ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

L2_059_052G1_scaffold_277_9

Organism: L2_059_052G1_public_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 16 / 38 MC: 16
Location: 9662..13759

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
pelX; pectate disaccharide-lyase PelX (EC:4.2.2.9) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 52.8
  • Coverage: 879.0
  • Bit_score: 891
  • Evalue 3.00e-256
Pectate disaccharide-lyase n=1 Tax=Clostridium butyricum DKU-01 RepID=M8K8Y3_CLOBU similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 97.4
  • Coverage: 1365.0
  • Bit_score: 2703
  • Evalue 0.0
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:KJZ86667.1}; TaxID=1523154 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium sp. IBUN125C.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 98.4
  • Coverage: 1365.0
  • Bit_score: 2730
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sp. IBUN125C → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4098
ATGAAAAGAAAAGTTTTATCAATGTTAATTAGCACAACAACAGCTGTATCTATGTTTTCAACTTTTGCAAGTGCAGAAGTTAAAGATGATTCAGTAAACACTACTCAAGACAAATCTGTAGTATCAAACGAAAGTTATGAAAATTTGTCAGACTTAGAAGACAATAACGGTTTAGAAGTTACAAATGAAACTACAACTGGAGCAGCAATCACCAGTGATATAGGGTTATCTATTTCACCAGATATTATTGTTGACAAGCAATATTCTGGAAATGAAGGTGAGAATGTAGGTGGTATACCTACATATAATACAATTTCATCAGCTATACAATCTATAAATAAAGATAATTCAGATGAAAAAATAATCTTTATAAAAAATGGAATATATAAAGAAAAATTGACTATAGCAGTACCTAATATTACTCTTGTTGGTGAAAGTGCAGCTCATACAGTTATAACTTATGATGATGCCTCAGGTACTATAAAAAGAAGTGAAGATGGTGGTGATGGAGTAGTTACTTATGGAACGAGCAGTTCTTCAAGTGTAACAATAAAAGAGTTAGCAGAAAACTTTAAAGCAGCAAATCTTACAATTGCAAATTCTTTTGATGAAGATGTAAATGCTGGTATTGCTAATAAACAGGCTGTTGCAATGAAAAATGAAGCTGATAAAAGCGTATTTGAAAATTGTAGATTCATAGGGAATCAAGATACACTATATGCAAATAAGAAAAGACAGTATTATCATAATTGTTTCATTTGTGGAGATGTAGATTTTATTTTTGGAGGCGCTCAAGCCGTTTTTGATAATTGTGAAATAAAATCTGTAAATAGAGAAGGAATATCACCAAAGGGATATGTTGCAGCACCAAGTACATTAAAAGATAATGTGTATGGATTTTTAATTCAAAATTCTAAATTAACAAGCAATATAAATGAAAAAGGATCAGTATATCTTGGAAGACCTTGGCATCCATCAAGTGAAACAAATCTTGGACATACTGTGATATCTAATGTTGTATATGAAAATTGCGATTTAGGAGCTCATATAGCAGCTGATGGATGGTCTACAATGTCAAATGCAGGAGTCATCACTAATCCGTTGGATAATGATATGTATGAATATAATAATTATGGTGAAGGTTCTGCAAATGGAGAAAACTCAAATAGAAGACAGCTTGAAAATATTGATAAATATAATAAGGAAAATATATTAAATAACTGGGACCCAAGTGATGATTTAAAGATGTTAGCATCATATCCAGAGGATGAACAAGATTATGATGAAAATGAAGATTATAGTGATTTTATAAAAGATGATTATGCAGATACTTCAGAGGATGACAACACTGGAAATAGTAGCACTGAAACTTCAGATAATATTGCTGAAAAGATTAATTGGAATTCTACAGTCTTTGGAGTAACTACTTCAAAAGAAAATAATGAAATAAATGTTGCAACTGATGAAAATGGAAAAAAAGTTATTAATTTAAGATCTGGAAACTCTGATGGTACAAATGCAGGTGGTAAGGTAACTGGATCAAATGATGGTATATCATACTATTATACAGAAATAGATCCATCAGAAAACTTTGAGCTTTCAGCAAATGTTAAAGTAAATTATTTTGAAAAAACTAAGCCAGATAAGCAATGTGGATTTGGAATTATGGCAAGAGATCAATTAGGTGTAGCTAACGATGTTTCAACCGCGCCATCCAATATGGTTTTGGTTGGTGGATATAAAGCTAATATTGAGTCTGTATACAGAAGTGGTGTAACAAAAGATTTAGATGGAAAAATAACAATGAATGGAGAACATAAATTTGCAGATCGTCCAGCTAATGATGGTAGTGCCACATATAAATTAACTCTTAAAAAGACCAATACAGGATATATATGTTCTGTTGATGATGGTGAAGAAGTAACTTATTATGAACCTAAGTTATTGGAAGTTGCAGATAGTGGAAAGATATATGTTGGATTCTTTACAGCACGTATTGCATCAATACAAGTTTCAAATATTAATTTAACTAAATCTAATGTGGCTACAGATCCAGCTGGTGAATCTAAACCAGCTGAAGTAATAGTTCCAGCATTAAATATAAAATCAGGAGATGCAACAGGAAGTACGAGTTATGATTTTAAGGTACAGCCTACAGTTAAAGGTAATTTAAATATTAAATTAAATGATAGTAATGTGTATAGTGGTAAGGCGGATTCAGAATCAATATTGTCAGTACCTACAGTTCTTAAAAGTGTAGATAATAAATTTGAGATAGAGTATACTCCATATGTGACTGATAATAATACTGATACAACTGTAATAAATAAAACATTTATTGTTAACGTTAAATCATATGGTGTTGAAAACGGAGATATTTATGTATCACCAAATGGAACTGAAAGTGGTGATGGTACAATAGATAATCCTATAGATATTTATAGTGCTGTAAAATATGTAAATAATGGTCAAACTATTAAGGTTAAAGGTGGAACATATAATCTTATATATCCAATAACTATAGAAAGTACTAATAATGGAACAAAAGATAATATGAAGTCATTTGAATCTTATGATGGAAGAGCAATATTTGATTTTGGAAAAGCCTCAAAAGGATTTTTCTTAAACGGGAGTTACTGGAATATAAAAGGTATAGATGTAACAAATACAGCAGATGCTAATGCTGGTCTCAGAGTAGCAGGAAACTATAATATTTTGGAAAATATAAAGACATATAAAAATGGTGATACTGGATTACAGATAAGTTCGCTTTCAACAGATGATCCAAAGGAATTATGGCCTAAATATAATGAAATAATAAATTGTGATTCATATGATAATATGGATGCTGCCATGAATAATGCAGATGGATTTGCAGCTAAGCTTACAACAGGTGAAGGAAATGTATTTAAAGGATGCGTATCTCATAATAACTGTGATGATGGATGGGATTTATTTAGCAAACTTGAGATAGGTAAAATAGGCGCTGTTACAATAGAAAATTGTATAGCTTATGGTAATGGAACATTAAGTGATGGTACAGTAACAAAAGGGGATGGAAATGGATTTAAGTTAGGAGGAGAAGGTCTTCCTGTTAAACATACATTATTAAATTCATTATCATTTAACAATGATGCAGCAGGTGTTACAGGTAATAGTAATCCAGCATGTGTGGTGAAAAATACTATATCTTCCGATAATTATAAGAATTATAGTTTAGATTATTACACAACTGCTATCCTTGCTTATGAATTTGAAAATGATAAATCATTTAGAACAGTTTCAAGTGACGTAGAAGATTACATTCCTGATTACGTTAAAGGAGAAACAAATTATTTTTATAATGGACAGGATTCAGAAAATGCAGAAGGTAAGAAATTAGATAAATCAATGTTTAAGGGTACAGAAATGCCAGTATCTATAGAAAGAGATGAAAATAATAATATAATATGGCCAGAGTATATGGCATTAGTAAATGCATCTGATTCAGGTTCAAATGACAATAACTCAGGAAATAACGGTGATAGCAACAATAGTAGTAGTGGAAGTAATTTAGGAAGTAGCAATACAGGAAATAACAGTGGATCACAGAGTACAACAACACACCATAGTCATAGTACATCATCCTCTTCTAGCAGTGAAAATATATCAGAAGCAATATATATAGATAGTTCTACAAGTGCAGGGCAGACTGAAGAAAATCAAGAATTACAGAATAATAAAGTTAAAAATGGATGGAACCAAAATGAAGATAAAACATGGTTTTTTATAAATTCTAATGGAGAAAAGGTGCAAGGATGGCTTAAAGATGGAGCGCTATGGTATCATTTAAATCCAGATGGAAGTATGCAGACAGGCTGGTTAAAAGATAATGATGGAGTATGGTATTATCTAAGTAATAATGGAAGCATGAAAACTGGTTGGTTAAGAGATAGTAATGGTAAATGGTACTATTTAAATGAAGATGGATCAATGAAAACAGGCTGGCTAAAAGACAATGATGGAAAGTGGTATTATTTGAATCAATCAGGTGAGATGATAGTTGATACAGTAGTAGATGGTTATGTTTTAAGTTCTAATGGACAATGTATCTATTAG
PROTEIN sequence
Length: 1366
MKRKVLSMLISTTTAVSMFSTFASAEVKDDSVNTTQDKSVVSNESYENLSDLEDNNGLEVTNETTTGAAITSDIGLSISPDIIVDKQYSGNEGENVGGIPTYNTISSAIQSINKDNSDEKIIFIKNGIYKEKLTIAVPNITLVGESAAHTVITYDDASGTIKRSEDGGDGVVTYGTSSSSSVTIKELAENFKAANLTIANSFDEDVNAGIANKQAVAMKNEADKSVFENCRFIGNQDTLYANKKRQYYHNCFICGDVDFIFGGAQAVFDNCEIKSVNREGISPKGYVAAPSTLKDNVYGFLIQNSKLTSNINEKGSVYLGRPWHPSSETNLGHTVISNVVYENCDLGAHIAADGWSTMSNAGVITNPLDNDMYEYNNYGEGSANGENSNRRQLENIDKYNKENILNNWDPSDDLKMLASYPEDEQDYDENEDYSDFIKDDYADTSEDDNTGNSSTETSDNIAEKINWNSTVFGVTTSKENNEINVATDENGKKVINLRSGNSDGTNAGGKVTGSNDGISYYYTEIDPSENFELSANVKVNYFEKTKPDKQCGFGIMARDQLGVANDVSTAPSNMVLVGGYKANIESVYRSGVTKDLDGKITMNGEHKFADRPANDGSATYKLTLKKTNTGYICSVDDGEEVTYYEPKLLEVADSGKIYVGFFTARIASIQVSNINLTKSNVATDPAGESKPAEVIVPALNIKSGDATGSTSYDFKVQPTVKGNLNIKLNDSNVYSGKADSESILSVPTVLKSVDNKFEIEYTPYVTDNNTDTTVINKTFIVNVKSYGVENGDIYVSPNGTESGDGTIDNPIDIYSAVKYVNNGQTIKVKGGTYNLIYPITIESTNNGTKDNMKSFESYDGRAIFDFGKASKGFFLNGSYWNIKGIDVTNTADANAGLRVAGNYNILENIKTYKNGDTGLQISSLSTDDPKELWPKYNEIINCDSYDNMDAAMNNADGFAAKLTTGEGNVFKGCVSHNNCDDGWDLFSKLEIGKIGAVTIENCIAYGNGTLSDGTVTKGDGNGFKLGGEGLPVKHTLLNSLSFNNDAAGVTGNSNPACVVKNTISSDNYKNYSLDYYTTAILAYEFENDKSFRTVSSDVEDYIPDYVKGETNYFYNGQDSENAEGKKLDKSMFKGTEMPVSIERDENNNIIWPEYMALVNASDSGSNDNNSGNNGDSNNSSSGSNLGSSNTGNNSGSQSTTTHHSHSTSSSSSSENISEAIYIDSSTSAGQTEENQELQNNKVKNGWNQNEDKTWFFINSNGEKVQGWLKDGALWYHLNPDGSMQTGWLKDNDGVWYYLSNNGSMKTGWLRDSNGKWYYLNEDGSMKTGWLKDNDGKWYYLNQSGEMIVDTVVDGYVLSSNGQCIY*