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NECEvent2014_10_1_scaffold_184_8

Organism: NECEvent2014_10_1_Lactobacillus_gasseri_34_15

near complete RP 49 / 55 MC: 8 BSCG 51 / 51 ASCG 14 / 38 MC: 1
Location: 6835..8160

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Cellobiose-specific PTS system IIC component n=1 Tax=Lactobacillus gasseri K7 RepID=S1S0U5_9LACO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.8
  • Coverage: 441.0
  • Bit_score: 880
  • Evalue 8.00e-253
  • rbh
PTS cellobiose transporter subunit IIC similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 99.8
  • Coverage: 441.0
  • Bit_score: 880
  • Evalue 2.30e-253
  • rbh
Permease IIC component {ECO:0000256|PIRNR:PIRNR006351}; TaxID=1403312 species="Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Lactobacillaceae; Lactobacillus.;" source="Lactobacillus gasseri 130918.; similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.8
  • Coverage: 441.0
  • Bit_score: 880
  • Evalue 1.10e-252

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Lactobacillus gasseri → Lactobacillus → Lactobacillales → Bacilli → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1326
ATGTCATCTTTAGTTAAATGGCTTGAAACTTACGTTTTACCTCCTGCATCTCGCTTAGCTCAAGTCCGCTGGCTAGTTGCAATGCGGGATACTTTTATTTCTTTACTACCAATTACAATGGCTGGTTCAATTGCAATGCTATTTAATAGCATCATTAGAGCCGCTAAAGTGCAAATGCATTGGGATACCTTTTATTCTTTGATGCAGCCGATTGTCGCAATTGATAATATTATTTGGGAAGGTACATTTGCACTTTTTGCAGTTTATTTTGCGATTTCTTGGGGCTATCACTTAGCTAAGACCTATGAAGTAAATCGTTTTGCTGGTTCAGTTGCTTCCTTAGTTGCTTTTGCAATGAGTATTAGCGATTCAGTGAAATTACGTATTGATGGAGATGTGGTTGATATTAAAAATGCTTTTGATATTAAGCAGTTTTCAACAATGGGATTATTTACAGCTATTATTTTTGGCTGTATTGGGACTGCCTTGTTTATTGTATTTTATAAGGCAAGAATTCGGCTTAAAGTTGATACCAGTATGCCCCATGCGGAATGGGTAGCATTTAGTACTTTAATTTCAATTCTACTTTCAGTATTTATTGTTGGCTTTGTTAATTACGCCTTTCAACGGCTTACTGGAACTTATTTTGGTAATTGGCTTCTTGCTACTATTCAGCGTCCCTTGGTTAATTTGGGGCAGGGTTTTGGAGTCGTCTTATTGGTTACCTTTCTAGTTCAAATCTTTTGGTTCTTTGGGATTAACGGCATTAGCGTTTTAACTCCAGTGATGGACTCTTTGTGGTTAACTCCAGAAAATATTAACGTTACAGCTGTTCGAAATAGTGAGCATGTTCCATATATTTGGGTTCGCGATTCATTTAATGTATTTGCTTGGTTTGGTGGAGCAGGAGGTACATTAGTATTAATTATTGCAATCTTGATGTTTTCTAAACGTAAAGATTATCGAACAATAGCGAAGATGGCTGTAGCACCTGGGGTATTTAATATTAATGAGCCTATTATTTTTGGCTTACCTGTAGTTTTTAATCCAGTTTATTTAATTCCATTTGTTGTTGCTCCGCTTGTAAATGTGTCACTAGCATATTGGGCTACAACGGCCGGCCTAGTTAATCCGGTTCAAATTTTTGTTCCAACAGTAATGCCGCCACTTATTGGACCATTTCTAGCATGTAATTATGACTGGCGTGCTATTGTTTTAGCGCTTATTAATATGGTAATTGCACTTCTTATCTGGATGCCGTTTGTTTTTGCAGCTGACAAGATTGCTAAACAAGATAATAATCAACGCAATTTCTATTTACCATAG
PROTEIN sequence
Length: 442
MSSLVKWLETYVLPPASRLAQVRWLVAMRDTFISLLPITMAGSIAMLFNSIIRAAKVQMHWDTFYSLMQPIVAIDNIIWEGTFALFAVYFAISWGYHLAKTYEVNRFAGSVASLVAFAMSISDSVKLRIDGDVVDIKNAFDIKQFSTMGLFTAIIFGCIGTALFIVFYKARIRLKVDTSMPHAEWVAFSTLISILLSVFIVGFVNYAFQRLTGTYFGNWLLATIQRPLVNLGQGFGVVLLVTFLVQIFWFFGINGISVLTPVMDSLWLTPENINVTAVRNSEHVPYIWVRDSFNVFAWFGGAGGTLVLIIAILMFSKRKDYRTIAKMAVAPGVFNINEPIIFGLPVVFNPVYLIPFVVAPLVNVSLAYWATTAGLVNPVQIFVPTVMPPLIGPFLACNYDWRAIVLALINMVIALLIWMPFVFAADKIAKQDNNQRNFYLP*