ggKbase home page

L2_040_089G1_scaffold_66_15

Organism: L2_040_089G1_public_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 18 / 38 MC: 16
Location: 8084..10651

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
PdpB n=2 Tax=Clostridium perfringens RepID=B1BUM1_CLOPF similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 855.0
  • Bit_score: 1735
  • Evalue 0.0
PdpB {ECO:0000313|EMBL:EDT14563.1}; TaxID=451755 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium perfringens E str. JGS1987.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 855.0
  • Bit_score: 1735
  • Evalue 0.0
PdpB protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 29.3
  • Coverage: 317.0
  • Bit_score: 144
  • Evalue 7.70e-32

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium perfringens → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2568
ATGTTTATAAAAAGTGATTCCTCAAAAGGCATTAATTATAATTTTGAAAATAAAGATATATGTTTAACAGAATGTTTATTTATAGGTCCTATCAAAAATCCTATAGAGAATAATTTTTTTAATTATAAATTAGATAATATATTCATTAATAATAATTTTAAAATTACTGAAGGTGAGTACTTATATTTAATAAATAAAGAAAAATGTCTATTGAAATATTTTTCTAAACTTGAGAGATTCAATGGAAATTATTATAGAAAATCATTAGATTTTTCAGAATTTAATTTAAAAAAAGATGAAAGAATTTTTGCGTTTTTTAATATTAATTCTAATATTGATAGAAATATTATTTTAAAAATAGGTAGATCCAATGATTTTAAATTATGGTTAAATAATACTCTTATTTATAATAAATCATCTATAATATATAATGAATTTTATGAATCAACTGGATTTAGTGATTCAATCTTCATAAATTTAAAATTAAATAAAGGAGATAATTTAATTTTAATAGAATTAAATAAAAATTCTCAAATGATTTCATTAAAATTATCTAAAGATAAATATGATAATGAATTAAATGTATTTAAAGATTATTATGAAAGTACTTGTTTAAATAGAATTGGTATTATTCATCACACCAACTTATGTATTAATCTAGATAAATACGAATTTATGATAATACCTAAGGATTATATAAATATTGATCTAAATAGTGAATTAACAATAAAAATTATATTTAAAAATAATGTTATTAGTATAATTAAATCAAAATTTTATAAAAAAAATATAATTAATATTTTAGAATTTAAAAATAGTGACGAATGTATTATGAACATTGAAGTTATATATTTAACTAAAAGTAATATTAATATGATACATAAATTAAAGGTTCTGTTACCTAATTATTTGTTTTTAAAGAGTAATTCAAAAGGATATAGAAATAATATTATTAATTATTTGGATTTTATAAAGAAGGATATTCCTTTAGAAATGATTCCATGGATAATTTCTGAAGAATATAATAAAATAATAGATTTAAGTAGTATTACAAGTTATTTATTAGATACTAGTGGAATTCATAGGATATTTTTCACTTCAAAGTTAGACAATACTCTTCAAAATATTTGTGTATTTCTACCGGAAGATTATTCTAGAGAAAAAAGTTATTCAATAGTTGTACATTTAGCACCGGCAGTATCGGGAAATTTTATAAAGTTTCATAGTCAGAAGTCTTATAAATCTAATGTAATTTTTGTTGAAATTTCAACTAGGGGCGTAACACAAGGAAGTTATATAGGAGAATATGCAATATTAGAAAATATAAAAATTTTAAAAGAGATTTTAAAATTAAAAAAATATACTTTCAATTTTATAGGTTATTCAACAGGTGCATTTGCAGTTTGGGCATTAGCAGAAAATTATCCTGATATGGTTAATTCTATTGTAACAATTTCTGGTTTTCCTTATTATAGAAACTTGTGTAACTTAACTAATATACCGATTTTAAATATATCTGGAGATAATGATGATATGATTAAAAGATCATTTGAAGAACCAACCAATTTCTTTAAGAATAAAAATCCACAATATAAAGGATTATTACTTAAAGAAGCAGATCATCTTACAATCATGAACACTCTATTTAGTAAGTATGTTATAAATACATTAATAAACAGAAATCCAAATGAAATTATCAATGTATCATTTAGGACTGAAAGAATGAGACATAATAAAACAAAATACATAGAAATATTAAGTTATAAAGATTATTATGGAAAAATTGATATTGAGTTTTATAATGAACAAATTAATATAAATATTGAAAATATTACTAGTTTTATATTTTATGTTCCTTCAAATTTTAAAAATAAAAAATTTGATATTTATATAATAAATAATAATATAAAGCAAAAATTCACTATAAAAGATACTGATAAATTATTGTTTAAATATTTTAAAAATAGATTTATATTAATTGATGAAGAAGTATTAGAAGTTAATTTAATAGATAATATTAAGGGAATGGGACTGTTAGATATATATATGGATAGTATTAAAATATTATTTCGGAATACTACAAATGATGAAGTTCGCAAAAGTATGTATAAAGTTGCAAAAACAATGTCAAATTTAAAAACAATGGGATATAATCCGAATGTTAATGTTAATTATAAAATAGAATGTATAGATTATTTTCATAAAGATAATTATTGTAACGATAACATAATTCTAATTAATGAAGGAGAAAATAATTTTTTTGAAGAAATAATTCACAAACTTCCTATTAAACCGTATTGCAATGGGTTTTATTATAACGATGAATTTATAGAAGGTGATTATTGTATATTATTTATAACTAAGAATCCATATAATGATAAGAAAAAGCTTCTTATCATTTATTCAACAAAATATGAACTATTTAATTCTAATTATTTTTTAAGAAATTTTATAATACCAAGTTATTCAAATGGTTTAAATCAATGGTTAAATGGAGACGCCTTAATATATAAAGATAAAGAATATATAGTAATTAATTCGATAGGTTGTCCGATTAAATTTAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 856
MFIKSDSSKGINYNFENKDICLTECLFIGPIKNPIENNFFNYKLDNIFINNNFKITEGEYLYLINKEKCLLKYFSKLERFNGNYYRKSLDFSEFNLKKDERIFAFFNINSNIDRNIILKIGRSNDFKLWLNNTLIYNKSSIIYNEFYESTGFSDSIFINLKLNKGDNLILIELNKNSQMISLKLSKDKYDNELNVFKDYYESTCLNRIGIIHHTNLCINLDKYEFMIIPKDYINIDLNSELTIKIIFKNNVISIIKSKFYKKNIINILEFKNSDECIMNIEVIYLTKSNINMIHKLKVLLPNYLFLKSNSKGYRNNIINYLDFIKKDIPLEMIPWIISEEYNKIIDLSSITSYLLDTSGIHRIFFTSKLDNTLQNICVFLPEDYSREKSYSIVVHLAPAVSGNFIKFHSQKSYKSNVIFVEISTRGVTQGSYIGEYAILENIKILKEILKLKKYTFNFIGYSTGAFAVWALAENYPDMVNSIVTISGFPYYRNLCNLTNIPILNISGDNDDMIKRSFEEPTNFFKNKNPQYKGLLLKEADHLTIMNTLFSKYVINTLINRNPNEIINVSFRTERMRHNKTKYIEILSYKDYYGKIDIEFYNEQININIENITSFIFYVPSNFKNKKFDIYIINNNIKQKFTIKDTDKLLFKYFKNRFILIDEEVLEVNLIDNIKGMGLLDIYMDSIKILFRNTTNDEVRKSMYKVAKTMSNLKTMGYNPNVNVNYKIECIDYFHKDNYCNDNIILINEGENNFFEEIIHKLPIKPYCNGFYYNDEFIEGDYCILFITKNPYNDKKKLLIIYSTKYELFNSNYFLRNFIIPSYSNGLNQWLNGDALIYKDKEYIVINSIGCPIKFK*