ggKbase home page

L1_008_000M1_scaffold_155_18

Organism: dasL1_008_000M1_concoct_61_fa

near complete RP 30 / 55 MC: 1 BSCG 19 / 51 ASCG 38 / 38
Location: 18837..21413

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
UvrD/REP helicase {ECO:0000313|EMBL:EFC93355.1}; EC=3.6.1.- {ECO:0000313|EMBL:EFC93355.1};; TaxID=521002 species="Archaea; Euryarchaeota; Methanobacteria; Methanobacteriales; Methanobacteriaceae; Methanobrevibacter.;" source="Methanobrevibacter smithii DSM 2374.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 858.0
  • Bit_score: 1743
  • Evalue 0.0
UvrD/REP family DNA helicase (EC:3.6.1.-) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 43.1
  • Coverage: 552.0
  • Bit_score: 434
  • Evalue 3.70e-119
UvrD/REP helicase n=1 Tax=Methanobrevibacter smithii DSM 2374 RepID=D2ZQ08_METSM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 858.0
  • Bit_score: 1743
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Methanobrevibacter smithii → Methanobrevibacter → Methanobacteriales → Methanobacteria → Euryarchaeota → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 2577
TTGAAAGAATATTATCAAATTGAAGATTTGCCAATTGAATTAAAAAATGAACTTAAAGACAGTGCTTCTTTTTTTGATAATTTTGAGGGTAAATCATTAGACGAACAACAAAGAATTGCCTGTATTTTGAATGATTGTGATTTGGAAATTATTGCAGGTGCAGGAACTGGTAAAACTCACACATTACTTGCTAAAGCAGAATATTTAATTGAAAAGAAAAATATTTCTCCTGATGATATTTTATTTTTATCCTTTTCAAAATCTTGTGTAGAAGAATTAATTGAAAAATTAAATTATAATGTTCCTACAAGTACAATTCATTCTTTTGGGCTGTCGTTAATCAATGAATACAGGGATAAAGAAGTATATGATGGTAGAGGTTTTAAAAAGATTTTTGAGGAGTATTTAAAAACAGCATCAGATAAACAAATAGATGATATAACAAATTACTGTGAAAATAATCTTAACTCTCATGATATGATTAAATTAATAGAGTTGGATCGGGAAATTGAAAAATTTAATCATTTAATTTCAAAATCAAATATTTCTTCAAGAATTAAAAGTTTCATTGATTTATTTAAAGGTAAAGGATATGTTGCTTCTGATTTTAAAAAGATTAAATCTAAATGTAAACATGACTTTGAAACTAATAATGGAGGATATTATACAAATAAAAATTATTTAAATAACATGGCTTTTATTCAGATAGTTGAACCAGTCTTTAGGTTTTATGAGGGTTACCTTTTTAAAAATCATTTAATTGACTTTAATGACATGATTAACAAAGCAATTGACTTGGTTGAAAATAAAGGAATATTCAATAATTTTAAATATATTTTTGTTGATGAATATCAGGATATCTCTTATAAAAATTTTCAGTTTATAAAAACTCTCAAACAAGCTTGTAATGCTCATTTGGTTGTTGTTGGGGATGATTGGCAATCTATTTATGGTTTTAGAGATAGTGATATTACTCTGTTTAATGATTTTTGTGATTATTTCCCAAATGCAAATAGAGTTTTCATTGAAAAAACTTATAGAAATCCTCAGGAATTAATTGACATTGCAGGTAATTTTATAATGAAAAATGAGTCACAATTTAAAAAATCATTAAAATCAGATAAATCTATTGAAAAACCTGTAAAAATAATTTTTGATAGGGATTCAGATTCAATTTATAATCTCATTTATAATTTATCAAAAGATAATGAAAGGGTATTCATTTTAGGCAGGTATAATGGGGATATTGATAAGTTTATATTTGATACTGGATTAGTTAAAAAATCAAAAGGTAGTTATAAACAAATAACAAATGATTATGAAAGTATAAAGAATGTGGAATATCGTACAATTCATAAAGCAAAAGGTCTTGAAGCAGATTATGTAGTTTTAATCAATGTTTTTAATAGGGATTGGGGATTTCCTAATAAATTTTATCCACCATATTTTGTGAATTTAATACAGGATTGGGATTATGATAAAAAATTAGAAGAAGAACGTAGATTGTTTTATGTTGCTATTACTCGTGCTAAAAAAGGAGTTTATATATTTACAGAAGATTATAATCAGTCTGAGTATATTGATGAATTAATAGATGAAAATAATTTAGAATTAATTTATAGTGATGATTTTAACCGATTCAAGGAATTTGATAGTGTAGAAGAGGAAGATGTTAAAGCTAATTTAATTGATTTAAGCGATTTTGATAATTCTGAAGGTATTGAAATTAAAGCTAATCAGAAGGATTTTGGAAATAAGCTCCTTAAATCAAGAAAGTATGATGAAGCAGAAGATTTTTATAAAAAATTAATAACAAATATGTATTTTTTAAATGATTATTATCCATATAGAAAATTAGTTGAAGTATATTATAAAAAAAGAGATAATTTGAATGTTATAAACACAGTTGAAGAATTTTTTAAAAGTGGACGATTTTGTAATGAATCACAGGTATTGTGGTTCGAATCAAAATATAAAAAAGCATGTAAGTACTCTGGCTATAGTTTTTCTAATTTTGATGCATGTTTGGATTATTTTAATGAACATGGCCTTAAAAATAAAGACAAACAAAATGAACCTGTTCCAATTGCAGCAAGAATTCAAAGTGGTGGAGGAAAGGTAAAAATTATTTCTCAGGAGGCACATAATATAAAATCTGAATATCATGAGTTAAGCCTTAAATATAAATCCGCCAGATCTAGTAAAAAAGCATTATATTTTTTCGAGCAGTTATGGGATAGAAAAGAGTTTACAAAAAATTTAACTGCATATAAGAGATTATGTTCATTATATTATGATACACAACAATATGAAAAAGTAATAGAAGTTGCAACGGAATATTTTAATAGTGATGCCCGTAAAACTAAGTCAAGTCCTGCTTGGTTTAATAAAAAAATTGCAGAAGCTAGTAAAAAATTAGATAAATCTCCAGTAAACGAATCATCGAACCCTATTAAAACAACTAACTTATCAAATGATGAATTATTATTTAAATATGCTGATTTATATGAAAAAGGATTATTGACTAAATATGAATTTGATAGAAAGAAAAAGGAATTATTATTTAATGATGATTAA
PROTEIN sequence
Length: 859
LKEYYQIEDLPIELKNELKDSASFFDNFEGKSLDEQQRIACILNDCDLEIIAGAGTGKTHTLLAKAEYLIEKKNISPDDILFLSFSKSCVEELIEKLNYNVPTSTIHSFGLSLINEYRDKEVYDGRGFKKIFEEYLKTASDKQIDDITNYCENNLNSHDMIKLIELDREIEKFNHLISKSNISSRIKSFIDLFKGKGYVASDFKKIKSKCKHDFETNNGGYYTNKNYLNNMAFIQIVEPVFRFYEGYLFKNHLIDFNDMINKAIDLVENKGIFNNFKYIFVDEYQDISYKNFQFIKTLKQACNAHLVVVGDDWQSIYGFRDSDITLFNDFCDYFPNANRVFIEKTYRNPQELIDIAGNFIMKNESQFKKSLKSDKSIEKPVKIIFDRDSDSIYNLIYNLSKDNERVFILGRYNGDIDKFIFDTGLVKKSKGSYKQITNDYESIKNVEYRTIHKAKGLEADYVVLINVFNRDWGFPNKFYPPYFVNLIQDWDYDKKLEEERRLFYVAITRAKKGVYIFTEDYNQSEYIDELIDENNLELIYSDDFNRFKEFDSVEEEDVKANLIDLSDFDNSEGIEIKANQKDFGNKLLKSRKYDEAEDFYKKLITNMYFLNDYYPYRKLVEVYYKKRDNLNVINTVEEFFKSGRFCNESQVLWFESKYKKACKYSGYSFSNFDACLDYFNEHGLKNKDKQNEPVPIAARIQSGGGKVKIISQEAHNIKSEYHELSLKYKSARSSKKALYFFEQLWDRKEFTKNLTAYKRLCSLYYDTQQYEKVIEVATEYFNSDARKTKSSPAWFNKKIAEASKKLDKSPVNESSNPIKTTNLSNDELLFKYADLYEKGLLTKYEFDRKKKELLFNDD*