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NECEvent2014_10_1_scaffold_141_6

Organism: NECEvent2014_10_1_Lactobacillus_gasseri_34_15

near complete RP 49 / 55 MC: 8 BSCG 51 / 51 ASCG 14 / 38 MC: 1
Location: 5603..9079

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
ATP-dependent helicase/deoxyribonuclease subunit B {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01453, ECO:0000256|SAAS:SAAS00044212}; EC=3.1.-.- {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01453, ECO:0000256|SAAS:SAAS00044217};; EC=3. similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2278
  • Evalue 0.0
ATP-dependent helicase/deoxyribonuclease subunit B n=1 Tax=Lactobacillus gasseri K7 RepID=S1RYV4_9LACO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2273
  • Evalue 0.0
  • rbh
ATP-dependent helicase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 99.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2278
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

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Taxonomy

Lactobacillus gasseri → Lactobacillus → Lactobacillales → Bacilli → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3477
ATGATTAATGTAATTACTGGTAGACAAGTAGACAACTTGCAAAATGATATTATTGATCAAGCTGTTAAGTCATATTACCAAGATAAAACGCACGATGTTTTTATTATCGTGCCAAACCATATTAAGTTTACCACAGAAGTACGCGCACTTAGCAAGCTCTCTGTTTTAACGAATAAAAAACAAGTAGCAGTTAATAAATTGCACATTTTATCGTTTTCACGACTAGCTTGGTATTTTTTGAAGGATGAAGCAATCAAGTTGCCCCAGATTTTAGATGATGCTGCTAGTGTGATGTTACTTGAGCAAATTGTTAAAGATCATCAGAATGAACTAAAACTATTTCAAAATAAGAATCAGATTACGTCTGGTGCCTTAAAGCAAATGTATGAAGCAATTTTATCAGTTCGGGCTGGAAATATTGAACTAGAAAATATTGATAATGAAAAATTAAATGAAGAAACCAGCTATAAAGTCCATGATTTGCGAATTATTTATGATGATTTTATCGAACGGCTATCTGAAAAATTTGCAACAAAAGATGAAATGCAGCTCCTGCTTAATGAGTTTCTAGCTAAAAGCAACAATTTGAGCAGCATGGAATTTTATTTTTCTGATTTTTCGCATTTTTCCTTGCAGGAATTAACTTCAGTGCGTTTAATTTCAAAAAAAGCTAAAAATACAACTTTAGCATTTAAGACAAAAGTCGGCAAGATAGACAGTAAAGCGGAACCTGGAGACTATGATTATGTAGTTCAAAGAACAATTGGACAACTAGAGCATTTTTGGCAAAATCAGCAATTAAATTATCAAACTACTGAATTTCCACTCAGTCAGACTAATCCTAGCTCCCTGTTAAATGGTGTTTGGACTAAGACTAGCAGCTTTGATGAAAGTTTGAGTAAATTTTTGCAACCAGTTAAAGCAGATTCTAGATATGCTGAAGCATACTTTGTCGCACGGACAATCTACCAACAAGTTGCTTTAAACCACTATCGCTATCAAGACTTTTTAGTTTTAGCGCCAAATTTAAGTGAATATGAAACTTACTTAACGCCAATTTTGCGTCAAAATAATATTCCCTTCTTCAATGACCTGCAAAAGGAGATGAAATATCATCCCTTGGTTGTTGCAGTAGAAAATCTCCAGCAAATTTTTAAGCGTGGTTTTCAAACAGATAATGTAATTGCGCTAATGAAAACACAGCTGTTTATTCCCGAGTGGTATAAGAGCGTAGCACGTTATCAAAACGATGTGGATTTACTTGAAAACTTTGTGTTGGCACATGGTATTAAGGGAAGTCTTTGGAACAAGCCTTTAAAAAACTTTGTGGATGCGGAAGTAATTGCACTTGATAAGTCAGAGCAAGAGGTGGAAGAACTTGAGCGATTACGTCAATACTTTATCAGTATTCTAAGTAAATTTTTTGAAGAAATAGAAGCAGAGAAAGATCCGCAAGCTGGAGTGACAATTTTTTGGAACTTCTTAATTAAAAATCGAGTTGCAAAAAGACTAGAGGCTTGGCGAAAAGAAGCAAATGATGCTGGAGACTTACAGTTAGCGCAGCAGCCTGAACAAGTTTGGTCAACCCTAAACGATTTGCTAAAGGATTACTTATTGGTAGCCAAGGAATTTTCATTAGAACAATTTTTTGATCTTTTAATTAGTGGATTTAGTGAGGCTAATTTCTCACAAATTCCATCTACTCTTGATGCAGTTAACATCTCTGAAATGGGAATGGTTCAAGGACAAGGTTATAAGCAAGTATTTATTATTGGGGCAACAAGTAGTAATTTACCGCAGATTGAGAAAATTCCAGGTTTCTTTAGTTCAGAGAACTTGGAACAGCTAAATGATGGGAATAATACTAGTGGCTATTTAGAGGATCAACAAAAAATTAATAATCTAGATCAGAATTATCAGTTTGGTAATGCATTAAGTTTAGCCAGTGATAAGATTTATATTTCCTATCCTGTAATTAATACGGCAAATGAACGATTAGAACCATCTATCTTTTATAAACAACTTCTTAGATTAACCCAGGCAGAAGAGTTTTCACAGCATGATTTACCTAATTCTGCTGGTGATCTTTTAACCTTTATGACTAATCCGGAAGCTAGTTTGGGCTATTTAACTTACTTAAAGAGCAAGCAAGCCGTTAAGGTAGATTCTATCTTAGAGATGACTGAGCAGAAAATAGGCGAAGTAGCTCAAAATGTCCTTGAAGGAAGCAGCTTTAAGAATATTCCCGAAAATCTCTCACCAGAATTGGCACAGGAACTTTACGGAGATCGGATAGAGACTTCAGTTTCACAACTTGAAACTTATTATCAGAATTCTTTTGAATATTTCTTAAATTACGGCCTACATTTAAAGAAGCGATTTGAAAATGAACTTGATGTAATTCAGGCAGGTAATTATTATCATGAAACTTTTGACTATTTAGTTAAAAAGATTAAAGAGAAAAACTTAAATTTTGCTGATTTAACTGATAGTAAGTTAACAGAGTTACTAATTGAAGTACGAGAGGAGTTAAAAGAAAAAGGCAGATATCGTCAACTTTTAAATGATCCATTCAATAAATATTTGTTCCATAAGCTAGACCAAACCACATCTAATGTTGCTCATTATTGGCATAGCAATGTAAATAAAACAACTTTTAGACCACAATATTCAGAATTAAGTTTCGGTAAAAATCAAAAAGTAACAGGTCTATCCTATAGTTGGAAAGATGAAAATAATAAAAAGAAGATTGTTGATCTACGAGGAAAAATGGACCGAGTTGATCTGGCTAAGGTAAATGATCGAGTTTTAGGAGAGGTAATTGACTATAAGTCTTCTGCTAAAAAGTTTGATTTAGGTCTCTTTGCCAATGGAATTTCGATGCAAATGATTTCTTATTTGGAAGTCTTAAAAAAGAATAATAAGTTTTTTGCTCAAGGTAAAAACTTAGATGTTTTAGGAGCTTTTTATCAAAATATTACTAGCAGCTTGGAACGCTTAAGTAGTGATAAGATGATTCTGAGCAACTATCAAATTAAGGATCTTCTCAAAGAAAGTACTAAGAAACTAATGTATAACGGAATTTTAATTGCTGATGAAGAGATTCTGGACCTGATTGAACCAGGAATGGAGAAAGATCGAGCTAATTCAGAAATATATAGCAGCGTTAAAAGAAAGGTAAATGGCGACATAAGTTGGCCACGAAATCAGAGTTTTACTCCTGATCAATTAGAATTGCTATTGGCATATAATTCCTACTTAATCAAGAATGCTGGTAGTGAGATTTTATCAGGTAAGATTAAACTTGATCCATATACTTACGGACAACAGAGTTCCTTAACTTATTCTGACTTTAAAGATATTTTCTTCTTTGATGCTATGTTAAAAGAAAATAATTACCATAAAATTAAAGCAATTGATAAAAAGACGCTTTTGAACTTAATTAAAGAAAAACTGGATTTGGATGGTGATGAATAG
PROTEIN sequence
Length: 1159
MINVITGRQVDNLQNDIIDQAVKSYYQDKTHDVFIIVPNHIKFTTEVRALSKLSVLTNKKQVAVNKLHILSFSRLAWYFLKDEAIKLPQILDDAASVMLLEQIVKDHQNELKLFQNKNQITSGALKQMYEAILSVRAGNIELENIDNEKLNEETSYKVHDLRIIYDDFIERLSEKFATKDEMQLLLNEFLAKSNNLSSMEFYFSDFSHFSLQELTSVRLISKKAKNTTLAFKTKVGKIDSKAEPGDYDYVVQRTIGQLEHFWQNQQLNYQTTEFPLSQTNPSSLLNGVWTKTSSFDESLSKFLQPVKADSRYAEAYFVARTIYQQVALNHYRYQDFLVLAPNLSEYETYLTPILRQNNIPFFNDLQKEMKYHPLVVAVENLQQIFKRGFQTDNVIALMKTQLFIPEWYKSVARYQNDVDLLENFVLAHGIKGSLWNKPLKNFVDAEVIALDKSEQEVEELERLRQYFISILSKFFEEIEAEKDPQAGVTIFWNFLIKNRVAKRLEAWRKEANDAGDLQLAQQPEQVWSTLNDLLKDYLLVAKEFSLEQFFDLLISGFSEANFSQIPSTLDAVNISEMGMVQGQGYKQVFIIGATSSNLPQIEKIPGFFSSENLEQLNDGNNTSGYLEDQQKINNLDQNYQFGNALSLASDKIYISYPVINTANERLEPSIFYKQLLRLTQAEEFSQHDLPNSAGDLLTFMTNPEASLGYLTYLKSKQAVKVDSILEMTEQKIGEVAQNVLEGSSFKNIPENLSPELAQELYGDRIETSVSQLETYYQNSFEYFLNYGLHLKKRFENELDVIQAGNYYHETFDYLVKKIKEKNLNFADLTDSKLTELLIEVREELKEKGRYRQLLNDPFNKYLFHKLDQTTSNVAHYWHSNVNKTTFRPQYSELSFGKNQKVTGLSYSWKDENNKKKIVDLRGKMDRVDLAKVNDRVLGEVIDYKSSAKKFDLGLFANGISMQMISYLEVLKKNNKFFAQGKNLDVLGAFYQNITSSLERLSSDKMILSNYQIKDLLKESTKKLMYNGILIADEEILDLIEPGMEKDRANSEIYSSVKRKVNGDISWPRNQSFTPDQLELLLAYNSYLIKNAGSEILSGKIKLDPYTYGQQSSLTYSDFKDIFFFDAMLKENNYHKIKAIDKKTLLNLIKEKLDLDGDE*