ggKbase home page

AB_69_bin_160_scaffold_741_10

Organism: AB_69_bin_160

near complete RP 31 / 55 MC: 3 BSCG 21 / 51 MC: 1 ASCG 35 / 38
Location: comp(6124..8808)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
UPF0182 protein Slip_1163 n=1 Tax=Syntrophothermus lipocalidus (strain DSM 12680 / TGB-C1) RepID=D7CMK1_SYNLT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 43.7
  • Coverage: 933.0
  • Bit_score: 784
  • Evalue 7.10e-224
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 43.7
  • Coverage: 933.0
  • Bit_score: 784
  • Evalue 2.00e-224
UPF0182 protein Slip_1163 {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01600}; Flags: Precursor;; TaxID=643648 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Syntrophomonadaceae; Syntrophothermus.;" source="Syntrophothermus lipocalidus (strain DSM 12680 / TGB-C1).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 43.7
  • Coverage: 933.0
  • Bit_score: 784
  • Evalue 1.00e-223

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Syntrophothermus lipocalidus → Syntrophothermus → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2685
ATGAACAAGAATTGGATTATGAGGATAATCATTTTTATTATAGTTATACTGCTAATTTCTTTAGCTGGTTTAACGAAACTGTTTACTGATTATTTATGGTTTAGTTCATTAGGCTTTGATCAAATCTTCTTAATAACTCTTCTTTCTAAGATTAAATTATTTGGAATTGCTGCAGCTATTTTTTTCATTTTTGCCCTTGTTAATATCTGGATATCATCCATTGTAATAAAAAAAAAGAAATTTCCCTTCAAATTCAAATTACTAATCATATTCTTTTTATCTCTTTACGTCAGCAAGAGTGTTTCTGCGCAATGGTTAAAATTTTTACAATTTATTAATCAAACATCGTTTGGAATGGTTGATCCAATTTTTGCAAAAGACGTTTCTTTTTACATTTTTTCATTGCCTTTTTATGAATTTGTTTTAGGATTTTTAATGAGCGTTATATTTTTAACAACTGTGCTTGTTATCCTTGATTATCTAAGTTCTTACTTAGACGCTAAACAAATGTTTGCTAAGCAACAGTTGCCTGGAGTTATCACTCAAAAACCAGTTGATTTTAAGAAATTACTTACTAAAAGAAAAGCAATTACCCATTCAGGGATTTTACTTTCAGTATTGTTTTTATTGCTAGCTGCAAAACACTATCTTTCAAGATTTTCAATAATGTATTCCAAGCAAGGAATTGTTGTAGGTGCAGGTTATTCGGATGTTGTAGCATATTTGCCTATGATTAAAATTATGATGGTATTAGCTGTCATTATGGCAGCATTACTGCTAGTTTGGGTATTTTTTATTTCAAAAGAGCCTAAATTAAGAAAAAGACATTTTATTGTTTACGCACTGGTCGCATATCTTATTTTTGGAGTTATTGGCCCAACAGTAATTCCTGGGCTAGTACAAACTTTAAAGGTATCACCAAATGAAATTAACCTTGAAAAGCCATATATTGAAAATAATATTAAATTTACAAGATTTGCTTATGGTTTAGAAACTGTTGAAGAAAGAGATTTTAATGTCAATATTGGATTAACTTCTAGTATGTTGGATAATGCAAAAGAAACAATTGATAATGTTAGAATTTTAGATTGGAGACCATTAACAACAACTTACAAACAAACTCAAGAAATTAGGCTATATTATGATCTTGCAGGAATTGACATAGATAGATATAATATTGATGGAAAATATACTCAAGTAATGCTCGCTCCAAGAGAATTAGATCAAAGTCAAATTACCTCAAATGCAAAAACTTGGGTAAATCTGCACATGGTTTATACTCATGGTTATGGTGTAGTAATGAGTCCTGTCAACCATGTTACAAAACAAGGCCTACCAAATTATTTTATTAAGGATATCCCTCCAGTTTATACTGTTGATGAAGAAAATTTAAAGATTATAAAACCTCAAGTGTACTATGGAGAAAATGATAATGAATTTGTCCTAGTTAACACAAAAACAAAAGAATTTGACTATCCAAAGGGAGACACTAATGAATATGTTAGTTATGATGGCAAGGGAGGAATTGAACTTAATTCCTTTTTTAAAAAATTATTAATGGCGATTAGATTTAAAGATATTAAAATATTATTATCTTCAGACTTAACAGACAAAAGCAAGATAATGTTTACCAGAGATATTGCTAAAAGAATTGCGACAATTACTCCATTTTTAGGGCTTGATGAAGATCCTTATTTAGTAATTGATAATGGTAGATTACTATGGATTGTGGATGCTTATACAGTTTCAGGAAATTTCCCATATTCCGAGAAATACGGACAAATAAATTATATAAGAAACTCTGTAAAAATTGTTGTTGATGCATATGATGGTACAGTAACATATTATGTTATGGATACAAAAGATCCAATAATGTTAACTTATGCCAAAATATTCCCTAAACAGTTTAAGCAATTTGGAGCTATGCCTGACAGCATAAAAGAGCATATTAAATATCCAATTGACTTATTTAAAATACAAGCTCAAATTTACAGTACTTACCATATGGATGATGTTAAAGTCTTTTACAATAAAGAAGATGCATGGCAAATTCCCAATGAAGTTTATGGTGTAGGCCAAAAAGTTAAGGTAGAACCTTATTATATAATAATAAAACTTCCTGGAGAAAATAAAGAAGAGTTTGTTTTAATGACCTCATTTTCTCCAATAAGAAAAGATAATATGGTTGCTTGGATGGCTGCAAGATCAGATGGCAGTAATTATGGAGATTTGATACTTTATAAGTTCCAAAAAGATAAATTAATTTATGGGCCTTTACAAATTGAAGCAAAAATTGATCAAGATTCAGAAATTTCACAGCAACTTACTCTTTGGAGCCAGCAAGGTTCAAGGGTAACAAGAGGAAATTTACTTGTTATCCCGATTAATGATAGTATTCTTTACATTGAACCGCTTTACATACAGGCTGAAACAGGCCAACTTCCTGAATTAAAAAGGGTTTTAGTTTCTGATGGAGTTTCAGTGGTGATGGAAGAAACCTTAGCTGAAGCATTAGAAGCAATGTTTGGAAAGACAAAAATAGTTGATGTGCCAGATAAAATAGTTACAATTGAAGAAGCTCAGATTTATTATAATCTTATTGAAGAATCTATGAGGGAAGGAGATTGGGCAGGAATTGGAGATAACTTTGATAAGTTAGGAAGTATTCTAGCTGGTTTGACTTAA
PROTEIN sequence
Length: 895
MNKNWIMRIIIFIIVILLISLAGLTKLFTDYLWFSSLGFDQIFLITLLSKIKLFGIAAAIFFIFALVNIWISSIVIKKKKFPFKFKLLIIFFLSLYVSKSVSAQWLKFLQFINQTSFGMVDPIFAKDVSFYIFSLPFYEFVLGFLMSVIFLTTVLVILDYLSSYLDAKQMFAKQQLPGVITQKPVDFKKLLTKRKAITHSGILLSVLFLLLAAKHYLSRFSIMYSKQGIVVGAGYSDVVAYLPMIKIMMVLAVIMAALLLVWVFFISKEPKLRKRHFIVYALVAYLIFGVIGPTVIPGLVQTLKVSPNEINLEKPYIENNIKFTRFAYGLETVEERDFNVNIGLTSSMLDNAKETIDNVRILDWRPLTTTYKQTQEIRLYYDLAGIDIDRYNIDGKYTQVMLAPRELDQSQITSNAKTWVNLHMVYTHGYGVVMSPVNHVTKQGLPNYFIKDIPPVYTVDEENLKIIKPQVYYGENDNEFVLVNTKTKEFDYPKGDTNEYVSYDGKGGIELNSFFKKLLMAIRFKDIKILLSSDLTDKSKIMFTRDIAKRIATITPFLGLDEDPYLVIDNGRLLWIVDAYTVSGNFPYSEKYGQINYIRNSVKIVVDAYDGTVTYYVMDTKDPIMLTYAKIFPKQFKQFGAMPDSIKEHIKYPIDLFKIQAQIYSTYHMDDVKVFYNKEDAWQIPNEVYGVGQKVKVEPYYIIIKLPGENKEEFVLMTSFSPIRKDNMVAWMAARSDGSNYGDLILYKFQKDKLIYGPLQIEAKIDQDSEISQQLTLWSQQGSRVTRGNLLVIPINDSILYIEPLYIQAETGQLPELKRVLVSDGVSVVMEETLAEALEAMFGKTKIVDVPDKIVTIEEAQIYYNLIEESMREGDWAGIGDNFDKLGSILAGLT*