ggKbase home page

L1_007_000M1_scaffold_403_2

Organism: L1_007_000M1_public_UNK

megabin RP 52 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 19 / 38 MC: 17
Location: 933..3716

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Putative CRISPR-associated helicase n=1 Tax=Uncultured methanogenic archaeon RC-I RepID=Q0W588_UNCMA similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 34.2
  • Coverage: 758.0
  • Bit_score: 352
  • Evalue 9.30e-94
cas3; putative CRISPR-associated helicase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 34.2
  • Coverage: 758.0
  • Bit_score: 352
  • Evalue 2.60e-94
Putative CRISPR-associated helicase {ECO:0000313|EMBL:CAJ36455.1}; TaxID=351160 species="Archaea; Euryarchaeota; Methanomicrobia; Methanocellales; Methanocellaceae; Methanocella.;" source="Methanocella arvoryzae (strain DSM 22066 / NBRC 105507 / MRE50).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 34.2
  • Coverage: 758.0
  • Bit_score: 352
  • Evalue 1.30e-93

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Methanocella arvoryzae → Methanocella → Methanocellales → Methanomicrobia → Euryarchaeota → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 2784
ATGTTTGTTATTCATTTAGAACACGCACCAGACAGCATCCGCGGTGAATTATCGTTATTCTCTCAGGAGATTGCCCCATTCACATTCGTCTCTAGTGCATCAGCCAGAACACGTGACAGATTATGGGAGGACATTGTTAATATTGATGGCATCTCTGCCGTTTTAATATATACAGATAAAAATGAACAGAAATACAGCGTAAAAAAAATTGGTTATCCATCATACGAATTTGAAAATTTTGATGGTCTACAGCTGATTGTAAAACCTGAAAACACGTTGACAAAAATGATAGCAGAAAAATTATGGGCAAAACTAAATCTAAAAAAATCATTAATTGACCATATGTTAGAGACCGGAATTGTTGCTGGGTGTCTGATGAATGGAATTTTTAAGCCGCTGGTCAATAGACTCGTTGAATTAACTGGAATTGATGAACCTGTTTTAAAACAGCAAATCATTTTTATTTGTGCAATGCATGATATTGGTAAAGCGCACCCGGTTTTCCAGGGGCGAGACGTTGAGACAAACGAGATGTTGAGTGGGTATGAACTGAATCAGGAAACAGTATCTACAATGTTCAGGCATGAGGAATATGCGGAAGAAATGATAAAACAAACACATTTATTCGGGTTTGATACAGATAAACGCAGTGAAATGATAATTCGTCAAATAATCAGCTTGCATCACCAAAAAGAAAAGGAAAGAAAAAAAGAAGATTTCATGCCGATAAAATCCAAAATCGTTGAACGTTGGAGCAATATCCAAAAATATATTTATAATTACATCAAAGAGATTTTTCCGTGCGAAAAAATCGAATTTCCAAATATTATATTTAATGACCATAAAATTGGTTTTGCTGTAGAAAATGGAATCCTTGGAATACTCATTACGTCTGACTGGATTGCATCAAATAATGAAGCAATGGACAACAAAACGATTAAAGATTTTTCTGATATTGGACAATATTTAGATTGGAAAAAGAGAGTCGTAACAGCATTTTTATTTGGCGAAAATTTAACACGTTCAGCATTTCCGGATACTCGTTCGTTTGATAGTCTGTTTCATTTTGGAAACGGTCGCCCGGTACAGCGCGATGTTGTTGATATAGTACAGAAAAACAATATCAAGTTAATGTTAATTGAATCTGGCTGCGGCTCTGGCAAAACTGAGGCTGCACTATATGCCGCATCAGTCTTAGGTAATAAAAACGGATTATCGGGAATTTATATGGGACTGCCAACAGGCACTTCTGCTGAGGCTATTCAGGGAAGAGTTGATGATTTTTTGGGTGAATTACATATGCGAAAAACAAAATTGTATACGTCAAAATCTATGCTATTGAGGGAAAATAATACTGAACCGTCATGGACGGATGTCTCACGGCAGAGATTATTAACTCCATCTGCTGTCGGGACAGTTGACCAGGTGATGACTGCTGCCAGGCTGGTGAGATTTGAAAGTGTCAGAATGGCCGGACTGTCGTCCAAAGTGTTGATTATCGATGAAATTCACGCGTATGATGCATATATGATTACGGTCATTGAGCGGTTATTGCAAATTTGTAATGTTCTCGGAATCCCCGTTATTTTGTTATCTGCTACATTGCCAGTATCAACAAAAAAGAAATTATTTTCAACAATAATTAACGAGTCAGATATTGATATGCATAGTGGCTATCCGCTGATTTCATATGTAACAACTGATAATGAATTTTATGAATGCCAGTCCGAATCATATGAGCCAGATAAAAATATTGAATGCGAATCATTACCGATTTTAAATGATTACGAATCAATTGCAGAGCGGGCTGTAAAAAACGTGGAGCGTGGCGGTTGTGAGTGTGTTATCATGAACACCGTTGCTGATGCAATCAATGTGTATGATAGTATTAAAAAAATTGCTGATGATAATTACAACGTTATCCTGTATCATGCGCGTATGCCAGAAACAACAAAAGACGAAAAAATAAAAAAGATTTTAAAATGGTGTGGAAAGGACAGGAGCGAGAGACCGGAGCGGGCAATTATTGTTGGAACGCAGGTACTAGAGCAGTCAATTGATATTGATGTTGATTATATGATAACAGCAATCTGTCCGGTTGACCTATTGCTGCAGAGAATCGGGCGATATCATCGTCACGGTGATGCCGGGACTATTCGTGAACGTATGGCGATAAAAAATATTGTGCAAGTTTTGGTTCCTGATACAGATGATGATGCGGAATATGGCGGGACTGGTCACGTATATAAACCATGCTATTTGGATGCAACGCGCCAGGTGATAGTAGAGCGCCCTATATTGCAGATACCATCATGCACGCCAGAGATTATCAATCGCGTGTATGAATCGGCAGACATCAAGACCGTGACAGAGGATAGAATCAAAAATGCGAAATCCGATGCCGGAAACATTAACATTGAAAATGGCTTTGAGCTGTATGAAAAATGTGCGCTCGGAAAATTGTCTGATAGATATATTAATGTACGAGAGTCTGGAGAGCCGACCGTGCAGATTGCAATTCTGGATGAAAATGAAATGCAAGCGGCAAAAGAAAAAAGAAACAGAAACGATAAAAACAACAACGAAATTAATGTAATTGAATTATTCAAAAGCAGCGTTGTGACTGTTCCGATGCATTATCTGGATGGTTTTGACGAGGGAGAATATGGAACTGGAATTTTTAGAGATGTGAAAATTTTCAGCTTGAATGATATTGTTAATTCCAATGGCGATAGAAAAATTTGCATTGATGGCGAATACGGATTCAGGGTTTTGGATGTGTAA
PROTEIN sequence
Length: 928
MFVIHLEHAPDSIRGELSLFSQEIAPFTFVSSASARTRDRLWEDIVNIDGISAVLIYTDKNEQKYSVKKIGYPSYEFENFDGLQLIVKPENTLTKMIAEKLWAKLNLKKSLIDHMLETGIVAGCLMNGIFKPLVNRLVELTGIDEPVLKQQIIFICAMHDIGKAHPVFQGRDVETNEMLSGYELNQETVSTMFRHEEYAEEMIKQTHLFGFDTDKRSEMIIRQIISLHHQKEKERKKEDFMPIKSKIVERWSNIQKYIYNYIKEIFPCEKIEFPNIIFNDHKIGFAVENGILGILITSDWIASNNEAMDNKTIKDFSDIGQYLDWKKRVVTAFLFGENLTRSAFPDTRSFDSLFHFGNGRPVQRDVVDIVQKNNIKLMLIESGCGSGKTEAALYAASVLGNKNGLSGIYMGLPTGTSAEAIQGRVDDFLGELHMRKTKLYTSKSMLLRENNTEPSWTDVSRQRLLTPSAVGTVDQVMTAARLVRFESVRMAGLSSKVLIIDEIHAYDAYMITVIERLLQICNVLGIPVILLSATLPVSTKKKLFSTIINESDIDMHSGYPLISYVTTDNEFYECQSESYEPDKNIECESLPILNDYESIAERAVKNVERGGCECVIMNTVADAINVYDSIKKIADDNYNVILYHARMPETTKDEKIKKILKWCGKDRSERPERAIIVGTQVLEQSIDIDVDYMITAICPVDLLLQRIGRYHRHGDAGTIRERMAIKNIVQVLVPDTDDDAEYGGTGHVYKPCYLDATRQVIVERPILQIPSCTPEIINRVYESADIKTVTEDRIKNAKSDAGNINIENGFELYEKCALGKLSDRYINVRESGEPTVQIAILDENEMQAAKEKRNRNDKNNNEINVIELFKSSVVTVPMHYLDGFDEGEYGTGIFRDVKIFSLNDIVNSNGDRKICIDGEYGFRVLDV*