ggKbase home page

AB_3033_bin_19_scaffold_2148_18

Organism: AB_3033_bin_19

near complete RP 30 / 55 MC: 5 BSCG 19 / 51 MC: 2 ASCG 35 / 38
Location: comp(17074..20070)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
DNA-directed RNA polymerase {ECO:0000256|RuleBase:RU000431}; EC=2.7.7.6 {ECO:0000256|RuleBase:RU000431};; TaxID=77133 species="Bacteria; environmental samples.;" source="uncultured bacterium.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 28.6
  • Coverage: 521.0
  • Bit_score: 177
  • Evalue 8.10e-41
DNA-directed RNA polymerase n=1 Tax=uncultured bacterium RepID=K1YED5_9BACT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 28.6
  • Coverage: 521.0
  • Bit_score: 177
  • Evalue 5.80e-41
rpoB; RNA polymerase subunit beta similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 27.8
  • Coverage: 571.0
  • Bit_score: 168
  • Evalue 5.80e-39

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

uncultured bacterium → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2997
ATGAATATAATTAACCCAAATTTTAAAATTAATAAAGATAAAAATATTTTTAATATAAGAAAAAAAGAATATGACAATATCATAAATATAGTTTCAGAAATTTTAAAACCTGTTGAGGATTTAGGATTTATTATTAATGAATTATATTTAAAAGATTCAAAATTTTCATCAGGTGAATTATCAAAAACAGTAAAACAAAATTTAATAATTAGATTAAAAAAAGAAAATTCAGAAATTGATTTAAGTATGGTAATTCCAAAATTAATAGATAATAATTATATAATTATAAATGGAAAAAAGAAAATACCCCTCTTTCAATTATTTGATATTCCTATATGTACACGAGGAAAAAATATTAAATTACGTACAAATGTTGCAACTATGATGATTTTTAAAGAAAAAGAACCACCTTTTATTACAGTTAGTTTTTTATCGAAAAAAGTACCATTAGCTCTTTTAATGTTTGCTTTTTTTAATGCAGAGAATCTTAATAAAACATATGATTTTAATCAAATAAATGTATCTACAGATTCAAAAAATCTATACGAAAATCTTTTATATGATCTTAAGATTTTTTATAAAGAATCAAAAAATTATACACAAGATGATTTTATTGCTGAAGTTGGTAGAATGTATTCAAAATATAATGCAAAATCAAAAGGTGAGGATATCATATATGCTCTTGAGTTAATTCCAAAAATTGACATTCTATCTAGTAGATTTTTTAAGACAAATTCTATATTAGAAGAAATTATAAATGTTTTAAAAAATGGAAATATTGATGATACTTATTTTGTAAATAAACGTATTAGATGTTTAGAATATATGATATTTTCAAAAATTTCAAAATCTGTTTTTGATTTATGTATTTCTAATCGAACTGCAAAACAACCAAAATTTAATATTAATTCAACTCAGATTTTAAAGGAGTGTAATGTTTCTGATATTATTCAATTTGATTTTTCAATAAATCCTATAGAAGAACTTACAAAACTTTCTCGTGTTAGTTTACTTGGGCCAGGAGGTTTTAAAAGAGATAATGTGCCTAAACATTTACGAGATATTCATTCATCTATGTTTGGAAGAATCTGTCCTGTCGACACTCCTGACAGAGATAATTGTGGTATTTTACAAAACTTAATTCCCAATGTAATATTAGATAAAAATTTAAAATTTGGAACAGATTATTTAAAACATCAACCAATTTCAATACCAGTTTCATTAGTTCCATTTTGTGAAAATGACGACCAGACAAGATTACAGATGTCTTCTTCCCAAATGCGACAATCGATTATGTTAAAAAATTTTGAACAACCTTTAATAAGATCTGGTTGTGAAGGTTTATATACAGATTTTACCCAATTTATAAAAAGAGCTAAAAAAGATGGGTATGTGGTATATATTGGAAATCAATATATTATAGTTCAATATCTTGATAAAGAAGTTGAAATTTTTAATATTAAATTTAAAAATATTTATGTTGAAAATATAGACTTTATGAATATTTATGTTAATGAAGGTGATAAATTTAAAGCTGGAGATATTTTAGCTGAAAGTAATTTTTGTAAAGATGGAAAAATAAATATTGGCCGAAATCTTTTAACAGCAGTTATGTCTTATTATGGAAATAATTATGAAGATGGAATTGTTATTTCTAAAAAATTAGTTGATGAAAATATTTTAACATCTGTCCATTGTAGAAATTTATCATTTATATTACCTATTAGTCGAGTTTTGTTATCATTAAATACAAATTGTTATAAACCATTACCAGATAAACTTGAAAAAATTAAAACCGGAAATCCATATGCAATAATTAAAGAAATGTCTTCTTTTGATTTATGTTCTTCATTTAATGAGAAAGTTATTTTAAAAGCAGTAAATAATTATATTATAACAGATGTAAATATTTATCCAAATGAATGGAATGATGAAATTCCTGAATTTAAAAAATGGGTTGAAGAAAGAATTGAAAATCAAAAAAGTGAAGAAAATGTATTAAAGAAAGTTCTTAATGAAAATTTAGATAAAGCTGAAGCTTCCACTTTTATAAGAGATAATAGTTTAAATAAATTTTCATATGTTGGTAAATTTAAAAATAAAGGTGAAAAAATTAATGGAATGTTAGTTGAAATAAATAGTATATTTTTTAGAAAAGTTCAAGTTGGAGATAAATTAGCTAATCGACATGGAAATAAAGGAGTTATTTCTAGAATTGTAGATCATGATAAAATGCCATTAACTGAATCTGGGGAACATGTTGATATTTGCATCAATCCTTTAGGTATAATTTCAAGAATGAATATAGGTCAATTATTTGAACTTCAATTATCTGAAACTTTATGTGGTTTAAAAAATCAATTAAATCAAATGTTTGATAATAAGAACCAAAAACAAATTAGAGAACATTTGTTATCATATATTAAAATTATTGATAATACAAAAAATAATTGGTACTATAATCAATTTAAAAAACAATTACCAGATAAAATTGATAAACAATTTATTAAAGAATTAACAATTATTCAACCCCCATTTGAATCATTAAATATTGATCAAATTAAAAAAGCTTTTAAATTTACAAATACTAAACCAGAACAAAAAATATTTGATCCAATTTCACAACAAAATATAGTTAATAAAATTGCTATTGGAAAAATATACTTTTTTAGAATGGTGCATATAGCTGATGGAAAATTAGCAGCGAGAGGGATTGGGTCATATTCACGCCGCACACTACAACCTTTAGGAGGAAGAAAAAATAAAGGAGGTCAGAGATGTGGGGAACAAGAGAATGCGTGTCTTATAGGTCATGATGCACCTATTAATTTATTTGAATTTTTCACAACAAAATCAGATTGTATTGATTTAAAAAATAAATATATTAAAAAGTTTGTAAATACTGATTTAATAAATTTGCCTCAAAAATATGATGAAATACCAGAATCAATTAAACTTTTAAATGCATATTTTACAGTAATTGGAATTGAAAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 999
MNIINPNFKINKDKNIFNIRKKEYDNIINIVSEILKPVEDLGFIINELYLKDSKFSSGELSKTVKQNLIIRLKKENSEIDLSMVIPKLIDNNYIIINGKKKIPLFQLFDIPICTRGKNIKLRTNVATMMIFKEKEPPFITVSFLSKKVPLALLMFAFFNAENLNKTYDFNQINVSTDSKNLYENLLYDLKIFYKESKNYTQDDFIAEVGRMYSKYNAKSKGEDIIYALELIPKIDILSSRFFKTNSILEEIINVLKNGNIDDTYFVNKRIRCLEYMIFSKISKSVFDLCISNRTAKQPKFNINSTQILKECNVSDIIQFDFSINPIEELTKLSRVSLLGPGGFKRDNVPKHLRDIHSSMFGRICPVDTPDRDNCGILQNLIPNVILDKNLKFGTDYLKHQPISIPVSLVPFCENDDQTRLQMSSSQMRQSIMLKNFEQPLIRSGCEGLYTDFTQFIKRAKKDGYVVYIGNQYIIVQYLDKEVEIFNIKFKNIYVENIDFMNIYVNEGDKFKAGDILAESNFCKDGKINIGRNLLTAVMSYYGNNYEDGIVISKKLVDENILTSVHCRNLSFILPISRVLLSLNTNCYKPLPDKLEKIKTGNPYAIIKEMSSFDLCSSFNEKVILKAVNNYIITDVNIYPNEWNDEIPEFKKWVEERIENQKSEENVLKKVLNENLDKAEASTFIRDNSLNKFSYVGKFKNKGEKINGMLVEINSIFFRKVQVGDKLANRHGNKGVISRIVDHDKMPLTESGEHVDICINPLGIISRMNIGQLFELQLSETLCGLKNQLNQMFDNKNQKQIREHLLSYIKIIDNTKNNWYYNQFKKQLPDKIDKQFIKELTIIQPPFESLNIDQIKKAFKFTNTKPEQKIFDPISQQNIVNKIAIGKIYFFRMVHIADGKLAARGIGSYSRRTLQPLGGRKNKGGQRCGEQENACLIGHDAPINLFEFFTTKSDCIDLKNKYIKKFVNTDLINLPQKYDEIPESIKLLNAYFTVIGIEN*