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L1_008_000G1_scaffold_517_5

Organism: L1_008_000G1_public_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 53 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 19 / 38 MC: 18
Location: 3514..6843

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family n=3 Tax=Parabacteroides merdae RepID=A7AJP0_9PORP similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 57.6
  • Coverage: 1044.0
  • Bit_score: 1264
  • Evalue 0.0
TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family {ECO:0000313|EMBL:EDN85031.1}; TaxID=411477 species="Bacteria; Bacteroidetes; Bacteroidia; Bacteroidales; Porphyromonadaceae; Parabacteroides.;" source="Parabacteroides merdae ATCC 43184.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 57.6
  • Coverage: 1044.0
  • Bit_score: 1264
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor plug similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 43.2
  • Coverage: 1124.0
  • Bit_score: 929
  • Evalue 6.30e-268

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Parabacteroides merdae → Parabacteroides → Bacteroidales → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3330
ATGCAATTTAGGAAAAAGCAGATATTGCTAATCATATTCTTTTTCTTTTTTATATGTAACGGTTTATTTGCACAGTTGTCTCAAAAAATCGATATACGATTAGAAAAAGGAACGATTAAAAGTTTTTTTACTGCGATAGAAAGTAAAACGGATTATACATTCATGTATAATAATCTAGAACTTACGACTCCAGTAACAATCACGGCAAAACAAATTGAGTTATCAACAGTTTTAGAACATGTTTTGTCTCCATTGAATATTGAATATGAAGTTTCTGGCAAGCGTATTATTCTGAAAAAAGCAAAAGGTTTGTCTGAAAATAATAAGACGGTAATTGTCGGTACTGTTACTGATGAACGGGGAGAACCAATAATAGGAGCTAATCTTGTAGAGAAGGGAACCACGAATGGAACTATAACCGACTATAATGGACAATTTAGTATTTCGGTTGCAAAAAATGCGGTATTACAAGTTTCTTATATTGGCTATATAGCACAAGAGTTGGCTTTGAAAAACAAAAAATCCATAAATATCGTACTGAAGGAAGATCTTAAAATGTTGGAGGAAGTAGTAGTGGTAAGCTATGGTACTCAGAAAAAGAGAGATATGACGGGATCTATTTCAAGTGTGAAAGCAGATGCATTAAGTGACTTGCCTGTAGGACAAATTGGACAGAAGTTACAAGGACAAGTCGCAGGTGTACAAATTAATCAATCTACTGGTATTCCTGGACAAGGAATGGCTTTTCGTATCCGCGGAGCTGTTTCTATCAATAATAGCAGCCAACCATTAATTGTAGTAGATGGTTTCCCTATTTCTACTGGGTTGAATAATATTAATCCAGATGAAATAGAATCTTTCTCTGTATTAAAAGATGCAGCAGCAACCGCCTTATATGGCTCTAGAGCTGGTAATGGGGTCATTCTTATAACTACAAAAAGAGGTAAACAAGGTAAATTGAATGTACAAGTTCAGGCAAATTTAGGGGTTCAAACATTAAATGGACTGAACGACATGGATGTAATGAACGCTAGAGAGTTTGCACAATTTAAAAAAGAATCTTTTGAAGATGCCATAAAATGGGGAAAAAGAGAAGAAAGTCTAGGAGTTCCAACTCAATACCAAAATCCTAATCAGTATGGAGAGGGAACTGACTGGTATAAGCTAATGACACAAAATGCTCTCATACAGAATTATTCTATAAATTTTGCCGGAGGTAACAAAGCTGCTACAACGTCAAATACTATTGGTTATTTCAAGCAAGATGGGGTTGTTAAAAACTCTGGATTCGAACGCATTTCATTTCGAAGTAATAATGATTTTCAATTAAATGATAGAGTGAAAATAGGCTTAAGTGTATCGCCTATTCTTCAATTATTCCATAACCAAGGGACAGACGGAAATCGAGCTATCCTTAGTGCTTCGATGCTAGCTGATCCTACAGAAAGTCCTTATGACGAAAATGGAAATTTAAAAATTTCTCTGAGTCCATCTTCTTCGGGAACAGGAATGTTTTCTCAAGTTAACTGGGTGCGTGCTATAACGGAAAGAAAAGATAATTATAATATATTGACGCTTTTAGCAAATGCATTTATTGATATTGATATTTGGGGAGGAATTAAATATAAAATGCAAACAGGAATAGATACAGAATGGAGAAAGCAAAGGACATGGACTCCAAGTACAGCTGCAGGAGATTGGATTTCTGCACCTCCGGGAAAGGCTTCTGCTAATTACAATAATGCCAATTACTATACATGGAATGTTGAAAATATGCTCACATTTGACAAAACTTTCGGTAATCATACTGTAGGTGCATTGATTGGATATTCAGCTCAGAAATATAGACGGGAATTTGCAAACATTTCCGGAAGCGAATTTCCTGATGACGAAATAGAGTGGATTACTTCTGCTTTGACTACGCGACAAGGCAATACCGGCATGGAAGACTGGACTATTGCATCTTTATTAGCTAGAATTTCTTATAAATTCAAAGACAAATATTTATTGCAAGCAAATATTAGACGCGATGGTAGTTCCCGTTTTGGCTCTGGTCACAAATGGGCCAATTTCCCTTCTGCATCTGCTGGGTGGATAATTTCAGAAGAACCTTTTATGGAATCATCAAGAGAATTGATGAATTACTTGAAACTGCGAGTCAGCTATGGTATAACAGGTAATTATAACATAGGAAACTATACGCATCTTGCGACAGTTGCTTCTGCAAATTATCCTTTTGGAGGAGAAGTTTCTCCTGGGAAAACTCTGACACAAATAGGTAATCAAAAACTATCTTGGGAAGAGAACTCACAGTTTGATATTGGAGTAGATTTTGGTTTTCTTAATGATAGGATTTTTTTAATGTATGATTTTTATACCAAAAAGACAAAGTCATTGCTTAATAATCTAGAAATACCATGGACTTCAGGTTTTAGTAGCGTGATGTCAAACATGGGAAAAATTAAAAGTTGGGGACATGAAATTTCAATTGAATCAAGAAATTTGGTTGGAGAATTTCAATGGAAAACAAACTTAAATTTAACATTTAATCGTAATAAGGTACTACAACTTAGCGCCATGAGTGATCATATTGGTGGAGATTCAGAATTCTATAATTGGAACAGATTGGAAGTGGGTCAACCTGTTGGAATTTTTATGGGATATGTATTTGATGGTGTATATATGAATAAGTCGGAATTTGACTCACAGCCTAAACACTCCACTTCACAAATAGGCTCTGTAAGGATGAAAGATATCAGTGGACCTACTGGAGTCCCAGACGGAATAATTGATATGAATGATAGAACAAAAATTGGCGATCCTAATCCGGATATGATATTTGGTATCACAAACGAGTTCAAATGGAAGAATTTTGATTTAAGTCTTTTACTTACTGGTCAGCTTGGAGGAGATATTTTTGCCGGATGTTATGAGAATACACTGAATCTAGATGGCGTATTTAATGTATTGAAAACAGTAAAAAATCGTTGGCGTTCAGAGGAAAATCCTGGGAACGGGCTTATTCCTAGTACAATGGCAGGTACAACAGAGCTTTATCGTTCCAATCATAGCGGATGGGTTTATGATGCAACACATTTAAGTTTAAAAAATCTAACATTAGGCTATACTATTCCATTTAAATCTAATAAGTATATATCTAATGCTAGAATATATTTCTCAGCTCAACAACTTTTTACTATCTGTAGTTATCCTGGGCCTAATCCACAAGTTTCGGATAATAATGAGTTGGGATGGAATGGAATGGGAGTTGATAGAACTACTTATCCAATCCCTCGTACATTTAGTGTTGGATGTAGTATTAATTTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1110
MQFRKKQILLIIFFFFFICNGLFAQLSQKIDIRLEKGTIKSFFTAIESKTDYTFMYNNLELTTPVTITAKQIELSTVLEHVLSPLNIEYEVSGKRIILKKAKGLSENNKTVIVGTVTDERGEPIIGANLVEKGTTNGTITDYNGQFSISVAKNAVLQVSYIGYIAQELALKNKKSINIVLKEDLKMLEEVVVVSYGTQKKRDMTGSISSVKADALSDLPVGQIGQKLQGQVAGVQINQSTGIPGQGMAFRIRGAVSINNSSQPLIVVDGFPISTGLNNINPDEIESFSVLKDAAATALYGSRAGNGVILITTKRGKQGKLNVQVQANLGVQTLNGLNDMDVMNAREFAQFKKESFEDAIKWGKREESLGVPTQYQNPNQYGEGTDWYKLMTQNALIQNYSINFAGGNKAATTSNTIGYFKQDGVVKNSGFERISFRSNNDFQLNDRVKIGLSVSPILQLFHNQGTDGNRAILSASMLADPTESPYDENGNLKISLSPSSSGTGMFSQVNWVRAITERKDNYNILTLLANAFIDIDIWGGIKYKMQTGIDTEWRKQRTWTPSTAAGDWISAPPGKASANYNNANYYTWNVENMLTFDKTFGNHTVGALIGYSAQKYRREFANISGSEFPDDEIEWITSALTTRQGNTGMEDWTIASLLARISYKFKDKYLLQANIRRDGSSRFGSGHKWANFPSASAGWIISEEPFMESSRELMNYLKLRVSYGITGNYNIGNYTHLATVASANYPFGGEVSPGKTLTQIGNQKLSWEENSQFDIGVDFGFLNDRIFLMYDFYTKKTKSLLNNLEIPWTSGFSSVMSNMGKIKSWGHEISIESRNLVGEFQWKTNLNLTFNRNKVLQLSAMSDHIGGDSEFYNWNRLEVGQPVGIFMGYVFDGVYMNKSEFDSQPKHSTSQIGSVRMKDISGPTGVPDGIIDMNDRTKIGDPNPDMIFGITNEFKWKNFDLSLLLTGQLGGDIFAGCYENTLNLDGVFNVLKTVKNRWRSEENPGNGLIPSTMAGTTELYRSNHSGWVYDATHLSLKNLTLGYTIPFKSNKYISNARIYFSAQQLFTICSYPGPNPQVSDNNELGWNGMGVDRTTYPIPRTFSVGCSINF*