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L1_007_000M1_scaffold_95_18

Organism: dasL1_007_000M1_metabat_metabat_56_fa_fa

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 50 / 51 MC: 3 ASCG 13 / 38
Location: comp(21825..30383)

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Value Algorithm Source
DNA-directed RNA polymerase subunit beta {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01321}; Short=RNAP subunit beta {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01321};; EC=2.7.7.6 {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01321};; RNA polymerase subunit beta {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01321}; Transcriptase subunit beta {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01321}; TaxID=1206781 species="Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Paenibacillaceae; Paenibacillus.;" source="Paenibacillus alvei DSM 29.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 24.7
  • Coverage: 1253.0
  • Bit_score: 298
  • Evalue 9.00e-77
rpoB; DNA-directed RNA polymerase subunit beta (EC:2.7.7.6) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 24.8
  • Coverage: 1213.0
  • Bit_score: 270
  • Evalue 4.10e-69
DNA-directed RNA polymerase subunit beta n=1 Tax=Paenibacillus alvei DSM 29 RepID=K4ZPR2_PAEAL similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 24.7
  • Coverage: 1253.0
  • Bit_score: 298
  • Evalue 6.40e-77

Lists

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Notes

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Taxonomy

Paenibacillus alvei → Paenibacillus → Bacillales → Bacilli → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 8559
ATGAGTTTTAAATTGCAAAACAGACAACGTACAGCTTTCAATAATTTAATCTACAAAGAGATTCCAGCGTTATTGAAAAAGAGTACAAAGTTTGTAAAGGATGATTATAAAATTGAGTTTTTTCCATATCCTTTTAATGCAAGTGAACCTCTTACCAAAGATGGTACTGTTTACCAAGTAGTCAAAGTAAATTGTGTTGTTACTGCATTAAAGACAGGAGAGAAGATTTCATTTAATCTCGATTTGTTGAATTTACCAATTCTTGAAGATCTCGGTTTTAAGATACGTGGTAACTACATTCAAGTGCTTGATTCTTACAATCGTAAGTCCGGATGGAGTTTCTCTAAGTCAACAACAAGAGATGGAACACAGCAATTCGAGGCTACATTACTTCCAATTGGAGATTCAGTAAGATCACTAAACATTAAGTACTTGAACAAAGGTATAATGGTTTCTAAAAAGAACAAGGACAAGGGAGATAAGTACGCTGATATTGATGTCTGCACTTTTCTTAAAGCCATCACAGGAATGAACGAAATGGAGTTAATCCAGATGTTCGGTTTTGATAATCCTTTTGTTCTGCAAGCCTTTAACCCAGATAGAAAAAAGCAGACTGAAATAAAGCATGAGAACTTTAACAACAGAAATGACTGTATTTACATGACAGCCTATGCTTTCTTTGGTTCTAAACAGGTAAGTGAAAATTCAGTAATCACTGATTTGCAGGATAAGATTGATCGACAGCTTTTTACTAAAAGCTACTTCGATTTAGGCCAGGGAAATCTCGAACGATTAAACAACACCCAGTCATTTGTAAATCGTGCTAGCAATAAGTATTTAGCACAGACAATCACCGTCGGTGGTAAGACGTACGAAGCTGGCATTACTTTGACTGAACCTTTGCTAAAAGAGATAGACAATAGTTTAATTGACACTCTTAAGGTTGAATACTGTGGAAAAGTCTACACTCTTAAGAAATTCTCTATCTTTAATTTCAGAGTACTTGGTCTCAGAGCAGCAGAAGTAATCACTGTTGACGAAGTCAGCTTTAGCAAAGGACATGTCTTCACAATGGAAGATCTGCAAGTTCTTAATGATAGTGATTTAACTTGTATTGAAGTTTTAGACAATAATAACAATAGGATAAAAGTAGTTCGTAGAACAGATGCCTCAAAGCTGTACGTTGAGGATTTGTACACAGCAATCAGTATTCTGTTCGACAACATTAATGGCTTTGATACATTTGGAAGTGACTACGAGTTAACGAACAGGGTGGTTGTTCCATACGACAAGAAAGTGTGTGATATTATCAGTTCACATCTCCGAATGATCTATAACACACTTGAAAACTCATTAAGTGCTGCAAGCAATTCCAACACCTTACTGCCAGAGTTCTTTGACAACTTTAGCATAGAAAAAGTCAAAGACGGTAGAAATGTTTATGATTTGAATAAATTCATTTCAAGCATTACTAAGACTGATTCAGGAACTGGACAAATGGCTGATATGACAAACATCATGTCAAGTCTTGAGAAGGCTAACAAAGTAACTGCTAACATTAGTTCACAGTCAATCACAGATGCCCTCGTTAGTGTGCAGGACTTACAAAATGGTCGACTTGACCCAATCGATTCCCCAGAGTCCAGTAAGATTGGTATTGTACATCACAGAACCATTTTAACCAAGAACGATGATGACGGTAATCTTTTAGTCCCGTTCATACCAGTTAAAGATGGTGAGGTTGTTAGTGACAAACCTGTTTACTTAACAGCAGTCGAGGAAAAAGATCAATACATTGCAGAATGGTGTGAGACCTTCAAGAACGGTGACGGAAGTAAGAAACAGAGAGTTTTAGCTCGGTACTGTGGTAATGTTCTTACAGTAGATACCCACTTGGTAACATACAAGGAGTATTCACCCTTAGCCACGATGTCACCCGCACGTAGCTGTATTCCATTCCAGAACCACTCAAACGGTAAAAGATTGTTGATGTCGTGCAATCATCACAAACAGGCAGTACCTACCTTTGGTGCGTGCAGAGCTAGAGTTGGCACAGGGTGTGAAAGTATTTTAGACACAGGTAACTACACAGCAAAAGATCTGTTGGAAGATTTCTATGATTGTAACTCTCAGATGTTTCCGGAGATAAAAAATCACAAAGAAGAGATTCTTAACAGTGATCTTAAATTGCTTAGCATTGATGTGGGAAGAGGTACAAAGACTTTACTGTTAAAAGTAATGGCAATGGAGAAGTTAGGGGATAAATTCCCACAGACTACAAAACTCCTAGTGCCTTTTGCACAAAAGACAACAGAAAAGAACATGTTCTCCTACAGAGTCAATGCAGTGCCAAACAATGTCTACAAGTCTAGCGATGTCGTAGCGTACGCTCTCGGTTACTCTTTAGACCAGAAAGAGACAGAAGTCTTTGCTGACTATGGTGGTTTCCAGGTTGAGAAGGATACGTTCAATTCCGGTTTAGCCATGGGAATGGACTTGACCATTGCTTTCAAAACATACGAAAGTTCTACCATTGATGATGCCGTTACAATTAGTAACGAGATTGTAATGGACGACACATTGTCATCCATCTACATGGTAGACATTAAGCATGAATTACATTCAGACGATGAACGAGAAGAGGTATTTGGTAAACTAAGTTCCTCTGATGTTAGAAATAATTACCCTTACATTAAGGAGGATGGTATGCCAGAAAAAGGTACTATTCTTCGTAATGGTGATGTAGTAATGACCGTTATAATCAAAAAGGGATTAGGCTCTCACAAGCAAAAGGAAATAACTTTAACCGGGTACACAGAAGGACAGGTTGTTGATGCTTTCATTTACGAGAAGGACGGAGCTAAGATCGGCAAGGTCATTTTAGCCACGAGAGCTACCGCAGAGGAAGGCGATAAAATGTCAGGTCGCCATGGTAACAAAGGTGTAATCGCTAAGATAAAACCAGCCGAAGAAATGCCTTATGACCCAGTAACAGGACGTACTGTACAGGTAGTTCTTAACCCTCTTGGTGTACCTTCACGTATGAACATTTCACAGTTACTAGAATTAGTAGTTGGTGAAGCAATGAGAAAGAAAGACCACCGAATTGTAATCAGTCCTTTCTACAAGGATGATTTGAAGATTGTAAATGATTTAGCCCAGGAGTGCGATGTACATCCAAAATACCTGTGTGATGGGCGTACAGGAAAAATGTTCAAAAGACCTATTAATCTTGGAACACTTCACATGTTCAAATTAGTACACATGGTAAACAAAAAGGCACATTCCATCGGAAGTAATGTTAAGGTTGATCCTATCTTTGGTCAGCCTAGACATGGACAGAAGAACGATGGTGGACAGTCTTTCGAAGAGATGTGTTGTTGGTGTGTTTCTGGTGTAGGTGCTACAAAAGTCTTACAGGACATGTACACAGTACAGTCTGACGATTTAGCCTCGAAGAAACGTTTACTTCTTGAAGTCAGAGATGATCCTAGTAATGTAAAGATCGAAGGTACAAATAATAGTGATTTCATCATGCAGGCTTTCATTCGTTCGATGGGGTGTGAACTCACAACAACAGAGCATGGTTACGAGTTTAGCCCACTCACTGACGACATGATTCGTTCACTGTCAAGCATTCCAGTAGATCACCCAGACAACCTACATTCCTCCGCTATTTTCGGAGATTCCTCAAGACCTGAGATGAGTGTTCGAAACAGAAGTAAATGGGGTTACATTGATTTACATTGTGAAGTAATACATCCTACATGGATTGTCAAAGGTTCTTTAGATAAGTTAATTCTGTGTCGTTACAAGAAAGAAGCTGACATTGACTCAGAGAGAGCCCCAGAAGAAATGCCATTAGGAAAGATCTCTAGAGAACGTTTCTCCAATTTGATTAAGTCAGAGGTTTTAGCCAAGCTCCCTGACGACAATAGTCGTTTACCATACGTTGTCCTAATTGATCCAAAAATTCTTGGAACTTTAAGCGAGAGCGAAAGAGAGCAGTACAAAACTGGAATGTCCGCTTTAGTCGAGATCTTTAAAAGAATCGATGTTAATTACACACGTAATTATTATCAGTCATTGATCGACAAAAAGGAAGCAGCTGGAGAAGAATCCGACGAAGGTGTAATCGAGAATTTACATCTGTGTGATACATTCCTTGCTTCCCAAGGAGACGAGGGTGATTCCTCTTTAGCCGAGTACGTAATCTCTGCATTTCCAGTTATGCCGCAAAGCTTCCGACCTATCATAAAGAGTCTCAATCTTAATGGAATTCCTGACTTTGACTGGCACTACAAACAGATTTTAAATGCTGTTACAGATGTTAAAAATAAGAACAAATCGCAGGATTCACTGTTAACACTGTACAGAGCAATTTCAGTCTTCATCGGTTTTGAAAAGGTAAAAGACCTTGAGTACCAGACTGTTTTACTTTGGTTCTATGGACACAACTCTGTAAACAAGAATCATGGTAAAATTCGTGAAGCAGTACAGAAGAAGAGAACAATCTGTTCAGGTCGTTCTGTAATCATACCAATGCAGAATGTACAAATGAAACCTACAGAGATTGGAGTACCACTCTCAATGGTAGTAAAGATGTGGGGAGAACGACTCATTTCCTACATTGGGCAGCACACGTGTGAAGAGAATACCTTCAAAGGCATTTTAGCCCAGAAGTTCCTTAATGTCTTAGCAGCAAAGAACAAAACTAAGTTCCTAGAGATGTACAAGCAGTACTACGCTAAGTACTTTGAGATTGATGAAGACAGAATCATAACACAGTTCATGGATTGGATTACTGAGTTTATTGAAGGTGATGCAAGTCTTGGTTTAGACCAGCAAGTTGTTCTTGCAGGACGACAGCCTTCTTTACACCGTTTTAGTGTAAGAGCTTTTTACGTTAAAATAGTACAGAGCAAAGCAATCCAGATTCATCCACTTTCGTGTAAAGGTTACAACGCTGACTTCGATGGAGACACCATGTGGTTGGTAGC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PROTEIN sequence
Length: 2853
MSFKLQNRQRTAFNNLIYKEIPALLKKSTKFVKDDYKIEFFPYPFNASEPLTKDGTVYQVVKVNCVVTALKTGEKISFNLDLLNLPILEDLGFKIRGNYIQVLDSYNRKSGWSFSKSTTRDGTQQFEATLLPIGDSVRSLNIKYLNKGIMVSKKNKDKGDKYADIDVCTFLKAITGMNEMELIQMFGFDNPFVLQAFNPDRKKQTEIKHENFNNRNDCIYMTAYAFFGSKQVSENSVITDLQDKIDRQLFTKSYFDLGQGNLERLNNTQSFVNRASNKYLAQTITVGGKTYEAGITLTEPLLKEIDNSLIDTLKVEYCGKVYTLKKFSIFNFRVLGLRAAEVITVDEVSFSKGHVFTMEDLQVLNDSDLTCIEVLDNNNNRIKVVRRTDASKLYVEDLYTAISILFDNINGFDTFGSDYELTNRVVVPYDKKVCDIISSHLRMIYNTLENSLSAASNSNTLLPEFFDNFSIEKVKDGRNVYDLNKFISSITKTDSGTGQMADMTNIMSSLEKANKVTANISSQSITDALVSVQDLQNGRLDPIDSPESSKIGIVHHRTILTKNDDDGNLLVPFIPVKDGEVVSDKPVYLTAVEEKDQYIAEWCETFKNGDGSKKQRVLARYCGNVLTVDTHLVTYKEYSPLATMSPARSCIPFQNHSNGKRLLMSCNHHKQAVPTFGACRARVGTGCESILDTGNYTAKDLLEDFYDCNSQMFPEIKNHKEEILNSDLKLLSIDVGRGTKTLLLKVMAMEKLGDKFPQTTKLLVPFAQKTTEKNMFSYRVNAVPNNVYKSSDVVAYALGYSLDQKETEVFADYGGFQVEKDTFNSGLAMGMDLTIAFKTYESSTIDDAVTISNEIVMDDTLSSIYMVDIKHELHSDDEREEVFGKLSSSDVRNNYPYIKEDGMPEKGTILRNGDVVMTVIIKKGLGSHKQKEITLTGYTEGQVVDAFIYEKDGAKIGKVILATRATAEEGDKMSGRHGNKGVIAKIKPAEEMPYDPVTGRTVQVVLNPLGVPSRMNISQLLELVVGEAMRKKDHRIVISPFYKDDLKIVNDLAQECDVHPKYLCDGRTGKMFKRPINLGTLHMFKLVHMVNKKAHSIGSNVKVDPIFGQPRHGQKNDGGQSFEEMCCWCVSGVGATKVLQDMYTVQSDDLASKKRLLLEVRDDPSNVKIEGTNNSDFIMQAFIRSMGCELTTTEHGYEFSPLTDDMIRSLSSIPVDHPDNLHSSAIFGDSSRPEMSVRNRSKWGYIDLHCEVIHPTWIVKGSLDKLILCRYKKEADIDSERAPEEMPLGKISRERFSNLIKSEVLAKLPDDNSRLPYVVLIDPKILGTLSESEREQYKTGMSALVEIFKRIDVNYTRNYYQSLIDKKEAAGEESDEGVIENLHLCDTFLASQGDEGDSSLAEYVISAFPVMPQSFRPIIKSLNLNGIPDFDWHYKQILNAVTDVKNKNKSQDSLLTLYRAISVFIGFEKVKDLEYQTVLLWFYGHNSVNKNHGKIREAVQKKRTICSGRSVIIPMQNVQMKPTEIGVPLSMVVKMWGERLISYIGQHTCEENTFKGILAQKFLNVLAAKNKTKFLEMYKQYYAKYFEIDEDRIITQFMDWITEFIEGDASLGLDQQVVLAGRQPSLHRFSVRAFYVKIVQSKAIQIHPLSCKGYNADFDGDTMWLVALLTEEAKKEAIEKMSPEHNFINPKNSTIILEHSQDEVLGCYCATMLKDNADNIGEIYEDTKDFVNDLFYYSDLAQLQTDVENSVIETYNFVCYSDLATGRHYLSTAGRILFNSLIPYGFTDKKFTNPLGLPGIDVEKYCDLAYDGLLASGSGRGPIKYCSISQICKDLFSEMGEPCIYIYQKILEFGFFYSDLFGITLSIEDLDLETRKKELIGEADKIKALIEKDYQKGLISAEDKKDAVVKLYKNTNNKIKEDLISSIPRNNNFFIIFDSGARGNASQLMQTSGAIGILQKTATEDLETSLTSNYTEGISSFDMHLSTYSSRTGVATTQNETATAGHATRHAVYEAAGLEIVEYDCGKKDWWYDIEWANHRPELDRFIPSKEWFDKHLLGKLTVDKETYEVFDGTLAKSDGEHGIITEDSYDKLKEGFHHVSVRGFNEFFDEDDFDEDDDTEFFEGVALAQKISTWDVALEGKGLFTPVGMKILNNEDNLKEFKKLAKVKKTVDDLEGSFSQEYIVSDRCITVIKEKHLKEIKTTEGTFTFRYKMAKLSRNLLVGREGRNLPFLELHSEVFKSGHIMAVNLITDKTLDWVEEKGLDTIEARIMLDCESEHGICSRCYGLGFSDAKLQEIGANVGIEAAQSIGEPAAQLTMSLVNSGGVAGESVANGVEIVGAMLQGNLPGSILAPEIANMDGYINIIRYDDTVGIRIEPEDCETGKVCKQCMEENSMLECPYGKVSKVSCLVANKQRATSLRVGNGQYVQAGDQLTNGFLQPSGEQINARFVHPDLITSEHIPDLAKLLRTKQIIWLDCYFYTFKENNIFINPRHFEIFARLQLFKVTVLDSNHNALAKTDDGSINFLQGGRYDYSVIAKSSNKPKKFAIRTSTIEEVVTDNSGLLTALSFEDVPKLLAQFANEKRKVDVRYNNAIIGGLNVGANLEHLKTQPKMLHKPAVIQKFNQEKPKPNGPLIETFYTAGSESSSLDQLDLTGALDDLMSLGSLGSVASDGGDNLNLGDSLGSLDLGENLDALAPETTEGTNLDGMNSFGLDFDDDDDDDDDSISNDFNLEKEGTKVGGMDFFNQGLTQSAEESAPLTPSAPSTEESKESTPSTEESNRSDINPDFTKFFAEEKPIPDFPTEDDGEEYEINYNDDDSDDNPATEEVEEEVEEESDDKEGSKGNKTMSLF*