ggKbase home page

AB_3033_bin_19_scaffold_2148_20

Organism: AB_3033_bin_19

near complete RP 30 / 55 MC: 5 BSCG 19 / 51 MC: 2 ASCG 35 / 38
Location: comp(20931..23636)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
rpoC; DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit (EC:2.7.7.6) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 30.2
  • Coverage: 948.0
  • Bit_score: 366
  • Evalue 1.30e-98
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' n=1 Tax=Dictyoglomus thermophilum (strain ATCC 35947 / DSM 3960 / H-6-12) RepID=B5YDT7_DICT6 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 30.2
  • Coverage: 948.0
  • Bit_score: 366
  • Evalue 4.60e-98
Tax=CG_Omnitr_02 similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 31.2
  • Coverage: 918.0
  • Bit_score: 379
  • Evalue 9.70e-102

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

CG_Omnitr_02 → Omnitrophica → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2706
ATGCCAAAACTTTTAGATTTTCAAAATTTTTGTGAAAATTTACAAGAAATTACTACAACAAAAATTATGAATAAAAAAAAATTTCATCCTGAAGGGTTATTTTCTGAGCAAATTTTTGGGCCAATGAAGAATTATACTTGTCAATGTGGAACTTATTATGGTATTTCTAAATCAGGAAATAATTGTGAAATATGTAAAGTTGATATTGTAAATAGTAATGAACGTCGAAAAAGATTTGCAAAAATAATTTTACCTATTCCTGTTATAAACCCAATATTTTATGATCTATTAATAGTATTGGGTGGTTCTAATTTAAAAGGTGCGTTAACTGAATTAATGAAAAATGATAAAAGTATTTTATATTTAGATGAAGATGAACATGTTATAACAACAAACTCAGAACTAATTCCAAAAAATAAAGAAACTTGGGAAGGTCTTAATGCTATTCAAAAAATAATAAAAGATCTTGCAAATAATCTTTCAGAAGAGATTGCAGATTGGAAACTTATAAAAAATAATTTAGATAAACTCATCATTAATCAAATTATAGTTTTACCTCCAGATTTAAGACCGGCTGCAAAAGGTATTAAAAAAAATAATCAGATAGTTGATAAAATAAATAGATTCTATATGCAAATTTTAACAAAAAAAGAATCTATGAAAAATACAATTATTGATATAAGAACTAATAAAAAGTTATATTATATTTATTTTAAACAATTACAAAAAGACGTTAATGAACTTTATCATCATATTTTAGAAAAAATGTCTAAAAAAGAAGGGCTTATTAGAGGAAATATTTTAGGAAAAAGAATTGATTTTTCTGGTCGAGCTGTAATTACTCCAGAACCAACTTTAAAGATAGATGAATGTATTTTACCTTATAAAATGGTTTTAGAAATATTTAAACTTCAAATTTCTAAAAAATTAATAGAGATCGGAAAATTCAAACTTCTTAATAAAGCTATTTCTTTTATTGATGAATGTATTGAAAATTCTTCTCCAGTTTTATTTGATTTATGTAAATTGATTATTAAAGATGAAGTTTGTATTTTAAACAGACAACCTTCATTACATAGAATAGGAATGTTAGGATTTAAAATCAAAATAAGTTTAGATTCTGTCATTAAAATACACCCTATGATATGTGCTCCATTAAATGCAGATTTTGACGGTGATTGTATCGCAGTTTATGTTCCAATTTCTGAAGAAGCAAAACAAGAAATAAAAGATAAAATTTTTATTACTAAAAATTTAAGCAGTCCAGCTAATGGATCTTTATCAACTATTCCGACTCAAGATATAATTTTAGGAATATATGCTTTAACTACAAATAATTTACCAGATTATAAAAATATAATAAAATATAAAAATGAAAATATAAGTAAGGGGGAAGTTGAATTTAATAAATGTCTTCCAGAAGATTACCCTGTTGTTTTTGGAAAAGTAGATAAAAAACGTTTATTAGAAATTCTAAATGATATTAAAAATTTATATCCAATTGAAGAAATAACAAAAACTTTAGATAAAATAAAAAGAATAGGATTTAAATTTGCAACTTTATTTGGAACTACTATGGTTCTTAATGAATGTGTAATAAATGAATCAAATAAAATATGTAATGAAATATATTCTTCAGATAATATTATAGAACAATTAAATAAATTTTCTAATAATGATATTACAGAATTTTTAAAAAAGAATTTTAAATATGCTTATATGCTTGAATCTGGAGCAAGAGGTAGTTGGGAACAAATTAAACAAATGATATTAACAAGAGGGTTTATTTCAAATTTTGATGGTGAAATTTTAGAAACTCCTATTAAACATAGTTTGATAGAAGGATTAGATGAAAAAGAATTTTTTAATTCGACATATGGATGTCGAAAAGGACTTTTGGATGTAGCGTTGAATACAGGAGTTTCTGGTTATCTTTCAAGAAAATTAATTTTTACTTGTGCTAATTTACAATTAGGAAATTCTGATGATTGTGGAACTACTGATTGTTTAGAAGTTTTTATTAATACAAAACGAAAAGCTAAAATGTTAATAGGAAGATTTTATATTAAAAATAATATTTTAATACAAATAAAAAAAGAAGATGTTAAAAATTTATTAGGGCAAACAATTCAATTAAGAAGTCCTATTTTATGTAAAAATAAAAATATATGTCATAAATGTTATGGTAATACATATGAAGAATTACATAGTAAATATATAGGAATTATTGCAGCCCAAACTTTAGGGGAAAGAGGAACTCAGTTAATATTAAGGACGTTTCATTTCAGTGGATCAGCAATTATAAATAATGAAAAAGGAAAAAATACAGATATGAAACAAAAAGATATTGTTGCAGATTTATCAACAATATCAAAATTATTACATAAATTTAAAGGAAAAACTTATAAAGAAATTACTTCAGAATTATTTGATGTTTATTCTCATAATCAAGATATTTATCATATCCATTTTGAATGTATTGTAGCTCAATTGATGTGGTATAAACATAAAAAATGGAGACTTTATGAAAATAGAAATGAATTAGTCCCAGAATATTTTAGTATTCAATCGACACCAAGTCAAGAAAGTTGGATTTTAGGTTTAAGTTTTTCTAATCCAAAAAGACATATTTTAAAAGGTCTTTTAAATAAAGGTAATTATAAAGGAATTATTGATAAAATTCTTATTGGAGAAAGAATAACATGA
PROTEIN sequence
Length: 902
MPKLLDFQNFCENLQEITTTKIMNKKKFHPEGLFSEQIFGPMKNYTCQCGTYYGISKSGNNCEICKVDIVNSNERRKRFAKIILPIPVINPIFYDLLIVLGGSNLKGALTELMKNDKSILYLDEDEHVITTNSELIPKNKETWEGLNAIQKIIKDLANNLSEEIADWKLIKNNLDKLIINQIIVLPPDLRPAAKGIKKNNQIVDKINRFYMQILTKKESMKNTIIDIRTNKKLYYIYFKQLQKDVNELYHHILEKMSKKEGLIRGNILGKRIDFSGRAVITPEPTLKIDECILPYKMVLEIFKLQISKKLIEIGKFKLLNKAISFIDECIENSSPVLFDLCKLIIKDEVCILNRQPSLHRIGMLGFKIKISLDSVIKIHPMICAPLNADFDGDCIAVYVPISEEAKQEIKDKIFITKNLSSPANGSLSTIPTQDIILGIYALTTNNLPDYKNIIKYKNENISKGEVEFNKCLPEDYPVVFGKVDKKRLLEILNDIKNLYPIEEITKTLDKIKRIGFKFATLFGTTMVLNECVINESNKICNEIYSSDNIIEQLNKFSNNDITEFLKKNFKYAYMLESGARGSWEQIKQMILTRGFISNFDGEILETPIKHSLIEGLDEKEFFNSTYGCRKGLLDVALNTGVSGYLSRKLIFTCANLQLGNSDDCGTTDCLEVFINTKRKAKMLIGRFYIKNNILIQIKKEDVKNLLGQTIQLRSPILCKNKNICHKCYGNTYEELHSKYIGIIAAQTLGERGTQLILRTFHFSGSAIINNEKGKNTDMKQKDIVADLSTISKLLHKFKGKTYKEITSELFDVYSHNQDIYHIHFECIVAQLMWYKHKKWRLYENRNELVPEYFSIQSTPSQESWILGLSFSNPKRHILKGLLNKGNYKGIIDKILIGERIT*