ggKbase home page

JS_AP1_S143_scaffold_24016_curated_start_adj_6

Organism: JS_AP1_S143_scaffold_24016_curated_start_adj

complete (manually assigned) RP 0 / 55 BSCG 0 / 51 ASCG 0 / 38
Location: comp(6895..12855)

Top 3 Functional Annotations

There are no annotations for this feature.

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

No taxonomy information

Sequences

DNA sequence
Length: 5961
ATGGCACAAATGTCTTCTGAAGAAGCGCTTAACGGTATTTTTAACATTCTTGAAACTATGGTAAATCAGCATGAAGAGAAAAAGAAAGAAACTCTTGAATAGAAAGCTGATAGTACTATAGTAAGTTTGTTATAGGGTATTGTTGAGACAGCTAAAGATGAATCAGCAGCAACAGTTGGTGAATAGTTAGAGAAACTGTCAAAAGGACTAGTTGCAATGGAATCAATAGATAATGACGTATTAAATAAAGTTGCCACATCTATAGGAAATGTAAATACTGTTTTATCAAGTCTTAAAGTAGATAATGATACATTTGATAATATTGATAGTTTCTTGAAAGCTATTAATAAAATGACTGAAATAAATGCGGAAGGAGCGAAGAATATTGTTGATTTTATTCAGGGATTAACATTATAGAATTCTAAATAGGTAGGTCGAAGTGTTGGTATTATAAAAGCTGTTGTGGAAACTCTGGGAACTTTAGTTGCTATAGATATGATTAAACTATAGTCAAATATTAATAAACTAGATGTAAATACAGCGGAACGAGCTGGTAAATTTATTACAGCATTAATTAATTCTATCAGTAAAGCAAATCCAAAATAGAAAGACATAGAAAGACTTATTAAACCGATTGGTGATTTAATGGGTGGTATATCTAAATTAGTTGACTCTAATGTATTTAAAATGAAAATTAGTTTAAATCCAATTAGAGGTTGGCTTTTAGGTAGACAATTAGGTTAGTTTATAACATCAATTTCTAAATATTTAAAAGGTGATTTAAAAGTAGATGAAAGTATAAAATATTTAGCTGGTATATTAGATCCTCTTGTAAAACTTGCAGATCCAAAACAAAAAATTTCAGTTTTTAAATTAGCTAGAACATTAAATAAAGTTACTGCTACAATACTTGGTGATTTCTTTGCAACATTTGTTAATAAAATACCAAAAGAAGAACAAGCATATAAAACGGTTAACAGTATGGTTGCGATATTAACTGTTTTATTCAACATTAAAAAAATGTAGGTATTAAACTTTAAATTCGCTGTAAGTTCCTTAACTGAAAAACGTGCAAAGAAATTAGTTAATTTCTTTAATACTATATTATCTCAAAAATGGGATGTAAAACAAGTTAATGCTATATCTGCTTTTTTTAAAGCATGGGATGATGCAATGCGATCATTATTATTAGGTGTTATATTCATTGCATTAACTATAAAAGTTACATCATTTAAAACAATAGTTGAATCTGTACTTGTTGTTCGTTATTTAATTAAATTCATGAAAACTACAGTAACAGATTTAGTAACAGATTTAAGTAAAAAAGATGTAAAAAATTCATGTGATATTATAAGAATGTTATCAATATCAATAGGAACTATTGGAGGTATATTAATAGCATTATCATTAGTAACTAAATTAGTTGGTATTGGTACAGTAGTAGTTAGTTTATTAATATTAAGATCTGCTGTAAATGGTTTTAAGAATATAATAAAAGATTTATCAGATCAGAAACTTGATAAAAGTTTAAAATATGCTCAAGGCGTATTAACTGGTATTGGTTTAATGGTAATGTCATTGTCCGTATCTTTATTATTATTAGCATTAACAGTAAAGAATAATACTGTTGAAACCATTATTGCTTCTATAGGAATATTAACATTATTTGTTGCTGGTTCAATTTATCTTGTAAATAAATTATCTAGTATAGATTCTAAAAATCTTAATGCATCAACAAATGCAATGTTGAAGATTGCAGGTGTATTTGCTATAATTGCATTGGTATCTGCAACTTTATTAGCACCAATTGGTAATCATTTAGGTGATGTTATGAAAGGCGGATTTGTTGTTTCATTAGTTATTGCATTAGGTATTTTTGCAGTTAAATATATAGCTAAAGTAAATAAAGATATAGAGCAAGGAACATCTAATTTATTAAAAATATCATTAATTTTTGCATTAGTTTCAATTATATCATTAACCTTATTAATACCTATAGGTAAAAAGGCAGATGATGTAATAGGCGGTACAATTATTACACTTACAATAATTGCTGGATTAATATTTGGCGTTAAATTATTAAATAAAGTAAACGGTAAGCTTGCATTATGGGGATTAGCAGCAACGGCTGTATTAGCTGTCATTTATATGGGTATTACTTTAATTACTAAAGATTTATTGATACCAATAGGTTAGAATGGTAAAGAAGCTGGTATAGGTATGGGTATAACATTATTCATTATTGTAACTCTTATATTCGGTACATATATATTATCTAAAGTAAATGGTAAAAAAGCAGCATATGCTATATTAGCGACCGCAGCAATGGCATTTATTTTATTAGGTATTTCATTAATTACTAAAGATATATTAATACCTATAGGTAAAATGTGGGATGACGCATTAATAGGTGCAGGTGTTGTGTTAGGTATTATTGCAATATTTGGTGCAATTTTATTTGCAATTGGTAAAATGAATTTAAAACATAAGATTGCTATTAAATAGGGTGCTAAAATAATGATGGAAATCGGACTTGTTATGTTAATAACAGGTACAGCTTGCTTATTATTTGCTATAGAATCCAGAAAACTTTATCAATTAAATGATGGTGGTGCAGTTGTATTAGGTGCATTAACTATGACAATAATGATGGGTTTAATGGGTTTAATACTTTATAATGTCGGTAAACTTAAAAAATATTCTGAAAAGATTGCAGAAGGTGGAGCATTAATGATAGCTATAGGTGCATTACTTGATATTATTGGAGGAACAATGGTTTTATTCTCGTATGAATGTAAAAAGATAGATGACTTTAATAAAGACGGTGCAGTATTCTTAGGTGCAGGAACAATGGTTGCATTATTAGCAGTTATGGGTGTTATAATGACAGCATTAGGTACAATGACTCCACTTCTTCCTTTTATTGCTGCTGGTGCAGTAGTTATGACTGCGATTGCAGGTATAATGACATTAGTATCAGGTACAATGATTTTATTTATGAAAGCATTGGAATTAATGTTACCATATAATGAAGAAAAACTGAAGAAAATAGGTAAAACAACTGTTACTTTATTTAATGTAATGTTTGACGTAATAAAAGCTGCTGCACCTAATCCTATACAAATGGTATAGGCAATTGCTGCTGGTGCATTTGCACCTATTATTATGGCAGTGTTTGGAGTATTAACATTAACTGTTAGGGAGATGAAATATATAACAGAGATTTGTAATTCAAAGATGATTCAAACTTTCTCTGAAATAATGTTAGGTAAATCAAAAGATGATGTTAATAGTGTTCTCGGTTCAATGCAAGCAATTGTTAATGCATTTAGTAATTTTAATGGATATGCAATGGCATTAATAGTTTCAATGGCATTACGCCCTATATTAACAACAATATCTGATTACATTGATATTATTATGAAAGTTGCAACAATGAATTATATTGCTGGTTATGATGATAATGGTAAACCTATGTATGAACATTTACCTGCAACTGTATTTGCAGATGCAGCTTCTGCTGTTACTAAAGGATTTACAGAATTCTTAACAGGATTAAGCAACGGTTTTAAAGACTTAGATGCTTTGAAAATTGTAGTCTTATCTGTATTAACATTAGCATTAAATCCTATTATAGATACAGTTGGTAAATTTGTAGATGTCGTGATGAAAGTTGCAACAGGTACATATATAATTGGTTATGATAATAATAAGAAACCTATATTTTAGAAAATAACATCTACAGATTTTAGTAAAGCTGCATCTGCTGTTTCATTATAGTTTAATCTATTTTTATAGCATTTAAGTAATGGCTTTAGTAAGATGAAACTTACAGCAATGTTTGCTATTGCTACAATAGGATAGGTTATGGAACCTGTTATGGATGCTGTTTCAAAATTTGTTGATACAGTAATTAAGGTTTCTACTATGTAGATAGTAACAGGTTACGATAAAAATGGTAAACCTATATATGAACCAGTAGAACCTAGTACATTTGGGGATGCTGCTAAGGTTGTATCAGAAAAATTTAAAGATTTTATTGTTAAATTAGGTGAAGCTTTTACGAACTTATAGCCTAATATGATATAGGCAATGGATGCAATGAAAGATTCTATTGTTCCTATAATGGATGGAGTTAGTAAATTTGTTGATTCTATTCTTAAATTAGCAACGGGTATGTATATTAAAGAATATAAAAAAGATAAAGATGGTAATTATACTGTACCTGTTTATGATAAAGTAACTAAGAAAATGTATACAGATGCAGCTGATGCTATAGCATAGAAATTCGCATCTTTTATTGATTAGTTAGTTAATATGTTTGAAAGACATGGTTCATTCTGGGGAAATAAAACAGAAGATGCATTAAATGCAATAGGTGGTTCTATTGGACCTGTTATGGACGGATTAGGAAAATATGTAGATTCAGTTCTTAAATTAGCAACTGGTACATATATAAAAGGTTATGATAGAAATAAAAATCCTATATTTGGAACAGTAACACCAGAAGATTTTAAGAAAGCTGCAGAAAAGATAGCAAAATCATTTACAGAATTTATTGATATATTAATTAAAAAATTTGCAAATGATAGTTTTATAGAGAAAGCAGAATCTATTGCTGATATTATAAAAAATACTATTAATCCTATTGTGAATGCAGTAAAAGCGTTTTCTGATACATTAAAACCATTCTTAGCATTAACATCTAATAAGAAAGGTACAACTGCATAGTCAAAAGATTATTTGTGTTTACAACCTAAATTCATAAGAACAATATCTCAAAACATTGCAAATGCATTTGTCGATTTTATTACTATTATTTCTAATAATCTTTCTAAAAAAGAAAATATGGAAAAATATAATAAAATTCAATCAACTGCTAAAGTAGTCAATGCGGTAATGAAAACTATTAAAACATCAGTAGATAATCTTAAGAGAATAATTACAACAATGACAGATGATTAGGGTAAAGTATTATCACAAGGAAATGAGGTTGCATCTAAGTTTACATCTGTATTAACATAGTTAGCTACATATTTTAGTACACCTGACAAAGATTTTAAAACGTCAAAATCATCTGCTGATATGGCATAGAACTTTGTGGTTTCTGTATATAAAGTTGTTGGTGTATATAGGAAAATAATAAATCAATTAACATTTGATACTAAAGTAAAACCTATTACAACAGTTACTAATTTTGGAAATGTATTAACAAAAATGCAACATCAGATGATAGGAGTTTCAAAAGCATCAGATCATATTGATTTCTAGAGAACTGCACAATTTATGGATCTTTATTTAGAGATTGCAAAGAAAATGATTTATCTTTCAAGAGAAATGCAACGCCAGAAACAGTTAGGAACTCATATTAATATGTTTATTAATAATATAAAGAGATTAACATCTCCTGAAATTAATAGAAATATGAATGTTACTTCTGGTTCTATGCGTACATATACAGCAAGGTTAAAAACATTTACTGCATAGATACAAGTAACTACAAGTAAAGTTGAAATATATACAACTAAACTTGAAGCTGCACGTAAAGCATTAAAATCATTAGATGACGAAATTATTAATAAAGAAAAAGCACGTAATAATGCATTATAGCAATTTGCTAATAAGATTAATAATATTGCAGTAGCAGTTGATAGAATGAAGAATTCATTTGATAGACTTGATGAGAATGCGATTCTTAATAGATTCGATGGTATTAGAGAATTATTAGATCTTATCACAACTAATACGGATATACCTGCTAATACTCAACAACATAATAATGTATAGCAACCTGTGCATACAGTTGGTAATAGAGTTGTTCCTCAACAAAAAGGTGTTCAAAATACATTACGTCCAGGTTAGACAAATCATAATTATTATGGTAATAATGTACCTACACAAGGTAGAGTTACTTTCTATTTCAAGAATACTACAATCGATGGTTTCTTCAAAAATGCTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1987
MAQMSSEEALNGIFNILETMVNQHEEKKKETLE*KADSTIVSLL*GIVETAKDESAATVGE*LEKLSKGLVAMESIDNDVLNKVATSIGNVNTVLSSLKVDNDTFDNIDSFLKAINKMTEINAEGAKNIVDFIQGLTL*NSK*VGRSVGIIKAVVETLGTLVAIDMIKL*SNINKLDVNTAERAGKFITALINSISKANPK*KDIERLIKPIGDLMGGISKLVDSNVFKMKISLNPIRGWLLGRQLG*FITSISKYLKGDLKVDESIKYLAGILDPLVKLADPKQKISVFKLARTLNKVTATILGDFFATFVNKIPKEEQAYKTVNSMVAILTVLFNIKKM*VLNFKFAVSSLTEKRAKKLVNFFNTILSQKWDVKQVNAISAFFKAWDDAMRSLLLGVIFIALTIKVTSFKTIVESVLVVRYLIKFMKTTVTDLVTDLSKKDVKNSCDIIRMLSISIGTIGGILIALSLVTKLVGIGTVVVSLLILRSAVNGFKNIIKDLSDQKLDKSLKYAQGVLTGIGLMVMSLSVSLLLLALTVKNNTVETIIASIGILTLFVAGSIYLVNKLSSIDSKNLNASTNAMLKIAGVFAIIALVSATLLAPIGNHLGDVMKGGFVVSLVIALGIFAVKYIAKVNKDIEQGTSNLLKISLIFALVSIISLTLLIPIGKKADDVIGGTIITLTIIAGLIFGVKLLNKVNGKLALWGLAATAVLAVIYMGITLITKDLLIPIG*NGKEAGIGMGITLFIIVTLIFGTYILSKVNGKKAAYAILATAAMAFILLGISLITKDILIPIGKMWDDALIGAGVVLGIIAIFGAILFAIGKMNLKHKIAIK*GAKIMMEIGLVMLITGTACLLFAIESRKLYQLNDGGAVVLGALTMTIMMGLMGLILYNVGKLKKYSEKIAEGGALMIAIGALLDIIGGTMVLFSYECKKIDDFNKDGAVFLGAGTMVALLAVMGVIMTALGTMTPLLPFIAAGAVVMTAIAGIMTLVSGTMILFMKALELMLPYNEEKLKKIGKTTVTLFNVMFDVIKAAAPNPIQMV*AIAAGAFAPIIMAVFGVLTLTVREMKYITEICNSKMIQTFSEIMLGKSKDDVNSVLGSMQAIVNAFSNFNGYAMALIVSMALRPILTTISDYIDIIMKVATMNYIAGYDDNGKPMYEHLPATVFADAASAVTKGFTEFLTGLSNGFKDLDALKIVVLSVLTLALNPIIDTVGKFVDVVMKVATGTYIIGYDNNKKPIF*KITSTDFSKAASAVSL*FNLFL*HLSNGFSKMKLTAMFAIATIG*VMEPVMDAVSKFVDTVIKVSTM*IVTGYDKNGKPIYEPVEPSTFGDAAKVVSEKFKDFIVKLGEAFTNL*PNMI*AMDAMKDSIVPIMDGVSKFVDSILKLATGMYIKEYKKDKDGNYTVPVYDKVTKKMYTDAADAIA*KFASFID*LVNMFERHGSFWGNKTEDALNAIGGSIGPVMDGLGKYVDSVLKLATGTYIKGYDRNKNPIFGTVTPEDFKKAAEKIAKSFTEFIDILIKKFANDSFIEKAESIADIIKNTINPIVNAVKAFSDTLKPFLALTSNKKGTTA*SKDYLCLQPKFIRTISQNIANAFVDFITIISNNLSKKENMEKYNKIQSTAKVVNAVMKTIKTSVDNLKRIITTMTDD*GKVLSQGNEVASKFTSVLT*LATYFSTPDKDFKTSKSSADMA*NFVVSVYKVVGVYRKIINQLTFDTKVKPITTVTNFGNVLTKMQHQMIGVSKASDHIDF*RTAQFMDLYLEIAKKMIYLSREMQRQKQLGTHINMFINNIKRLTSPEINRNMNVTSGSMRTYTARLKTFTA*IQVTTSKVEIYTTKLEAARKALKSLDDEIINKEKARNNAL*QFANKINNIAVAVDRMKNSFDRLDENAILNRFDGIRELLDLITTNTDIPANTQQHNNV*QPVHTVGNRVVPQQKGVQNTLRPG*TNHNYYGNNVPTQGRVTFYFKNTTIDGFFKNA*