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NECEvent2014_10_1_scaffold_244_4

Organism: NECEvent2014_10_1_Lactobacillus_gasseri_34_15

near complete RP 49 / 55 MC: 8 BSCG 51 / 51 ASCG 14 / 38 MC: 1
Location: comp(2018..4996)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Type III restriction-modification system StyLTI enzyme res n=1 Tax=Lactobacillus gasseri K7 RepID=S1SNS4_9LACO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 992.0
  • Bit_score: 1980
  • Evalue 0.0
  • rbh
Type III site-specific deoxyribonuclease {ECO:0000313|EMBL:CDA27936.1}; TaxID=1263084 species="Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Lactobacillaceae; Lactobacillus; environmental samples.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 81.9
  • Coverage: 992.0
  • Bit_score: 1658
  • Evalue 0.0
restriction endonuclease similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 81.7
  • Coverage: 992.0
  • Bit_score: 1651
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Lactobacillus amylovorus CAG:719 → Lactobacillus → Lactobacillales → Bacilli → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2979
ATGAAGATTAAACTTGAAACTTTACAACATCAAGTAGATGCACTAAGGGCTATCGATCAAGCTTTTCCAGGAATAGATATGATGAGTGATGATCCAGACGCTAATTACATCTATGCTAATCCGTTAATTAATTGTCGCTACAAAGATAAAGCTAATATTGATATTAAAATGGAGACAGGAACTGGTAAGACTTATGTTTATACCAGAATGATGTATGAGCTTCATAAAAAATATGGACTATTTAAATTTGTAATTGTTGTCCCAACTCCAAGTATTAAAGAAGGAACGAGAAGTTTTATTACTAGTGATTATGCTAAGCAACACTTTAGTCAGTATTATGAAAATACACGGATTCAATTAAATGTAATAAATGCAGGTGATTTTAAGTCGCGCTCAGGGCGAAGAAACTTTCCAGCTCAACTATCAGAGTTTGTAGAAGCTACGCGGCAGAATGCTAATCAGATCGAAGTATTATTAATCAATCAAGGAATGCTCAGCTCAAAATCCATGAGCCGTAAGGACTATGACCAAACTCTACTAGGCGGAGAAAATATTCCGATTAAGGCAATTGCTGCGACAAGGCCAGTGGTAATTATTGATGAACCACACCGTTTTCCACGTAACAAAAAGTCTTATAAAGATATTGAATTATTAAAGCCTCAACTAATCGTTAGATTTGGTGCAACATTTCCTTTGGTTGCATCTGGTCGTGGCAAAAATAGAGTAACTAAACCAGATTATTATCGTGGAAAACCACAATTTAATTTGGATGCAGTAGATAGTTTTAACCAAGGCTTAGTTAAAGGAATTGATATTGATTATCCTGATATTCCAAAGGAACAAGCAGAGCATTTATATAAGGTAAAGCAAGCAAAAGCTAGAGAGTTGATTTTATCTAGAAATGGACATGATTATTCTATTTCTGCTGGTGAAAATTTAGCCGATATTGATTCCGGGTTTGAAGGCAACATTATTTATTCAGGGGGAACAGATAAAGAATTATCTAATGGATTAGCTTTATCAAAAGATATGGAGCTTATTCCAGGAACTTTTGCTAAAAATTATCAGGATGAAATTATATCTCAAGCATTAGATTGTCATTTTAAGGCCGAAGAAGATAATTTTTTAAGACCAGATTCAGCAAATAATATGCCTAAGATAAAAACTTTATCTCTATTCTTTATCGATAGTATTGCTAGCTTCCGTGGTAAAAACAATACTAAGGGATGGCTTGCACAGCATTTTGAAGAGTTACTGACTAAGAAACTACAAAACTTGATTAATAAATATGAATTAGCGATCGACGAGAGAGAAAAAGAATACTGTTCTTTTCTCAAAGCAACGTTACGAAGCTTAAAATCAGATCATCAAAATGTTTATGCTGGTTATTTTAGTGAAGATCGTGGAAATTCTGATGAAGACATTCAAGCTGAGGTAGAAGATATTCTGAAAAATAAGGAAAAACTCCTTAGCTTTAAAGATAAAGATGGTAATTGGATTACAAGACGATTTTTGTTTTCAAAATGGACTTTGCGTGAAGGATGGGATAATCCTAATGTTTTTGTCATTGCAAAGCTTCGAAGATCTGGTTCGGAAATTAGCAAGATTCAAGAAGTTGGTCGTGGTTTAAGATTACCAGTTGATGAAACAGGACATCGTTTAAATCAGGATGAGTGGCAAAGTAGATTGTCATTTTTAATTGGATATGATGAACGGAATTTTGCTCAGAAATTAGTCGGTGAAGTTAATGATGATATTCCTCTTGATATAAATAAAGAGGAATTAACTGAAGATATGATTGATACCATTGTTAAGGTAAGAAAGAAAACAGATCCGAAATTTAATGAAGATAAGTTACTTGATGATTTAGATGAACATAATGTAATAACTAGATCAAATAAATTTAAACCAGAAGTTGAGTTGAGAGGTCAAAAAATGTCAGGATATGAGGCATTATGTCAGTTATATCCAGAGCTAGAACAACAAACAAAAGTCGCAAAAGGTAAAATTAGAGATAAAAACTCAAAAGAAAGTACTCAAGTAAAACTTAGAAAACAAAACTGGCAGCAATTGAAAAATTTATGGATGCAATTAGCTAGAAGACAAATGATAAAATTTGATTCTTCTGTAAACTCAGTTGCTGAAATAGTTGCTAAGAATGTATTCAACGATAATGATAATAAGATTTTTGTCCTACAAAGACCTCAAATAATTCATCAGCAACTTGAAACTACTGATGATGGTGCTGAAATTAGAGAGACACAAACTGATTATAATGCCACATATTTAACTATGAATTATGGTAAGTTCTTAAAAATATTAGCGAAGCAAACAGATTTATCAGTTAATTTGCTGAATAACTTAATGATTAAAGCAGTTAAACGGTTGGGTGGAAATAAAAACTATATTAATGAAAATACATTGAGTAATCTAATTCGTACATTTAATAAACAATTTAATGAACGAATAAGACAATCTTATAGTTATGAACCTTTAGATTTTGTTTCATCAACTTCTATTTATAATGCCAAAAAACACGAATTTGTTGACTCATTGCCAGCAAATGTTTTAGGAATCTACGTCTCAGACCATTCTACAGCTGACAAAGCTTATTTATACGATCGACCACCACTTCGATATGATAGTGCTGATCCAGAATTGAAAATTTTGAATAGAACGTATAGTCCTAAAATTAGTGTATTTGGAAAATTACCAAAAAAAGCCATCAAGATTCCACGTTTTGACAATGGTACGACTACACCAGATTTTATTTTTATGGTTGAAAATAATAACAAATCAGCTTATTTAATTATTGAAACTAAAGCAGAAAATATGCGCTTAGATGATGCTGAGATAGGAATTATTCAACAAAAATATTTCGATCAATTAAAAGAATCTGGAGTTTATTATCGGATGGCAACTAGTGAACAAGAAGTACACGATTTAATTAACAAATTAGAGAATGGAGAACTGAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 993
MKIKLETLQHQVDALRAIDQAFPGIDMMSDDPDANYIYANPLINCRYKDKANIDIKMETGTGKTYVYTRMMYELHKKYGLFKFVIVVPTPSIKEGTRSFITSDYAKQHFSQYYENTRIQLNVINAGDFKSRSGRRNFPAQLSEFVEATRQNANQIEVLLINQGMLSSKSMSRKDYDQTLLGGENIPIKAIAATRPVVIIDEPHRFPRNKKSYKDIELLKPQLIVRFGATFPLVASGRGKNRVTKPDYYRGKPQFNLDAVDSFNQGLVKGIDIDYPDIPKEQAEHLYKVKQAKARELILSRNGHDYSISAGENLADIDSGFEGNIIYSGGTDKELSNGLALSKDMELIPGTFAKNYQDEIISQALDCHFKAEEDNFLRPDSANNMPKIKTLSLFFIDSIASFRGKNNTKGWLAQHFEELLTKKLQNLINKYELAIDEREKEYCSFLKATLRSLKSDHQNVYAGYFSEDRGNSDEDIQAEVEDILKNKEKLLSFKDKDGNWITRRFLFSKWTLREGWDNPNVFVIAKLRRSGSEISKIQEVGRGLRLPVDETGHRLNQDEWQSRLSFLIGYDERNFAQKLVGEVNDDIPLDINKEELTEDMIDTIVKVRKKTDPKFNEDKLLDDLDEHNVITRSNKFKPEVELRGQKMSGYEALCQLYPELEQQTKVAKGKIRDKNSKESTQVKLRKQNWQQLKNLWMQLARRQMIKFDSSVNSVAEIVAKNVFNDNDNKIFVLQRPQIIHQQLETTDDGAEIRETQTDYNATYLTMNYGKFLKILAKQTDLSVNLLNNLMIKAVKRLGGNKNYINENTLSNLIRTFNKQFNERIRQSYSYEPLDFVSSTSIYNAKKHEFVDSLPANVLGIYVSDHSTADKAYLYDRPPLRYDSADPELKILNRTYSPKISVFGKLPKKAIKIPRFDNGTTTPDFIFMVENNNKSAYLIIETKAENMRLDDAEIGIIQQKYFDQLKESGVYYRMATSEQEVHDLINKLENGELK*