ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

L3_072_000M1_scaffold_640_2

Organism: dasL3_072_000M1_metabat_metabat_24_fa_fa

near complete RP 46 / 55 MC: 1 BSCG 48 / 51 MC: 1 ASCG 12 / 38
Location: comp(714..4928)

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
M protein repeat protein n=1 Tax=Eubacterium biforme DSM 3989 RepID=B7CDC6_9FIRM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 54.1
  • Coverage: 1030.0
  • Bit_score: 1057
  • Evalue 0.0
M protein repeat protein {ECO:0000313|EMBL:EEC89251.1}; TaxID=518637 species="Bacteria; Firmicutes; Erysipelotrichia; Erysipelotrichales; Erysipelotrichaceae; Holdemanella.;" source="Holdemanella biformis DSM 3989.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 54.1
  • Coverage: 1030.0
  • Bit_score: 1057
  • Evalue 0.0
lytB; LytB endo-beta-N-acetylglucosaminidase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 27.5
  • Coverage: 389.0
  • Bit_score: 168
  • Evalue 8.20e-39

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Holdemanella biformis → Holdemanella → Erysipelotrichales → Erysipelotrichia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4215
ATGAAGAGTAAATCAAAATTATTAACGGGATTTGCGGCTGCCAGTATGGTTATAACTCAAGCTGGTCAGTTGCATGTTTTCGCAAAAGGTGCAGCAATGGATTCTACAGAAAATCATTTAGTTTTGGAGAATACGAACGCAAAGAAAACAAAGAAAGAATTATTAGAAGAACAGCTTTCGAATGCTTCAAAAAAAGCAGAAGAAGCTAAAAAGGTTGAGAGTGATGCAAGATCGAAGTATGAAAATTATAAAACTTCGACGTATGATGTTTTAAATGCGTATCAATTATCGAAAAAGAATGATTATGATATAGTTTCACTTGAAACTCAAAATGAAATTTTAAAGGCTTTAGAACAACAAATTTCAAATTTAGAGGCAAATCAGAAAGAATTAACTTTGGCAAATGATAAGAAAAAGGAATTGTCATCTAAATTGGATGATGCTTCTAACAAATTAATTGAAGCACAAACTCAATTGGATAAGGCGCAAAAAGAGTATGATGCTTTATTGAATGGTAGTAGTGAAGAAGCTTTGTCAAAGGATGTGGAAGCTAAAAAGTTAGCTTTAGAAAAAGCACAAAAAGATTTGGCTGATGCACAAAAGACAGTGGATGATTTAAATGCACAAAAGGCTAGTGTTGAAGCAAGTATTGTTGATGCTACAAAGAGTTATGAGGATGCCAAAGCAGCTTATGAAAAAGCACAGAGTGCAACTTTACAAGCTCAAAAGGATTTAGATAGTGCAACTTCAAATTATAATGAAAAGAAGGCTATTTATGATAGTGCAAGTGATCCTACTTTAAAAGCTCAATATGAAGCAGATGTAATTCAGGCTGAAAAGGATTTGGTTACGGCTCAAAATAATTTGAAGAGTGCTACTGATGATCAGAGTGCTAAAGAAAATGCAGTAAATAAGGCTCAAACAAATTTAAATCAAGTGAATACAAATATTCAATTTTTACAATCGCAAATTGATTCTAAACAAAAAGAATTGGATGGCTTAGATAAAAACATTGGTGCTGCTCAACAAGAATTGGAGAGTGCAAAAAAAGAACTTGAATCTGCAAAACAAGATAAAACAAATAAGGATACAGCTTTGGAGAATGCAAAACAGGTTTTAGAGAGTGCTAAAAAAGAAGTAACTGTTCAGCAAACAAAGGTTGATGAAGCACAAGATGCAGTGACAAATCAACAAAAACTTGTAGATCAATTAAGAACAGATAAAGAGCAGGCGCAGGCTAAGATTGCCCAAGGTTCTAAAGGATTCTTTGAAGCTTATGGATACACAGATGCATTAAAAATCTTAGAAAAACAGAGTACTGCAAATGGTGGATATACAAATATTGGTGCCGAAAATGATGCGACAAGTTTAGAAAATTTCAAGCGTGCTTTAAGTATGGTACGATATGGAAATACATTAAGAACAACGGATACAAATGTACCGGGATTAAGTGATTTAACGGTCAATCCAACATTATTTGCGATTTCGCAGGTACAACTTAATGCGACAGCCAATGGGAAAATATTTGGGCATTCTAAACTTTATCGTGTTGGAGAAAACATAGCGGCTGCTACTTATAAAAGTAATGATGAATTGTTATTTAACGGTTGGTATACAGAAGAAAAACAAGTATATGATTATATTACTGCCAGGGGTTGGACAGAAGATGATTTGTACAATGATGCCGCTAAATATAAAGAAGTTCAACAGGCTTTAAATCAACAATATCCTCAGGTAGGCCATTACACTAATATTATTAATAAGAATTATACAACTACAGGTACAGCTTATATTTATTCAAAAGATCCAGCACCAGATGGATGGGAATGCAATGCAGGACAAGTGTTTGATTTTGTTCAACACTCTTCTTACATAACGACTGCAAATACAATGACAATCGATGAATTTGAAGCTAAGTTTAATGAGTACTATAACAAGCTTATGAATGCAGATAGTGTTTTAAGTGAGAATCAAACTAAATTAGATAGTTTGAAATCAGAATTAGAAAAACAAAAGGCTTTGTTCGCAACTAAACAAGCAACTCAATCAAGTGTACAAAAAAATGTACAAACTGCAACTGATCAAGCAACTTCAGCACAAAATGCAGTTACGGCCGCTCAATCTAAGGTAGATACAAAACAGGCTAGTCTTGATCAATTGATGAAAGACAGTGCTGCATCAGGTTTATTAAATGAAATCAATTCTTTAAAGGCATCTAAAAAAAATGCAGAAACAAATGATTTGGTAAATGCTCAAAAGGTTTTATCGGCTGCTCAAAAAGAGAAAATGATTGCTGATCAAAATGTTGTAGATAAAACGGCATTGGTGAATGATGCAAAGGCTAATTTAGATTTGAAGAAAAAGGTTTTGGCTGAATCAAATAAGGGTGTAGAGTTGGCTCAGTCCAATCTTGAGGTTGCCAAAAAGAATTTGGATGAAAAGACAAATGTTTTAAAAACAGCTAAATCGAATGAGTCTAGTAAGGAAGGCTTGTATGATTCTAGTAAGAATAGTTTGGATTGTTTAAATATGAAACTTTCTGAATTAAATAAGGATTTAGAAGCAGCTAAAAATAGTGCTTCTACAAAAGAAAATGCTTTATTAAATACAAAGAAGGCTTATGATAGTGCGATTCAAAAGCAGAGTGATGTTAAAAAATTAAAACAAGATATTGATAGTAAAAAATCTGTAATAGATAGTTATCAAAAGGATATACAATCATTTAAGGAAGCTATTTCTAAATTAGATGCATCTATCAAACAATTAGAGAATGAAGAGGCTTCAATGAAGGCTAGAATAGCTGAAATTCAAAAAGTAATGGATGCATATGATAAGCTATGCGCAAATCCAAATGGAATTTTGGATGTAGTAAGTAGTGATGATGAAATCATTAATGGTTTGTATGATAAATTGAATTCTATGAAGGAAGCTTATGATGTATATTTAAAAGCTCTAAATGAATTTAATAAAGCAGAGTCTATCAATAATCAAAATAAAAAAGAATTAGATGATGCATCAGAGAATTATAATAAGGCTAGTGATGAATTGAAAAAGGCTCAGGATGAACTAGATGCTTATTTAAAAGTAACGGGTACTCCTGGATGGCATAAATTAGATAATGATTGGTACTTTGTAGATTCAAATGGTAATTTAGTTACTAATAAATGGCAAGGAAACTATTACTTAGAAAGTGATGGTAAGATGGCCACAAATAAATGGATTGGCGATTGTTATGTTGGAAGTGATGGTTTATGGATTGAAAATAAATGGATTCAATCTGGAAATCAATGGTGGTATAGACGTGGTGATGGTACTTATACTACAAATGATTTTGAAACAATTTCTGGACAAACATATTACTTTGATGCAAGTGGCTATATGGTAACGGGTTGGAAACAAATCAAATCTAATTGGTATTTCTTTAATGCTTCTGGAGCCGTGGTAAAATCAGCTTGGCAAGGAAATTACTATTTAGGATCTGATGGTGTAATGCTTACAAATACCTTTACTCCAGATGGATATTATGTCGGTGCAGATGGTGTTTATGTAAGAAATCAGAAGATTACTGCAGAAGATAAAGACTATTATTTGAATGCAGATGGTAAAGTAGCTAAGAATCAATGGTCTGGTGATTATTATCTAGATAGTAATGGAAATCCATATATCAATAGATGGGCAGGAAGCTATTGGTGTGGTAGTGATGGTAAATATGTTAAATCTAGTTGGGTAGACAACAATAAATATTATGTCGGAGCCAATGGTATTTATGTCACAAACCAATGGGTTGGTGATTACTATTTGAATGGTTCTGGTGTTAAAGCCACAAATGCATGGGTAGGTGACTACTGGTGTGGTGAAGATGGTAAGTACATGAAATCTTCATGGGTTGATAACGGTAAATATTATGTTGGATCAAATGGTGTTTATGTCACAAACCAATGGGTAGGCGATTACTATTTGAATGGTTCTGGTTTAGTTACTAATAACGCATGGGTAGGAAACTACTGGTGTGGAAGTGATGGAAAATATGTTAAATCAGCATGGGTAGATAACAATCGTTATTATGTAAATGAAAATGGTGTATATGTAGCAGGTGCTTGGCAACAAGACAGCAAAGGTTGGAAGTATCATGCAGGAAGTGTATATGCAAAAGATATTACATTAAATATTAATGGTACATCTTATACATTTGATGGTAATGGTTATATGAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1405
MKSKSKLLTGFAAASMVITQAGQLHVFAKGAAMDSTENHLVLENTNAKKTKKELLEEQLSNASKKAEEAKKVESDARSKYENYKTSTYDVLNAYQLSKKNDYDIVSLETQNEILKALEQQISNLEANQKELTLANDKKKELSSKLDDASNKLIEAQTQLDKAQKEYDALLNGSSEEALSKDVEAKKLALEKAQKDLADAQKTVDDLNAQKASVEASIVDATKSYEDAKAAYEKAQSATLQAQKDLDSATSNYNEKKAIYDSASDPTLKAQYEADVIQAEKDLVTAQNNLKSATDDQSAKENAVNKAQTNLNQVNTNIQFLQSQIDSKQKELDGLDKNIGAAQQELESAKKELESAKQDKTNKDTALENAKQVLESAKKEVTVQQTKVDEAQDAVTNQQKLVDQLRTDKEQAQAKIAQGSKGFFEAYGYTDALKILEKQSTANGGYTNIGAENDATSLENFKRALSMVRYGNTLRTTDTNVPGLSDLTVNPTLFAISQVQLNATANGKIFGHSKLYRVGENIAAATYKSNDELLFNGWYTEEKQVYDYITARGWTEDDLYNDAAKYKEVQQALNQQYPQVGHYTNIINKNYTTTGTAYIYSKDPAPDGWECNAGQVFDFVQHSSYITTANTMTIDEFEAKFNEYYNKLMNADSVLSENQTKLDSLKSELEKQKALFATKQATQSSVQKNVQTATDQATSAQNAVTAAQSKVDTKQASLDQLMKDSAASGLLNEINSLKASKKNAETNDLVNAQKVLSAAQKEKMIADQNVVDKTALVNDAKANLDLKKKVLAESNKGVELAQSNLEVAKKNLDEKTNVLKTAKSNESSKEGLYDSSKNSLDCLNMKLSELNKDLEAAKNSASTKENALLNTKKAYDSAIQKQSDVKKLKQDIDSKKSVIDSYQKDIQSFKEAISKLDASIKQLENEEASMKARIAEIQKVMDAYDKLCANPNGILDVVSSDDEIINGLYDKLNSMKEAYDVYLKALNEFNKAESINNQNKKELDDASENYNKASDELKKAQDELDAYLKVTGTPGWHKLDNDWYFVDSNGNLVTNKWQGNYYLESDGKMATNKWIGDCYVGSDGLWIENKWIQSGNQWWYRRGDGTYTTNDFETISGQTYYFDASGYMVTGWKQIKSNWYFFNASGAVVKSAWQGNYYLGSDGVMLTNTFTPDGYYVGADGVYVRNQKITAEDKDYYLNADGKVAKNQWSGDYYLDSNGNPYINRWAGSYWCGSDGKYVKSSWVDNNKYYVGANGIYVTNQWVGDYYLNGSGVKATNAWVGDYWCGEDGKYMKSSWVDNGKYYVGSNGVYVTNQWVGDYYLNGSGLVTNNAWVGNYWCGSDGKYVKSAWVDNNRYYVNENGVYVAGAWQQDSKGWKYHAGSVYAKDITLNINGTSYTFDGNGYMK*