ggKbase home page

L2_059_382G1_scaffold_466_4

Organism: L2_059_382G1_public_UNK

megabin RP 52 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 16 / 38 MC: 16
Location: 3230..6655

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Transcription-repair-coupling factor {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00969}; Short=TRCF {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00969};; EC=3.6.4.- {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00969};; TaxID=428126 species="Bacteria; Firmicutes; Erysipelotrichia; Erysipelotrichales; Erysipelotrichaceae; Erysipelatoclostridium.;" source="[Clostridium] spiroforme DSM 1552.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.1
  • Coverage: 1141.0
  • Bit_score: 2218
  • Evalue 0.0
Transcription-repair-coupling factor n=1 Tax=Clostridium spiroforme DSM 1552 RepID=B1BYS0_9FIRM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.1
  • Coverage: 1141.0
  • Bit_score: 2218
  • Evalue 0.0
transcription-repair coupling factor similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 42.5
  • Coverage: 1148.0
  • Bit_score: 919
  • Evalue 6.70e-265

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

[Clostridium] spiroforme → Erysipelatoclostridium → Erysipelotrichales → Erysipelotrichia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3426
ATGGATTGTTTAGATAATATTTTAAAACAGAACTTAGCTTTTAATGCTTTGTTAAATGGTAAAGGAAATATCGTCGTTAATGATGTTAGCGATGAGGCACTATTATTAACTAGTGCCTTTTTGAAGTTGAAAAGGAATATTGTTGTAGTGAAGGCTAATCAATACGAGGCAAATATGCTTTATCAAAAAGTAATGTTACTTAATGAAAAAGATGTTTCGTTGTTTGCAGTAGATGAATCATATCGTATTGAAGCTTTAGCAGCATCTCCTGAATTGTTAGGACAAAGAATTGATACAATGTATCAATTAACTAAAAATGAACCTAGAATTTTAATTACTCATAGTCAGGCGATAATAAGATATTTGCCAACTAAACAATTATTTATAGATAATTGTTTAAAAATAAAAGTAGGAATGCAAATAGATATTTATGATTTAAAAGCAAGTCTTTTAAAATCAGGATATCAAAGTATAATTAGAGTTGATCAACCTTTTTATTTTTCTAAACGTGGTGGTGTAATTGATGTCTTTTCAATTCAATATGAAAATCCAATTAGAATTGAATTCTTTGATGATGAAATAGAAAGTATTCGTTTTTATAATCAAAATACTCAAAGAACAATAGAAAATACTAATGAAATAACGATCTTACCAGCAAGCGATATTTTATATGATGATCAAGAAGTGACAAAAGTCATTAGTAAAATTAATGATTTAAGGGATAGTCAAGCTGAAATATTAGATGAATTATATTTAGAGGATTTTTTAAATAAAGTATCGATTGACCAAGAAAATCTTCGAAATCATGATACAAGTTTTTCAATGTATTCATATTATAATTTATTTAACCAAACAACTAGTATTAGTGATTATCTAGATGATCCTTTGATCATTCTTTCAAATAGCCAAGATATTAATTTTGCTTTTAAAAATTATCTAGAAGAAAATTTTTATTATTATCAAGAATTAATTAATGTTGGTAAAAGTGTAAAGGGTTTGAATTTATTTAGAGATCTTTATGAAGTTACAGATAAAGCAACGATAGAATTTAAATCATTTGCAACAGATGAAAAAGATGTGATATTTAATGGTCGAACTGTTATGATTGATAGTCAAGATGAAAAGATGCTGATTAGTCAAATTAGAAGTTATTTAAAACTATCGACAGTAATTATTGCATTAGATGATGAACGTCAAATTCGTTTAATTAGTGAATTATTAAATCGCCATGAGCTTTTATACACTATGCTAGATAATAGTGGTGAATTTTATTCAGGGTTAAATCTTGTTATTGATAAAATCGGTTTTGGTTTTGAGTTAGTTGATGAAAATATTGTTGTTATTAGTTCTAATGAGTTATTTAAGACTAAAAATGTAAAAAAACCTAAGTATTTTAAATATAAAAATGCTAAGGTTTTAAAGGATTATCAAGAATTAGAAATTGGTGATTATGTAGTTCATGATAATTATGGAATAGGTCAATACTTAGGAATTAAAACTTTAGAGGTACAAGGGGTTCACCGTGATTATTTATATGTAGCTTATGCTGGAGATGATACATTATACATTCCTGTTGAACAATTTAATTTAGTGCGTAAATATTCAAGTAGTGAAGGGAAAGTACCTAAGATTAATAAATTAGGTAGTTCACAGTGGCAAAAAGCTAAAGCTAAAGCAAGAAATAAAGTTGATGATATTGCAGATAAATTAATTGAAATATATGCTGCAAGAATGAATCAAACAGGGTATGCGTTCCCTGTTGATAATGAAATGCAATTTGAATTTGAAAATGCATTTGGTTATGAATTAACAGAAGATCAAGTACGCTCAGTTAAAGAAATTAAAGAAGATATGGAAAAACCGCAACCAATGGACCGTCTTTTATGTGGAGATGTTGGTTTTGGTAAAACTGAAGTAGCATTAAGAGCCGTTTTTAAAGCTATTTTGGGTAATAAACAAGTTGCGTTTTTGTGTCCAACAACGATTTTATCAATGCAACATTATAAAACAATGTTAGATCGTTTTGAAAATTTCCCAGTAAAAGTTGCTTTATTAAATCGTTTTACTTCAACTAAACAAAAAAATCAAATTTTAAAAGATCTTAAGGAAGGAAATATTGATTTATTAGTTGGAACACATCGAATTTTATCTAAAGATGTTGAATTTAAAGATATTGGTTTATTGTGTATTGATGAAGAACAGCGTTTTGGAGTTAAACAAAAAGAGAAAATTAAAGAATATCGAAAAACAATTGATGTTTTAACACTTAGTGCTACTCCAATTCCTAGAACATTACAAATGTCATTAATGGGAATTAGAGGTTTATCACAAATAGAAACGCCACCTAAAAATCGCCAACCAGTACAAACATATGTAATTGAAAAAAATGATGTGTTGATTAAACAAATTATTGAACGTGAATTAGCACGCGATGGACAAGTTTTTTATTTACACAATCGAACAAGCAATATTGCCAATACTGCAGATAAAATTGGTAGAATGGTACCTGGAGCTAAAGTTGTTGTTGGCCATGGAAAAATGGATAAAAATGAAATAGAAGATGTAATGATGCGTTTTGTAAATAAAGAATACAACGTTCTTATTTGTACAACAATTATTGAAACAGGAATTGATATTCCAAATGCTAATACTATAATAGTTGAAAATGCTGATAAATTTGGGTTAAGTCAACTTTACCAAATTAAAGGACGTGTTGGACGTAGCAACCGAGGTGCTTATGCATATTTATTATATAATCCATCTAAAGTATTAACTGAAGAAGCTAGTAAACGATTAAAGGCCATTAAGGAATTTACTGAATTAGGTAGTGGTTATAAAATTGCAATGCGTGATCTTGCAATTCGAGGAGCTGGAGATATTTTAGGTGGAACACAATCTGGTTTCATTGATTCAATTGGATTTGATATGTTTATGAAAATATTACAAGATTCGGTTAATCAAAAAATGGGTAAACAAGAACAAGAAATTGATATTAAAAATGTAAATGTCAATGTTGATGGCTATATTCCTCATGATTATGTATCTAGCGATATTGAAAAATTAGAGTTATATCAACGATTAGATAATACTAAAACAATTAGTGCTATTGATCATTTAAAAACTGAATTTATTGATTATTATGGTAAATTACCTGATGAAGTTGCAGCTTTAATTGAAAAACGTAAGCTTGATATTTTAGCTTCATCAAAAATTATTGATATTTTAGAAGAAAAGAAAGGTAATATTGAAATTACTTTTAGTAGTGATTATAGCAAAAATGTAAAAGGGGATCAGTTGTTTGAATTAGTAAATCGTCTGTTTACTAGACCTAGATTTAAACAAATTGATAATAAAATAGCAATTGTACTACCAAAAGGTGATCAATGGTTAAATAGATTAAATGAATTAATTAGTATGCTCAGTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1142
MDCLDNILKQNLAFNALLNGKGNIVVNDVSDEALLLTSAFLKLKRNIVVVKANQYEANMLYQKVMLLNEKDVSLFAVDESYRIEALAASPELLGQRIDTMYQLTKNEPRILITHSQAIIRYLPTKQLFIDNCLKIKVGMQIDIYDLKASLLKSGYQSIIRVDQPFYFSKRGGVIDVFSIQYENPIRIEFFDDEIESIRFYNQNTQRTIENTNEITILPASDILYDDQEVTKVISKINDLRDSQAEILDELYLEDFLNKVSIDQENLRNHDTSFSMYSYYNLFNQTTSISDYLDDPLIILSNSQDINFAFKNYLEENFYYYQELINVGKSVKGLNLFRDLYEVTDKATIEFKSFATDEKDVIFNGRTVMIDSQDEKMLISQIRSYLKLSTVIIALDDERQIRLISELLNRHELLYTMLDNSGEFYSGLNLVIDKIGFGFELVDENIVVISSNELFKTKNVKKPKYFKYKNAKVLKDYQELEIGDYVVHDNYGIGQYLGIKTLEVQGVHRDYLYVAYAGDDTLYIPVEQFNLVRKYSSSEGKVPKINKLGSSQWQKAKAKARNKVDDIADKLIEIYAARMNQTGYAFPVDNEMQFEFENAFGYELTEDQVRSVKEIKEDMEKPQPMDRLLCGDVGFGKTEVALRAVFKAILGNKQVAFLCPTTILSMQHYKTMLDRFENFPVKVALLNRFTSTKQKNQILKDLKEGNIDLLVGTHRILSKDVEFKDIGLLCIDEEQRFGVKQKEKIKEYRKTIDVLTLSATPIPRTLQMSLMGIRGLSQIETPPKNRQPVQTYVIEKNDVLIKQIIERELARDGQVFYLHNRTSNIANTADKIGRMVPGAKVVVGHGKMDKNEIEDVMMRFVNKEYNVLICTTIIETGIDIPNANTIIVENADKFGLSQLYQIKGRVGRSNRGAYAYLLYNPSKVLTEEASKRLKAIKEFTELGSGYKIAMRDLAIRGAGDILGGTQSGFIDSIGFDMFMKILQDSVNQKMGKQEQEIDIKNVNVNVDGYIPHDYVSSDIEKLELYQRLDNTKTISAIDHLKTEFIDYYGKLPDEVAALIEKRKLDILASSKIIDILEEKKGNIEITFSSDYSKNVKGDQLFELVNRLFTRPRFKQIDNKIAIVLPKGDQWLNRLNELISMLS*