ggKbase home page

L1_008_000M1_scaffold_13325_2

Organism: L1_008_000M1_public_UNK

megabin RP 52 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 20 / 38 MC: 16
Location: 166..3123

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Predicted type II restriction enzyme, methylase subunit n=1 Tax=Methanobrevibacter smithii (strain PS / ATCC 35061 / DSM 861) RepID=A5UP24_METS3 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 54.1
  • Coverage: 1003.0
  • Bit_score: 1096
  • Evalue 0.0
Predicted type II restriction enzyme, methylase subunit {ECO:0000313|EMBL:ABQ87952.1}; TaxID=420247 species="Archaea; Euryarchaeota; Methanobacteria; Methanobacteriales; Methanobacteriaceae; Methanobrevibacter.;" source="Methanobrevibacter smithii (strain PS / ATCC 35061 / DSM 861).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 54.1
  • Coverage: 1003.0
  • Bit_score: 1096
  • Evalue 0.0
type II restriction enzyme, methylase subunit similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 54.1
  • Coverage: 1003.0
  • Bit_score: 1096
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Methanobrevibacter smithii → Methanobrevibacter → Methanobacteriales → Methanobacteria → Euryarchaeota → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 2958
GTGGATAAAAGTGCTATTAAATCTTTTGCTATTGAATCTAGAAAACAACTGATTGAAAGTGTTAAATATCAGGCTAATTTAATTGGTATAACTGCCGATGGTATTTCTGACCCCGTTTCTGTTGCTAATGGTATGGAGACTTATGATTATGGTGCTGGTACACATACTATATTTGATGAGGACATACCAAAAAGAGAAAGTTTAGTTCGAGAAGTAAAGAATAAAGGTTATGATAATGTTGTTGAAGAAGTTGCTTATACTTGGTTTAATAGGATAATTGCTATTAGATTTATGGAAGTTAATGATTATATTCCAACAAGGACAAGAGTACTTTCTAGTGAAACAAAGGGGAAAACTGAACCGGATATAATTGCTGATGCATTAGATTTAGAATTAAATTACTCTGATGAGGATCTGGAGATCATAATAAAATATAAGGAAGAAAATAAATTAGATGATTTGTTTCAATTGTTATTTATTAAGCAATGTAACAAATTAAATGAAATCCTCCCAGGGCTGTTTGAAAAAACCGATGATTGGATGGAACTATTATTAGATATTTCTTTTATTAATAAAAATGGTATTATCAGAAAATTAATTAATATTCCTGAAAATATTTTTAATAATCAGGTTGAGATTATTGGTTGGTTATATCAGTTTTATAATACTGAATTAAAAGCAGAAACTGATAAAATTAATAATGTTCCAAAAGAAAAAATACCCTTCATAACTCAATTATTCACCCCTAATTGGATTGTAAAATATATGGTAGAGAATTCTTTAGGTAGGTTATGGTTGGATTCACATAATGATGGTGAACTTAAATCTACCTGGGAATACTATTTAGATGATATTGAACAAAATTCTAATGTAAAATATCATTTAACTGATTTAAAAAATAATGCTGTTGATCTGGAGGAAATTAAAATTATTGATCCGTGTATGGGTTCAGGACATATTTTGGTTTATGCATTTGATGTGTTAATGCAAATTTATCTTTCTGAAGGTTTTACTAAGAATGATGCAACCATTTCTATTTTAAAAAATAATTTACATGGAATTGATGTTGATGATAGAGCATTTCAATTAACTTATTTTTCAATAATGATGAAAGCAAGAGAATACAATCGCAATATTTTTAATGAAAATATTTATCCTCATGTTTTATCAATTAAAGAATCAAATGACATATCTTATGATATACTTGAATTCATAGAAGAAAATGGTTTAAGCATAAAAAATGAATTAAAATATATTCTCGATGTGTTTAAAGATAGTAAAGAATGGGGAAGTTTGTTAATTCTTAAAAATATTGATTATGGATTAATCAAAAGAGAATTGTTAAGTTTAAATCGAAAAAGTTTCAATGATGTAATCTCATTAAAATATAAACAAATTATATTTGAATTAATTAGTATATTGGAACTATGTGAGATTTTATCAAATAAATATGATGTAGTGATTACAAATCCTCCTTATCTTGCTGCAAAAAAGATGAATGCTAATTTAAAGAAGTTTTTGAAAAATAATTATCCTAATACTAAAGGAGATTTATGTGTAACTTTCATTGAAAAATGTTTTGATTTGTCAAAGAAAAATGGATTGGTATCTTTAATAACTCAAAATTCATTCATGTTTTTATCCACATATGAAAAATTAAGAAAATATTTGTTAGAAAAAAATTTAATTAATTTAATTCATTTAGGGTCTAAATCATTTGAAGAAATCAAAGGGGAAAAAGTTCAAACTGCTTCATTTGTTTTTAGAAATTATGAAATATCCAATTATGTTTCTGTTTTTTATAGATTAATTGATTATGGTTCTTCTAATTTAAAACAAATGGAATTTTTCAATCCTAATAATAGATTTTTATTTAATTTGGAAGATTGTTATAAAATACCTGGAATGCCGTTTTCATATTGGGTGGACAATAGTTGGATAAATATTTTTAGAGAAGGAAAACCATTATCTAAAATTGGGGATGTTAAAGCGGGATTGCAAACAGCTAATAATGAAAAGTTTTTACGGTTATGGCATGAAATAGATATAAAAAAATTTTCAGAATTTAATGATTCTTCTTTAAGTAAATGGTTCCCATATAATAAAGGAGGTAATTTTAGAAAATGGTATGGAAATCATGAGTATCTTATTAATTGGGAAAATAATGGATTTGAACTAAAAAATTTTAAGAAGTCAGTTATTAGAAATCCTAATTTTTATTTTAAGAAGTCAATTAGTTGGTCGTTGTTAGGTTCGCCATTAGGAATTCGTTTTTATCCAGAAGGGTTTTTATTTGATATGAATGGCTCTTCTTTATTTTTAGATGATGAAAATTATTATTATATTGGTGGATGTTTAGGTTCAAAAGTAGCTAATGAACTTTTATCTATATTAAATCCTACTTTAGCATTTCAAGTAGGAAATATTAAAACAATACCCATTATTTTTAGCTCATATTATTTTGAAGAGGTTAATAATATTGTTAAAGAGAATATTGAGATATGTAAAAATGATTATGATGACTATGAAACAAGTTGGAATTTTAATTCCCATCCATTTATAAAATTCAATGGGAGAAATTTAAGAGAAATATTTGAAAATTGGAATAATTATAAGATAAATCAATTTAGTTTACTTAAATCAAATGAAATAAAATTAAATAATATTTTTTCTAAAATATATGCTGTGGATATCAATGAGGATGCTGATGATAAAATTATCTCAGTTACGAAAGCTAATTATGAATTCGATGTCCAGTCTTTCATTTCATTTTCTGTTGGTTGTATCTTTGGTCGTTATTCATTGGATAAAGAAGGTTTGGAATTTGCTGGAGGGAATTTTAATATTAATGATTATTCAACTTTTATTCCTGATGATGATAATGTTATTCCTGTTTTAGATACTGAATATTTCACTGATGATATTGTTGGACGATTTGTAGAATTTGTAAAAATATGC
PROTEIN sequence
Length: 986
VDKSAIKSFAIESRKQLIESVKYQANLIGITADGISDPVSVANGMETYDYGAGTHTIFDEDIPKRESLVREVKNKGYDNVVEEVAYTWFNRIIAIRFMEVNDYIPTRTRVLSSETKGKTEPDIIADALDLELNYSDEDLEIIIKYKEENKLDDLFQLLFIKQCNKLNEILPGLFEKTDDWMELLLDISFINKNGIIRKLINIPENIFNNQVEIIGWLYQFYNTELKAETDKINNVPKEKIPFITQLFTPNWIVKYMVENSLGRLWLDSHNDGELKSTWEYYLDDIEQNSNVKYHLTDLKNNAVDLEEIKIIDPCMGSGHILVYAFDVLMQIYLSEGFTKNDATISILKNNLHGIDVDDRAFQLTYFSIMMKAREYNRNIFNENIYPHVLSIKESNDISYDILEFIEENGLSIKNELKYILDVFKDSKEWGSLLILKNIDYGLIKRELLSLNRKSFNDVISLKYKQIIFELISILELCEILSNKYDVVITNPPYLAAKKMNANLKKFLKNNYPNTKGDLCVTFIEKCFDLSKKNGLVSLITQNSFMFLSTYEKLRKYLLEKNLINLIHLGSKSFEEIKGEKVQTASFVFRNYEISNYVSVFYRLIDYGSSNLKQMEFFNPNNRFLFNLEDCYKIPGMPFSYWVDNSWINIFREGKPLSKIGDVKAGLQTANNEKFLRLWHEIDIKKFSEFNDSSLSKWFPYNKGGNFRKWYGNHEYLINWENNGFELKNFKKSVIRNPNFYFKKSISWSLLGSPLGIRFYPEGFLFDMNGSSLFLDDENYYYIGGCLGSKVANELLSILNPTLAFQVGNIKTIPIIFSSYYFEEVNNIVKENIEICKNDYDDYETSWNFNSHPFIKFNGRNLREIFENWNNYKINQFSLLKSNEIKLNNIFSKIYAVDINEDADDKIISVTKANYEFDVQSFISFSVGCIFGRYSLDKEGLEFAGGNFNINDYSTFIPDDDNVIPVLDTEYFTDDIVGRFVEFVKIC