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NECEvent2014_10_1_scaffold_133_5

Organism: NECEvent2014_10_1_Lactobacillus_crispatus_36_608

near complete RP 50 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38 MC: 1
Location: comp(2942..5581)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
ABC transporter, permease protein n=1 Tax=Lactobacillus crispatus EM-LC1 RepID=V5ELA6_9LACO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.1
  • Coverage: 879.0
  • Bit_score: 1745
  • Evalue 0.0
  • rbh
ABC transporter, permease protein {ECO:0000313|EMBL:EST03673.1}; TaxID=1328863 species="Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Lactobacillaceae; Lactobacillus.;" source="Lactobacillus crispat similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.1
  • Coverage: 879.0
  • Bit_score: 1745
  • Evalue 0.0
ABC transporter, permease protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 98.9
  • Coverage: 878.0
  • Bit_score: 1736
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Lactobacillus crispatus → Lactobacillus → Lactobacillales → Bacilli → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2640
ATGATGCTTAAATTTCTTAACTCACGACACATTGCAATTAATCGTAAAAATATTTTTTTCTGGCTTAGTTTTTTGCTACCGGCTTTGATTTTCTTGAGTTACTTTTTCTACAGCAAAAATGGAGTGCTCACTGTCGACTTAGGTCAACAATATGTTGATTTTCTTGCCTTCTTCAGGCGAAATTTGTTCTCCCATCCCTTGCGCTTAATCTATTCCTTTTCTAATGGTTTAGGCGGTTCAATGCTAGCAACTGATGCCTATTATCTCTGCAGTCCTTTCAATCTACTCTTATTTTTATTTCCGCAACATTTTTTGCCACAAGCAATTTTAATTATTATCGCATTAAAAATTGGAGCGGCGGGACTATCTTCCTACTACTATTGGCAGCAAAAAATCACTAATCACTTTTACGCTTTAGCGGCTAGTTCGGCTTATGCCCTTTCAGGCTACGTTATTGGCAATCACTATAATCTGATGTGGCTTGATTCTGTGATTTTGCTTCCTTTATTGATTAATGCCATCGACCGCTTGCTTGCCCACCAAAAAAATAAGTTAATTTTAATTACCTTTTTGCTTTGGTTCACTAATTTTTATACCGGATTTATGGCATTAGCCTTTGGTTTGCTTTATCTGTTAAGCAAAATTTTCTTCATTAATAAGCAGGAGCGCCTACACCTTAACTGGATTTATTTAAGAAAAAGTATCGCTGGTTCATTTTTAGATGCCTTTATGCTCTTCCCCGTTCTGGTTGAAATGTTGCAAGGCAAGGCTAGTTCTACTGCCTCCTGGAATTTGGGCTGGCAGTTTTCTCCAGTTGAACAGCTGACTAAGTTAGCCGAAGGGGCCTATAACTTTCATGAAATGCAGGAAGGGATGCCCAACATTTATCTGACAATGCCTTTCTTGTTGCTGACAATTTTATATTTTTTAAGTAAAAAGATTAACTGGCAGCGTAAATTAGCAAACGGAATTTTACTCATTTTCTTAATTGCTTCTCTTTTTTGGACACCACTGGTTTTACTCTGGCATTTAGGCCAATTCCCTGTCTGGTATCCTGGTCGTTTCAGCTTTGTGTTGATCTTTTTTGCGCTAAATCTAGGCGTTATTGCATTAGAACAAAAAGAACGTATAGCTTATTGGCAGACCGGACTTCTGACTCTATTTTCTTTAGGTTTAATTGTTTATATAGTATTTAATGCCTCACATTTTGACTTTCTAACTGAAGATGCGCAGATTGCCACGGGAGCTTTTCTAGCCCTCGGAATCTTGTTTATTGGCTTTATTTATCATCAACACAGTTTTGCCGCGCCATTTTTCTATTTAGTTATCGAGCTTGAGTTAATCGTCAACCTAGTACTATGTCTAGGCAATTTAGCTTATCAAAAAAATAGCGATTATCAGAACTTTACCACTAATGTCAGCCAAGCAGTACAATACGCAAATCAACATGATTCTGGATTTTACCGAACTGAAAAGACTTTCTATCGTTCTGATGATGATCCTTTTAGCGCTGGTTATTACGGTTTAAGTAATTTTAATTCGATTTCTGATCAAAAAGTACTCAACCTGATCAACAATCTTGGATTTCTAAACAATAATAATTCCTACACTAATTTTGGCGGAACTACTTTGATAGATGATTTACTTGGAATCAAATATTATCTTTTGCCCAATGATGAAATCACAACGATCAAGTCTGGTAAGCAAATGAAGTATGACAATTCCAACCACCGCGTTGATGCCAGCGATTATCATTTGCAAAAACGCTTTGCCCAACTATATCTAGTGAAAAATAATGCCGCTTTGCCCCTACTCTTTTTAACATCACAAAAAACGCAAAAAATCAATTTTAACTCTCTAGATATTACTAGTAATCAAACCAAATTCTTTCAAGCAGTTACAGGGGCAAAAGTGCAGCTGTTTAAGCAGATCAATTGGCCTAAAGCAAAATTAATTAATGTAACTAGTATGAAAAACGATCAACTACAATATAATCGTAAAAACAATAAGCAAATCGCACGCATCATTTTCAATTTCAAACCACAGACTGATGATTCTTACTACATTGAAATGCCCGGTGAGATCGATGATAATGCCATTTCAATGACAGTTAATGGTGCTAATATTAATCTGGCAGTACGTGATCAAAATGCCCGTCTCATTAATCTAGGTAGCCACCAGCGTGGTCAACGGTTGCAAGTTACTTTTGAACTAAAAAAAGATAAACTCGACCTTAGTGGCATTCACTTCTGGCGCTTAAACACACAAAAGCTCGAGCAGATTATACATCGTTTTAAGCAAAAACAACCAAACTTTAAACAAACATCTGCTTTGATCATCAAATCTAATCATTTCACAACGAAGAAGATGATGACATTGGCGTCAACTATTCCTAATAACATTAACTGGTTAGTTTTAGATAATGGCAAAATAATTAACAAGAATAAAACCTTGTTCATGAATGCTTTTTTAAACTTCAAGTTGAATCCAGGAAAATATCAAATTACATTAATTTATGTACCATGGGTTCTTCTACTGGGGATGTTGGTTAGCTTAATTAGTTTAACAATTTTATTAATTTGCAAGAAAAAAGCCGCTGTTAGCGCTAACAGCAAAACTTTTACTAGACCTACTGTATAA
PROTEIN sequence
Length: 880
MMLKFLNSRHIAINRKNIFFWLSFLLPALIFLSYFFYSKNGVLTVDLGQQYVDFLAFFRRNLFSHPLRLIYSFSNGLGGSMLATDAYYLCSPFNLLLFLFPQHFLPQAILIIIALKIGAAGLSSYYYWQQKITNHFYALAASSAYALSGYVIGNHYNLMWLDSVILLPLLINAIDRLLAHQKNKLILITFLLWFTNFYTGFMALAFGLLYLLSKIFFINKQERLHLNWIYLRKSIAGSFLDAFMLFPVLVEMLQGKASSTASWNLGWQFSPVEQLTKLAEGAYNFHEMQEGMPNIYLTMPFLLLTILYFLSKKINWQRKLANGILLIFLIASLFWTPLVLLWHLGQFPVWYPGRFSFVLIFFALNLGVIALEQKERIAYWQTGLLTLFSLGLIVYIVFNASHFDFLTEDAQIATGAFLALGILFIGFIYHQHSFAAPFFYLVIELELIVNLVLCLGNLAYQKNSDYQNFTTNVSQAVQYANQHDSGFYRTEKTFYRSDDDPFSAGYYGLSNFNSISDQKVLNLINNLGFLNNNNSYTNFGGTTLIDDLLGIKYYLLPNDEITTIKSGKQMKYDNSNHRVDASDYHLQKRFAQLYLVKNNAALPLLFLTSQKTQKINFNSLDITSNQTKFFQAVTGAKVQLFKQINWPKAKLINVTSMKNDQLQYNRKNNKQIARIIFNFKPQTDDSYYIEMPGEIDDNAISMTVNGANINLAVRDQNARLINLGSHQRGQRLQVTFELKKDKLDLSGIHFWRLNTQKLEQIIHRFKQKQPNFKQTSALIIKSNHFTTKKMMTLASTIPNNINWLVLDNGKIINKNKTLFMNAFLNFKLNPGKYQITLIYVPWVLLLGMLVSLISLTILLICKKKAAVSANSKTFTRPTV*