACTAGGTGGTACATTAGAAGAGGAAGAAGATGAAACAGCAGATATTTATGATGGAAAATATATCAAAAAAAGTCCGGGTGGGACTATAGTAGATATTGAAGTCTTTTCAAACTTTTCAGATGATCAATTTCCAGAATTAAAAACTCTTATTAATAGAACCAATAGAAGATATAAAAAACCATCAAAAGAAAAATTTAAAGATAGAGGAACTACTGTCAAAGGGATCTTAATTAAATTTAAGATTGAACAAGAGTTACATATTGGGGTTGGAGATAAATTATGTAATAGATATGGAAATAAAGGAATAATCTCATTGATTGAAAAAGAAGAGCTTATGCCAAGAACTCCGTGGGGAGAAAGAATAGAAATTATCTTTAACCCACTGGGGGTTGTTAGTAGAATGAATATGGGGCAAATGTTTGAGCTTTATTGTGGGCTCATTTCAAAAACACTAGCTTCCAGAATTATAAAGAGTAAAAATAAAGCAGAAGTTGTAAAATTATTTAGAATTGTATTAGGTAAATTGGATACTTCTCCTGGAAAACAATTCGCAAGTTCGTTTGTTAAAAATATAGAAAAATTAGGACCAAAACAATTTAAAACAATGGTAGATCAAATTAGAACAACTAAATCTGTTCCAATAATTATTCCTCCATTTAAAGCCCCCTCACATAAAGATATTGCAAATACTTTGAAAGTTCTTGGGTTAAAAACAGGTTATAAATTAAAGCTTCCAGAATATAATACAACAACTAAAAGTAATGTACCTTTTGGATATATTTATATGTCAAAATTAGAACATATTGGAGCAAATAAAATACATTCAAGGTCAACTGGTCCAATGGTTGGTAAAACATCTCAACCAACTGGGGGCAAAAGAAAAGAGGGTGGTCAAAGGATAGGTGAAGGTGACACATATGCTCTATTATCTTATAATTGTCCTACAGTTTTATCTGAATTATTAGGACCTCTTTCTGATGATGTTGCAACTAAAAAAGAGATAGAATCAGATATAATTCAAACAGGGTCAGCTGAGTTTAGAGAAACAAAAGTATCTCCGACAAAAGATTTATTAAATGCTTATTTTATAGCTTTAATGTTGGGAAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 1366
MIQFKSLVQYTRVVDGIRFPQNNKEPFLLVYFSENSNLIEDYPKLNLRLVDLKHVVVPLTKIPRTRMTPAFKKIYQQYKLLPYASNMAFPKNRNILYDLSNYLNAIDVMYKPTTYRQRAGFLINNALLKAFVTFPSNYKKTLIYSIDMTKDLNSFVNRKVFPLLRHIKDGDLYFDNLILAMVGETDTRYRLLIKNGEFKFSRLFQLLKRIKPISSEEEQEEEIKNASQVVYSTVSNKIDVSGRGTVKNAIHDYLRKDKKTFEKASSNELSSDEINRATIASILFKVNGNLEKSKRLAKSIPSKNLAIAVKKISSQYKDEMLKPQETINTSEMIINNQSNIPKRVDNKSPEHIFNKRQIDFQTNLRKDLINAFKVLETQDIPLKFKSFKMSDLPSKMGEIRKSDVALITVILVDKFGNEHIIHLEIPKIDPNTGTFRVNGERKCLINQISINPISFPKEFDSKFESSYSTFHIYSKRTKTKQYLESYMGSFRLPFIILLSYAFGFEKTLKQYKIKHTITETKPSKDKLFCKVPLSYIVFEGLDTNLKKELAQSFIQAKVINYKVEQEFGSKEYFNDLIIAITGRVDSTYLITNNVKYIVDPIAKQVLVNQQLPSNLSVIMEYMATKAVTGFVQDRNDITNQRIRNSEILVHLAQKQILAAYTDYKNQVLSGNEDAKLTLQENKLMSQFINLEIVQNMEYANPVEEMATITKVSPVGKTVGGIPDKQAIQLDARNVHPSYFGNIDPLDTAEGGNIGITQQLTVDAYITSARGMFSQKEITNKENSGMLSTTTAMIPFIENNEGARIIMAANQAKQMLPLKNPEAPIIQSGYESTLTNVLSDAFIKRSPCNGKVINITKDSINILCRDNKKQQVDITPQHLKSGSGVDTLSVFTPRVKEGQTIKTRQIVAEGGCMSGGSISLGRTLSACYMAYKGYNFEDGIVISETVVQNQKLTSLHGIAIEVTVEEGDRIVKLADIGQKTKKGDPLFVKAIGSLEELLGGTLEEEEDETADIYDGKYIKKSPGGTIVDIEVFSNFSDDQFPELKTLINRTNRRYKKPSKEKFKDRGTTVKGILIKFKIEQELHIGVGDKLCNRYGNKGIISLIEKEELMPRTPWGERIEIIFNPLGVVSRMNMGQMFELYCGLISKTLASRIIKSKNKAEVVKLFRIVLGKLDTSPGKQFASSFVKNIEKLGPKQFKTMVDQIRTTKSVPIIIPPFKAPSHKDIANTLKVLGLKTGYKLKLPEYNTTTKSNVPFGYIYMSKLEHIGANKIHSRSTGPMVGKTSQPTGGKRKEGGQRIGEGDTYALLSYNCPTVLSELLGPLSDDVATKKEIESDIIQTGSAEFRETKVSPTKDLLNAYFIALMLGN*